MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 117050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017267	CGC	2	6	207976	207981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417275
5002	NC_017267	GC	3	6	208038	208043	0 %	0 %	50 %	50 %	384417275
5003	NC_017267	CAG	3	9	208084	208092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417275
5004	NC_017267	GCTT	2	8	208112	208119	0 %	50 %	25 %	25 %	384417275
5005	NC_017267	CGG	2	6	208134	208139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417275
5006	NC_017267	CGC	3	9	208165	208173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417275
5007	NC_017267	GCC	2	6	208191	208196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417275
5008	NC_017267	GC	3	6	208213	208218	0 %	0 %	50 %	50 %	384417275
5009	NC_017267	TTG	2	6	208262	208267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417275
5010	NC_017267	CCG	3	9	208337	208345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417275
5011	NC_017267	CCA	2	6	208356	208361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417275
5012	NC_017267	CAG	2	6	208384	208389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417275
5013	NC_017267	ACG	2	6	208436	208441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417276
5014	NC_017267	GCC	2	6	208456	208461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417276
5015	NC_017267	TCCCTG	2	12	208586	208597	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384417276
5016	NC_017267	GCC	2	6	208600	208605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417276
5017	NC_017267	CCG	2	6	208606	208611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417276
5018	NC_017267	CG	3	6	208616	208621	0 %	0 %	50 %	50 %	384417276
5019	NC_017267	GCC	2	6	208647	208652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417276
5020	NC_017267	GC	5	10	208676	208685	0 %	0 %	50 %	50 %	384417276
5021	NC_017267	CGC	2	6	208709	208714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417276
5022	NC_017267	CTG	2	6	208719	208724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417276
5023	NC_017267	CAC	2	6	208781	208786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417276
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5025	NC_017267	GC	3	6	208854	208859	0 %	0 %	50 %	50 %	384417276
5026	NC_017267	GGT	2	6	208869	208874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417276
5027	NC_017267	GTGCG	2	10	208879	208888	0 %	20 %	60 %	20 %	384417276
5028	NC_017267	TAC	2	6	208932	208937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417276
5029	NC_017267	CG	3	6	208943	208948	0 %	0 %	50 %	50 %	384417276
5030	NC_017267	GCA	2	6	208984	208989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_017267	ACC	2	6	208992	208997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_017267	TGC	2	6	209119	209124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_017267	CCG	2	6	209136	209141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_017267	GGC	2	6	209195	209200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417277
5035	NC_017267	TGC	2	6	209218	209223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417277
5036	NC_017267	CGTG	2	8	209227	209234	0 %	25 %	50 %	25 %	384417277
5037	NC_017267	CCG	2	6	209302	209307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417277
5038	NC_017267	GCT	2	6	209333	209338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417277
5039	NC_017267	GCC	2	6	209367	209372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_017267	GCG	2	6	209383	209388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_017267	AGC	2	6	209427	209432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_017267	GGCG	2	8	209438	209445	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_017267	AGC	2	6	209524	209529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417278
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5047	NC_017267	CTG	2	6	209699	209704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417279
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5049	NC_017267	CTGG	2	8	209744	209751	0 %	25 %	50 %	25 %	384417279
5050	NC_017267	CCG	2	6	209808	209813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417279
5051	NC_017267	GCT	2	6	209842	209847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417279
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5053	NC_017267	GGCCA	2	10	209924	209933	20 %	0 %	40 %	40 %	384417279
5054	NC_017267	CACC	2	8	209941	209948	25 %	0 %	0 %	75 %	384417279
5055	NC_017267	GC	3	6	209949	209954	0 %	0 %	50 %	50 %	384417279
5056	NC_017267	CCA	2	6	209994	209999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417279
5057	NC_017267	GCT	2	6	210055	210060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417279
5058	NC_017267	GCC	3	9	210090	210098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417279
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5060	NC_017267	CTG	2	6	210137	210142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417279
5061	NC_017267	GGCGAC	2	12	210245	210256	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384417279
5062	NC_017267	GCC	2	6	210258	210263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417279
5063	NC_017267	CGCC	2	8	210337	210344	0 %	0 %	25 %	75 %	384417279
5064	NC_017267	CG	3	6	210369	210374	0 %	0 %	50 %	50 %	384417279
5065	NC_017267	GGCC	2	8	210391	210398	0 %	0 %	50 %	50 %	384417279
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5102	NC_017267	CGC	2	6	211865	211870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_017267	TCC	2	6	211897	211902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_017267	GCA	2	6	211959	211964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_017267	CACT	2	8	211990	211997	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_017267	CG	3	6	212034	212039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_017267	GCAC	2	8	212046	212053	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_017267	GCT	2	6	212100	212105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_017267	GACC	2	8	212116	212123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_017267	CTT	2	6	212136	212141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_017267	CCT	2	6	212157	212162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_017267	CGG	2	6	212180	212185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_017267	TC	3	6	212260	212265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_017267	GCCT	2	8	212301	212308	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_017267	CG	3	6	212364	212369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_017267	GCGCC	2	10	212408	212417	0 %	0 %	40 %	60 %	384417280
5117	NC_017267	ATCTTC	2	12	212424	212435	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384417280
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5122	NC_017267	TGC	3	9	212701	212709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417280
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5124	NC_017267	GGT	2	6	212859	212864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417280
5125	NC_017267	GCA	2	6	212872	212877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417280
5126	NC_017267	GCC	2	6	212904	212909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417280
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5128	NC_017267	TGC	2	6	212947	212952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417280
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5131	NC_017267	GCT	2	6	213026	213031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417280
5132	NC_017267	GGCCT	2	10	213054	213063	0 %	20 %	40 %	40 %	384417280
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5143	NC_017267	TGT	2	6	213472	213477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417280
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5147	NC_017267	GCT	2	6	213688	213693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5164	NC_017267	CG	4	8	214257	214264	0 %	0 %	50 %	50 %	384417281
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5212	NC_017267	GGCG	2	8	216273	216280	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5213	NC_017267	GCC	2	6	216394	216399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417283
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5230	NC_017267	AAC	2	6	217177	217182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417283
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5232	NC_017267	CCA	2	6	217217	217222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417283
5233	NC_017267	A	6	6	217222	217227	100 %	0 %	0 %	0 %	384417283
5234	NC_017267	ACG	2	6	217379	217384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417283
5235	NC_017267	GC	3	6	217413	217418	0 %	0 %	50 %	50 %	384417283
5236	NC_017267	CCA	2	6	217454	217459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417283
5237	NC_017267	CGG	2	6	217475	217480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417283
5238	NC_017267	GCAG	2	8	217486	217493	25 %	0 %	50 %	25 %	384417283
5239	NC_017267	AGC	2	6	217507	217512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417283
5240	NC_017267	ATGC	2	8	217547	217554	25 %	25 %	25 %	25 %	384417283
5241	NC_017267	CGAT	2	8	217575	217582	25 %	25 %	25 %	25 %	384417283
5242	NC_017267	GCCA	2	8	217624	217631	25 %	0 %	25 %	50 %	384417284
5243	NC_017267	GC	4	8	217651	217658	0 %	0 %	50 %	50 %	384417284
5244	NC_017267	GGC	2	6	217677	217682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417284
5245	NC_017267	CGG	2	6	217763	217768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5246	NC_017267	ATG	2	6	217847	217852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_017267	GCTA	2	8	217857	217864	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5248	NC_017267	GCG	2	6	217897	217902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5249	NC_017267	ACC	2	6	218001	218006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5250	NC_017267	GGC	2	6	218049	218054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5252	NC_017267	AGGA	2	8	218153	218160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_017267	GGC	2	6	218316	218321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5256	NC_017267	CG	3	6	218497	218502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5257	NC_017267	CCA	2	6	218548	218553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5260	NC_017267	GCA	2	6	218631	218636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5269	NC_017267	ACACTG	2	12	219027	219038	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5272	NC_017267	TGC	2	6	219330	219335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5273	NC_017267	GTC	2	6	219342	219347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5281	NC_017267	TGG	2	6	219522	219527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5282	NC_017267	TGC	2	6	219647	219652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5284	NC_017267	TTG	2	6	219704	219709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5313	NC_017267	ACCGT	2	10	221898	221907	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5372	NC_017267	GGC	2	6	224831	224836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5373	NC_017267	GAG	2	6	224851	224856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5375	NC_017267	CAGTG	2	10	224914	224923	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5379	NC_017267	TAT	2	6	225060	225065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384417285
5380	NC_017267	GCG	2	6	225206	225211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417285
5381	NC_017267	TGC	2	6	225312	225317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5382	NC_017267	AT	3	6	225405	225410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5383	NC_017267	GCC	2	6	225580	225585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417286
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5385	NC_017267	TTCG	2	8	225611	225618	0 %	50 %	25 %	25 %	384417286
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5422	NC_017267	T	7	7	227311	227317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5423	NC_017267	C	6	6	227320	227325	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5424	NC_017267	GATTT	2	10	227331	227340	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5454	NC_017267	GTT	2	6	228596	228601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5487	NC_017267	CGG	2	6	230057	230062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417288
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5489	NC_017267	CAC	2	6	230194	230199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5490	NC_017267	GCA	2	6	230232	230237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5491	NC_017267	GCG	2	6	230258	230263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5492	NC_017267	GTGCA	2	10	230275	230284	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5494	NC_017267	CGT	2	6	230390	230395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5495	NC_017267	TCACAT	2	12	230487	230498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5496	NC_017267	GCA	2	6	230502	230507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5497	NC_017267	CG	3	6	230511	230516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5498	NC_017267	CAGC	2	8	230532	230539	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5499	NC_017267	CGT	2	6	230547	230552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5500	NC_017267	GC	4	8	230572	230579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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