MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 14766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010717	CAGC	2	8	18	25	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010717	GATG	2	8	44	51	25 %	25 %	50 %	0 %	188574271
3	NC_010717	CCCG	2	8	89	96	0 %	0 %	25 %	75 %	188574271
4	NC_010717	GTCG	2	8	839	846	0 %	25 %	50 %	25 %	188574271
5	NC_010717	CGAT	2	8	847	854	25 %	25 %	25 %	25 %	188574271
6	NC_010717	GCCG	2	8	1257	1264	0 %	0 %	50 %	50 %	188574271
7	NC_010717	TGCC	2	8	1286	1293	0 %	25 %	25 %	50 %	188574271
8	NC_010717	AAAC	2	8	1548	1555	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010717	CCTG	2	8	1728	1735	0 %	25 %	25 %	50 %	188574272
10	NC_010717	GGAC	2	8	1764	1771	25 %	0 %	50 %	25 %	188574272
11	NC_010717	CCCG	2	8	1858	1865	0 %	0 %	25 %	75 %	188574272
12	NC_010717	CTGC	2	8	1978	1985	0 %	25 %	25 %	50 %	188574272
13	NC_010717	CCGT	2	8	1996	2003	0 %	25 %	25 %	50 %	188574272
14	NC_010717	TGCG	2	8	2438	2445	0 %	25 %	50 %	25 %	188574272
15	NC_010717	CGAA	2	8	2471	2478	50 %	0 %	25 %	25 %	188574272
16	NC_010717	CAAT	2	8	3317	3324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010717	GTCC	2	8	3338	3345	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010717	CCTG	2	8	3896	3903	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010717	CCGT	2	8	3911	3918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010717	GCCT	2	8	4859	4866	0 %	25 %	25 %	50 %	188574273
21	NC_010717	CCCG	2	8	5023	5030	0 %	0 %	25 %	75 %	188574273
22	NC_010717	CGAA	2	8	6349	6356	50 %	0 %	25 %	25 %	188574274
23	NC_010717	GCAG	2	8	7154	7161	25 %	0 %	50 %	25 %	188574274
24	NC_010717	GCCG	2	8	8332	8339	0 %	0 %	50 %	50 %	188574275
25	NC_010717	ACCC	2	8	9457	9464	25 %	0 %	0 %	75 %	188574276
26	NC_010717	GCCT	2	8	9629	9636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010717	GCAA	2	8	9860	9867	50 %	0 %	25 %	25 %	188574277
28	NC_010717	TGGG	2	8	9899	9906	0 %	25 %	75 %	0 %	188574277
29	NC_010717	GTCG	2	8	11718	11725	0 %	25 %	50 %	25 %	188574278
30	NC_010717	CGTT	2	8	12446	12453	0 %	50 %	25 %	25 %	188574279
31	NC_010717	GGTG	2	8	12543	12550	0 %	25 %	75 %	0 %	188574279
32	NC_010717	GAAG	2	8	12913	12920	50 %	0 %	50 %	0 %	188574280
33	NC_010717	GCGA	2	8	13751	13758	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010717	GTGC	2	8	14563	14570	0 %	25 %	50 %	25 %	188574282
35	NC_010717	GATC	2	8	14757	14764	25 %	25 %	25 %	25 %	188574283
36	NC_010717	GGTG	2	8	15800	15807	0 %	25 %	75 %	0 %	188574284
37	NC_010717	CATC	2	8	15932	15939	25 %	25 %	0 %	50 %	188574284
38	NC_010717	AAAG	2	8	16934	16941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010717	GTTG	2	8	17210	17217	0 %	50 %	50 %	0 %	188574285
40	NC_010717	GTTG	2	8	17496	17503	0 %	50 %	50 %	0 %	188574285
41	NC_010717	GGCT	2	8	17840	17847	0 %	25 %	50 %	25 %	188574285
42	NC_010717	CGGC	2	8	18077	18084	0 %	0 %	50 %	50 %	188574285
43	NC_010717	CGTG	2	8	18727	18734	0 %	25 %	50 %	25 %	188574286
44	NC_010717	TGGC	2	8	19134	19141	0 %	25 %	50 %	25 %	188574286
45	NC_010717	GCCG	2	8	19175	19182	0 %	0 %	50 %	50 %	188574286
46	NC_010717	CGGC	2	8	19317	19324	0 %	0 %	50 %	50 %	188574286
47	NC_010717	CGGG	2	8	20730	20737	0 %	0 %	75 %	25 %	188574287
48	NC_010717	GATC	2	8	20740	20747	25 %	25 %	25 %	25 %	188574287
49	NC_010717	GCCG	2	8	20805	20812	0 %	0 %	50 %	50 %	188574287
50	NC_010717	GAGC	2	8	20974	20981	25 %	0 %	50 %	25 %	188574287
51	NC_010717	AGCA	2	8	21883	21890	50 %	0 %	25 %	25 %	188574287
52	NC_010717	AGCG	2	8	22214	22221	25 %	0 %	50 %	25 %	188574288
53	NC_010717	GCAG	2	8	22231	22238	25 %	0 %	50 %	25 %	188574288
54	NC_010717	GCGT	2	8	22332	22339	0 %	25 %	50 %	25 %	188574288
55	NC_010717	CGTG	2	8	22665	22672	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010717	CCGG	2	8	22678	22685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010717	TCGA	2	8	22814	22821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010717	GTCT	2	8	22940	22947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010717	CGCC	2	8	24328	24335	0 %	0 %	25 %	75 %	188574291
60	NC_010717	CGCC	2	8	24525	24532	0 %	0 %	25 %	75 %	188574291
61	NC_010717	CAGC	2	8	24686	24693	25 %	0 %	25 %	50 %	188574291
62	NC_010717	CGCC	2	8	24913	24920	0 %	0 %	25 %	75 %	188574291
63	NC_010717	CTGC	2	8	25081	25088	0 %	25 %	25 %	50 %	188574291
64	NC_010717	GCGT	2	8	25100	25107	0 %	25 %	50 %	25 %	188574291
65	NC_010717	TGCC	2	8	25470	25477	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010717	TGGC	2	8	25495	25502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010717	CAGC	2	8	25717	25724	25 %	0 %	25 %	50 %	188574292
68	NC_010717	TGCG	2	8	26177	26184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010717	CTTC	2	8	26232	26239	0 %	50 %	0 %	50 %	188574293
70	NC_010717	TTAT	2	8	26366	26373	25 %	75 %	0 %	0 %	188574293
71	NC_010717	GCCC	2	8	26805	26812	0 %	0 %	25 %	75 %	188574293
72	NC_010717	TGCC	2	8	26843	26850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010717	GCAC	2	8	27401	27408	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010717	GGGC	2	8	27932	27939	0 %	0 %	75 %	25 %	188574295
75	NC_010717	TCGA	2	8	28086	28093	25 %	25 %	25 %	25 %	188574295
76	NC_010717	GCCG	2	8	28514	28521	0 %	0 %	50 %	50 %	188574295
77	NC_010717	GCCG	2	8	29546	29553	0 %	0 %	50 %	50 %	188574298
78	NC_010717	CGGC	2	8	30052	30059	0 %	0 %	50 %	50 %	188574298
79	NC_010717	GATG	2	8	30109	30116	25 %	25 %	50 %	0 %	188574298
80	NC_010717	TCAC	2	8	30640	30647	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010717	CTTG	2	8	30731	30738	0 %	50 %	25 %	25 %	188574299
82	NC_010717	GCCG	2	8	30797	30804	0 %	0 %	50 %	50 %	188574299
83	NC_010717	GGTG	2	8	31229	31236	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010717	AGAA	2	8	31471	31478	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010717	CTTT	2	8	31781	31788	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010717	GCGT	2	8	32472	32479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010717	CTGG	2	8	33004	33011	0 %	25 %	50 %	25 %	188574300
88	NC_010717	GCGA	2	8	33039	33046	25 %	0 %	50 %	25 %	188574300
89	NC_010717	AGCA	2	8	33177	33184	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010717	TCAA	2	8	33340	33347	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010717	GCTC	2	8	34089	34096	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010717	TGGG	2	8	34288	34295	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010717	GTCT	2	8	34314	34321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010717	GTGC	2	8	35525	35532	0 %	25 %	50 %	25 %	188574302
95	NC_010717	GGCG	2	8	35570	35577	0 %	0 %	75 %	25 %	188574302
96	NC_010717	CAGG	2	8	36155	36162	25 %	0 %	50 %	25 %	188574303
97	NC_010717	CCAG	2	8	37016	37023	25 %	0 %	25 %	50 %	188574305
98	NC_010717	CGAC	2	8	37551	37558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010717	TGGC	2	8	37580	37587	0 %	25 %	50 %	25 %	188574306
100	NC_010717	ACCA	2	8	37806	37813	50 %	0 %	0 %	50 %	188574306
101	NC_010717	TGCG	3	12	39144	39155	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010717	TGCA	2	8	39172	39179	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010717	CAGT	2	8	39194	39201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010717	TTGC	2	8	39448	39455	0 %	50 %	25 %	25 %	188574308
105	NC_010717	CAAC	2	8	39651	39658	50 %	0 %	0 %	50 %	188574308
106	NC_010717	TGTT	2	8	39901	39908	0 %	75 %	25 %	0 %	188574308
107	NC_010717	CGAA	2	8	40850	40857	50 %	0 %	25 %	25 %	188574309
108	NC_010717	TGCT	2	8	41425	41432	0 %	50 %	25 %	25 %	188574311
109	NC_010717	TCGG	2	8	41888	41895	0 %	25 %	50 %	25 %	188574311
110	NC_010717	TCCA	2	8	42534	42541	25 %	25 %	0 %	50 %	188574312
111	NC_010717	CATG	2	8	42786	42793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010717	GCAG	2	8	42849	42856	25 %	0 %	50 %	25 %	188574313
113	NC_010717	GCGG	2	8	42864	42871	0 %	0 %	75 %	25 %	188574313
114	NC_010717	CCAC	2	8	43438	43445	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_010717	TCGA	2	8	43476	43483	25 %	25 %	25 %	25 %	188574314
116	NC_010717	CGAA	2	8	43693	43700	50 %	0 %	25 %	25 %	188574314
117	NC_010717	CCCG	2	8	43857	43864	0 %	0 %	25 %	75 %	188574314
118	NC_010717	GATG	2	8	44277	44284	25 %	25 %	50 %	0 %	188574316
119	NC_010717	CCGA	2	8	44443	44450	25 %	0 %	25 %	50 %	188574316
120	NC_010717	GACA	2	8	44570	44577	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010717	CTGG	2	8	44868	44875	0 %	25 %	50 %	25 %	188574317
122	NC_010717	CCAT	2	8	45118	45125	25 %	25 %	0 %	50 %	188574317
123	NC_010717	GCTG	2	8	45579	45586	0 %	25 %	50 %	25 %	188574317
124	NC_010717	CGTC	2	8	46301	46308	0 %	25 %	25 %	50 %	188574318
125	NC_010717	GCGT	2	8	46374	46381	0 %	25 %	50 %	25 %	188574318
126	NC_010717	CACG	2	8	46531	46538	25 %	0 %	25 %	50 %	188574318
127	NC_010717	CGTC	2	8	46827	46834	0 %	25 %	25 %	50 %	188574318
128	NC_010717	ATCC	2	8	47022	47029	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010717	CGCA	2	8	47513	47520	25 %	0 %	25 %	50 %	188574320
130	NC_010717	GTGC	2	8	47553	47560	0 %	25 %	50 %	25 %	188574320
131	NC_010717	CTGA	2	8	47618	47625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010717	AAGC	2	8	47883	47890	50 %	0 %	25 %	25 %	188574321
133	NC_010717	GCTG	2	8	49848	49855	0 %	25 %	50 %	25 %	188574324
134	NC_010717	CAGC	2	8	50445	50452	25 %	0 %	25 %	50 %	188574324
135	NC_010717	GTGA	2	8	50791	50798	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010717	TGCG	2	8	50961	50968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010717	TGGC	2	8	51833	51840	0 %	25 %	50 %	25 %	188574326
138	NC_010717	CGCA	2	8	52522	52529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_010717	GCCG	2	8	52866	52873	0 %	0 %	50 %	50 %	188574327
140	NC_010717	GACG	2	8	53140	53147	25 %	0 %	50 %	25 %	188574327
141	NC_010717	CACC	2	8	54320	54327	25 %	0 %	0 %	75 %	188574328
142	NC_010717	GTTG	2	8	54500	54507	0 %	50 %	50 %	0 %	188574328
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144	NC_010717	GCCG	2	8	54732	54739	0 %	0 %	50 %	50 %	188574329
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