MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 124176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_010717	TGC	3	9	168904	168912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574441
4003	NC_010717	GCT	2	6	168956	168961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574441
4004	NC_010717	CGGTG	2	10	168968	168977	0 %	20 %	60 %	20 %	188574441
4005	NC_010717	CAC	2	6	168981	168986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574441
4006	NC_010717	ATC	2	6	169023	169028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574441
4007	NC_010717	CG	4	8	169040	169047	0 %	0 %	50 %	50 %	188574441
4008	NC_010717	CAC	2	6	169053	169058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574441
4009	NC_010717	GCCT	2	8	169062	169069	0 %	25 %	25 %	50 %	188574441
4010	NC_010717	GCC	2	6	169183	169188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574441
4011	NC_010717	GC	3	6	169267	169272	0 %	0 %	50 %	50 %	188574441
4012	NC_010717	GTT	2	6	169274	169279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574441
4013	NC_010717	TCG	2	6	169285	169290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574441
4014	NC_010717	GTG	2	6	169305	169310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574441
4015	NC_010717	CG	3	6	169334	169339	0 %	0 %	50 %	50 %	188574441
4016	NC_010717	CGG	2	6	169343	169348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574441
4017	NC_010717	CG	3	6	169378	169383	0 %	0 %	50 %	50 %	188574441
4018	NC_010717	GGGC	2	8	169427	169434	0 %	0 %	75 %	25 %	188574441
4019	NC_010717	CGG	2	6	169451	169456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574441
4020	NC_010717	GC	3	6	169499	169504	0 %	0 %	50 %	50 %	188574441
4021	NC_010717	ACCCCG	2	12	169608	169619	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	188574441
4022	NC_010717	TGC	2	6	169648	169653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574441
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4028	NC_010717	TGG	2	6	170086	170091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574441
4029	NC_010717	CGC	2	6	170114	170119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574441
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4032	NC_010717	CGG	2	6	170297	170302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574441
4033	NC_010717	GAT	2	6	170375	170380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188574441
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4037	NC_010717	TCG	2	6	170572	170577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574441
4038	NC_010717	CTG	2	6	170589	170594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574441
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4041	NC_010717	ACG	2	6	170665	170670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574441
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4054	NC_010717	GCA	2	6	171037	171042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574441
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4056	NC_010717	CGG	2	6	171080	171085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574441
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4102	NC_010717	TG	3	6	173081	173086	0 %	50 %	50 %	0 %	188574442
4103	NC_010717	TGG	2	6	173100	173105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574442
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4106	NC_010717	GCG	2	6	173189	173194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574442
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4108	NC_010717	CA	3	6	173258	173263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_010717	GTTC	2	8	173264	173271	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_010717	C	6	6	173277	173282	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4111	NC_010717	CGAAC	2	10	173286	173295	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4112	NC_010717	TTC	2	6	173340	173345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_010717	TGG	2	6	173363	173368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4119	NC_010717	GCAT	3	12	173489	173500	25 %	25 %	25 %	25 %	188574443
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4254	NC_010717	GGC	2	6	180131	180136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4277	NC_010717	CGG	2	6	181254	181259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4492	NC_010717	A	6	6	190032	190037	100 %	0 %	0 %	0 %	188574463
4493	NC_010717	GCGG	2	8	190039	190046	0 %	0 %	75 %	25 %	188574463
4494	NC_010717	CG	3	6	190054	190059	0 %	0 %	50 %	50 %	188574463
4495	NC_010717	CGT	2	6	190066	190071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574463
4496	NC_010717	CAT	2	6	190166	190171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574463
4497	NC_010717	CGGG	2	8	190175	190182	0 %	0 %	75 %	25 %	188574463
4498	NC_010717	GAACGG	2	12	190250	190261	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	188574463
4499	NC_010717	CGC	2	6	190357	190362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574463
4500	NC_010717	GC	3	6	190437	190442	0 %	0 %	50 %	50 %	188574463

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