MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xenorhabdus bovienii SS-2004 chromosome

Total Repeats: 3014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013892	ATTGA	2	10	2152	2161	40 %	40 %	20 %	0 %	290473096
2	NC_013892	GATCA	2	10	8526	8535	40 %	20 %	20 %	20 %	290473102
3	NC_013892	TTGCT	2	10	9354	9363	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013892	TAGTC	2	10	10491	10500	20 %	40 %	20 %	20 %	290473103
5	NC_013892	AATTC	2	10	11252	11261	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013892	AATGG	2	10	11479	11488	40 %	20 %	40 %	0 %	290473105
7	NC_013892	ATTTT	2	10	12784	12793	20 %	80 %	0 %	0 %	290473106
8	NC_013892	ATAAA	2	10	12831	12840	80 %	20 %	0 %	0 %	290473106
9	NC_013892	TTATC	2	10	14117	14126	20 %	60 %	0 %	20 %	290473109
10	NC_013892	TTTCA	2	10	14688	14697	20 %	60 %	0 %	20 %	290473109
11	NC_013892	TCATT	2	10	14801	14810	20 %	60 %	0 %	20 %	290473109
12	NC_013892	GGAAC	2	10	15108	15117	40 %	0 %	40 %	20 %	290473109
13	NC_013892	TTCGC	2	10	17838	17847	0 %	40 %	20 %	40 %	290473110
14	NC_013892	GGTCG	2	10	20468	20477	0 %	20 %	60 %	20 %	290473111
15	NC_013892	TTTGA	2	10	25440	25449	20 %	60 %	20 %	0 %	290473114
16	NC_013892	TGCAT	2	10	25819	25828	20 %	40 %	20 %	20 %	290473114
17	NC_013892	CGCTT	2	10	26336	26345	0 %	40 %	20 %	40 %	290473115
18	NC_013892	GCTTC	2	10	29043	29052	0 %	40 %	20 %	40 %	290473118
19	NC_013892	ATTCA	2	10	30735	30744	40 %	40 %	0 %	20 %	290473119
20	NC_013892	CAGCT	2	10	31284	31293	20 %	20 %	20 %	40 %	290473120
21	NC_013892	AACAA	2	10	31513	31522	80 %	0 %	0 %	20 %	290473120
22	NC_013892	TGGCC	2	10	31538	31547	0 %	20 %	40 %	40 %	290473120
23	NC_013892	ATCAG	2	10	31735	31744	40 %	20 %	20 %	20 %	290473121
24	NC_013892	AAAAT	2	10	33627	33636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013892	AGCGA	2	10	33959	33968	40 %	0 %	40 %	20 %	290473124
26	NC_013892	TGAAT	2	10	36048	36057	40 %	40 %	20 %	0 %	290473125
27	NC_013892	TGATT	2	10	36795	36804	20 %	60 %	20 %	0 %	290473126
28	NC_013892	TTAAA	2	10	37118	37127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013892	TTGCT	2	10	40510	40519	0 %	60 %	20 %	20 %	290473130
30	NC_013892	GATCA	2	10	42163	42172	40 %	20 %	20 %	20 %	290473131
31	NC_013892	AAACA	2	10	42374	42383	80 %	0 %	0 %	20 %	290473131
32	NC_013892	TCCAA	2	10	42999	43008	40 %	20 %	0 %	40 %	290473132
33	NC_013892	CGTTA	2	10	43590	43599	20 %	40 %	20 %	20 %	290473132
34	NC_013892	ATAAA	2	10	44703	44712	80 %	20 %	0 %	0 %	290473133
35	NC_013892	GCATT	2	10	45129	45138	20 %	40 %	20 %	20 %	290473134
36	NC_013892	TCAAT	2	10	45577	45586	40 %	40 %	0 %	20 %	290473134
37	NC_013892	TGCGC	2	10	45709	45718	0 %	20 %	40 %	40 %	290473134
38	NC_013892	ACATT	2	10	46167	46176	40 %	40 %	0 %	20 %	290473135
39	NC_013892	GTGAC	2	10	47228	47237	20 %	20 %	40 %	20 %	290473136
40	NC_013892	AGTTA	2	10	50469	50478	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013892	CCGAG	2	10	53506	53515	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013892	CCACC	2	10	54896	54905	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
43	NC_013892	CCAAT	2	10	55375	55384	40 %	20 %	0 %	40 %	290473138
44	NC_013892	GAATA	2	10	56279	56288	60 %	20 %	20 %	0 %	290473138
45	NC_013892	AATCC	2	10	58931	58940	40 %	20 %	0 %	40 %	290473140
46	NC_013892	GGAAA	2	10	59325	59334	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013892	TGATT	2	10	60320	60329	20 %	60 %	20 %	0 %	290473142
48	NC_013892	GATCA	2	10	63346	63355	40 %	20 %	20 %	20 %	290473145
49	NC_013892	ACCAC	2	10	66130	66139	40 %	0 %	0 %	60 %	290473148
50	NC_013892	CCCGC	2	10	66465	66474	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
51	NC_013892	GCTGT	2	10	66880	66889	0 %	40 %	40 %	20 %	290473150
52	NC_013892	TAATG	2	10	69785	69794	40 %	40 %	20 %	0 %	290473152
53	NC_013892	TATTT	2	10	73320	73329	20 %	80 %	0 %	0 %	290473154
54	NC_013892	CTGTT	2	10	75883	75892	0 %	60 %	20 %	20 %	290473156
55	NC_013892	GTTGA	2	10	77525	77534	20 %	40 %	40 %	0 %	290473157
56	NC_013892	TGAGA	2	10	77801	77810	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013892	GTGGC	2	10	79305	79314	0 %	20 %	60 %	20 %	290473159
58	NC_013892	TATTT	2	10	82992	83001	20 %	80 %	0 %	0 %	290473163
59	NC_013892	GTATA	2	10	83543	83552	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013892	CCAAA	2	10	83830	83839	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_013892	ATTTT	2	10	84024	84033	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013892	ATATT	2	10	84078	84087	40 %	60 %	0 %	0 %	290473165
63	NC_013892	AAAAC	2	10	84330	84339	80 %	0 %	0 %	20 %	290473166
64	NC_013892	AAGGC	2	10	85588	85597	40 %	0 %	40 %	20 %	290473167
65	NC_013892	AACAG	2	10	86393	86402	60 %	0 %	20 %	20 %	290473167
66	NC_013892	AGGGC	2	10	87233	87242	20 %	0 %	60 %	20 %	290473168
67	NC_013892	GTTTT	2	10	93190	93199	0 %	80 %	20 %	0 %	290473175
68	NC_013892	TCACT	2	10	94889	94898	20 %	40 %	0 %	40 %	290473176
69	NC_013892	ACCTG	2	10	94915	94924	20 %	20 %	20 %	40 %	290473176
70	NC_013892	TCATT	2	10	95476	95485	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_013892	AAAAT	2	10	97219	97228	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013892	GATTC	2	10	98071	98080	20 %	40 %	20 %	20 %	290473179
73	NC_013892	GATGC	2	10	99352	99361	20 %	20 %	40 %	20 %	290473179
74	NC_013892	AATCA	2	10	99391	99400	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_013892	CTGAC	2	10	99872	99881	20 %	20 %	20 %	40 %	290473180
76	NC_013892	CCATC	2	10	101731	101740	20 %	20 %	0 %	60 %	290473181
77	NC_013892	TGTTT	2	10	108226	108235	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013892	AACAT	2	10	108821	108830	60 %	20 %	0 %	20 %	290473187
79	NC_013892	ACTTT	2	10	109692	109701	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013892	TAAAT	2	10	109766	109775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013892	GGCGT	2	10	110594	110603	0 %	20 %	60 %	20 %	290473190
82	NC_013892	TGAAT	2	10	112470	112479	40 %	40 %	20 %	0 %	290473191
83	NC_013892	AAGCC	2	10	119225	119234	40 %	0 %	20 %	40 %	290473202
84	NC_013892	TGGGC	2	10	119580	119589	0 %	20 %	60 %	20 %	290473202
85	NC_013892	GCCTT	2	10	119760	119769	0 %	40 %	20 %	40 %	290473203
86	NC_013892	AGAAT	2	10	122383	122392	60 %	20 %	20 %	0 %	290473205
87	NC_013892	CCATG	2	10	129066	129075	20 %	20 %	20 %	40 %	290473213
88	NC_013892	GGATA	2	10	129885	129894	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013892	GGGCA	2	10	131307	131316	20 %	0 %	60 %	20 %	290473214
90	NC_013892	TGTGG	2	10	131996	132005	0 %	40 %	60 %	0 %	290473214
91	NC_013892	TTGCA	2	10	132227	132236	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013892	AATAT	2	10	132616	132625	60 %	40 %	0 %	0 %	290473215
93	NC_013892	TAAAT	2	10	132898	132907	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013892	TTATT	2	10	134065	134074	20 %	80 %	0 %	0 %	290473217
95	NC_013892	ATTTG	2	10	138746	138755	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013892	TGATT	2	10	139010	139019	20 %	60 %	20 %	0 %	290473222
97	NC_013892	CCAAC	2	10	139112	139121	40 %	0 %	0 %	60 %	290473222
98	NC_013892	TATCT	2	10	140058	140067	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_013892	TGTTC	2	10	140216	140225	0 %	60 %	20 %	20 %	290473223
100	NC_013892	TGGAT	2	10	144275	144284	20 %	40 %	40 %	0 %	290473227
101	NC_013892	ATTAG	2	10	144350	144359	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013892	GGCTG	2	10	146467	146476	0 %	20 %	60 %	20 %	290473231
103	NC_013892	ATTAT	2	10	147664	147673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013892	TCAAC	2	10	147878	147887	40 %	20 %	0 %	40 %	290473234
105	NC_013892	AATAT	2	10	149157	149166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013892	CAAAA	2	10	151724	151733	80 %	0 %	0 %	20 %	290473239
107	NC_013892	TTTTC	2	10	154932	154941	0 %	80 %	0 %	20 %	290473243
108	NC_013892	TCTAT	2	10	155547	155556	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013892	CCTTT	2	10	156280	156289	0 %	60 %	0 %	40 %	290473244
110	NC_013892	ATATT	2	10	157584	157593	40 %	60 %	0 %	0 %	290473246
111	NC_013892	GAAAG	2	10	159604	159613	60 %	0 %	40 %	0 %	290473249
112	NC_013892	GAAGT	2	10	159710	159719	40 %	20 %	40 %	0 %	290473249
113	NC_013892	ATGAA	2	10	161286	161295	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013892	CCATT	2	10	162652	162661	20 %	40 %	0 %	40 %	290473252
115	NC_013892	ATTTT	2	10	163711	163720	20 %	80 %	0 %	0 %	290473255
116	NC_013892	AGGGC	2	10	172354	172363	20 %	0 %	60 %	20 %	290473264
117	NC_013892	TGTTT	2	10	172691	172700	0 %	80 %	20 %	0 %	290473264
118	NC_013892	GGTCA	2	10	173316	173325	20 %	20 %	40 %	20 %	290473265
119	NC_013892	GATGG	2	10	176763	176772	20 %	20 %	60 %	0 %	290473267
120	NC_013892	GGGAA	2	10	178876	178885	40 %	0 %	60 %	0 %	290473269
121	NC_013892	CCGGC	2	10	181836	181845	0 %	0 %	40 %	60 %	290473272
122	NC_013892	CGGTA	2	10	185039	185048	20 %	20 %	40 %	20 %	290473276
123	NC_013892	TTGGT	2	10	185699	185708	0 %	60 %	40 %	0 %	290473276
124	NC_013892	CGTTG	2	10	186017	186026	0 %	40 %	40 %	20 %	290473277
125	NC_013892	GGCGC	2	10	186668	186677	0 %	0 %	60 %	40 %	290473278
126	NC_013892	AGTTG	2	10	189274	189283	20 %	40 %	40 %	0 %	290473280
127	NC_013892	AAATC	2	10	190423	190432	60 %	20 %	0 %	20 %	290473280
128	NC_013892	TTATA	2	10	192934	192943	40 %	60 %	0 %	0 %	290473282
129	NC_013892	TAAAA	2	10	193282	193291	80 %	20 %	0 %	0 %	290473282
130	NC_013892	ATCAA	2	10	193416	193425	60 %	20 %	0 %	20 %	290473282
131	NC_013892	TAATA	2	10	193524	193533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013892	TAAAA	2	10	193607	193616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013892	AAAAT	2	10	196303	196312	80 %	20 %	0 %	0 %	290473284
134	NC_013892	GATAG	2	10	196384	196393	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013892	ATTTT	2	10	196666	196675	20 %	80 %	0 %	0 %	290473286
136	NC_013892	ATAAA	2	10	197227	197236	80 %	20 %	0 %	0 %	290473286
137	NC_013892	GCGTT	2	10	201347	201356	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013892	TTGAT	2	10	202010	202019	20 %	60 %	20 %	0 %	290473291
139	NC_013892	GTGAT	2	10	202499	202508	20 %	40 %	40 %	0 %	290473291
140	NC_013892	CATCG	2	10	205700	205709	20 %	20 %	20 %	40 %	290473294
141	NC_013892	GGTTG	2	10	205931	205940	0 %	40 %	60 %	0 %	290473294
142	NC_013892	ACCGT	2	10	208684	208693	20 %	20 %	20 %	40 %	290473295
143	NC_013892	TTAAT	2	10	210549	210558	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013892	ATGTA	2	10	211642	211651	40 %	40 %	20 %	0 %	290473296
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148	NC_013892	ATTTT	2	10	215478	215487	20 %	80 %	0 %	0 %	290473298
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155	NC_013892	GTTGC	2	10	221120	221129	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
156	NC_013892	GCGTT	2	10	222119	222128	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
157	NC_013892	GTGAT	2	10	223423	223432	20 %	40 %	40 %	0 %	290473307
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253	NC_013892	GTTGG	2	10	354777	354786	0 %	40 %	60 %	0 %	290473426
254	NC_013892	GTGAA	2	10	356672	356681	40 %	20 %	40 %	0 %	290473427
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257	NC_013892	TTTCC	2	10	358004	358013	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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259	NC_013892	AAAAT	2	10	359776	359785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_013892	ATTTA	2	10	360119	360128	40 %	60 %	0 %	0 %	290473431
261	NC_013892	TCACC	2	10	361229	361238	20 %	20 %	0 %	60 %	290473433
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264	NC_013892	GTCAT	2	10	364841	364850	20 %	40 %	20 %	20 %	290473437
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267	NC_013892	CTGAA	2	10	376838	376847	40 %	20 %	20 %	20 %	290473447
268	NC_013892	CATTC	2	10	380012	380021	20 %	40 %	0 %	40 %	290473451
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270	NC_013892	GCGTA	2	10	383221	383230	20 %	20 %	40 %	20 %	290473453
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403	NC_013892	GATAA	2	10	567569	567578	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
404	NC_013892	ATCCG	2	10	568349	568358	20 %	20 %	20 %	40 %	290473630
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