MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa M12 chromosome

Total Repeats: 7033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010513	CTCG	2	8	389	396	0 %	25 %	25 %	50 %	170729252
2	NC_010513	TTCG	2	8	549	556	0 %	50 %	25 %	25 %	170729252
3	NC_010513	ATTG	2	8	643	650	25 %	50 %	25 %	0 %	170729252
4	NC_010513	CGAT	2	8	825	832	25 %	25 %	25 %	25 %	170729252
5	NC_010513	CTGA	2	8	1196	1203	25 %	25 %	25 %	25 %	170729252
6	NC_010513	GCCG	2	8	1235	1242	0 %	0 %	50 %	50 %	170729252
7	NC_010513	AAAT	2	8	1396	1403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010513	ATTG	2	8	2341	2348	25 %	50 %	25 %	0 %	170729253
9	NC_010513	ATTT	2	8	2881	2888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010513	TTTC	2	8	3094	3101	0 %	75 %	0 %	25 %	170729254
11	NC_010513	TAAT	2	8	3276	3283	50 %	50 %	0 %	0 %	170729254
12	NC_010513	AGAA	2	8	3549	3556	75 %	0 %	25 %	0 %	170729254
13	NC_010513	ATGG	2	8	3717	3724	25 %	25 %	50 %	0 %	170729254
14	NC_010513	TTGA	2	8	3743	3750	25 %	50 %	25 %	0 %	170729254
15	NC_010513	TTTA	2	8	3754	3761	25 %	75 %	0 %	0 %	170729254
16	NC_010513	TTCT	2	8	3948	3955	0 %	75 %	0 %	25 %	170729254
17	NC_010513	AGAA	2	8	4414	4421	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010513	GATA	2	8	4559	4566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010513	GTCT	2	8	4881	4888	0 %	50 %	25 %	25 %	170729255
20	NC_010513	TCCT	2	8	5260	5267	0 %	50 %	0 %	50 %	170729255
21	NC_010513	AGTT	2	8	5283	5290	25 %	50 %	25 %	0 %	170729255
22	NC_010513	TGAT	2	8	5291	5298	25 %	50 %	25 %	0 %	170729255
23	NC_010513	ATTG	2	8	6240	6247	25 %	50 %	25 %	0 %	170729255
24	NC_010513	CAAT	2	8	6817	6824	50 %	25 %	0 %	25 %	170729255
25	NC_010513	CAGT	2	8	7341	7348	25 %	25 %	25 %	25 %	170729256
26	NC_010513	ATTG	2	8	7397	7404	25 %	50 %	25 %	0 %	170729256
27	NC_010513	TTGC	2	8	7560	7567	0 %	50 %	25 %	25 %	170729256
28	NC_010513	TTTG	2	8	7637	7644	0 %	75 %	25 %	0 %	170729256
29	NC_010513	GACT	2	8	8555	8562	25 %	25 %	25 %	25 %	170729257
30	NC_010513	TTTC	2	8	8916	8923	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010513	AAAT	2	8	8929	8936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010513	TGGC	2	8	9149	9156	0 %	25 %	50 %	25 %	170729258
33	NC_010513	ATCA	2	8	9380	9387	50 %	25 %	0 %	25 %	170729258
34	NC_010513	AGCA	2	8	9557	9564	50 %	0 %	25 %	25 %	170729258
35	NC_010513	AAAG	2	8	9586	9593	75 %	0 %	25 %	0 %	170729258
36	NC_010513	TTTA	2	8	10268	10275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010513	CAAT	2	8	10406	10413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010513	GAAA	2	8	11205	11212	75 %	0 %	25 %	0 %	170729259
39	NC_010513	GCTC	2	8	12530	12537	0 %	25 %	25 %	50 %	170729261
40	NC_010513	CCAA	3	12	12888	12899	50 %	0 %	0 %	50 %	170729262
41	NC_010513	AATC	2	8	13011	13018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010513	ATAC	2	8	13154	13161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010513	AAAG	2	8	13326	13333	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010513	TTGC	2	8	13991	13998	0 %	50 %	25 %	25 %	170729264
45	NC_010513	TCTA	2	8	14397	14404	25 %	50 %	0 %	25 %	170729264
46	NC_010513	GTAC	2	8	14552	14559	25 %	25 %	25 %	25 %	170729264
47	NC_010513	TGTA	2	8	15085	15092	25 %	50 %	25 %	0 %	170729264
48	NC_010513	CAAC	2	8	15264	15271	50 %	0 %	0 %	50 %	170729264
49	NC_010513	GGTG	2	8	15787	15794	0 %	25 %	75 %	0 %	170729264
50	NC_010513	CACC	2	8	16042	16049	25 %	0 %	0 %	75 %	170729264
51	NC_010513	ATTG	2	8	16818	16825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010513	CTGG	2	8	17180	17187	0 %	25 %	50 %	25 %	170729266
53	NC_010513	GCGT	2	8	17623	17630	0 %	25 %	50 %	25 %	170729266
54	NC_010513	GGCG	2	8	17708	17715	0 %	0 %	75 %	25 %	170729266
55	NC_010513	CTAT	2	8	17809	17816	25 %	50 %	0 %	25 %	170729266
56	NC_010513	CTGG	2	8	17827	17834	0 %	25 %	50 %	25 %	170729266
57	NC_010513	CTAG	2	8	17969	17976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010513	GCAG	2	8	18070	18077	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010513	TACA	2	8	18330	18337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010513	CAGA	2	8	18353	18360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010513	GATC	2	8	18365	18372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010513	CAAT	2	8	18727	18734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010513	GTGG	2	8	19556	19563	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010513	TCAG	2	8	19793	19800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010513	GTCA	2	8	20384	20391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010513	CAAC	2	8	20550	20557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010513	AGTT	2	8	21364	21371	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010513	GTCT	2	8	21455	21462	0 %	50 %	25 %	25 %	170729267
69	NC_010513	GAGC	2	8	21477	21484	25 %	0 %	50 %	25 %	170729267
70	NC_010513	ATCA	2	8	21709	21716	50 %	25 %	0 %	25 %	170729267
71	NC_010513	TGGC	2	8	21752	21759	0 %	25 %	50 %	25 %	170729267
72	NC_010513	ATTG	2	8	21769	21776	25 %	50 %	25 %	0 %	170729267
73	NC_010513	CCAA	2	8	22192	22199	50 %	0 %	0 %	50 %	170729267
74	NC_010513	AGTT	2	8	23831	23838	25 %	50 %	25 %	0 %	170729268
75	NC_010513	TATG	2	8	24119	24126	25 %	50 %	25 %	0 %	170729268
76	NC_010513	GCAA	2	8	24256	24263	50 %	0 %	25 %	25 %	170729269
77	NC_010513	TATT	2	8	24308	24315	25 %	75 %	0 %	0 %	170729269
78	NC_010513	TCTG	2	8	25085	25092	0 %	50 %	25 %	25 %	170729270
79	NC_010513	CACT	2	8	25283	25290	25 %	25 %	0 %	50 %	170729270
80	NC_010513	ACAG	2	8	25695	25702	50 %	0 %	25 %	25 %	170729271
81	NC_010513	TTAA	2	8	26250	26257	50 %	50 %	0 %	0 %	170729271
82	NC_010513	TTGA	2	8	27148	27155	25 %	50 %	25 %	0 %	170729272
83	NC_010513	TGAA	2	8	27488	27495	50 %	25 %	25 %	0 %	170729272
84	NC_010513	TGCC	2	8	27555	27562	0 %	25 %	25 %	50 %	170729272
85	NC_010513	CAAC	2	8	27920	27927	50 %	0 %	0 %	50 %	170729272
86	NC_010513	TGCC	2	8	27965	27972	0 %	25 %	25 %	50 %	170729272
87	NC_010513	GCGG	2	8	28062	28069	0 %	0 %	75 %	25 %	170729272
88	NC_010513	AGCC	2	8	28107	28114	25 %	0 %	25 %	50 %	170729272
89	NC_010513	TACC	2	8	28206	28213	25 %	25 %	0 %	50 %	170729272
90	NC_010513	ATTA	2	8	28420	28427	50 %	50 %	0 %	0 %	170729272
91	NC_010513	GACC	2	8	28872	28879	25 %	0 %	25 %	50 %	170729272
92	NC_010513	CCAG	2	8	29123	29130	25 %	0 %	25 %	50 %	170729272
93	NC_010513	AGTG	2	8	30804	30811	25 %	25 %	50 %	0 %	170729274
94	NC_010513	GCCA	2	8	31223	31230	25 %	0 %	25 %	50 %	170729274
95	NC_010513	AATA	3	12	31722	31733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010513	TGTT	2	8	32532	32539	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010513	TATT	2	8	32755	32762	25 %	75 %	0 %	0 %	170729275
98	NC_010513	TGCG	2	8	33618	33625	0 %	25 %	50 %	25 %	170729275
99	NC_010513	TGCG	2	8	34192	34199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010513	GTTT	2	8	35536	35543	0 %	75 %	25 %	0 %	170729279
101	NC_010513	CGTG	2	8	35549	35556	0 %	25 %	50 %	25 %	170729279
102	NC_010513	GATC	2	8	35835	35842	25 %	25 %	25 %	25 %	170729280
103	NC_010513	TTCT	2	8	36006	36013	0 %	75 %	0 %	25 %	170729280
104	NC_010513	GAGT	2	8	36090	36097	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010513	GCAG	2	8	36305	36312	25 %	0 %	50 %	25 %	170729281
106	NC_010513	GGTG	2	8	36433	36440	0 %	25 %	75 %	0 %	170729281
107	NC_010513	CAGG	2	8	36448	36455	25 %	0 %	50 %	25 %	170729281
108	NC_010513	TTCT	2	8	36924	36931	0 %	75 %	0 %	25 %	170729281
109	NC_010513	TGGG	2	8	37024	37031	0 %	25 %	75 %	0 %	170729281
110	NC_010513	GTTG	2	8	37184	37191	0 %	50 %	50 %	0 %	170729281
111	NC_010513	GTGC	2	8	38007	38014	0 %	25 %	50 %	25 %	170729282
112	NC_010513	AGTG	2	8	38422	38429	25 %	25 %	50 %	0 %	170729282
113	NC_010513	GATT	2	8	38819	38826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010513	ATCA	2	8	38878	38885	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010513	TGTC	2	8	39024	39031	0 %	50 %	25 %	25 %	170729283
116	NC_010513	TTGA	2	8	39559	39566	25 %	50 %	25 %	0 %	170729283
117	NC_010513	GTGA	2	8	39570	39577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010513	AGGC	2	8	39599	39606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010513	GCTT	2	8	39716	39723	0 %	50 %	25 %	25 %	170729284
120	NC_010513	CAGC	2	8	39914	39921	25 %	0 %	25 %	50 %	170729284
121	NC_010513	GCGG	2	8	40088	40095	0 %	0 %	75 %	25 %	170729284
122	NC_010513	AGTG	2	8	40931	40938	25 %	25 %	50 %	0 %	170729284
123	NC_010513	GGGT	2	8	41021	41028	0 %	25 %	75 %	0 %	170729284
124	NC_010513	GTCG	2	8	41241	41248	0 %	25 %	50 %	25 %	170729284
125	NC_010513	GTGC	2	8	41688	41695	0 %	25 %	50 %	25 %	170729284
126	NC_010513	GTCG	2	8	42480	42487	0 %	25 %	50 %	25 %	170729284
127	NC_010513	CAAG	2	8	42731	42738	50 %	0 %	25 %	25 %	170729284
128	NC_010513	TTGC	2	8	43188	43195	0 %	50 %	25 %	25 %	170729284
129	NC_010513	TGCA	2	8	43546	43553	25 %	25 %	25 %	25 %	170729285
130	NC_010513	GATA	2	8	43640	43647	50 %	25 %	25 %	0 %	170729285
131	NC_010513	ACAT	2	8	43734	43741	50 %	25 %	0 %	25 %	170729285
132	NC_010513	TTGA	2	8	44001	44008	25 %	50 %	25 %	0 %	170729285
133	NC_010513	GGAG	2	8	44243	44250	25 %	0 %	75 %	0 %	170729285
134	NC_010513	GGTT	2	8	45410	45417	0 %	50 %	50 %	0 %	170729287
135	NC_010513	TCCA	2	8	45955	45962	25 %	25 %	0 %	50 %	170729287
136	NC_010513	GAAT	2	8	46314	46321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010513	GTCG	2	8	46349	46356	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010513	TGTC	2	8	46428	46435	0 %	50 %	25 %	25 %	170729288
139	NC_010513	ACCA	2	8	46466	46473	50 %	0 %	0 %	50 %	170729288
140	NC_010513	GTCG	2	8	46830	46837	0 %	25 %	50 %	25 %	170729288
141	NC_010513	TTCG	2	8	47178	47185	0 %	50 %	25 %	25 %	170729288
142	NC_010513	TGGT	2	8	47198	47205	0 %	50 %	50 %	0 %	170729288
143	NC_010513	GGCG	2	8	47604	47611	0 %	0 %	75 %	25 %	170729288
144	NC_010513	GGGA	2	8	48205	48212	25 %	0 %	75 %	0 %	170729288
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