MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 124176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010717	CGGTG	2	10	251598	251607	0 %	20 %	60 %	20 %	188574515
6002	NC_010717	CTG	2	6	251634	251639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574515
6003	NC_010717	CG	3	6	251640	251645	0 %	0 %	50 %	50 %	188574515
6004	NC_010717	GT	3	6	251655	251660	0 %	50 %	50 %	0 %	188574515
6005	NC_010717	GTGG	2	8	251666	251673	0 %	25 %	75 %	0 %	188574515
6006	NC_010717	CTT	2	6	251754	251759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574515
6007	NC_010717	CGC	2	6	251901	251906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574515
6008	NC_010717	GCT	2	6	251907	251912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574515
6009	NC_010717	GCG	2	6	251982	251987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574515
6010	NC_010717	GCCG	2	8	252004	252011	0 %	0 %	50 %	50 %	188574515
6011	NC_010717	CG	3	6	252027	252032	0 %	0 %	50 %	50 %	188574515
6012	NC_010717	CG	4	8	252081	252088	0 %	0 %	50 %	50 %	188574515
6013	NC_010717	TGG	2	6	252107	252112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574515
6014	NC_010717	CATG	2	8	252156	252163	25 %	25 %	25 %	25 %	188574515
6015	NC_010717	CGA	2	6	252189	252194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574515
6016	NC_010717	ATT	2	6	252262	252267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188574515
6017	NC_010717	GCT	2	6	252318	252323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574515
6018	NC_010717	CG	3	6	252363	252368	0 %	0 %	50 %	50 %	188574515
6019	NC_010717	CGG	2	6	252375	252380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574515
6020	NC_010717	CGG	2	6	252393	252398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574515
6021	NC_010717	A	6	6	252463	252468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_010717	AC	3	6	252479	252484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_010717	ACG	2	6	252579	252584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574516
6024	NC_010717	TGT	2	6	252661	252666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574516
6025	NC_010717	ACC	2	6	252741	252746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188574516
6026	NC_010717	GCC	2	6	252797	252802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574516
6027	NC_010717	CGG	2	6	252824	252829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574516
6028	NC_010717	ATCG	2	8	252953	252960	25 %	25 %	25 %	25 %	188574516
6029	NC_010717	GCC	2	6	252984	252989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574516
6030	NC_010717	TCG	2	6	253050	253055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574516
6031	NC_010717	GC	4	8	253070	253077	0 %	0 %	50 %	50 %	188574516
6032	NC_010717	ACA	2	6	253141	253146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188574516
6033	NC_010717	GCT	2	6	253154	253159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574516
6034	NC_010717	GTT	2	6	253162	253167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574516
6035	NC_010717	TCA	2	6	253279	253284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188574516
6036	NC_010717	TTG	3	9	253392	253400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574516
6037	NC_010717	GGC	2	6	253523	253528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574516
6038	NC_010717	CGC	2	6	253559	253564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574516
6039	NC_010717	GCT	2	6	253585	253590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574516
6040	NC_010717	CGGC	2	8	253614	253621	0 %	0 %	50 %	50 %	188574516
6041	NC_010717	GCA	2	6	253630	253635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574516
6042	NC_010717	GAA	2	6	253652	253657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574516
6043	NC_010717	GCG	2	6	253678	253683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574516
6044	NC_010717	GTT	2	6	253709	253714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574516
6045	NC_010717	TCG	2	6	253794	253799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574516
6046	NC_010717	GTC	2	6	253913	253918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574516
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6048	NC_010717	TAACT	2	10	254043	254052	40 %	40 %	0 %	20 %	188574516
6049	NC_010717	GAGC	2	8	254060	254067	25 %	0 %	50 %	25 %	188574516
6050	NC_010717	CG	3	6	254074	254079	0 %	0 %	50 %	50 %	188574516
6051	NC_010717	GT	3	6	254121	254126	0 %	50 %	50 %	0 %	188574516
6052	NC_010717	CGC	2	6	254206	254211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574516
6053	NC_010717	GGT	2	6	254330	254335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188574516
6054	NC_010717	GAT	2	6	254336	254341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188574516
6055	NC_010717	TGC	2	6	254370	254375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574516
6056	NC_010717	TTG	2	6	254400	254405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574516
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6058	NC_010717	GCC	2	6	254438	254443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574516
6059	NC_010717	TCG	2	6	254463	254468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188574516
6060	NC_010717	CAA	2	6	254591	254596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188574516
6061	NC_010717	CGA	2	6	254599	254604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574516
6062	NC_010717	GAA	3	9	254669	254677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574516
6063	NC_010717	ATGC	2	8	254678	254685	25 %	25 %	25 %	25 %	188574516
6064	NC_010717	GCC	2	6	254702	254707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574516
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6070	NC_010717	TGA	2	6	254896	254901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188574516
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6081	NC_010717	CGGTG	2	10	255568	255577	0 %	20 %	60 %	20 %	188574516
6082	NC_010717	TTC	2	6	255579	255584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188574516
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6085	NC_010717	CAA	2	6	255666	255671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_010717	CAA	3	9	255684	255692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_010717	TGCT	2	8	255710	255717	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6088	NC_010717	GGC	2	6	255751	255756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_010717	GCA	2	6	255845	255850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6092	NC_010717	CGG	2	6	255921	255926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574517
6093	NC_010717	GC	3	6	255958	255963	0 %	0 %	50 %	50 %	188574517
6094	NC_010717	GCC	2	6	255975	255980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574517
6095	NC_010717	CATG	2	8	256073	256080	25 %	25 %	25 %	25 %	188574517
6096	NC_010717	GCC	2	6	256143	256148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574517
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6102	NC_010717	CAG	2	6	256515	256520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188574517
6103	NC_010717	CGG	2	6	256533	256538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188574517
6104	NC_010717	TG	3	6	256555	256560	0 %	50 %	50 %	0 %	188574517
6105	NC_010717	GAA	2	6	256569	256574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188574517
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6107	NC_010717	GTT	2	6	256719	256724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188574517
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6112	NC_010717	GTCGG	2	10	257107	257116	0 %	20 %	60 %	20 %	188574517
6113	NC_010717	GCC	2	6	257134	257139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574517
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6120	NC_010717	AGGTC	2	10	257474	257483	20 %	20 %	40 %	20 %	188574517
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6122	NC_010717	CGC	2	6	257573	257578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188574517
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6497	NC_010717	ACC	2	6	273153	273158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6498	NC_010717	TCG	2	6	273162	273167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6499	NC_010717	CAGGCC	2	12	273178	273189	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6500	NC_010717	GCC	3	9	273192	273200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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