MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 122975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016010	CGC	2	6	40472	40477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722975
1003	NC_016010	CAGG	2	8	40491	40498	25 %	0 %	50 %	25 %	346722975
1004	NC_016010	CGA	2	6	40505	40510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1005	NC_016010	GC	4	8	40533	40540	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
1006	NC_016010	CG	3	6	40541	40546	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
1007	NC_016010	GCA	2	6	40553	40558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1008	NC_016010	CGCC	2	8	40564	40571	0 %	0 %	25 %	75 %	346722975
1009	NC_016010	CGG	2	6	40658	40663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722975
1010	NC_016010	CG	4	8	40718	40725	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
1011	NC_016010	CGGT	2	8	40756	40763	0 %	25 %	50 %	25 %	346722975
1012	NC_016010	TTG	2	6	40798	40803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722975
1013	NC_016010	CCAT	2	8	40825	40832	25 %	25 %	0 %	50 %	346722975
1014	NC_016010	GCG	2	6	40873	40878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722975
1015	NC_016010	CGT	2	6	40889	40894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1016	NC_016010	CAG	2	6	40908	40913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1017	NC_016010	GCG	2	6	40943	40948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722975
1018	NC_016010	CAG	2	6	40965	40970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1019	NC_016010	CGA	2	6	40982	40987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1020	NC_016010	AGCG	2	8	40996	41003	25 %	0 %	50 %	25 %	346722975
1021	NC_016010	CTT	2	6	41033	41038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722975
1022	NC_016010	CAG	2	6	41043	41048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1023	NC_016010	GAA	2	6	41052	41057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722975
1024	NC_016010	GC	3	6	41095	41100	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
1025	NC_016010	GTT	2	6	41136	41141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722975
1026	NC_016010	ATC	2	6	41179	41184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722975
1027	NC_016010	GCCGAA	2	12	41193	41204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1028	NC_016010	AGC	2	6	41218	41223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1029	NC_016010	GCC	2	6	41256	41261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722975
1030	NC_016010	CCA	2	6	41300	41305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722975
1031	NC_016010	GCC	2	6	41385	41390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722975
1032	NC_016010	CGG	2	6	41438	41443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722975
1033	NC_016010	CCA	2	6	41468	41473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722975
1034	NC_016010	GCG	3	9	41561	41569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722975
1035	NC_016010	GCC	2	6	41646	41651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722975
1036	NC_016010	GCA	2	6	41687	41692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1037	NC_016010	CGC	2	6	41792	41797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722975
1038	NC_016010	TGC	2	6	41810	41815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1039	NC_016010	GCCC	2	8	41816	41823	0 %	0 %	25 %	75 %	346722975
1040	NC_016010	GGC	2	6	41886	41891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722975
1041	NC_016010	GCA	2	6	41906	41911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1042	NC_016010	GC	3	6	41997	42002	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
1043	NC_016010	CGC	2	6	42101	42106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722975
1044	NC_016010	CAG	2	6	42120	42125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1045	NC_016010	GC	3	6	42160	42165	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
1046	NC_016010	CG	3	6	42176	42181	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
1047	NC_016010	CGC	2	6	42209	42214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722975
1048	NC_016010	CCA	2	6	42248	42253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722975
1049	NC_016010	CGA	2	6	42269	42274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1050	NC_016010	GAT	2	6	42330	42335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722975
1051	NC_016010	GCG	2	6	42369	42374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722975
1052	NC_016010	GCAG	2	8	42488	42495	25 %	0 %	50 %	25 %	346722975
1053	NC_016010	CG	4	8	42512	42519	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
1054	NC_016010	GAT	2	6	42531	42536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722975
1055	NC_016010	CGCAG	2	10	42548	42557	20 %	0 %	40 %	40 %	346722975
1056	NC_016010	GGT	2	6	42572	42577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722975
1057	NC_016010	CAG	2	6	42597	42602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1058	NC_016010	CAG	3	9	42645	42653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1059	NC_016010	CG	4	8	42668	42675	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
1060	NC_016010	CCT	2	6	42686	42691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	346722975
1061	NC_016010	CTT	2	6	42722	42727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722975
1062	NC_016010	CAG	2	6	42783	42788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1063	NC_016010	GCTG	2	8	42803	42810	0 %	25 %	50 %	25 %	346722975
1064	NC_016010	GTG	2	6	42889	42894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722975
1065	NC_016010	CGG	2	6	42930	42935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722975
1066	NC_016010	AGT	2	6	42965	42970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722975
1067	NC_016010	GGC	2	6	42989	42994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722975
1068	NC_016010	GTC	2	6	43014	43019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1069	NC_016010	GCA	2	6	43064	43069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
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1072	NC_016010	CTG	2	6	43191	43196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1073	NC_016010	GC	5	10	43216	43225	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
1074	NC_016010	CGC	2	6	43262	43267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722975
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1077	NC_016010	GC	3	6	43395	43400	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
1078	NC_016010	GCCG	2	8	43461	43468	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
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1080	NC_016010	GCA	2	6	43580	43585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1081	NC_016010	CAG	2	6	43605	43610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
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1084	NC_016010	GC	3	6	43710	43715	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
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1088	NC_016010	CGCTG	2	10	43856	43865	0 %	20 %	40 %	40 %	346722975
1089	NC_016010	GCA	2	6	43898	43903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
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1092	NC_016010	CGA	2	6	44045	44050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
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1094	NC_016010	GTC	2	6	44103	44108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1095	NC_016010	CAC	2	6	44115	44120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722975
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1097	NC_016010	GC	3	6	44181	44186	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
1098	NC_016010	ACACC	2	10	44213	44222	40 %	0 %	0 %	60 %	346722975
1099	NC_016010	CG	4	8	44258	44265	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
1100	NC_016010	CAG	2	6	44298	44303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722975
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1102	NC_016010	CCG	2	6	44341	44346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722975
1103	NC_016010	CCA	2	6	44384	44389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722975
1104	NC_016010	GTC	2	6	44406	44411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1105	NC_016010	TCG	2	6	44449	44454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722975
1106	NC_016010	TGT	2	6	44462	44467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722975
1107	NC_016010	G	6	6	44501	44506	0 %	0 %	100 %	0 %	346722975
1108	NC_016010	GCG	2	6	44537	44542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_016010	ACG	2	6	44543	44548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_016010	GAT	2	6	44589	44594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016010	CAG	2	6	44670	44675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_016010	TGG	2	6	44787	44792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722976
1113	NC_016010	CCA	2	6	44880	44885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722976
1114	NC_016010	CGG	2	6	44920	44925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722976
1115	NC_016010	GCAG	2	8	45025	45032	25 %	0 %	50 %	25 %	346722976
1116	NC_016010	CAGC	2	8	45039	45046	25 %	0 %	25 %	50 %	346722976
1117	NC_016010	GC	3	6	45086	45091	0 %	0 %	50 %	50 %	346722976
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1120	NC_016010	GTT	2	6	45255	45260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722977
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1122	NC_016010	CGG	2	6	45301	45306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722977
1123	NC_016010	GCC	2	6	45318	45323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722977
1124	NC_016010	CG	3	6	45377	45382	0 %	0 %	50 %	50 %	346722977
1125	NC_016010	CGC	2	6	45429	45434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722977
1126	NC_016010	CCG	2	6	45525	45530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722977
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1128	NC_016010	GCG	3	9	45596	45604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722977
1129	NC_016010	GCG	3	9	45698	45706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722977
1130	NC_016010	TGC	2	6	45724	45729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722977
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1132	NC_016010	CG	3	6	45812	45817	0 %	0 %	50 %	50 %	346722977
1133	NC_016010	CG	4	8	45882	45889	0 %	0 %	50 %	50 %	346722977
1134	NC_016010	GAC	2	6	45936	45941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722977
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1139	NC_016010	GCA	2	6	46162	46167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722977
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1141	NC_016010	GT	3	6	46242	46247	0 %	50 %	50 %	0 %	346722977
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1144	NC_016010	CGA	2	6	46539	46544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1145	NC_016010	CAG	2	6	46592	46597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1146	NC_016010	TGT	2	6	46657	46662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722978
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1153	NC_016010	GCC	3	9	46827	46835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722978
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1159	NC_016010	GAT	2	6	47084	47089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1160	NC_016010	GC	3	6	47095	47100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1161	NC_016010	CAG	2	6	47173	47178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1234	NC_016010	TGGA	2	8	50589	50596	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1235	NC_016010	CGGTG	2	10	50620	50629	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1236	NC_016010	TGC	3	9	50631	50639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1239	NC_016010	TGG	2	6	50768	50773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722981
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1244	NC_016010	CGC	2	6	50999	51004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722981
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1247	NC_016010	GCC	2	6	51185	51190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722981
1248	NC_016010	TGG	4	12	51221	51232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722981
1249	NC_016010	GTG	2	6	51286	51291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722981
1250	NC_016010	TGG	2	6	51327	51332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722981
1251	NC_016010	GGC	2	6	51409	51414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722981
1252	NC_016010	GCA	2	6	51444	51449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722981
1253	NC_016010	TGC	2	6	51467	51472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722981
1254	NC_016010	CGT	2	6	51590	51595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722981
1255	NC_016010	GC	3	6	51671	51676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1256	NC_016010	CA	3	6	51711	51716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1257	NC_016010	CCAC	2	8	51727	51734	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1258	NC_016010	C	6	6	51738	51743	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1259	NC_016010	GTC	2	6	51770	51775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1260	NC_016010	CTG	2	6	51851	51856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722982
1261	NC_016010	GAA	2	6	51866	51871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722982
1262	NC_016010	CG	3	6	51918	51923	0 %	0 %	50 %	50 %	346722982
1263	NC_016010	ATG	2	6	51950	51955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722982
1264	NC_016010	GT	3	6	52002	52007	0 %	50 %	50 %	0 %	346722982
1265	NC_016010	CCG	2	6	52023	52028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722982
1266	NC_016010	TCG	2	6	52065	52070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722982
1267	NC_016010	AGA	2	6	52071	52076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722982
1268	NC_016010	CGTGG	2	10	52102	52111	0 %	20 %	60 %	20 %	346722982
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1270	NC_016010	CCA	2	6	52245	52250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722983
1271	NC_016010	TGG	2	6	52275	52280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722983
1272	NC_016010	GCC	2	6	52305	52310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722983
1273	NC_016010	TGG	2	6	52337	52342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722983
1274	NC_016010	TGG	2	6	52344	52349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722983
1275	NC_016010	GGT	2	6	52360	52365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722983
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1277	NC_016010	CCG	2	6	52470	52475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722983
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1280	NC_016010	GC	4	8	52601	52608	0 %	0 %	50 %	50 %	346722983
1281	NC_016010	GCT	2	6	52685	52690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722983
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1283	NC_016010	CGT	2	6	52859	52864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722983
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1285	NC_016010	TGC	2	6	52884	52889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722983
1286	NC_016010	GCA	2	6	52900	52905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722983
1287	NC_016010	TTC	3	9	52910	52918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722983
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1289	NC_016010	GCC	2	6	52967	52972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722983
1290	NC_016010	GCC	2	6	52979	52984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722983
1291	NC_016010	GCC	2	6	53007	53012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722983
1292	NC_016010	TTG	2	6	53027	53032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722983
1293	NC_016010	GCGCC	2	10	53048	53057	0 %	0 %	40 %	60 %	346722983
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1295	NC_016010	GTGGC	2	10	53064	53073	0 %	20 %	60 %	20 %	346722983
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1322	NC_016010	CAC	2	6	54010	54015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1323	NC_016010	CTT	2	6	54038	54043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1324	NC_016010	GC	4	8	54045	54052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1325	NC_016010	ATCGCC	2	12	54066	54077	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1326	NC_016010	GCA	2	6	54109	54114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1327	NC_016010	AGC	2	6	54188	54193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1328	NC_016010	GCATG	2	10	54197	54206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1329	NC_016010	CGGC	2	8	54233	54240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1330	NC_016010	CG	3	6	54244	54249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1331	NC_016010	GTC	2	6	54286	54291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1332	NC_016010	CACC	2	8	54363	54370	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1333	NC_016010	GCT	2	6	54395	54400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1334	NC_016010	AGC	2	6	54424	54429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1335	NC_016010	GCA	2	6	54465	54470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1336	NC_016010	CAC	2	6	54478	54483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1339	NC_016010	CGG	2	6	54693	54698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1340	NC_016010	CTG	2	6	54755	54760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1341	NC_016010	CTG	2	6	54779	54784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1342	NC_016010	CAA	2	6	54791	54796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1343	NC_016010	GC	4	8	54906	54913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1344	NC_016010	GCCG	2	8	54933	54940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1345	NC_016010	CG	3	6	55034	55039	0 %	0 %	50 %	50 %	346722984
1346	NC_016010	GCCAT	2	10	55061	55070	20 %	20 %	20 %	40 %	346722984
1347	NC_016010	GCACG	2	10	55131	55140	20 %	0 %	40 %	40 %	346722984
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1357	NC_016010	GCA	2	6	55545	55550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722984
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1359	NC_016010	GGC	2	6	55683	55688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1369	NC_016010	CCG	2	6	56056	56061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722985
1370	NC_016010	CG	3	6	56060	56065	0 %	0 %	50 %	50 %	346722985
1371	NC_016010	GCG	2	6	56089	56094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722985
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