MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Xenorhabdus nematophila ATCC 19061 plasmid XNC1_p

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014170	AG	3	6	889	894	50 %	0 %	50 %	0 %	296491825
2	NC_014170	TG	3	6	1432	1437	0 %	50 %	50 %	0 %	296491826
3	NC_014170	GA	3	6	3079	3084	50 %	0 %	50 %	0 %	296491828
4	NC_014170	TG	3	6	3897	3902	0 %	50 %	50 %	0 %	296491830
5	NC_014170	AT	3	6	4431	4436	50 %	50 %	0 %	0 %	296491832
6	NC_014170	TC	3	6	5191	5196	0 %	50 %	0 %	50 %	296491834
7	NC_014170	CT	3	6	6132	6137	0 %	50 %	0 %	50 %	296491834
8	NC_014170	TG	3	6	6178	6183	0 %	50 %	50 %	0 %	296491834
9	NC_014170	TC	3	6	6499	6504	0 %	50 %	0 %	50 %	296491834
10	NC_014170	AC	3	6	6515	6520	50 %	0 %	0 %	50 %	296491834
11	NC_014170	GT	3	6	8048	8053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014170	CT	3	6	8316	8321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014170	TC	3	6	9136	9141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014170	AG	4	8	9564	9571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014170	CT	3	6	11641	11646	0 %	50 %	0 %	50 %	296491838
16	NC_014170	TC	3	6	11766	11771	0 %	50 %	0 %	50 %	296491838
17	NC_014170	TG	3	6	12428	12433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014170	AG	3	6	12836	12841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014170	AC	3	6	13098	13103	50 %	0 %	0 %	50 %	296491839
20	NC_014170	AG	3	6	13231	13236	50 %	0 %	50 %	0 %	296491840
21	NC_014170	AG	3	6	15731	15736	50 %	0 %	50 %	0 %	296491843
22	NC_014170	AG	3	6	15782	15787	50 %	0 %	50 %	0 %	296491843
23	NC_014170	AG	3	6	16286	16291	50 %	0 %	50 %	0 %	296491843
24	NC_014170	GA	3	6	16974	16979	50 %	0 %	50 %	0 %	296491844
25	NC_014170	CT	3	6	17195	17200	0 %	50 %	0 %	50 %	296491844
26	NC_014170	AC	3	6	17326	17331	50 %	0 %	0 %	50 %	296491844
27	NC_014170	TG	3	6	20591	20596	0 %	50 %	50 %	0 %	296491848
28	NC_014170	CT	3	6	21722	21727	0 %	50 %	0 %	50 %	296491848
29	NC_014170	CA	3	6	23934	23939	50 %	0 %	0 %	50 %	296491848
30	NC_014170	TG	3	6	23965	23970	0 %	50 %	50 %	0 %	296491848
31	NC_014170	TC	3	6	24693	24698	0 %	50 %	0 %	50 %	296491848
32	NC_014170	TG	3	6	25746	25751	0 %	50 %	50 %	0 %	296491850
33	NC_014170	AG	3	6	26476	26481	50 %	0 %	50 %	0 %	296491850
34	NC_014170	CT	3	6	26589	26594	0 %	50 %	0 %	50 %	296491850
35	NC_014170	TC	3	6	27411	27416	0 %	50 %	0 %	50 %	296491850
36	NC_014170	AC	3	6	27841	27846	50 %	0 %	0 %	50 %	296491850
37	NC_014170	AG	3	6	29701	29706	50 %	0 %	50 %	0 %	296491853
38	NC_014170	CT	3	6	30614	30619	0 %	50 %	0 %	50 %	296491854
39	NC_014170	GA	3	6	30700	30705	50 %	0 %	50 %	0 %	296491854
40	NC_014170	AT	3	6	32730	32735	50 %	50 %	0 %	0 %	296491856
41	NC_014170	GA	3	6	33142	33147	50 %	0 %	50 %	0 %	296491856
42	NC_014170	AC	3	6	33336	33341	50 %	0 %	0 %	50 %	296491856
43	NC_014170	AT	3	6	34176	34181	50 %	50 %	0 %	0 %	296491856
44	NC_014170	AG	3	6	34330	34335	50 %	0 %	50 %	0 %	296491856
45	NC_014170	CT	3	6	34362	34367	0 %	50 %	0 %	50 %	296491856
46	NC_014170	GT	3	6	35847	35852	0 %	50 %	50 %	0 %	296491858
47	NC_014170	GT	3	6	35974	35979	0 %	50 %	50 %	0 %	296491858
48	NC_014170	AG	3	6	36246	36251	50 %	0 %	50 %	0 %	296491858
49	NC_014170	TC	3	6	37146	37151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014170	AG	3	6	37205	37210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014170	CT	3	6	37221	37226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014170	TC	3	6	37579	37584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014170	TG	3	6	39220	39225	0 %	50 %	50 %	0 %	296491863
54	NC_014170	AC	4	8	40237	40244	50 %	0 %	0 %	50 %	296491864
55	NC_014170	GA	3	6	40801	40806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014170	GA	3	6	41142	41147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014170	AG	4	8	41427	41434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014170	AG	3	6	41719	41724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014170	CT	3	6	45748	45753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014170	TG	3	6	45838	45843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014170	TC	3	6	45904	45909	0 %	50 %	0 %	50 %	296491867
62	NC_014170	GA	3	6	47858	47863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014170	GA	3	6	49985	49990	50 %	0 %	50 %	0 %	296491874
64	NC_014170	CT	3	6	50799	50804	0 %	50 %	0 %	50 %	296491874
65	NC_014170	GA	3	6	51035	51040	50 %	0 %	50 %	0 %	296491874
66	NC_014170	TC	3	6	51061	51066	0 %	50 %	0 %	50 %	296491874
67	NC_014170	AC	3	6	51623	51628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014170	CT	3	6	52162	52167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014170	TG	3	6	52509	52514	0 %	50 %	50 %	0 %	296491876
70	NC_014170	AC	3	6	54132	54137	50 %	0 %	0 %	50 %	296491879
71	NC_014170	AG	3	6	54978	54983	50 %	0 %	50 %	0 %	296491879
72	NC_014170	TC	3	6	56539	56544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014170	GA	3	6	56557	56562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014170	CT	3	6	57801	57806	0 %	50 %	0 %	50 %	296491883
75	NC_014170	TG	3	6	57858	57863	0 %	50 %	50 %	0 %	296491883
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93	NC_014170	AT	3	6	68557	68562	50 %	50 %	0 %	0 %	296491898
94	NC_014170	AT	3	6	68591	68596	50 %	50 %	0 %	0 %	296491898
95	NC_014170	TA	3	6	68823	68828	50 %	50 %	0 %	0 %	296491898
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104	NC_014170	TA	3	6	73430	73435	50 %	50 %	0 %	0 %	296491901
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110	NC_014170	AG	3	6	77644	77649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014170	AT	4	8	78124	78131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014170	AT	3	6	78384	78389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014170	AT	3	6	78430	78435	50 %	50 %	0 %	0 %	296491907
114	NC_014170	AT	3	6	78452	78457	50 %	50 %	0 %	0 %	296491907
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116	NC_014170	AT	3	6	79259	79264	50 %	50 %	0 %	0 %	296491907
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119	NC_014170	TC	3	6	80834	80839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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122	NC_014170	TC	4	8	85078	85085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014170	CA	3	6	85102	85107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014170	CA	4	8	85226	85233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014170	AG	3	6	85798	85803	50 %	0 %	50 %	0 %	296491913
126	NC_014170	TA	3	6	86584	86589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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128	NC_014170	TG	3	6	87272	87277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014170	CA	3	6	87352	87357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014170	TC	3	6	88187	88192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014170	CA	3	6	89197	89202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014170	AT	3	6	89343	89348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.