MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xenorhabdus bovienii SS-2004 chromosome

Total Repeats: 84552

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013892	TTA	2	6	242964	242969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_013892	TG	4	8	243044	243051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_013892	TAA	2	6	243071	243076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_013892	ATC	2	6	243110	243115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_013892	CTCC	2	8	243119	243126	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5006	NC_013892	T	8	8	243143	243150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_013892	GAATGC	2	12	243204	243215	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290473324
5008	NC_013892	TGG	2	6	243263	243268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473324
5009	NC_013892	TTC	2	6	243335	243340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473324
5010	NC_013892	GTG	2	6	243362	243367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473324
5011	NC_013892	CCAGAG	2	12	243385	243396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473324
5012	NC_013892	TCT	2	6	243434	243439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473324
5013	NC_013892	CGA	2	6	243449	243454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473324
5014	NC_013892	TAA	2	6	243585	243590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473324
5015	NC_013892	TGA	2	6	243615	243620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473324
5016	NC_013892	T	6	6	243621	243626	0 %	100 %	0 %	0 %	290473324
5017	NC_013892	GAT	2	6	243634	243639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473324
5018	NC_013892	ATA	2	6	243692	243697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473324
5019	NC_013892	GTG	2	6	243711	243716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473324
5020	NC_013892	TGT	2	6	243785	243790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473324
5021	NC_013892	GTTG	2	8	243847	243854	0 %	50 %	50 %	0 %	290473324
5022	NC_013892	GCA	2	6	243936	243941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473324
5023	NC_013892	CCAGA	2	10	243981	243990	40 %	0 %	20 %	40 %	290473324
5024	NC_013892	GCCA	2	8	244060	244067	25 %	0 %	25 %	50 %	290473324
5025	NC_013892	TGGA	2	8	244126	244133	25 %	25 %	50 %	0 %	290473324
5026	NC_013892	CAT	2	6	244203	244208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473324
5027	NC_013892	CTG	2	6	244261	244266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473324
5028	NC_013892	ATC	2	6	244273	244278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473324
5029	NC_013892	CCA	2	6	244304	244309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473324
5030	NC_013892	TCAT	2	8	244352	244359	25 %	50 %	0 %	25 %	290473324
5031	NC_013892	TG	3	6	244382	244387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_013892	TGT	2	6	244432	244437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_013892	TGT	2	6	244506	244511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_013892	TA	3	6	244512	244517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_013892	ATG	2	6	244525	244530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_013892	TGC	2	6	244705	244710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473325
5037	NC_013892	T	6	6	244730	244735	0 %	100 %	0 %	0 %	290473325
5038	NC_013892	TCA	2	6	244752	244757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473325
5039	NC_013892	ATC	2	6	244817	244822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473325
5040	NC_013892	GTT	2	6	244948	244953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473325
5041	NC_013892	T	7	7	245027	245033	0 %	100 %	0 %	0 %	290473325
5042	NC_013892	TGC	2	6	245061	245066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473325
5043	NC_013892	GCT	2	6	245092	245097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473325
5044	NC_013892	TTC	2	6	245103	245108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473325
5045	NC_013892	CGG	2	6	245155	245160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290473325
5046	NC_013892	TTG	2	6	245187	245192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473325
5047	NC_013892	AAT	2	6	245229	245234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_013892	T	7	7	245285	245291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_013892	CCTG	2	8	245538	245545	0 %	25 %	25 %	50 %	290473326
5050	NC_013892	CGT	2	6	245594	245599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473326
5051	NC_013892	TCA	3	9	245661	245669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473326
5052	NC_013892	ACA	2	6	245682	245687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473326
5053	NC_013892	TTG	2	6	245754	245759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473326
5054	NC_013892	ACTT	2	8	245843	245850	25 %	50 %	0 %	25 %	290473326
5055	NC_013892	GGT	2	6	245861	245866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473326
5056	NC_013892	AAG	2	6	246090	246095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473326
5057	NC_013892	CAC	2	6	246120	246125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473326
5058	NC_013892	AAG	2	6	246305	246310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473326
5059	NC_013892	CAT	2	6	246322	246327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473327
5060	NC_013892	AGA	2	6	246361	246366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473327
5061	NC_013892	CCA	2	6	246371	246376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473327
5062	NC_013892	GCGCT	2	10	246380	246389	0 %	20 %	40 %	40 %	290473327
5063	NC_013892	GCTG	2	8	246391	246398	0 %	25 %	50 %	25 %	290473327
5064	NC_013892	TCG	2	6	246478	246483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473327
5065	NC_013892	GCT	2	6	246670	246675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473327
5066	NC_013892	CTG	2	6	246713	246718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473327
5067	NC_013892	TGC	2	6	246822	246827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473327
5068	NC_013892	TAT	2	6	246877	246882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473327
5069	NC_013892	CGA	2	6	246942	246947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473327
5070	NC_013892	ATT	2	6	246978	246983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473327
5071	NC_013892	GCAG	2	8	247018	247025	25 %	0 %	50 %	25 %	290473327
5072	NC_013892	CTG	2	6	247064	247069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473327
5073	NC_013892	GAA	2	6	247070	247075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473327
5074	NC_013892	CTT	2	6	247080	247085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473327
5075	NC_013892	TGG	2	6	247086	247091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473327
5076	NC_013892	TGCC	2	8	247140	247147	0 %	25 %	25 %	50 %	290473327
5077	NC_013892	TTG	2	6	247233	247238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473327
5078	NC_013892	CAG	2	6	247262	247267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473327
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5080	NC_013892	TTC	2	6	247319	247324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473327
5081	NC_013892	AGC	2	6	247341	247346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473327
5082	NC_013892	AGC	2	6	247392	247397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473327
5083	NC_013892	CTGG	3	12	247436	247447	0 %	25 %	50 %	25 %	290473327
5084	NC_013892	A	6	6	247455	247460	100 %	0 %	0 %	0 %	290473327
5085	NC_013892	CG	3	6	247487	247492	0 %	0 %	50 %	50 %	290473327
5086	NC_013892	TGT	2	6	247497	247502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473327
5087	NC_013892	TGA	2	6	247515	247520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473327
5088	NC_013892	ATG	2	6	247581	247586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473327
5089	NC_013892	TGAA	2	8	247614	247621	50 %	25 %	25 %	0 %	290473327
5090	NC_013892	CTGTG	2	10	247672	247681	0 %	40 %	40 %	20 %	290473327
5091	NC_013892	CGT	2	6	247766	247771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473327
5092	NC_013892	TAT	2	6	247792	247797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473327
5093	NC_013892	A	6	6	247805	247810	100 %	0 %	0 %	0 %	290473327
5094	NC_013892	AGA	2	6	247837	247842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473327
5095	NC_013892	GTG	2	6	247883	247888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473327
5096	NC_013892	GAT	2	6	247889	247894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473327
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5098	NC_013892	TAA	2	6	248071	248076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473327
5099	NC_013892	AGA	2	6	248104	248109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473327
5100	NC_013892	AGA	2	6	248152	248157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473327
5101	NC_013892	CTC	2	6	248202	248207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	290473327
5102	NC_013892	GTG	2	6	248264	248269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473327
5103	NC_013892	TTC	2	6	248276	248281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473327
5104	NC_013892	GTGATG	2	12	248288	248299	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	290473327
5105	NC_013892	CAA	2	6	248309	248314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473327
5106	NC_013892	GTT	2	6	248356	248361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473327
5107	NC_013892	TGC	2	6	248400	248405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_013892	T	8	8	248443	248450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_013892	T	6	6	248462	248467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_013892	TGA	2	6	248486	248491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_013892	TGGT	2	8	248511	248518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_013892	ATC	2	6	248521	248526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_013892	CT	3	6	248657	248662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_013892	T	6	6	248702	248707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_013892	TAAA	2	8	248717	248724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_013892	CGGT	2	8	248779	248786	0 %	25 %	50 %	25 %	290473328
5117	NC_013892	ATCT	2	8	248802	248809	25 %	50 %	0 %	25 %	290473328
5118	NC_013892	TAAAT	2	10	248894	248903	60 %	40 %	0 %	0 %	290473328
5119	NC_013892	ATT	2	6	248939	248944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_013892	TCT	2	6	248975	248980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_013892	T	6	6	249039	249044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_013892	TA	3	6	249094	249099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_013892	ATT	2	6	249167	249172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_013892	T	7	7	249171	249177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_013892	T	7	7	249186	249192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5371	NC_013892	TC	3	6	262837	262842	0 %	50 %	0 %	50 %	290473341
5372	NC_013892	TTTC	2	8	262900	262907	0 %	75 %	0 %	25 %	290473341
5373	NC_013892	ACTGCC	2	12	262922	262933	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	290473341
5374	NC_013892	CTG	2	6	263028	263033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473341
5375	NC_013892	GTG	2	6	263124	263129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473341
5376	NC_013892	AGA	2	6	263132	263137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473341
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5378	NC_013892	GTG	2	6	263250	263255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473341
5379	NC_013892	GAC	2	6	263285	263290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473341
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5382	NC_013892	TGC	2	6	263580	263585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473341
5383	NC_013892	ATTCA	2	10	263603	263612	40 %	40 %	0 %	20 %	290473341
5384	NC_013892	TGGTT	2	10	263650	263659	0 %	60 %	40 %	0 %	290473341
5385	NC_013892	ACC	2	6	263684	263689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473341
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5391	NC_013892	TCT	2	6	263985	263990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473341
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5400	NC_013892	CATT	2	8	264373	264380	25 %	50 %	0 %	25 %	290473341
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5438	NC_013892	TCT	2	6	266155	266160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5469	NC_013892	ATTTT	2	10	268000	268009	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5470	NC_013892	TA	3	6	268023	268028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5471	NC_013892	TA	3	6	268055	268060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5472	NC_013892	TAT	2	6	268076	268081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5473	NC_013892	TAT	2	6	268104	268109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5474	NC_013892	ACA	2	6	268172	268177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5475	NC_013892	TTA	2	6	268186	268191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5476	NC_013892	TTTAA	2	10	268201	268210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5477	NC_013892	ATC	2	6	268348	268353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473343
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5479	NC_013892	TCAG	2	8	268399	268406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5480	NC_013892	TACG	2	8	268413	268420	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5481	NC_013892	AAT	2	6	268456	268461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5482	NC_013892	TA	3	6	268465	268470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5483	NC_013892	GAAAAA	2	12	268509	268520	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5484	NC_013892	ATA	2	6	268539	268544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5485	NC_013892	TTA	2	6	268592	268597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5486	NC_013892	TTAA	2	8	268606	268613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5487	NC_013892	CAA	2	6	268626	268631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473344
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5491	NC_013892	AAGA	2	8	268698	268705	75 %	0 %	25 %	0 %	290473344
5492	NC_013892	AC	3	6	268707	268712	50 %	0 %	0 %	50 %	290473344
5493	NC_013892	AATT	2	8	268714	268721	50 %	50 %	0 %	0 %	290473344
5494	NC_013892	CAAT	2	8	268766	268773	50 %	25 %	0 %	25 %	290473344
5495	NC_013892	CAA	2	6	268776	268781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473344
5496	NC_013892	GAA	2	6	268807	268812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473344
5497	NC_013892	TTCAA	2	10	268850	268859	40 %	40 %	0 %	20 %	290473344
5498	NC_013892	CTGAC	2	10	268966	268975	20 %	20 %	20 %	40 %	290473344
5499	NC_013892	CAG	2	6	269067	269072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473344
5500	NC_013892	CAG	2	6	269082	269087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473344

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