MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 122975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016010	AGCAAC	3	18	19805	19822	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_016010	GCC	2	6	19833	19838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_016010	CCG	2	6	19878	19883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722960
504	NC_016010	TGG	2	6	19918	19923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722960
505	NC_016010	CGC	2	6	19936	19941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722960
506	NC_016010	GGTG	2	8	19960	19967	0 %	25 %	75 %	0 %	346722960
507	NC_016010	GC	3	6	20012	20017	0 %	0 %	50 %	50 %	346722960
508	NC_016010	CAG	2	6	20084	20089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722960
509	NC_016010	CG	3	6	20119	20124	0 %	0 %	50 %	50 %	346722960
510	NC_016010	GCC	2	6	20153	20158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722960
511	NC_016010	CGG	2	6	20164	20169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722960
512	NC_016010	GCAG	2	8	20200	20207	25 %	0 %	50 %	25 %	346722960
513	NC_016010	GTGC	2	8	20208	20215	0 %	25 %	50 %	25 %	346722960
514	NC_016010	CCA	2	6	20260	20265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722960
515	NC_016010	CGG	2	6	20284	20289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722960
516	NC_016010	GCA	2	6	20299	20304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722960
517	NC_016010	CGC	2	6	20452	20457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722960
518	NC_016010	GCT	2	6	20479	20484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722960
519	NC_016010	CTC	2	6	20519	20524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	346722960
520	NC_016010	GC	3	6	20525	20530	0 %	0 %	50 %	50 %	346722960
521	NC_016010	GC	3	6	20594	20599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
522	NC_016010	GTGC	2	8	20622	20629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
523	NC_016010	CGTG	2	8	20664	20671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
524	NC_016010	CCTG	2	8	20725	20732	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
525	NC_016010	TTG	2	6	20739	20744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016010	TTG	2	6	20746	20751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016010	TTG	2	6	20753	20758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016010	CCG	2	6	20808	20813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_016010	TGC	2	6	20841	20846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_016010	CGT	2	6	20896	20901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722961
531	NC_016010	GGTCG	2	10	20945	20954	0 %	20 %	60 %	20 %	346722961
532	NC_016010	GGTG	2	8	20965	20972	0 %	25 %	75 %	0 %	346722961
533	NC_016010	GACG	2	8	21000	21007	25 %	0 %	50 %	25 %	346722961
534	NC_016010	GCC	2	6	21101	21106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722961
535	NC_016010	GGT	2	6	21158	21163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722961
536	NC_016010	CGA	2	6	21349	21354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722961
537	NC_016010	GCA	3	9	21384	21392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722961
538	NC_016010	CGG	2	6	21412	21417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722961
539	NC_016010	TCG	2	6	21477	21482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722961
540	NC_016010	GC	3	6	21581	21586	0 %	0 %	50 %	50 %	346722961
541	NC_016010	TGT	2	6	21811	21816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722961
542	NC_016010	CGC	2	6	21877	21882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722961
543	NC_016010	GCC	2	6	21887	21892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722961
544	NC_016010	TGCC	2	8	22000	22007	0 %	25 %	25 %	50 %	346722961
545	NC_016010	GTT	2	6	22010	22015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722961
546	NC_016010	GAT	2	6	22019	22024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722961
547	NC_016010	CAT	2	6	22030	22035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722961
548	NC_016010	GC	3	6	22267	22272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_016010	C	9	9	22279	22287	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
550	NC_016010	ACG	2	6	22293	22298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_016010	GC	4	8	22342	22349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_016010	CAG	2	6	22379	22384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_016010	TC	3	6	22418	22423	0 %	50 %	0 %	50 %	346722962
554	NC_016010	TTCC	2	8	22424	22431	0 %	50 %	0 %	50 %	346722962
555	NC_016010	ACCC	2	8	22440	22447	25 %	0 %	0 %	75 %	346722962
556	NC_016010	TGGC	2	8	22483	22490	0 %	25 %	50 %	25 %	346722962
557	NC_016010	GCCG	2	8	22508	22515	0 %	0 %	50 %	50 %	346722962
558	NC_016010	GC	3	6	22522	22527	0 %	0 %	50 %	50 %	346722962
559	NC_016010	GC	3	6	22550	22555	0 %	0 %	50 %	50 %	346722962
560	NC_016010	TGG	2	6	22585	22590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722962
561	NC_016010	TGC	2	6	22613	22618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722962
562	NC_016010	CTG	2	6	22681	22686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722962
563	NC_016010	GCCG	2	8	22698	22705	0 %	0 %	50 %	50 %	346722962
564	NC_016010	GTT	2	6	22728	22733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722962
565	NC_016010	GCT	2	6	22734	22739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722962
566	NC_016010	CGG	2	6	22749	22754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722962
567	NC_016010	GGC	2	6	22770	22775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722962
568	NC_016010	ATC	2	6	22807	22812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722962
569	NC_016010	GTG	2	6	22882	22887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722962
570	NC_016010	ATTC	2	8	22911	22918	25 %	50 %	0 %	25 %	346722962
571	NC_016010	CTG	2	6	22954	22959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722962
572	NC_016010	GGT	2	6	22962	22967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722962
573	NC_016010	TGG	2	6	22997	23002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722962
574	NC_016010	CA	3	6	23012	23017	50 %	0 %	0 %	50 %	346722962
575	NC_016010	GC	3	6	23058	23063	0 %	0 %	50 %	50 %	346722962
576	NC_016010	CG	3	6	23070	23075	0 %	0 %	50 %	50 %	346722962
577	NC_016010	GCA	2	6	23109	23114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_016010	GC	4	8	23190	23197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
579	NC_016010	CG	3	6	23271	23276	0 %	0 %	50 %	50 %	346722963
580	NC_016010	ACG	2	6	23339	23344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722963
581	NC_016010	TGG	3	9	23348	23356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722963
582	NC_016010	GAA	2	6	23365	23370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722963
583	NC_016010	GAA	2	6	23437	23442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722963
584	NC_016010	A	6	6	23449	23454	100 %	0 %	0 %	0 %	346722963
585	NC_016010	CCA	2	6	23477	23482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722963
586	NC_016010	GGT	2	6	23493	23498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722963
587	NC_016010	CGA	2	6	23549	23554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722964
588	NC_016010	CTGCC	2	10	23577	23586	0 %	20 %	20 %	60 %	346722964
589	NC_016010	GCA	2	6	23588	23593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722964
590	NC_016010	CG	3	6	23645	23650	0 %	0 %	50 %	50 %	346722964
591	NC_016010	GCCGAC	2	12	23664	23675	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	346722964
592	NC_016010	ACGC	2	8	23696	23703	25 %	0 %	25 %	50 %	346722964
593	NC_016010	GCG	2	6	23712	23717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722964
594	NC_016010	CTG	2	6	23718	23723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722964
595	NC_016010	GC	3	6	23770	23775	0 %	0 %	50 %	50 %	346722964
596	NC_016010	ATGTGG	2	12	23776	23787	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	346722964
597	NC_016010	GCCG	2	8	23843	23850	0 %	0 %	50 %	50 %	346722964
598	NC_016010	GCAT	2	8	23903	23910	25 %	25 %	25 %	25 %	346722964
599	NC_016010	GCA	2	6	23912	23917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722964
600	NC_016010	TGC	2	6	23959	23964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722964
601	NC_016010	GC	3	6	24026	24031	0 %	0 %	50 %	50 %	346722964
602	NC_016010	GGGC	2	8	24056	24063	0 %	0 %	75 %	25 %	346722964
603	NC_016010	GCAG	2	8	24077	24084	25 %	0 %	50 %	25 %	346722964
604	NC_016010	CG	3	6	24085	24090	0 %	0 %	50 %	50 %	346722964
605	NC_016010	GC	3	6	24204	24209	0 %	0 %	50 %	50 %	346722964
606	NC_016010	GC	3	6	24212	24217	0 %	0 %	50 %	50 %	346722964
607	NC_016010	GCCG	2	8	24292	24299	0 %	0 %	50 %	50 %	346722964
608	NC_016010	CG	3	6	24346	24351	0 %	0 %	50 %	50 %	346722964
609	NC_016010	CGCTG	2	10	24355	24364	0 %	20 %	40 %	40 %	346722964
610	NC_016010	GC	3	6	24374	24379	0 %	0 %	50 %	50 %	346722964
611	NC_016010	CGC	2	6	24436	24441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722964
612	NC_016010	CGG	2	6	24468	24473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722964
613	NC_016010	AGC	2	6	24557	24562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722964
614	NC_016010	CG	4	8	24571	24578	0 %	0 %	50 %	50 %	346722964
615	NC_016010	CTG	2	6	24579	24584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722964
616	NC_016010	GCG	2	6	24593	24598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722964
617	NC_016010	CAC	2	6	24620	24625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722964
618	NC_016010	GAC	2	6	24647	24652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722964
619	NC_016010	GAC	2	6	24664	24669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722964
620	NC_016010	ACG	2	6	24675	24680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_016010	GGC	2	6	24733	24738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722965
622	NC_016010	TGCC	2	8	24791	24798	0 %	25 %	25 %	50 %	346722965
623	NC_016010	GC	3	6	24834	24839	0 %	0 %	50 %	50 %	346722965
624	NC_016010	GCG	2	6	24841	24846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722965
625	NC_016010	TGGC	2	8	24869	24876	0 %	25 %	50 %	25 %	346722965
626	NC_016010	GCA	2	6	24986	24991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722965
627	NC_016010	TCG	3	9	25021	25029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722965
628	NC_016010	GC	3	6	25176	25181	0 %	0 %	50 %	50 %	346722965
629	NC_016010	GGT	2	6	25182	25187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722965
630	NC_016010	GCA	2	6	25217	25222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722965
631	NC_016010	GAT	2	6	25260	25265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722965
632	NC_016010	GC	3	6	25270	25275	0 %	0 %	50 %	50 %	346722965
633	NC_016010	GC	3	6	25289	25294	0 %	0 %	50 %	50 %	346722965
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759	NC_016010	ACC	2	6	29568	29573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722968
760	NC_016010	ACA	2	6	29601	29606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722968
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764	NC_016010	CGG	2	6	29793	29798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722968
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780	NC_016010	GCCG	2	8	30283	30290	0 %	0 %	50 %	50 %	346722968
781	NC_016010	GCC	2	6	30342	30347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
782	NC_016010	CAC	2	6	30373	30378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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785	NC_016010	CTG	2	6	30534	30539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
786	NC_016010	ATGG	2	8	30562	30569	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
787	NC_016010	CTACC	2	10	30615	30624	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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801	NC_016010	GT	3	6	31274	31279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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804	NC_016010	CG	3	6	31341	31346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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839	NC_016010	TGA	2	6	32968	32973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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851	NC_016010	TCGA	2	8	33652	33659	25 %	25 %	25 %	25 %	346722971
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871	NC_016010	GC	3	6	34829	34834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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882	NC_016010	CCAGC	2	10	35099	35108	20 %	0 %	20 %	60 %	346722972
883	NC_016010	TTG	2	6	35172	35177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722972
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887	NC_016010	TTC	2	6	35445	35450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722972
888	NC_016010	TCA	2	6	35530	35535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722972
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