MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 124176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010717	TGC	2	6	42417	42422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574312
1002	NC_010717	TTC	2	6	42494	42499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574312
1003	NC_010717	CAC	2	6	42512	42517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574312
1004	NC_010717	TCCA	2	8	42534	42541	25 %	25 %	0 %	50 %	188574312
1005	NC_010717	GCC	2	6	42551	42556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574312
1006	NC_010717	GCA	2	6	42595	42600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574312
1007	NC_010717	CAG	3	9	42602	42610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574312
1008	NC_010717	CAC	2	6	42637	42642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574312
1009	NC_010717	CAC	2	6	42680	42685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574312
1010	NC_010717	GGC	2	6	42722	42727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_010717	CATG	2	8	42786	42793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_010717	GC	3	6	42808	42813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_010717	GCG	2	6	42815	42820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_010717	GCAG	2	8	42849	42856	25 %	0 %	50 %	25 %	188574313
1015	NC_010717	GCGG	2	8	42864	42871	0 %	0 %	75 %	25 %	188574313
1016	NC_010717	CG	3	6	42877	42882	0 %	0 %	50 %	50 %	188574313
1017	NC_010717	GCA	2	6	43001	43006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_010717	CG	3	6	43010	43015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_010717	CCGCG	2	10	43127	43136	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1020	NC_010717	GCC	2	6	43147	43152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_010717	GGC	2	6	43177	43182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_010717	GC	3	6	43193	43198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_010717	GCA	2	6	43240	43245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_010717	GC	3	6	43246	43251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_010717	GC	3	6	43265	43270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_010717	CGG	2	6	43317	43322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_010717	GCG	2	6	43327	43332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_010717	CAC	2	6	43354	43359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_010717	CGA	2	6	43381	43386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_010717	GCG	3	9	43391	43399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_010717	CCAC	2	8	43438	43445	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1032	NC_010717	TTC	2	6	43449	43454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_010717	GT	3	6	43459	43464	0 %	50 %	50 %	0 %	188574314
1034	NC_010717	TCGA	2	8	43476	43483	25 %	25 %	25 %	25 %	188574314
1035	NC_010717	CGA	2	6	43529	43534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574314
1036	NC_010717	CCATCG	2	12	43603	43614	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	188574314
1037	NC_010717	CAC	2	6	43655	43660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574314
1038	NC_010717	CGAA	2	8	43693	43700	50 %	0 %	25 %	25 %	188574314
1039	NC_010717	ATC	2	6	43773	43778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574314
1040	NC_010717	TTG	2	6	43788	43793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574314
1041	NC_010717	CCCG	2	8	43857	43864	0 %	0 %	25 %	75 %	188574314
1042	NC_010717	CCA	2	6	43885	43890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574314
1043	NC_010717	GGC	2	6	43923	43928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574314
1044	NC_010717	GCC	2	6	43971	43976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574314
1045	NC_010717	CGG	2	6	43985	43990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574314
1046	NC_010717	TGC	2	6	43991	43996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574314
1047	NC_010717	CG	3	6	44025	44030	0 %	0 %	50 %	50 %	188574314
1048	NC_010717	CGG	2	6	44036	44041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574314
1049	NC_010717	CGC	2	6	44074	44079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574314
1050	NC_010717	CAG	2	6	44119	44124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574315
1051	NC_010717	GCA	2	6	44132	44137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574315
1052	NC_010717	GCA	2	6	44140	44145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574315
1053	NC_010717	GCG	2	6	44231	44236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_010717	GATG	2	8	44277	44284	25 %	25 %	50 %	0 %	188574316
1055	NC_010717	GGT	2	6	44365	44370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574316
1056	NC_010717	GAC	2	6	44371	44376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574316
1057	NC_010717	CGC	2	6	44377	44382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574316
1058	NC_010717	GAA	2	6	44431	44436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574316
1059	NC_010717	CCGA	2	8	44443	44450	25 %	0 %	25 %	50 %	188574316
1060	NC_010717	GCG	2	6	44530	44535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_010717	CG	3	6	44543	44548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_010717	CGT	2	6	44556	44561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_010717	GACA	2	8	44570	44577	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_010717	CG	3	6	44579	44584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_010717	GC	3	6	44681	44686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_010717	TCT	2	6	44779	44784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574317
1067	NC_010717	TCA	2	6	44837	44842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574317
1068	NC_010717	GTT	2	6	44853	44858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574317
1069	NC_010717	CTGG	2	8	44868	44875	0 %	25 %	50 %	25 %	188574317
1070	NC_010717	CAG	2	6	44913	44918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574317
1071	NC_010717	TGC	2	6	44936	44941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574317
1072	NC_010717	TCA	2	6	44996	45001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574317
1073	NC_010717	CAG	2	6	45051	45056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574317
1074	NC_010717	CTT	2	6	45069	45074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574317
1075	NC_010717	CCAT	2	8	45118	45125	25 %	25 %	0 %	50 %	188574317
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1077	NC_010717	CCA	2	6	45158	45163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574317
1078	NC_010717	CTC	2	6	45270	45275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188574317
1079	NC_010717	CG	3	6	45317	45322	0 %	0 %	50 %	50 %	188574317
1080	NC_010717	CTT	2	6	45357	45362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574317
1081	NC_010717	ACC	2	6	45366	45371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574317
1082	NC_010717	ATC	2	6	45429	45434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574317
1083	NC_010717	GCA	2	6	45457	45462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574317
1084	NC_010717	GTC	2	6	45495	45500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574317
1085	NC_010717	CTG	2	6	45507	45512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574317
1086	NC_010717	CAA	2	6	45530	45535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188574317
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1088	NC_010717	GCTG	2	8	45579	45586	0 %	25 %	50 %	25 %	188574317
1089	NC_010717	CG	3	6	45629	45634	0 %	0 %	50 %	50 %	188574317
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1091	NC_010717	ACT	2	6	45763	45768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1093	NC_010717	GAA	2	6	45863	45868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574318
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1095	NC_010717	TCG	2	6	45996	46001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574318
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1099	NC_010717	CCG	2	6	46228	46233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574318
1100	NC_010717	CGTC	2	8	46301	46308	0 %	25 %	25 %	50 %	188574318
1101	NC_010717	GCGT	2	8	46374	46381	0 %	25 %	50 %	25 %	188574318
1102	NC_010717	TCT	2	6	46516	46521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574318
1103	NC_010717	CACG	2	8	46531	46538	25 %	0 %	25 %	50 %	188574318
1104	NC_010717	TCA	2	6	46663	46668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574318
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1108	NC_010717	GCC	2	6	46809	46814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574318
1109	NC_010717	CGTC	2	8	46827	46834	0 %	25 %	25 %	50 %	188574318
1110	NC_010717	TC	3	6	46833	46838	0 %	50 %	0 %	50 %	188574318
1111	NC_010717	TCA	2	6	46840	46845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574318
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1113	NC_010717	TTA	2	6	46894	46899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_010717	GC	3	6	46904	46909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_010717	GAT	2	6	46941	46946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_010717	CAGGT	2	10	46976	46985	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_010717	ATCC	2	8	47022	47029	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_010717	GGT	2	6	47119	47124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574319
1119	NC_010717	TTCAT	2	10	47213	47222	20 %	60 %	0 %	20 %	188574319
1120	NC_010717	CA	3	6	47227	47232	50 %	0 %	0 %	50 %	188574319
1121	NC_010717	CTG	2	6	47260	47265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574319
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1124	NC_010717	CTG	2	6	47463	47468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574320
1125	NC_010717	CGCA	2	8	47513	47520	25 %	0 %	25 %	50 %	188574320
1126	NC_010717	GTGC	2	8	47553	47560	0 %	25 %	50 %	25 %	188574320
1127	NC_010717	CTGA	2	8	47618	47625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1129	NC_010717	GGC	2	6	47764	47769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574321
1130	NC_010717	CAGCGG	2	12	47823	47834	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	188574321
1131	NC_010717	AAGC	2	8	47883	47890	50 %	0 %	25 %	25 %	188574321
1132	NC_010717	GCG	2	6	47898	47903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_010717	T	6	6	47926	47931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_010717	TGCGCT	2	12	48245	48256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574322
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1167	NC_010717	GCC	3	9	49525	49533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1168	NC_010717	GCTTG	2	10	49600	49609	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1238	NC_010717	GC	3	6	52635	52640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1239	NC_010717	CT	3	6	52742	52747	0 %	50 %	0 %	50 %	188574327
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1251	NC_010717	ATC	2	6	53059	53064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574327
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1380	NC_010717	CGC	2	6	58255	58260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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