MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 117050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017267	GCA	2	6	189164	189169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417254
4502	NC_017267	AGC	2	6	189257	189262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417254
4503	NC_017267	TCT	2	6	189314	189319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417254
4504	NC_017267	GAG	2	6	189322	189327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384417254
4505	NC_017267	CAG	2	6	189423	189428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_017267	GC	3	6	189467	189472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4507	NC_017267	GTT	2	6	189479	189484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_017267	ACAA	2	8	189502	189509	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4509	NC_017267	GCAAGG	2	12	189550	189561	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4510	NC_017267	AGC	2	6	189564	189569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_017267	GC	3	6	189609	189614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4512	NC_017267	GC	4	8	189631	189638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4513	NC_017267	ACG	2	6	189658	189663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_017267	GCTG	2	8	189671	189678	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4515	NC_017267	GC	3	6	189693	189698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_017267	GCT	2	6	189701	189706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_017267	ATGTGA	2	12	189712	189723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_017267	ACG	2	6	189815	189820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_017267	TGCAC	2	10	189926	189935	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4520	NC_017267	GCTG	2	8	189967	189974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_017267	GGT	2	6	190010	190015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_017267	GC	3	6	190020	190025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4523	NC_017267	CAT	2	6	190043	190048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_017267	CCA	2	6	190053	190058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_017267	CTG	2	6	190119	190124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_017267	CTG	2	6	190191	190196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_017267	GGA	2	6	190250	190255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_017267	GCA	2	6	190263	190268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_017267	CG	4	8	190327	190334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_017267	CG	3	6	190338	190343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_017267	CGT	2	6	190349	190354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_017267	AAG	2	6	190376	190381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_017267	TTGC	2	8	190409	190416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4534	NC_017267	AAC	2	6	190498	190503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_017267	CTT	2	6	190527	190532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_017267	GCC	2	6	190599	190604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4537	NC_017267	GCA	2	6	190607	190612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_017267	GCA	2	6	190627	190632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417255
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4540	NC_017267	CG	4	8	190815	190822	0 %	0 %	50 %	50 %	384417255
4541	NC_017267	TTG	2	6	190824	190829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417255
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4544	NC_017267	GCA	2	6	190954	190959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417255
4545	NC_017267	TGCG	2	8	190961	190968	0 %	25 %	50 %	25 %	384417255
4546	NC_017267	TGCAC	2	10	190999	191008	20 %	20 %	20 %	40 %	384417255
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4550	NC_017267	CGA	2	6	191158	191163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417255
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4554	NC_017267	TCG	2	6	191407	191412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417255
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4556	NC_017267	GCTTGC	2	12	191536	191547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417255
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4558	NC_017267	GTT	2	6	191628	191633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_017267	CAC	2	6	191680	191685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_017267	CGGCCC	2	12	191695	191706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417256
4561	NC_017267	CAT	2	6	191740	191745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417256
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4567	NC_017267	CGT	2	6	191940	191945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417256
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4569	NC_017267	GGCTG	2	10	191973	191982	0 %	20 %	60 %	20 %	384417256
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4598	NC_017267	CGG	2	6	192996	193001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_017267	GC	3	6	193013	193018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_017267	GGC	2	6	193088	193093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_017267	TGCC	2	8	193097	193104	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4602	NC_017267	CGG	2	6	193161	193166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_017267	TGC	2	6	193167	193172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4619	NC_017267	GC	3	6	193863	193868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4620	NC_017267	CTG	2	6	193895	193900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_017267	TCG	2	6	193968	193973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_017267	TGG	2	6	194002	194007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_017267	GAT	2	6	194033	194038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417259
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4625	NC_017267	GCA	2	6	194053	194058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417259
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4745	NC_017267	AGCC	2	8	198361	198368	25 %	0 %	25 %	50 %	384417267
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4870	NC_017267	GCT	2	6	203476	203481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417273
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4872	NC_017267	AGCG	2	8	203570	203577	25 %	0 %	50 %	25 %	384417273
4873	NC_017267	TGG	2	6	203580	203585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417273
4874	NC_017267	GGT	2	6	203620	203625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417273
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4901	NC_017267	GCCG	2	8	204470	204477	0 %	0 %	50 %	50 %	384417273
4902	NC_017267	GCT	2	6	204496	204501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417273
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4975	NC_017267	CTGC	2	8	207093	207100	0 %	25 %	25 %	50 %	384417274
4976	NC_017267	GC	3	6	207099	207104	0 %	0 %	50 %	50 %	384417274
4977	NC_017267	GC	3	6	207177	207182	0 %	0 %	50 %	50 %	384417274
4978	NC_017267	TAC	2	6	207237	207242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417274
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4980	NC_017267	CAC	2	6	207305	207310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417274
4981	NC_017267	TGA	2	6	207319	207324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417274
4982	NC_017267	CG	4	8	207349	207356	0 %	0 %	50 %	50 %	384417274
4983	NC_017267	AGC	2	6	207418	207423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417274
4984	NC_017267	GCG	2	6	207442	207447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417274
4985	NC_017267	CGC	2	6	207463	207468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417274
4986	NC_017267	CGC	2	6	207551	207556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4987	NC_017267	ACG	2	6	207590	207595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4988	NC_017267	GCAC	2	8	207598	207605	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4989	NC_017267	GCA	2	6	207633	207638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4990	NC_017267	GC	3	6	207639	207644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4991	NC_017267	GCA	2	6	207654	207659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417275
4992	NC_017267	CAC	3	9	207685	207693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417275
4993	NC_017267	GCC	2	6	207727	207732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417275
4994	NC_017267	GCC	3	9	207776	207784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417275
4995	NC_017267	CGC	2	6	207838	207843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417275
4996	NC_017267	TGG	2	6	207849	207854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417275
4997	NC_017267	ACC	2	6	207863	207868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417275
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5000	NC_017267	CGT	2	6	207960	207965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417275

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