MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa M23 chromosome

Total Repeats: 7236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010577	CTCG	2	8	394	401	0 %	25 %	25 %	50 %	182680573
2	NC_010577	TTCG	2	8	554	561	0 %	50 %	25 %	25 %	182680573
3	NC_010577	ATTG	2	8	648	655	25 %	50 %	25 %	0 %	182680573
4	NC_010577	CGAT	2	8	830	837	25 %	25 %	25 %	25 %	182680573
5	NC_010577	CTGA	2	8	1201	1208	25 %	25 %	25 %	25 %	182680573
6	NC_010577	AAAT	2	8	1399	1406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010577	ATTG	2	8	2342	2349	25 %	50 %	25 %	0 %	182680574
8	NC_010577	TTTA	2	8	2889	2896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010577	TTTC	2	8	3097	3104	0 %	75 %	0 %	25 %	182680575
10	NC_010577	TAAT	2	8	3279	3286	50 %	50 %	0 %	0 %	182680575
11	NC_010577	AGAA	2	8	3552	3559	75 %	0 %	25 %	0 %	182680575
12	NC_010577	ATGG	2	8	3720	3727	25 %	25 %	50 %	0 %	182680575
13	NC_010577	TTGA	2	8	3746	3753	25 %	50 %	25 %	0 %	182680575
14	NC_010577	TTTA	2	8	3757	3764	25 %	75 %	0 %	0 %	182680575
15	NC_010577	AGAA	2	8	4408	4415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010577	GATA	2	8	4545	4552	50 %	25 %	25 %	0 %	182680576
17	NC_010577	GTCT	2	8	4867	4874	0 %	50 %	25 %	25 %	182680577
18	NC_010577	TCCT	2	8	5246	5253	0 %	50 %	0 %	50 %	182680577
19	NC_010577	AGTT	2	8	5269	5276	25 %	50 %	25 %	0 %	182680577
20	NC_010577	TGAT	2	8	5277	5284	25 %	50 %	25 %	0 %	182680577
21	NC_010577	ATTG	2	8	6226	6233	25 %	50 %	25 %	0 %	182680577
22	NC_010577	CAAT	2	8	6803	6810	50 %	25 %	0 %	25 %	182680577
23	NC_010577	CAGT	2	8	7327	7334	25 %	25 %	25 %	25 %	182680578
24	NC_010577	ATTG	2	8	7383	7390	25 %	50 %	25 %	0 %	182680578
25	NC_010577	TTTG	2	8	7623	7630	0 %	75 %	25 %	0 %	182680578
26	NC_010577	GACT	2	8	8541	8548	25 %	25 %	25 %	25 %	182680579
27	NC_010577	TTTC	2	8	8903	8910	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010577	TGGC	2	8	9136	9143	0 %	25 %	50 %	25 %	182680580
29	NC_010577	ATCA	2	8	9367	9374	50 %	25 %	0 %	25 %	182680580
30	NC_010577	AGCA	2	8	9544	9551	50 %	0 %	25 %	25 %	182680580
31	NC_010577	AAAG	2	8	9573	9580	75 %	0 %	25 %	0 %	182680580
32	NC_010577	TTTA	2	8	10255	10262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010577	CAAT	2	8	10391	10398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010577	TGTC	2	8	11097	11104	0 %	50 %	25 %	25 %	182680581
35	NC_010577	GAAA	2	8	11190	11197	75 %	0 %	25 %	0 %	182680581
36	NC_010577	CGGA	2	8	11689	11696	25 %	0 %	50 %	25 %	182680582
37	NC_010577	TGGC	2	8	11924	11931	0 %	25 %	50 %	25 %	182680582
38	NC_010577	CCAA	3	12	12864	12875	50 %	0 %	0 %	50 %	182680584
39	NC_010577	AATC	2	8	12987	12994	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010577	ATAC	2	8	13129	13136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010577	AAAG	2	8	13301	13308	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010577	TCTA	2	8	14371	14378	25 %	50 %	0 %	25 %	182680585
43	NC_010577	GTAC	2	8	14526	14533	25 %	25 %	25 %	25 %	182680585
44	NC_010577	TGTA	2	8	15059	15066	25 %	50 %	25 %	0 %	182680585
45	NC_010577	CAAC	2	8	15238	15245	50 %	0 %	0 %	50 %	182680585
46	NC_010577	GGTG	2	8	15761	15768	0 %	25 %	75 %	0 %	182680585
47	NC_010577	CACC	2	8	16016	16023	25 %	0 %	0 %	75 %	182680585
48	NC_010577	CTGG	2	8	17155	17162	0 %	25 %	50 %	25 %	182680587
49	NC_010577	GCGT	2	8	17598	17605	0 %	25 %	50 %	25 %	182680587
50	NC_010577	GGCG	2	8	17683	17690	0 %	0 %	75 %	25 %	182680587
51	NC_010577	CTAT	2	8	17784	17791	25 %	50 %	0 %	25 %	182680587
52	NC_010577	CTGG	2	8	17802	17809	0 %	25 %	50 %	25 %	182680587
53	NC_010577	GCAG	2	8	18027	18034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010577	TCCT	2	8	18137	18144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010577	CTGC	2	8	18299	18306	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010577	CAAT	2	8	18676	18683	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010577	GTGG	2	8	19603	19610	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010577	TCAG	2	8	19895	19902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010577	GTCA	2	8	20486	20493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010577	CAAC	2	8	20652	20659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010577	AGTT	2	8	21456	21463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010577	GTCT	2	8	21546	21553	0 %	50 %	25 %	25 %	182680589
63	NC_010577	GAGC	2	8	21568	21575	25 %	0 %	50 %	25 %	182680589
64	NC_010577	ATCA	2	8	21800	21807	50 %	25 %	0 %	25 %	182680589
65	NC_010577	TGGC	2	8	21843	21850	0 %	25 %	50 %	25 %	182680589
66	NC_010577	ATTG	2	8	21860	21867	25 %	50 %	25 %	0 %	182680589
67	NC_010577	CCAA	2	8	22283	22290	50 %	0 %	0 %	50 %	182680589
68	NC_010577	AGTT	2	8	23922	23929	25 %	50 %	25 %	0 %	182680591
69	NC_010577	TATG	2	8	24210	24217	25 %	50 %	25 %	0 %	182680591
70	NC_010577	GCAA	2	8	24347	24354	50 %	0 %	25 %	25 %	182680592
71	NC_010577	TATT	2	8	24399	24406	25 %	75 %	0 %	0 %	182680592
72	NC_010577	TCTG	2	8	25176	25183	0 %	50 %	25 %	25 %	182680593
73	NC_010577	CACT	2	8	25374	25381	25 %	25 %	0 %	50 %	182680593
74	NC_010577	ACAG	2	8	25786	25793	50 %	0 %	25 %	25 %	182680594
75	NC_010577	TTAA	2	8	26341	26348	50 %	50 %	0 %	0 %	182680594
76	NC_010577	TTGA	2	8	27239	27246	25 %	50 %	25 %	0 %	182680595
77	NC_010577	TGAA	2	8	27579	27586	50 %	25 %	25 %	0 %	182680595
78	NC_010577	TGCC	2	8	27646	27653	0 %	25 %	25 %	50 %	182680595
79	NC_010577	CAAC	2	8	28011	28018	50 %	0 %	0 %	50 %	182680595
80	NC_010577	TGCC	2	8	28056	28063	0 %	25 %	25 %	50 %	182680595
81	NC_010577	GCGG	2	8	28159	28166	0 %	0 %	75 %	25 %	182680595
82	NC_010577	AGCC	2	8	28204	28211	25 %	0 %	25 %	50 %	182680595
83	NC_010577	TACC	2	8	28303	28310	25 %	25 %	0 %	50 %	182680595
84	NC_010577	ATTA	2	8	28517	28524	50 %	50 %	0 %	0 %	182680595
85	NC_010577	GACC	2	8	28969	28976	25 %	0 %	25 %	50 %	182680595
86	NC_010577	CCAG	2	8	29220	29227	25 %	0 %	25 %	50 %	182680595
87	NC_010577	GCGT	2	8	29425	29432	0 %	25 %	50 %	25 %	182680595
88	NC_010577	AGTG	2	8	30884	30891	25 %	25 %	50 %	0 %	182680597
89	NC_010577	GCCA	2	8	31303	31310	25 %	0 %	25 %	50 %	182680597
90	NC_010577	AATA	3	12	31802	31813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010577	TCGA	2	8	32025	32032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010577	GGGC	2	8	32594	32601	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_010577	TGTT	2	8	32611	32618	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010577	TATT	2	8	32834	32841	25 %	75 %	0 %	0 %	182680598
95	NC_010577	ACGC	2	8	33644	33651	25 %	0 %	25 %	50 %	182680598
96	NC_010577	TGCG	2	8	33697	33704	0 %	25 %	50 %	25 %	182680598
97	NC_010577	TGCG	2	8	34272	34279	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010577	GTTT	2	8	35624	35631	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010577	CGTG	2	8	35637	35644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010577	GTGA	2	8	35883	35890	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010577	GCAG	2	8	36390	36397	25 %	0 %	50 %	25 %	182680600
102	NC_010577	GGTG	2	8	36518	36525	0 %	25 %	75 %	0 %	182680600
103	NC_010577	CAGG	2	8	36533	36540	25 %	0 %	50 %	25 %	182680600
104	NC_010577	TTCT	2	8	37009	37016	0 %	75 %	0 %	25 %	182680600
105	NC_010577	GTTG	2	8	37269	37276	0 %	50 %	50 %	0 %	182680600
106	NC_010577	GGGT	2	8	37293	37300	0 %	25 %	75 %	0 %	182680600
107	NC_010577	GTGC	2	8	38091	38098	0 %	25 %	50 %	25 %	182680601
108	NC_010577	AGTG	2	8	38506	38513	25 %	25 %	50 %	0 %	182680601
109	NC_010577	GATT	2	8	38903	38910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010577	ATCA	2	8	38962	38969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010577	TGTC	2	8	39108	39115	0 %	50 %	25 %	25 %	182680602
112	NC_010577	TTGA	2	8	39643	39650	25 %	50 %	25 %	0 %	182680602
113	NC_010577	GTGA	2	8	39654	39661	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010577	AGGC	2	8	39683	39690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010577	GCTT	2	8	39800	39807	0 %	50 %	25 %	25 %	182680603
116	NC_010577	CAGC	2	8	39998	40005	25 %	0 %	25 %	50 %	182680603
117	NC_010577	GCGG	2	8	40172	40179	0 %	0 %	75 %	25 %	182680603
118	NC_010577	CGTT	2	8	40335	40342	0 %	50 %	25 %	25 %	182680603
119	NC_010577	TCAT	2	8	40357	40364	25 %	50 %	0 %	25 %	182680603
120	NC_010577	AGTG	2	8	41015	41022	25 %	25 %	50 %	0 %	182680603
121	NC_010577	GGGT	2	8	41111	41118	0 %	25 %	75 %	0 %	182680603
122	NC_010577	GTCG	2	8	41331	41338	0 %	25 %	50 %	25 %	182680603
123	NC_010577	GTGC	2	8	41778	41785	0 %	25 %	50 %	25 %	182680603
124	NC_010577	GTCG	2	8	42570	42577	0 %	25 %	50 %	25 %	182680603
125	NC_010577	CAAG	2	8	42821	42828	50 %	0 %	25 %	25 %	182680603
126	NC_010577	TTGC	2	8	43278	43285	0 %	50 %	25 %	25 %	182680603
127	NC_010577	TGCA	2	8	43636	43643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010577	GATA	2	8	43730	43737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010577	CTTT	2	8	43747	43754	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_010577	ACAT	2	8	43824	43831	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010577	TTGA	2	8	44091	44098	25 %	50 %	25 %	0 %	182680604
132	NC_010577	GGAG	2	8	44333	44340	25 %	0 %	75 %	0 %	182680604
133	NC_010577	TCCA	2	8	46044	46051	25 %	25 %	0 %	50 %	182680606
134	NC_010577	GAAT	2	8	46403	46410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010577	ACCA	2	8	46551	46558	50 %	0 %	0 %	50 %	182680607
136	NC_010577	TTCG	2	8	47263	47270	0 %	50 %	25 %	25 %	182680607
137	NC_010577	TGGT	2	8	47283	47290	0 %	50 %	50 %	0 %	182680607
138	NC_010577	GGCG	2	8	47689	47696	0 %	0 %	75 %	25 %	182680607
139	NC_010577	GGGA	2	8	48290	48297	25 %	0 %	75 %	0 %	182680607
140	NC_010577	TGGG	2	8	48543	48550	0 %	25 %	75 %	0 %	182680607
141	NC_010577	ATTC	2	8	48736	48743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010577	AATT	2	8	49121	49128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010577	ATGC	2	8	49215	49222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010577	GTGA	2	8	49259	49266	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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