MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 117050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017267	TCG	2	6	252521	252526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417306
6002	NC_017267	CCA	2	6	252552	252557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417306
6003	NC_017267	CGG	2	6	252558	252563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417306
6004	NC_017267	TGCGG	3	15	252609	252623	0 %	20 %	60 %	20 %	384417306
6005	NC_017267	GAT	2	6	252646	252651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017267	TGC	2	6	252807	252812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417307
6007	NC_017267	GCG	2	6	252880	252885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417307
6008	NC_017267	CAT	2	6	252910	252915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417307
6009	NC_017267	GC	4	8	252927	252934	0 %	0 %	50 %	50 %	384417307
6010	NC_017267	GC	5	10	252941	252950	0 %	0 %	50 %	50 %	384417307
6011	NC_017267	AGC	2	6	252990	252995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417307
6012	NC_017267	CTG	2	6	253088	253093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417307
6013	NC_017267	GCAG	2	8	253291	253298	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_017267	GC	3	6	253322	253327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_017267	ACATC	2	10	253378	253387	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6016	NC_017267	TCGT	2	8	253407	253414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_017267	CAGC	2	8	253439	253446	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_017267	GTGCCT	2	12	253469	253480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_017267	CGA	2	6	253516	253521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_017267	CTG	2	6	253535	253540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_017267	TGT	2	6	253559	253564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417308
6022	NC_017267	GCT	2	6	253572	253577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417308
6023	NC_017267	GC	3	6	253580	253585	0 %	0 %	50 %	50 %	384417308
6024	NC_017267	CGA	2	6	253614	253619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417308
6025	NC_017267	CGC	2	6	253623	253628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417308
6026	NC_017267	CG	3	6	253681	253686	0 %	0 %	50 %	50 %	384417308
6027	NC_017267	CCA	3	9	253694	253702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417308
6028	NC_017267	CGC	2	6	253730	253735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417308
6029	NC_017267	CGA	2	6	253791	253796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417308
6030	NC_017267	CGTCA	2	10	253804	253813	20 %	20 %	20 %	40 %	384417308
6031	NC_017267	CG	4	8	253860	253867	0 %	0 %	50 %	50 %	384417308
6032	NC_017267	GCG	2	6	253913	253918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417308
6033	NC_017267	TCT	2	6	253943	253948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417308
6034	NC_017267	CTG	2	6	254023	254028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417308
6035	NC_017267	GCC	2	6	254158	254163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417308
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6039	NC_017267	AAC	2	6	254426	254431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417308
6040	NC_017267	TGC	2	6	254450	254455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417308
6041	NC_017267	GCC	2	6	254521	254526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417308
6042	NC_017267	GCG	2	6	254534	254539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417308
6043	NC_017267	AC	3	6	254562	254567	50 %	0 %	0 %	50 %	384417308
6044	NC_017267	CG	3	6	254576	254581	0 %	0 %	50 %	50 %	384417308
6045	NC_017267	CGG	2	6	254604	254609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417308
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6051	NC_017267	GC	3	6	254830	254835	0 %	0 %	50 %	50 %	384417308
6052	NC_017267	GCG	2	6	254846	254851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417308
6053	NC_017267	GC	3	6	254903	254908	0 %	0 %	50 %	50 %	384417308
6054	NC_017267	ACA	2	6	255098	255103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417308
6055	NC_017267	GTT	2	6	255156	255161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417308
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6057	NC_017267	CG	3	6	255379	255384	0 %	0 %	50 %	50 %	384417308
6058	NC_017267	CCGA	2	8	255385	255392	25 %	0 %	25 %	50 %	384417308
6059	NC_017267	CTGC	2	8	255409	255416	0 %	25 %	25 %	50 %	384417308
6060	NC_017267	CGG	3	9	255477	255485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417308
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6062	NC_017267	CCA	2	6	255551	255556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417308
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6065	NC_017267	CGCTG	2	10	255725	255734	0 %	20 %	40 %	40 %	384417308
6066	NC_017267	AGC	2	6	255784	255789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_017267	GCT	2	6	255790	255795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_017267	GGC	2	6	255806	255811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_017267	GTC	2	6	255822	255827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_017267	GCTT	2	8	255882	255889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6071	NC_017267	CGT	2	6	255968	255973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6073	NC_017267	AGC	2	6	255993	255998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_017267	TTGG	2	8	255999	256006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_017267	CCG	2	6	256019	256024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_017267	ACC	2	6	256124	256129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_017267	CGT	3	9	256131	256139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6082	NC_017267	ACTGCA	2	12	256244	256255	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6095	NC_017267	CACCGG	2	12	256682	256693	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384417309
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6108	NC_017267	GCGCCG	2	12	257197	257208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_017267	AGC	2	6	257238	257243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_017267	GCG	2	6	257324	257329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_017267	GCC	2	6	257352	257357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_017267	CGG	3	9	257366	257374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_017267	GCG	2	6	257375	257380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_017267	GC	3	6	257402	257407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_017267	GC	3	6	257409	257414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_017267	ATG	2	6	257429	257434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6119	NC_017267	ACCGCG	2	12	257699	257710	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384417310
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6121	NC_017267	TGG	2	6	257778	257783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417310
6122	NC_017267	GGCCCC	2	12	257798	257809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417310
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6124	NC_017267	GC	3	6	257986	257991	0 %	0 %	50 %	50 %	384417310
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6240	NC_017267	CGATGG	2	12	262430	262441	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384417314
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6243	NC_017267	CG	3	6	262563	262568	0 %	0 %	50 %	50 %	384417314
6244	NC_017267	CG	3	6	262598	262603	0 %	0 %	50 %	50 %	384417314
6245	NC_017267	CG	4	8	262634	262641	0 %	0 %	50 %	50 %	384417314
6246	NC_017267	GCC	2	6	262652	262657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417314
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6351	NC_017267	GC	3	6	266753	266758	0 %	0 %	50 %	50 %	384417318
6352	NC_017267	GCA	2	6	266785	266790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417318
6353	NC_017267	TGC	2	6	266806	266811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417318
6354	NC_017267	GCA	2	6	266827	266832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417318
6355	NC_017267	CAT	2	6	266869	266874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417318
6356	NC_017267	AGC	3	9	266898	266906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417318
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6358	NC_017267	CCAC	2	8	266987	266994	25 %	0 %	0 %	75 %	384417318
6359	NC_017267	CG	4	8	267022	267029	0 %	0 %	50 %	50 %	384417318
6360	NC_017267	TCG	2	6	267039	267044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417318
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6362	NC_017267	GTG	2	6	267146	267151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417318
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6364	NC_017267	CG	3	6	267309	267314	0 %	0 %	50 %	50 %	384417318
6365	NC_017267	GC	3	6	267380	267385	0 %	0 %	50 %	50 %	384417318
6366	NC_017267	TCG	2	6	267444	267449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417318
6367	NC_017267	TGC	2	6	267621	267626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417318
6368	NC_017267	GGC	2	6	267629	267634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417318
6369	NC_017267	GCCA	2	8	267650	267657	25 %	0 %	25 %	50 %	384417318
6370	NC_017267	CGC	3	9	267744	267752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417319
6371	NC_017267	CCATG	2	10	267753	267762	20 %	20 %	20 %	40 %	384417319
6372	NC_017267	CG	3	6	267766	267771	0 %	0 %	50 %	50 %	384417319
6373	NC_017267	CGCTG	2	10	267774	267783	0 %	20 %	40 %	40 %	384417319
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6376	NC_017267	GC	3	6	267880	267885	0 %	0 %	50 %	50 %	384417319
6377	NC_017267	GTT	2	6	267894	267899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417319
6378	NC_017267	CGGCAG	2	12	268017	268028	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384417319
6379	NC_017267	TGG	2	6	268070	268075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417319
6380	NC_017267	CGC	2	6	268082	268087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417319
6381	NC_017267	GCT	2	6	268107	268112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417319
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6383	NC_017267	TGC	2	6	268157	268162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417319
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6385	NC_017267	GCC	2	6	268273	268278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417319
6386	NC_017267	GATG	2	8	268287	268294	25 %	25 %	50 %	0 %	384417319
6387	NC_017267	GC	3	6	268325	268330	0 %	0 %	50 %	50 %	384417319
6388	NC_017267	GCC	2	6	268372	268377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417319
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6391	NC_017267	CCG	2	6	268400	268405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417319
6392	NC_017267	CTG	2	6	268420	268425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417319
6393	NC_017267	GC	3	6	268492	268497	0 %	0 %	50 %	50 %	384417319
6394	NC_017267	CAGC	2	8	268527	268534	25 %	0 %	25 %	50 %	384417319
6395	NC_017267	GGTG	2	8	268551	268558	0 %	25 %	75 %	0 %	384417319
6396	NC_017267	GC	3	6	268624	268629	0 %	0 %	50 %	50 %	384417319
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6403	NC_017267	CAGGC	2	10	268924	268933	20 %	0 %	40 %	40 %	384417320
6404	NC_017267	GCC	2	6	268970	268975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417320
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6433	NC_017267	TTTC	2	8	270162	270169	0 %	75 %	0 %	25 %	384417321
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6437	NC_017267	TGT	3	9	270322	270330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417321
6438	NC_017267	GATC	2	8	270397	270404	25 %	25 %	25 %	25 %	384417321
6439	NC_017267	CGG	2	6	270437	270442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417321
6440	NC_017267	CTTTC	2	10	270527	270536	0 %	60 %	0 %	40 %	384417321
6441	NC_017267	CGA	2	6	270544	270549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417321
6442	NC_017267	CCCAG	2	10	270595	270604	20 %	0 %	20 %	60 %	384417321
6443	NC_017267	GAT	2	6	270623	270628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417321
6444	NC_017267	CAAT	2	8	270741	270748	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6445	NC_017267	CAT	2	6	270805	270810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417322
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6450	NC_017267	CAG	2	6	270984	270989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417322
6451	NC_017267	CCG	2	6	271035	271040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417322
6452	NC_017267	GCC	2	6	271071	271076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417322
6453	NC_017267	CAG	2	6	271098	271103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417322
6454	NC_017267	TCTT	2	8	271162	271169	0 %	75 %	0 %	25 %	384417322
6455	NC_017267	CGG	2	6	271179	271184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417322
6456	NC_017267	TGC	3	9	271222	271230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417322
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6461	NC_017267	ACGCG	3	15	271433	271447	20 %	0 %	40 %	40 %	384417322
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6464	NC_017267	CGT	2	6	271481	271486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417322
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6467	NC_017267	GATC	2	8	271682	271689	25 %	25 %	25 %	25 %	384417322
6468	NC_017267	CTG	2	6	271716	271721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417322
6469	NC_017267	CG	3	6	271755	271760	0 %	0 %	50 %	50 %	384417322
6470	NC_017267	CAA	2	6	271845	271850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417322
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6472	NC_017267	CAA	2	6	271878	271883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417322
6473	NC_017267	AAT	2	6	271920	271925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384417322
6474	NC_017267	GTG	2	6	271957	271962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417322
6475	NC_017267	CAC	2	6	271995	272000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417322
6476	NC_017267	AAT	2	6	272036	272041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384417322
6477	NC_017267	ACC	3	9	272047	272055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417322
6478	NC_017267	GTC	2	6	272112	272117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417322
6479	NC_017267	CGC	2	6	272153	272158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417322
6480	NC_017267	GGCC	2	8	272213	272220	0 %	0 %	50 %	50 %	384417322
6481	NC_017267	AGC	2	6	272227	272232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417322
6482	NC_017267	GC	3	6	272231	272236	0 %	0 %	50 %	50 %	384417322
6483	NC_017267	CAC	2	6	272244	272249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417322
6484	NC_017267	GCC	2	6	272256	272261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417322
6485	NC_017267	CAG	2	6	272331	272336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417322
6486	NC_017267	CTT	2	6	272352	272357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417322
6487	NC_017267	GCC	2	6	272373	272378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417322
6488	NC_017267	AAT	2	6	272420	272425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384417322
6489	NC_017267	TTG	2	6	272428	272433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417322
6490	NC_017267	GATC	2	8	272444	272451	25 %	25 %	25 %	25 %	384417322
6491	NC_017267	CGC	2	6	272510	272515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417322
6492	NC_017267	CGC	2	6	272519	272524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417322
6493	NC_017267	ATC	2	6	272548	272553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417322
6494	NC_017267	CGG	2	6	272593	272598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417322
6495	NC_017267	TGC	3	9	272662	272670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417322
6496	NC_017267	CGT	2	6	272705	272710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417322
6497	NC_017267	CGC	3	9	272725	272733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417322
6498	NC_017267	GTC	2	6	272748	272753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417322
6499	NC_017267	ACC	2	6	272758	272763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417322
6500	NC_017267	CTGG	2	8	272831	272838	0 %	25 %	50 %	25 %	384417322

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