MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 117050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017267	GC	3	6	230596	230601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_017267	GCT	2	6	230641	230646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_017267	CCTTGC	2	12	230649	230660	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_017267	TTTG	2	8	230700	230707	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_017267	CAA	2	6	230725	230730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_017267	GC	3	6	230738	230743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5507	NC_017267	GC	3	6	230872	230877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_017267	GCG	2	6	230899	230904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_017267	CAG	2	6	230962	230967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_017267	CTT	2	6	230974	230979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_017267	GC	3	6	230980	230985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_017267	GGT	2	6	231037	231042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017267	GT	3	6	231069	231074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017267	GCACG	2	10	231178	231187	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5515	NC_017267	ACC	2	6	231200	231205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_017267	GAA	2	6	231214	231219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017267	TCG	2	6	231260	231265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_017267	AGC	2	6	231293	231298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_017267	TGG	3	9	231342	231350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_017267	CGG	2	6	231483	231488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_017267	AAC	2	6	231734	231739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_017267	CAC	2	6	231741	231746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_017267	GAG	2	6	231774	231779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_017267	GCAAGC	2	12	231820	231831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417289
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5527	NC_017267	GCA	2	6	231980	231985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417289
5528	NC_017267	GCG	2	6	232043	232048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417289
5529	NC_017267	CGG	2	6	232061	232066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417289
5530	NC_017267	TCG	2	6	232204	232209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417289
5531	NC_017267	GC	3	6	232257	232262	0 %	0 %	50 %	50 %	384417289
5532	NC_017267	AAG	2	6	232284	232289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417289
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5534	NC_017267	ACGC	2	8	232398	232405	25 %	0 %	25 %	50 %	384417289
5535	NC_017267	TGC	2	6	232408	232413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417289
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5539	NC_017267	GC	4	8	232544	232551	0 %	0 %	50 %	50 %	384417289
5540	NC_017267	GC	3	6	232592	232597	0 %	0 %	50 %	50 %	384417289
5541	NC_017267	TGC	2	6	232735	232740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417289
5542	NC_017267	TGC	2	6	232755	232760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_017267	GGC	2	6	232763	232768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_017267	AAG	2	6	232835	232840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017267	GTT	2	6	232864	232869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017267	AATCCG	2	12	232900	232911	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_017267	CG	3	6	233032	233037	0 %	0 %	50 %	50 %	384417290
5548	NC_017267	T	8	8	233082	233089	0 %	100 %	0 %	0 %	384417290
5549	NC_017267	GCG	2	6	233124	233129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417290
5550	NC_017267	AGT	2	6	233296	233301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417290
5551	NC_017267	CGG	2	6	233321	233326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417290
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5554	NC_017267	CCG	2	6	233389	233394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417290
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5558	NC_017267	CAG	2	6	233621	233626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417290
5559	NC_017267	ACG	2	6	233688	233693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417290
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5561	NC_017267	GCCT	2	8	233780	233787	0 %	25 %	25 %	50 %	384417290
5562	NC_017267	ACCG	2	8	233939	233946	25 %	0 %	25 %	50 %	384417290
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5567	NC_017267	CAG	2	6	234047	234052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417290
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5579	NC_017267	T	6	6	234583	234588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_017267	ATAC	2	8	234621	234628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5581	NC_017267	GATG	2	8	234646	234653	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5599	NC_017267	GCAAGG	2	12	235630	235641	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384417291
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5602	NC_017267	GC	4	8	235711	235718	0 %	0 %	50 %	50 %	384417291
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5605	NC_017267	GCT	2	6	235781	235786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417291
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5611	NC_017267	GCTG	2	8	236047	236054	0 %	25 %	50 %	25 %	384417291
5612	NC_017267	GGCGCG	2	12	236093	236104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417291
5613	NC_017267	CAT	2	6	236123	236128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417291
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5615	NC_017267	TGTT	2	8	236240	236247	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5620	NC_017267	GTTTT	2	10	236424	236433	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_017267	CG	3	6	236520	236525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_017267	CGT	2	6	236539	236544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_017267	TTG	2	6	236568	236573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5869	NC_017267	CGA	2	6	246740	246745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417299
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5997	NC_017267	CTGC	2	8	252372	252379	0 %	25 %	25 %	50 %	384417306
5998	NC_017267	GCCCAT	2	12	252421	252432	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384417306
5999	NC_017267	TCG	2	6	252455	252460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417306
6000	NC_017267	CAG	2	6	252475	252480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417306

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