MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 122975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_016010	CTG	2	6	80360	80365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723008
2003	NC_016010	TGA	2	6	80445	80450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723008
2004	NC_016010	AAG	2	6	80505	80510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346723008
2005	NC_016010	GCT	2	6	80593	80598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723008
2006	NC_016010	TTG	2	6	80635	80640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_016010	CCA	2	6	80730	80735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723009
2008	NC_016010	CAG	2	6	80863	80868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723009
2009	NC_016010	AAGTC	2	10	80902	80911	40 %	20 %	20 %	20 %	346723009
2010	NC_016010	CTG	2	6	81007	81012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723009
2011	NC_016010	TCA	2	6	81069	81074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723009
2012	NC_016010	TTC	2	6	81119	81124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723009
2013	NC_016010	TTG	2	6	81141	81146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723009
2014	NC_016010	GCT	2	6	81261	81266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723009
2015	NC_016010	GCA	2	6	81306	81311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_016010	TG	3	6	81317	81322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_016010	GCT	2	6	81350	81355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_016010	AGGA	2	8	81461	81468	50 %	0 %	50 %	0 %	346723010
2019	NC_016010	AGAC	2	8	81656	81663	50 %	0 %	25 %	25 %	346723010
2020	NC_016010	CTT	2	6	81671	81676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723010
2021	NC_016010	T	6	6	81779	81784	0 %	100 %	0 %	0 %	346723010
2022	NC_016010	CAG	2	6	81851	81856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723010
2023	NC_016010	CGT	2	6	81920	81925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723010
2024	NC_016010	T	6	6	81939	81944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_016010	TGG	2	6	82033	82038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_016010	GCT	2	6	82134	82139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_016010	GAT	2	6	82231	82236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723011
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2031	NC_016010	TTC	2	6	82365	82370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2033	NC_016010	CAC	2	6	82434	82439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2035	NC_016010	GCATCG	2	12	82513	82524	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2036	NC_016010	AGGTGC	2	12	82539	82550	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2037	NC_016010	TCT	2	6	82556	82561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2038	NC_016010	GCT	2	6	82585	82590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2039	NC_016010	TGC	2	6	82617	82622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2040	NC_016010	AGC	2	6	82630	82635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2041	NC_016010	TGA	2	6	82667	82672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_016010	CTG	2	6	82807	82812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_016010	CG	3	6	82820	82825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2044	NC_016010	AACGCC	2	12	82851	82862	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2045	NC_016010	GCT	2	6	82893	82898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2046	NC_016010	TGCG	2	8	82912	82919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2047	NC_016010	GGCA	2	8	82958	82965	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2048	NC_016010	CGG	2	6	83071	83076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723012
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2050	NC_016010	TCG	2	6	83189	83194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2051	NC_016010	GC	3	6	83218	83223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2052	NC_016010	ATG	2	6	83234	83239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_016010	TGC	2	6	83380	83385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2054	NC_016010	ACTC	2	8	83414	83421	25 %	25 %	0 %	50 %	346723013
2055	NC_016010	CGCT	2	8	83424	83431	0 %	25 %	25 %	50 %	346723013
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2059	NC_016010	GGCG	2	8	83526	83533	0 %	0 %	75 %	25 %	346723013
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2062	NC_016010	GGC	2	6	83648	83653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723013
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2096	NC_016010	CGG	2	6	84638	84643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2097	NC_016010	GT	3	6	84654	84659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2098	NC_016010	GC	3	6	84695	84700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2099	NC_016010	GCA	2	6	84705	84710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2100	NC_016010	CGTCG	2	10	84717	84726	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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2102	NC_016010	GCAG	2	8	84756	84763	25 %	0 %	50 %	25 %	346723014
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2112	NC_016010	GTG	2	6	85225	85230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723014
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2114	NC_016010	GTGCA	2	10	85361	85370	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2115	NC_016010	CGCTG	2	10	85399	85408	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2116	NC_016010	GC	3	6	85428	85433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2117	NC_016010	GACA	2	8	85521	85528	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2118	NC_016010	CG	3	6	85537	85542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2119	NC_016010	AAG	2	6	85559	85564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_016010	CG	3	6	85572	85577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2121	NC_016010	CGC	2	6	85585	85590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2123	NC_016010	GCG	2	6	85738	85743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723015
2124	NC_016010	CCG	2	6	85751	85756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723015
2125	NC_016010	GCG	2	6	85761	85766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723015
2126	NC_016010	CATC	2	8	85836	85843	25 %	25 %	0 %	50 %	346723015
2127	NC_016010	CGC	2	6	85876	85881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723015
2128	NC_016010	CG	3	6	85893	85898	0 %	0 %	50 %	50 %	346723015
2129	NC_016010	TGC	2	6	85975	85980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723016
2130	NC_016010	CTG	2	6	85982	85987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723016
2131	NC_016010	GCT	2	6	85995	86000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723016
2132	NC_016010	GCG	2	6	86041	86046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723016
2133	NC_016010	GGC	2	6	86067	86072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723016
2134	NC_016010	GC	3	6	86090	86095	0 %	0 %	50 %	50 %	346723016
2135	NC_016010	TCT	2	6	86114	86119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723016
2136	NC_016010	CGC	2	6	86124	86129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723016
2137	NC_016010	CGG	2	6	86144	86149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723016
2138	NC_016010	CGC	2	6	86192	86197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723016
2139	NC_016010	GAT	2	6	86343	86348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723016
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2141	NC_016010	CGC	2	6	86631	86636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723016
2142	NC_016010	TCGA	2	8	86638	86645	25 %	25 %	25 %	25 %	346723016
2143	NC_016010	A	6	6	86668	86673	100 %	0 %	0 %	0 %	346723016
2144	NC_016010	GGC	3	9	86727	86735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723016
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2146	NC_016010	GCC	2	6	86836	86841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723016
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2149	NC_016010	TGC	2	6	86878	86883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723016
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2152	NC_016010	GC	3	6	86925	86930	0 %	0 %	50 %	50 %	346723016
2153	NC_016010	CGG	2	6	86970	86975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723016
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2156	NC_016010	TGC	2	6	87192	87197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723017
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2160	NC_016010	GTCCA	2	10	87332	87341	20 %	20 %	20 %	40 %	346723017
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2163	NC_016010	GC	3	6	87469	87474	0 %	0 %	50 %	50 %	346723017
2164	NC_016010	GCAT	2	8	87485	87492	25 %	25 %	25 %	25 %	346723017
2165	NC_016010	GC	3	6	87529	87534	0 %	0 %	50 %	50 %	346723017
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2168	NC_016010	GCG	2	6	87593	87598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723017
2169	NC_016010	ACC	2	6	87632	87637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723017
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2173	NC_016010	GC	3	6	87798	87803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2174	NC_016010	GGC	2	6	87820	87825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2175	NC_016010	GC	3	6	87908	87913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2177	NC_016010	GCT	2	6	87921	87926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2180	NC_016010	CG	3	6	88064	88069	0 %	0 %	50 %	50 %	346723018
2181	NC_016010	GC	3	6	88092	88097	0 %	0 %	50 %	50 %	346723018
2182	NC_016010	GCC	2	6	88103	88108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723018
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2195	NC_016010	TGC	2	6	88524	88529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723019
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2239	NC_016010	GCGCGA	2	12	90130	90141	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	346723019
2240	NC_016010	GATG	2	8	90169	90176	25 %	25 %	50 %	0 %	346723019
2241	NC_016010	GC	3	6	90184	90189	0 %	0 %	50 %	50 %	346723019
2242	NC_016010	CGG	2	6	90193	90198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723019
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2244	NC_016010	CAC	2	6	90217	90222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346723019
2245	NC_016010	CGCA	2	8	90230	90237	25 %	0 %	25 %	50 %	346723019
2246	NC_016010	CGG	2	6	90243	90248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723019
2247	NC_016010	GAC	2	6	90263	90268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723019
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2249	NC_016010	GC	3	6	90287	90292	0 %	0 %	50 %	50 %	346723019
2250	NC_016010	GGC	2	6	90331	90336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723019
2251	NC_016010	CGG	3	9	90349	90357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723019
2252	NC_016010	GCT	2	6	90367	90372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723019
2253	NC_016010	TGC	2	6	90390	90395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723019
2254	NC_016010	CTG	2	6	90437	90442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723019
2255	NC_016010	TGG	2	6	90507	90512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346723019
2256	NC_016010	CG	3	6	90533	90538	0 %	0 %	50 %	50 %	346723019
2257	NC_016010	CGC	2	6	90582	90587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723019
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2259	NC_016010	CGA	2	6	90652	90657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723019
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2289	NC_016010	GC	3	6	91786	91791	0 %	0 %	50 %	50 %	346723019
2290	NC_016010	GGTC	2	8	91807	91814	0 %	25 %	50 %	25 %	346723019
2291	NC_016010	GC	5	10	91856	91865	0 %	0 %	50 %	50 %	346723019
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2313	NC_016010	CGC	2	6	92577	92582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2315	NC_016010	CGC	2	6	92623	92628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2316	NC_016010	GTGCGG	2	12	92630	92641	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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2320	NC_016010	T	7	7	92714	92720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2321	NC_016010	CAG	2	6	92721	92726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2322	NC_016010	GCAGC	2	10	92727	92736	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2323	NC_016010	GCT	2	6	92772	92777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2324	NC_016010	TCT	2	6	92804	92809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2325	NC_016010	GCAGTG	2	12	92836	92847	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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2329	NC_016010	CG	3	6	92979	92984	0 %	0 %	50 %	50 %	346723020
2330	NC_016010	GAC	2	6	93007	93012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723020
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2332	NC_016010	AGC	2	6	93077	93082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723020
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2340	NC_016010	CGCAG	2	10	93330	93339	20 %	0 %	40 %	40 %	346723021
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2348	NC_016010	GTC	2	6	93694	93699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2349	NC_016010	GCA	2	6	93710	93715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2350	NC_016010	TGC	3	9	93756	93764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2351	NC_016010	TGC	2	6	93768	93773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2352	NC_016010	TCG	2	6	93796	93801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2353	NC_016010	GC	3	6	93882	93887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2354	NC_016010	ATCG	2	8	93907	93914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2355	NC_016010	GTA	2	6	93922	93927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2356	NC_016010	GTC	2	6	93971	93976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2357	NC_016010	CGT	2	6	93987	93992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2358	NC_016010	CGA	2	6	94115	94120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2359	NC_016010	CG	3	6	94165	94170	0 %	0 %	50 %	50 %	346723022
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2363	NC_016010	TGC	2	6	94247	94252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723022
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2365	NC_016010	TTC	2	6	94345	94350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346723022
2366	NC_016010	GCAA	2	8	94354	94361	50 %	0 %	25 %	25 %	346723022
2367	NC_016010	CGG	2	6	94425	94430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346723022
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2369	NC_016010	GAT	2	6	94488	94493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346723022
2370	NC_016010	CTG	2	6	94567	94572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723022
2371	NC_016010	TGC	2	6	94586	94591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723022
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2373	NC_016010	ACCG	2	8	94651	94658	25 %	0 %	25 %	50 %	346723022
2374	NC_016010	GCTG	2	8	94679	94686	0 %	25 %	50 %	25 %	346723022
2375	NC_016010	GCC	2	6	94720	94725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346723022
2376	NC_016010	AGC	2	6	94886	94891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346723022
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2379	NC_016010	TGC	2	6	95000	95005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346723022
2380	NC_016010	TTG	2	6	95062	95067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346723022
2381	NC_016010	ATC	2	6	95071	95076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346723022
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