MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 124176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010717	TGCG	2	8	126761	126768	0 %	25 %	50 %	25 %	188574399
3002	NC_010717	GTGC	2	8	126810	126817	0 %	25 %	50 %	25 %	188574399
3003	NC_010717	GGCGT	2	10	126821	126830	0 %	20 %	60 %	20 %	188574399
3004	NC_010717	GCA	2	6	126930	126935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574399
3005	NC_010717	GCGT	2	8	127005	127012	0 %	25 %	50 %	25 %	188574399
3006	NC_010717	GCGCA	2	10	127024	127033	20 %	0 %	40 %	40 %	188574399
3007	NC_010717	CAG	2	6	127051	127056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574399
3008	NC_010717	GCC	2	6	127087	127092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574399
3009	NC_010717	CCG	2	6	127127	127132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574399
3010	NC_010717	GGC	2	6	127135	127140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574399
3011	NC_010717	CAG	2	6	127180	127185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574399
3012	NC_010717	GCCC	2	8	127233	127240	0 %	0 %	25 %	75 %	188574399
3013	NC_010717	CG	3	6	127245	127250	0 %	0 %	50 %	50 %	188574399
3014	NC_010717	GCT	2	6	127275	127280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574399
3015	NC_010717	GCA	2	6	127281	127286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574399
3016	NC_010717	CGG	2	6	127360	127365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574399
3017	NC_010717	ATC	2	6	127367	127372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574399
3018	NC_010717	CG	3	6	127474	127479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_010717	ACG	2	6	127515	127520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574400
3020	NC_010717	GCC	2	6	127556	127561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574400
3021	NC_010717	GCG	3	9	127564	127572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574400
3022	NC_010717	ACA	2	6	127573	127578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188574400
3023	NC_010717	GT	3	6	127583	127588	0 %	50 %	50 %	0 %	188574400
3024	NC_010717	TTAA	2	8	127844	127851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_010717	AAT	2	6	127855	127860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_010717	TG	3	6	127925	127930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_010717	AGC	2	6	127938	127943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_010717	GTTG	2	8	127981	127988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_010717	AAC	2	6	128040	128045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_010717	ATC	2	6	128085	128090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_010717	GCAAGC	2	12	128126	128137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574401
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3033	NC_010717	GCA	2	6	128187	128192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574401
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3035	NC_010717	GGC	2	6	128231	128236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574401
3036	NC_010717	GGC	2	6	128240	128245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574401
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3040	NC_010717	GCG	2	6	128349	128354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574401
3041	NC_010717	GAC	2	6	128377	128382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574401
3042	NC_010717	CGA	2	6	128388	128393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574401
3043	NC_010717	CTG	2	6	128419	128424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574401
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3045	NC_010717	TCCGG	2	10	128495	128504	0 %	20 %	40 %	40 %	188574401
3046	NC_010717	CG	4	8	128562	128569	0 %	0 %	50 %	50 %	188574401
3047	NC_010717	CAG	2	6	128675	128680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574401
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3053	NC_010717	CGC	2	6	128811	128816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574401
3054	NC_010717	CGA	2	6	128825	128830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574401
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3056	NC_010717	GC	3	6	128898	128903	0 %	0 %	50 %	50 %	188574401
3057	NC_010717	GTT	2	6	129171	129176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_010717	CCTT	2	8	129181	129188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_010717	GCG	2	6	129202	129207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_010717	A	6	6	129227	129232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_010717	TGA	2	6	129248	129253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_010717	GCA	3	9	129330	129338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_010717	GTTGG	2	10	129428	129437	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_010717	CTT	2	6	129515	129520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_010717	TGA	2	6	129536	129541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188574402
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3070	NC_010717	GC	3	6	129721	129726	0 %	0 %	50 %	50 %	188574402
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3083	NC_010717	CGGC	2	8	130250	130257	0 %	0 %	50 %	50 %	188574404
3084	NC_010717	CACG	2	8	130270	130277	25 %	0 %	25 %	50 %	188574404
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3087	NC_010717	CGGC	2	8	130304	130311	0 %	0 %	50 %	50 %	188574404
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3098	NC_010717	GAC	2	6	130849	130854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574405
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3110	NC_010717	GCG	2	6	131783	131788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_010717	CAG	2	6	131792	131797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3122	NC_010717	CCTGC	2	10	132222	132231	0 %	20 %	20 %	60 %	188574407
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3124	NC_010717	TCC	2	6	132319	132324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188574407
3125	NC_010717	CCG	2	6	132338	132343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574407
3126	NC_010717	ACC	2	6	132367	132372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574407
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3128	NC_010717	TGG	2	6	132437	132442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574407
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3132	NC_010717	CGG	2	6	132516	132521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574407
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3142	NC_010717	CTG	2	6	133074	133079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574407
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3230	NC_010717	GCCC	2	8	136909	136916	0 %	0 %	25 %	75 %	188574410
3231	NC_010717	CAG	3	9	136941	136949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574410
3232	NC_010717	ACA	2	6	136951	136956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188574410
3233	NC_010717	CA	3	6	136967	136972	50 %	0 %	0 %	50 %	188574410
3234	NC_010717	ATC	2	6	137025	137030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3235	NC_010717	ACG	2	6	137106	137111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3236	NC_010717	TAC	2	6	137113	137118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3237	NC_010717	CCA	2	6	137143	137148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3238	NC_010717	GC	3	6	137153	137158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3239	NC_010717	AAC	2	6	137168	137173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3240	NC_010717	ATC	2	6	137183	137188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3241	NC_010717	TCAA	2	8	137199	137206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3242	NC_010717	GCC	2	6	137259	137264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3243	NC_010717	AAT	2	6	137291	137296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_010717	CAG	2	6	137314	137319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3245	NC_010717	GGAT	2	8	137411	137418	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3246	NC_010717	A	7	7	137420	137426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_010717	CTT	2	6	137450	137455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3248	NC_010717	ACCT	2	8	137543	137550	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3249	NC_010717	GCA	2	6	137551	137556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3251	NC_010717	TA	3	6	137594	137599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3372	NC_010717	GCT	2	6	143563	143568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574418
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3479	NC_010717	TTGT	2	8	148188	148195	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3480	NC_010717	GCG	2	6	148205	148210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3481	NC_010717	CCT	2	6	148237	148242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3482	NC_010717	CGG	2	6	148305	148310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3483	NC_010717	GCC	2	6	148339	148344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3484	NC_010717	A	6	6	148390	148395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3485	NC_010717	GAG	2	6	148430	148435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3486	NC_010717	AC	3	6	148503	148508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3487	NC_010717	TGC	2	6	148548	148553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3488	NC_010717	CGT	2	6	148565	148570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574423
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3491	NC_010717	CGT	2	6	148661	148666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574423
3492	NC_010717	GCG	2	6	148693	148698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574423
3493	NC_010717	GC	4	8	148707	148714	0 %	0 %	50 %	50 %	188574423
3494	NC_010717	CAC	3	9	148732	148740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574423
3495	NC_010717	GGT	2	6	148778	148783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574423
3496	NC_010717	GTC	2	6	148921	148926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574423
3497	NC_010717	CGT	2	6	148978	148983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3498	NC_010717	GCT	2	6	149075	149080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574424
3499	NC_010717	TG	3	6	149134	149139	0 %	50 %	50 %	0 %	188574424
3500	NC_010717	AAG	2	6	149175	149180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574424

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