MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa M12 chromosome

Total Repeats: 51845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010513	CAG	2	6	194598	194603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729393
4002	NC_010513	CGG	2	6	194642	194647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729393
4003	NC_010513	TGCC	2	8	194650	194657	0 %	25 %	25 %	50 %	170729393
4004	NC_010513	TGCAT	2	10	194663	194672	20 %	40 %	20 %	20 %	170729393
4005	NC_010513	ACCA	2	8	194801	194808	50 %	0 %	0 %	50 %	170729393
4006	NC_010513	TCC	2	6	194831	194836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170729393
4007	NC_010513	ACA	2	6	194862	194867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729393
4008	NC_010513	GAT	2	6	194905	194910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729393
4009	NC_010513	CTG	2	6	195063	195068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729393
4010	NC_010513	TGC	2	6	195099	195104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729394
4011	NC_010513	GCA	2	6	195134	195139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729394
4012	NC_010513	TCT	2	6	195184	195189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170729394
4013	NC_010513	TCG	2	6	195193	195198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729394
4014	NC_010513	GTA	2	6	195284	195289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729394
4015	NC_010513	CCT	3	9	195317	195325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170729394
4016	NC_010513	CAG	2	6	195410	195415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729394
4017	NC_010513	AGT	2	6	195451	195456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729394
4018	NC_010513	CAC	3	9	195459	195467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170729394
4019	NC_010513	GCT	2	6	195539	195544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729394
4020	NC_010513	GCC	2	6	195545	195550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729394
4021	NC_010513	ATC	2	6	195586	195591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729394
4022	NC_010513	CAGA	2	8	195611	195618	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4023	NC_010513	TCA	2	6	195664	195669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729395
4024	NC_010513	AC	3	6	195777	195782	50 %	0 %	0 %	50 %	170729395
4025	NC_010513	GTG	2	6	195804	195809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729395
4026	NC_010513	TGGT	2	8	195818	195825	0 %	50 %	50 %	0 %	170729395
4027	NC_010513	CGT	2	6	195839	195844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729395
4028	NC_010513	CAG	2	6	195859	195864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729395
4029	NC_010513	TGG	2	6	195866	195871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729395
4030	NC_010513	GCA	2	6	195908	195913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729395
4031	NC_010513	CGC	2	6	195916	195921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729395
4032	NC_010513	CGG	2	6	195972	195977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729395
4033	NC_010513	TTG	2	6	195995	196000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729395
4034	NC_010513	CGCGC	2	10	196006	196015	0 %	0 %	40 %	60 %	170729395
4035	NC_010513	GTG	2	6	196116	196121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729395
4036	NC_010513	GCC	2	6	196313	196318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729395
4037	NC_010513	GC	3	6	196362	196367	0 %	0 %	50 %	50 %	170729395
4038	NC_010513	GCATGC	2	12	196401	196412	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170729395
4039	NC_010513	TGA	2	6	196558	196563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729395
4040	NC_010513	CAT	2	6	196576	196581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729395
4041	NC_010513	TGT	2	6	196590	196595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729395
4042	NC_010513	GGT	2	6	196616	196621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729395
4043	NC_010513	GCA	2	6	196651	196656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729395
4044	NC_010513	CA	3	6	196707	196712	50 %	0 %	0 %	50 %	170729395
4045	NC_010513	CAT	2	6	196780	196785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729395
4046	NC_010513	GCA	2	6	196805	196810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729395
4047	NC_010513	CAA	2	6	196909	196914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729395
4048	NC_010513	GGCTT	2	10	196941	196950	0 %	40 %	40 %	20 %	170729395
4049	NC_010513	TGC	2	6	196963	196968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729395
4050	NC_010513	GAG	2	6	197039	197044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729395
4051	NC_010513	TGCT	2	8	197055	197062	0 %	50 %	25 %	25 %	170729395
4052	NC_010513	TGTCA	2	10	197113	197122	20 %	40 %	20 %	20 %	170729396
4053	NC_010513	TCC	2	6	197153	197158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170729396
4054	NC_010513	ACC	2	6	197174	197179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170729396
4055	NC_010513	TGC	2	6	197189	197194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729396
4056	NC_010513	ATT	2	6	197243	197248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729396
4057	NC_010513	GC	3	6	197287	197292	0 %	0 %	50 %	50 %	170729396
4058	NC_010513	GT	3	6	197311	197316	0 %	50 %	50 %	0 %	170729396
4059	NC_010513	CAC	2	6	197324	197329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170729396
4060	NC_010513	AAC	2	6	197491	197496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729396
4061	NC_010513	CG	3	6	197531	197536	0 %	0 %	50 %	50 %	170729396
4062	NC_010513	TGGT	2	8	197694	197701	0 %	50 %	50 %	0 %	170729396
4063	NC_010513	CAG	2	6	197780	197785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729396
4064	NC_010513	TGAT	2	8	197839	197846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_010513	GGC	2	6	197872	197877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_010513	TGC	2	6	197894	197899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_010513	TGA	2	6	197966	197971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_010513	GAT	2	6	197972	197977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_010513	CAC	2	6	198021	198026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_010513	ATGA	2	8	198067	198074	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_010513	TTA	2	6	198093	198098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_010513	GATTTT	2	12	198101	198112	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_010513	T	10	10	198135	198144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_010513	CAT	2	6	198234	198239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_010513	TTC	2	6	198293	198298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_010513	GAT	2	6	198319	198324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_010513	AGA	2	6	198413	198418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_010513	ATG	2	6	198425	198430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_010513	T	6	6	198666	198671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_010513	AGT	2	6	198677	198682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_010513	TG	3	6	198683	198688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_010513	GAT	2	6	198727	198732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_010513	ATC	2	6	198754	198759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_010513	GTA	2	6	198760	198765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_010513	ATT	2	6	198832	198837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_010513	ATG	2	6	198840	198845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_010513	TC	3	6	198858	198863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_010513	ATGG	2	8	198884	198891	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_010513	CTT	2	6	198892	198897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_010513	T	6	6	198929	198934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_010513	TCT	2	6	198946	198951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_010513	T	6	6	198982	198987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_010513	TGG	2	6	199083	199088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_010513	TGA	2	6	199111	199116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_010513	CAC	2	6	199161	199166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_010513	GC	3	6	199250	199255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4097	NC_010513	TGC	2	6	199305	199310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_010513	TTA	2	6	199319	199324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_010513	GCAAGT	2	12	199395	199406	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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4101	NC_010513	TTG	2	6	199448	199453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729397
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4103	NC_010513	CAG	3	9	199508	199516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729397
4104	NC_010513	TGCT	2	8	199548	199555	0 %	50 %	25 %	25 %	170729397
4105	NC_010513	TGG	2	6	199753	199758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729397
4106	NC_010513	TGGGGA	2	12	199761	199772	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	170729397
4107	NC_010513	TGC	2	6	199785	199790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729397
4108	NC_010513	TGCC	2	8	199813	199820	0 %	25 %	25 %	50 %	170729397
4109	NC_010513	TGAT	2	8	199830	199837	25 %	50 %	25 %	0 %	170729397
4110	NC_010513	TCC	2	6	199920	199925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170729397
4111	NC_010513	CTG	2	6	199976	199981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729397
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4114	NC_010513	TTG	3	9	200129	200137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729397
4115	NC_010513	GCG	2	6	200243	200248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729397
4116	NC_010513	TAA	2	6	200257	200262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170729397
4117	NC_010513	TGG	2	6	200322	200327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729397
4118	NC_010513	TGC	2	6	200338	200343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729397
4119	NC_010513	GC	3	6	200342	200347	0 %	0 %	50 %	50 %	170729397
4120	NC_010513	TGG	2	6	200397	200402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729397
4121	NC_010513	GCATC	2	10	200416	200425	20 %	20 %	20 %	40 %	170729397
4122	NC_010513	AGG	2	6	200478	200483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729397
4123	NC_010513	AGC	2	6	200604	200609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729397
4124	NC_010513	CTG	2	6	200610	200615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729397
4125	NC_010513	CACC	2	8	200621	200628	25 %	0 %	0 %	75 %	170729397
4126	NC_010513	ACG	2	6	200675	200680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729397
4127	NC_010513	AACAA	2	10	200689	200698	80 %	0 %	0 %	20 %	170729397
4128	NC_010513	ACA	2	6	200707	200712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729397
4129	NC_010513	TCA	2	6	200752	200757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729397
4130	NC_010513	CAG	2	6	200793	200798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_010513	AGC	2	6	200877	200882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729398
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4134	NC_010513	CAT	2	6	201049	201054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729398
4135	NC_010513	TGC	2	6	201134	201139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729398
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4137	NC_010513	GTG	2	6	201194	201199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729398
4138	NC_010513	TCA	2	6	201211	201216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4139	NC_010513	TGG	2	6	201234	201239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_010513	GATT	2	8	201484	201491	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_010513	TG	3	6	201502	201507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_010513	GTT	2	6	201523	201528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_010513	TCT	2	6	201603	201608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4144	NC_010513	AGTC	2	8	201624	201631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4145	NC_010513	CA	3	6	201698	201703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4146	NC_010513	GTTG	2	8	201751	201758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_010513	TGT	2	6	201759	201764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_010513	TGT	2	6	201800	201805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_010513	GTT	2	6	201809	201814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4150	NC_010513	CAT	2	6	201831	201836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4151	NC_010513	GATGT	2	10	201841	201850	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_010513	GGC	2	6	201996	202001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729399
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4154	NC_010513	GTT	2	6	202071	202076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729399
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4157	NC_010513	TGA	2	6	202173	202178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4158	NC_010513	GTT	2	6	202223	202228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4159	NC_010513	TGA	2	6	202272	202277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4160	NC_010513	GCT	2	6	202283	202288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4162	NC_010513	T	6	6	202338	202343	0 %	100 %	0 %	0 %	170729400
4163	NC_010513	GCA	2	6	202353	202358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729400
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4173	NC_010513	CAT	2	6	202859	202864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4175	NC_010513	GAT	2	6	202919	202924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4176	NC_010513	TG	4	8	202981	202988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4177	NC_010513	TTG	2	6	203061	203066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4178	NC_010513	TG	3	6	203083	203088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4179	NC_010513	ATC	2	6	203212	203217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4180	NC_010513	GTGTT	2	10	203241	203250	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4181	NC_010513	GTTGC	2	10	203277	203286	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4182	NC_010513	ACCGA	2	10	203361	203370	40 %	0 %	20 %	40 %	170729401
4183	NC_010513	GATC	2	8	203390	203397	25 %	25 %	25 %	25 %	170729401
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4199	NC_010513	ATC	2	6	204021	204026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4201	NC_010513	TGG	2	6	204038	204043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4202	NC_010513	CGC	2	6	204055	204060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4203	NC_010513	GTT	2	6	204094	204099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4205	NC_010513	CTTG	2	8	204160	204167	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4206	NC_010513	TGC	2	6	204191	204196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4213	NC_010513	CTG	2	6	204487	204492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4215	NC_010513	TGA	2	6	204571	204576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4230	NC_010513	TGTCG	2	10	205720	205729	0 %	40 %	40 %	20 %	170729404
4231	NC_010513	GTTGC	2	10	205918	205927	0 %	40 %	40 %	20 %	170729404
4232	NC_010513	ACT	2	6	205954	205959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729404
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4234	NC_010513	TTTG	2	8	206129	206136	0 %	75 %	25 %	0 %	170729404
4235	NC_010513	ATC	2	6	206161	206166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729404
4236	NC_010513	CGATG	2	10	206198	206207	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4237	NC_010513	GCT	2	6	206312	206317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729405
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4243	NC_010513	TGT	3	9	206457	206465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729405
4244	NC_010513	CGA	2	6	206496	206501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729405
4245	NC_010513	GGTTG	2	10	206536	206545	0 %	40 %	60 %	0 %	170729405
4246	NC_010513	GGC	2	6	206606	206611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729405
4247	NC_010513	TGC	2	6	206613	206618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729405
4248	NC_010513	TGCGC	2	10	206629	206638	0 %	20 %	40 %	40 %	170729405
4249	NC_010513	TGGT	2	8	206681	206688	0 %	50 %	50 %	0 %	170729405
4250	NC_010513	TTCA	2	8	206714	206721	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4251	NC_010513	CGC	2	6	206787	206792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4252	NC_010513	GGC	2	6	206867	206872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4253	NC_010513	AGT	2	6	206970	206975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729406
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4272	NC_010513	CTG	2	6	207912	207917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4360	NC_010513	T	8	8	212928	212935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4361	NC_010513	GAT	2	6	212942	212947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4367	NC_010513	TCTT	2	8	213179	213186	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4373	NC_010513	GCG	2	6	213371	213376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729409
4374	NC_010513	GAT	2	6	213393	213398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729409
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4378	NC_010513	GCG	2	6	213713	213718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729410
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4386	NC_010513	GTGAT	2	10	214260	214269	20 %	40 %	40 %	0 %	170729410
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4389	NC_010513	CGT	2	6	214335	214340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4390	NC_010513	ACT	2	6	214386	214391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4392	NC_010513	TG	3	6	214507	214512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_010513	T	6	6	214514	214519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_010513	TG	3	6	214532	214537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4395	NC_010513	TTG	2	6	214557	214562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4396	NC_010513	GTT	2	6	214568	214573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4409	NC_010513	T	6	6	215141	215146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4450	NC_010513	CTG	2	6	217484	217489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4497	NC_010513	TGG	2	6	219816	219821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729416
4498	NC_010513	CAG	2	6	219827	219832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729416
4499	NC_010513	GGT	2	6	219835	219840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729416
4500	NC_010513	TTG	2	6	219885	219890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729416

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