MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa M12 chromosome

Total Repeats: 51845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010513	AGCC	2	8	146535	146542	25 %	0 %	25 %	50 %	170729359
3002	NC_010513	GTG	2	6	146558	146563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729359
3003	NC_010513	T	7	7	146608	146614	0 %	100 %	0 %	0 %	170729359
3004	NC_010513	TGG	3	9	146676	146684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729359
3005	NC_010513	GT	3	6	146715	146720	0 %	50 %	50 %	0 %	170729359
3006	NC_010513	TGT	2	6	146810	146815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729359
3007	NC_010513	GGTT	2	8	146821	146828	0 %	50 %	50 %	0 %	170729359
3008	NC_010513	TGG	2	6	146835	146840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729359
3009	NC_010513	CGT	2	6	146937	146942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729359
3010	NC_010513	AAT	2	6	146951	146956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170729359
3011	NC_010513	CGC	2	6	146989	146994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729359
3012	NC_010513	ATT	2	6	147028	147033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729359
3013	NC_010513	GC	3	6	147059	147064	0 %	0 %	50 %	50 %	170729359
3014	NC_010513	CTT	3	9	147091	147099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_010513	GT	3	6	147107	147112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_010513	TGCGT	2	10	147202	147211	0 %	40 %	40 %	20 %	170729360
3017	NC_010513	GT	3	6	147237	147242	0 %	50 %	50 %	0 %	170729360
3018	NC_010513	CAG	2	6	147307	147312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729360
3019	NC_010513	ATC	2	6	147356	147361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729360
3020	NC_010513	TGCG	2	8	147558	147565	0 %	25 %	50 %	25 %	170729360
3021	NC_010513	CTT	2	6	147654	147659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170729360
3022	NC_010513	CCA	2	6	147662	147667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170729360
3023	NC_010513	CGGG	2	8	147711	147718	0 %	0 %	75 %	25 %	170729360
3024	NC_010513	GTC	2	6	147895	147900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729360
3025	NC_010513	GCC	2	6	147931	147936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729360
3026	NC_010513	CTC	2	6	147937	147942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170729360
3027	NC_010513	TTC	2	6	147979	147984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170729360
3028	NC_010513	GTAG	2	8	148074	148081	25 %	25 %	50 %	0 %	170729360
3029	NC_010513	GTG	2	6	148093	148098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729360
3030	NC_010513	TGC	2	6	148102	148107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729360
3031	NC_010513	GTC	2	6	148111	148116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729360
3032	NC_010513	TGA	2	6	148134	148139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729360
3033	NC_010513	GCCA	2	8	148165	148172	25 %	0 %	25 %	50 %	170729360
3034	NC_010513	CGCGTG	2	12	148251	148262	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	170729360
3035	NC_010513	CGT	2	6	148302	148307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729360
3036	NC_010513	GCG	2	6	148379	148384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729360
3037	NC_010513	TGA	2	6	148542	148547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729360
3038	NC_010513	TGC	2	6	148597	148602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729360
3039	NC_010513	TGC	2	6	148632	148637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729360
3040	NC_010513	AGC	2	6	148652	148657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729360
3041	NC_010513	TAG	2	6	148734	148739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729360
3042	NC_010513	GTGGGT	2	12	148807	148818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_010513	GT	3	6	148817	148822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_010513	GATA	2	8	148826	148833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_010513	GCT	2	6	148888	148893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_010513	CCCA	2	8	148900	148907	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3047	NC_010513	AGCC	2	8	148937	148944	25 %	0 %	25 %	50 %	170729361
3048	NC_010513	CTA	2	6	148992	148997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729361
3049	NC_010513	CGA	2	6	149094	149099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729361
3050	NC_010513	CGT	2	6	149129	149134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729361
3051	NC_010513	TTC	2	6	149185	149190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170729361
3052	NC_010513	CG	3	6	149200	149205	0 %	0 %	50 %	50 %	170729361
3053	NC_010513	GGC	2	6	149320	149325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729361
3054	NC_010513	TGC	2	6	149353	149358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729361
3055	NC_010513	GGTC	2	8	149417	149424	0 %	25 %	50 %	25 %	170729361
3056	NC_010513	CAG	2	6	149425	149430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729361
3057	NC_010513	GCA	2	6	149454	149459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729361
3058	NC_010513	GGC	2	6	149542	149547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729361
3059	NC_010513	CAG	2	6	149557	149562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729361
3060	NC_010513	GTT	2	6	149593	149598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729361
3061	NC_010513	ATC	2	6	149657	149662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729361
3062	NC_010513	TAAT	2	8	149680	149687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_010513	TCA	2	6	149716	149721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729362
3064	NC_010513	TGT	2	6	149751	149756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729362
3065	NC_010513	GT	3	6	149755	149760	0 %	50 %	50 %	0 %	170729362
3066	NC_010513	GTG	2	6	149763	149768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729362
3067	NC_010513	TGC	2	6	149773	149778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729362
3068	NC_010513	GCA	2	6	149854	149859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729362
3069	NC_010513	CGC	2	6	149868	149873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729362
3070	NC_010513	CG	3	6	150010	150015	0 %	0 %	50 %	50 %	170729362
3071	NC_010513	GAT	2	6	150035	150040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729362
3072	NC_010513	GAC	2	6	150046	150051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729362
3073	NC_010513	TGT	2	6	150144	150149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729362
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3076	NC_010513	TTG	3	9	150240	150248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729362
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3078	NC_010513	GCA	2	6	150369	150374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729362
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3080	NC_010513	GGT	2	6	150427	150432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729362
3081	NC_010513	TGG	2	6	150435	150440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729362
3082	NC_010513	CGG	2	6	150495	150500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729362
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3084	NC_010513	TGGT	2	8	150696	150703	0 %	50 %	50 %	0 %	170729362
3085	NC_010513	ATG	2	6	150720	150725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729362
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3087	NC_010513	TGA	2	6	150817	150822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729362
3088	NC_010513	CTG	2	6	150899	150904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729362
3089	NC_010513	TGC	2	6	150936	150941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729363
3090	NC_010513	TG	3	6	151130	151135	0 %	50 %	50 %	0 %	170729363
3091	NC_010513	TGAT	2	8	151202	151209	25 %	50 %	25 %	0 %	170729363
3092	NC_010513	GTT	2	6	151227	151232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729363
3093	NC_010513	GTTG	2	8	151296	151303	0 %	50 %	50 %	0 %	170729363
3094	NC_010513	TTG	2	6	151346	151351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729363
3095	NC_010513	GGGT	2	8	151368	151375	0 %	25 %	75 %	0 %	170729363
3096	NC_010513	GCGT	2	8	151388	151395	0 %	25 %	50 %	25 %	170729363
3097	NC_010513	GGA	2	6	151400	151405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_010513	ACG	2	6	151453	151458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_010513	TGT	2	6	151482	151487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_010513	G	6	6	151515	151520	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_010513	TACA	2	8	151523	151530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3102	NC_010513	GCA	2	6	151549	151554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_010513	GAG	2	6	151724	151729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_010513	GCT	2	6	151757	151762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_010513	GC	3	6	151775	151780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_010513	GGC	2	6	151810	151815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_010513	CGG	2	6	151908	151913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_010513	ACTT	2	8	151982	151989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_010513	GGT	2	6	152014	152019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_010513	GTG	3	9	152046	152054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_010513	TGC	2	6	152142	152147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_010513	GCG	2	6	152183	152188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_010513	TGT	2	6	152193	152198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_010513	AGAACA	2	12	152254	152265	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3115	NC_010513	AGG	2	6	152292	152297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729364
3116	NC_010513	GC	3	6	152305	152310	0 %	0 %	50 %	50 %	170729364
3117	NC_010513	CGTTG	2	10	152335	152344	0 %	40 %	40 %	20 %	170729364
3118	NC_010513	TCG	3	9	152345	152353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729364
3119	NC_010513	CTGC	2	8	152637	152644	0 %	25 %	25 %	50 %	170729364
3120	NC_010513	GTTGC	2	10	152661	152670	0 %	40 %	40 %	20 %	170729364
3121	NC_010513	G	6	6	152678	152683	0 %	0 %	100 %	0 %	170729364
3122	NC_010513	CAT	2	6	152684	152689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729364
3123	NC_010513	TGG	2	6	152722	152727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729364
3124	NC_010513	TGAG	2	8	152814	152821	25 %	25 %	50 %	0 %	170729364
3125	NC_010513	GAT	2	6	152858	152863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729364
3126	NC_010513	TTG	2	6	152889	152894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729364
3127	NC_010513	GCCGAT	2	12	153062	153073	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170729364
3128	NC_010513	GTG	2	6	153113	153118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729364
3129	NC_010513	TGT	2	6	153159	153164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729364
3130	NC_010513	ATG	2	6	153210	153215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729364
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3132	NC_010513	TCC	2	6	153290	153295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170729364
3133	NC_010513	TCT	2	6	153354	153359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170729364
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3137	NC_010513	TGC	2	6	153457	153462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729364
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3153	NC_010513	T	6	6	154266	154271	0 %	100 %	0 %	0 %	170729365
3154	NC_010513	GGCA	2	8	154307	154314	25 %	0 %	50 %	25 %	170729365
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3157	NC_010513	GGCCAT	2	12	154389	154400	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170729365
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3160	NC_010513	T	6	6	154476	154481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3161	NC_010513	TCAG	2	8	154488	154495	25 %	25 %	25 %	25 %	170729366
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3181	NC_010513	ATG	2	6	155544	155549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3183	NC_010513	AGCA	2	8	155574	155581	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3184	NC_010513	ATGG	2	8	155582	155589	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3185	NC_010513	TGC	2	6	155640	155645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3191	NC_010513	ATT	2	6	155953	155958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3210	NC_010513	AATA	2	8	156715	156722	75 %	25 %	0 %	0 %	170729367
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3231	NC_010513	AT	4	8	157936	157943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3232	NC_010513	TGG	2	6	158138	158143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_010513	CTG	2	6	158213	158218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3234	NC_010513	ATT	2	6	158245	158250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_010513	AGA	2	6	158369	158374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_010513	GTT	2	6	158393	158398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3237	NC_010513	ATC	2	6	158409	158414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3238	NC_010513	CAT	2	6	158470	158475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3239	NC_010513	GAT	2	6	158499	158504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_010513	GTT	2	6	158511	158516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_010513	GT	3	6	158591	158596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3242	NC_010513	TCAT	2	8	158650	158657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3243	NC_010513	GAA	2	6	158658	158663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_010513	AGT	2	6	158706	158711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_010513	TGG	2	6	158754	158759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3246	NC_010513	CGT	2	6	158771	158776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3247	NC_010513	GTGC	2	8	158787	158794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3248	NC_010513	GT	3	6	158800	158805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_010513	CAAGAG	2	12	158850	158861	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3250	NC_010513	AGT	2	6	158863	158868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3252	NC_010513	TGC	2	6	158914	158919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3351	NC_010513	T	7	7	162997	163003	0 %	100 %	0 %	0 %	170729372
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3492	NC_010513	TTA	2	6	169661	169666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3500	NC_010513	GGC	2	6	170047	170052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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