MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 124176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010717	CGA	2	6	21124	21129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574287
502	NC_010717	TGG	2	6	21205	21210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574287
503	NC_010717	GCG	2	6	21236	21241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574287
504	NC_010717	GCA	2	6	21264	21269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574287
505	NC_010717	GCG	2	6	21285	21290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574287
506	NC_010717	GTT	2	6	21307	21312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574287
507	NC_010717	CGA	3	9	21325	21333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574287
508	NC_010717	GCA	2	6	21363	21368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574287
509	NC_010717	CG	3	6	21383	21388	0 %	0 %	50 %	50 %	188574287
510	NC_010717	CAG	2	6	21440	21445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574287
511	NC_010717	CAG	2	6	21505	21510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574287
512	NC_010717	GC	3	6	21548	21553	0 %	0 %	50 %	50 %	188574287
513	NC_010717	CAG	2	6	21572	21577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574287
514	NC_010717	CGC	2	6	21619	21624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574287
515	NC_010717	ACC	2	6	21722	21727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574287
516	NC_010717	TGG	2	6	21874	21879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574287
517	NC_010717	AGCA	2	8	21883	21890	50 %	0 %	25 %	25 %	188574287
518	NC_010717	ACC	2	6	21972	21977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_010717	CA	3	6	21989	21994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_010717	GCC	2	6	22006	22011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_010717	C	6	6	22035	22040	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
522	NC_010717	CGA	2	6	22045	22050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_010717	GCA	2	6	22086	22091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_010717	AGCG	2	8	22214	22221	25 %	0 %	50 %	25 %	188574288
525	NC_010717	GCAG	2	8	22231	22238	25 %	0 %	50 %	25 %	188574288
526	NC_010717	CGC	2	6	22297	22302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574288
527	NC_010717	GCGT	2	8	22332	22339	0 %	25 %	50 %	25 %	188574288
528	NC_010717	CGG	2	6	22374	22379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574288
529	NC_010717	GCC	2	6	22433	22438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574289
530	NC_010717	GCT	2	6	22528	22533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574289
531	NC_010717	ACG	2	6	22564	22569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574289
532	NC_010717	ATG	2	6	22570	22575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188574289
533	NC_010717	GGC	2	6	22599	22604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574289
534	NC_010717	CGTG	2	8	22665	22672	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
535	NC_010717	CCGG	2	8	22678	22685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_010717	CGC	2	6	22760	22765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_010717	GCC	2	6	22774	22779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_010717	TCGA	2	8	22814	22821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_010717	CG	3	6	22832	22837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_010717	GGC	2	6	22854	22859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_010717	CAGCG	2	10	22879	22888	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
542	NC_010717	GTCT	2	8	22940	22947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
543	NC_010717	AGC	2	6	22951	22956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_010717	GCA	2	6	22994	22999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_010717	AAC	2	6	23059	23064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_010717	CG	3	6	23331	23336	0 %	0 %	50 %	50 %	188574290
547	NC_010717	GTT	2	6	23385	23390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574290
548	NC_010717	TCG	2	6	23405	23410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574290
549	NC_010717	GGC	2	6	23418	23423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574290
550	NC_010717	GAA	2	6	23424	23429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574290
551	NC_010717	TGC	2	6	23433	23438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574290
552	NC_010717	TCG	2	6	23455	23460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574290
553	NC_010717	TCT	2	6	23503	23508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574290
554	NC_010717	GCA	2	6	23516	23521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574290
555	NC_010717	GCT	2	6	23554	23559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574290
556	NC_010717	CG	4	8	23666	23673	0 %	0 %	50 %	50 %	188574290
557	NC_010717	GC	3	6	23754	23759	0 %	0 %	50 %	50 %	188574290
558	NC_010717	CAG	2	6	23811	23816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574290
559	NC_010717	GCG	2	6	23817	23822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574290
560	NC_010717	TCG	2	6	23842	23847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574290
561	NC_010717	GTC	2	6	23853	23858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574290
562	NC_010717	GCC	2	6	23862	23867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574290
563	NC_010717	CGC	2	6	23881	23886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574290
564	NC_010717	CTT	2	6	23909	23914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574290
565	NC_010717	CTG	2	6	23943	23948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574290
566	NC_010717	CAG	2	6	23949	23954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574290
567	NC_010717	TCG	2	6	23969	23974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574290
568	NC_010717	GCC	2	6	23990	23995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574290
569	NC_010717	GCC	2	6	23999	24004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574290
570	NC_010717	GCG	2	6	24020	24025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574290
571	NC_010717	TGC	2	6	24043	24048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574290
572	NC_010717	GTT	2	6	24175	24180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_010717	CGCC	2	8	24328	24335	0 %	0 %	25 %	75 %	188574291
574	NC_010717	AGC	2	6	24375	24380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574291
575	NC_010717	CAC	2	6	24410	24415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574291
576	NC_010717	GC	5	10	24492	24501	0 %	0 %	50 %	50 %	188574291
577	NC_010717	CGCC	2	8	24525	24532	0 %	0 %	25 %	75 %	188574291
578	NC_010717	TCC	2	6	24585	24590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188574291
579	NC_010717	CAGC	2	8	24686	24693	25 %	0 %	25 %	50 %	188574291
580	NC_010717	GCA	2	6	24808	24813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574291
581	NC_010717	GCG	2	6	24815	24820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574291
582	NC_010717	GC	4	8	24866	24873	0 %	0 %	50 %	50 %	188574291
583	NC_010717	CGCC	2	8	24913	24920	0 %	0 %	25 %	75 %	188574291
584	NC_010717	GC	3	6	24927	24932	0 %	0 %	50 %	50 %	188574291
585	NC_010717	CTT	2	6	25012	25017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574291
586	NC_010717	CG	3	6	25060	25065	0 %	0 %	50 %	50 %	188574291
587	NC_010717	CCG	3	9	25066	25074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574291
588	NC_010717	CTGC	2	8	25081	25088	0 %	25 %	25 %	50 %	188574291
589	NC_010717	CGC	2	6	25093	25098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574291
590	NC_010717	GCGT	2	8	25100	25107	0 %	25 %	50 %	25 %	188574291
591	NC_010717	GCA	2	6	25201	25206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574291
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593	NC_010717	CGG	2	6	25301	25306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574291
594	NC_010717	GCG	3	9	25320	25328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574291
595	NC_010717	GCG	2	6	25341	25346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574291
596	NC_010717	ATC	2	6	25353	25358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574291
597	NC_010717	GCG	3	9	25374	25382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_010717	TGCC	2	8	25470	25477	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_010717	TGGC	2	8	25495	25502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
600	NC_010717	CAC	2	6	25505	25510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574292
601	NC_010717	GCA	2	6	25518	25523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574292
602	NC_010717	GATGCG	2	12	25591	25602	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188574292
603	NC_010717	TGCCCA	2	12	25656	25667	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	188574292
604	NC_010717	CAG	2	6	25687	25692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574292
605	NC_010717	CAGC	2	8	25717	25724	25 %	0 %	25 %	50 %	188574292
606	NC_010717	CG	3	6	25783	25788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_010717	CA	3	6	25806	25811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_010717	CAC	2	6	25907	25912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_010717	GC	3	6	25972	25977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_010717	GCG	3	9	25991	25999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_010717	AGC	3	9	26007	26015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_010717	CCAGA	2	10	26027	26036	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
613	NC_010717	TGG	2	6	26097	26102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_010717	TGCG	2	8	26177	26184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
615	NC_010717	CTTC	2	8	26232	26239	0 %	50 %	0 %	50 %	188574293
616	NC_010717	TTAT	2	8	26366	26373	25 %	75 %	0 %	0 %	188574293
617	NC_010717	TGC	2	6	26385	26390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574293
618	NC_010717	GGC	2	6	26415	26420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574293
619	NC_010717	TGA	2	6	26435	26440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188574293
620	NC_010717	CTG	2	6	26479	26484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574293
621	NC_010717	GC	3	6	26494	26499	0 %	0 %	50 %	50 %	188574293
622	NC_010717	GGC	2	6	26508	26513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574293
623	NC_010717	CAA	2	6	26554	26559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188574293
624	NC_010717	GCCCG	2	10	26581	26590	0 %	0 %	40 %	60 %	188574293
625	NC_010717	CGA	2	6	26592	26597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574293
626	NC_010717	CCA	2	6	26622	26627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574293
627	NC_010717	CG	3	6	26631	26636	0 %	0 %	50 %	50 %	188574293
628	NC_010717	CGC	2	6	26672	26677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574293
629	NC_010717	CAG	2	6	26713	26718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574293
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631	NC_010717	GCCC	2	8	26805	26812	0 %	0 %	25 %	75 %	188574293
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