MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 13912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007705	CAGC	2	8	14	21	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007705	GATG	2	8	40	47	25 %	25 %	50 %	0 %	84621658
3	NC_007705	CCCG	2	8	85	92	0 %	0 %	25 %	75 %	84621658
4	NC_007705	GTCG	2	8	835	842	0 %	25 %	50 %	25 %	84621658
5	NC_007705	CGAT	2	8	843	850	25 %	25 %	25 %	25 %	84621658
6	NC_007705	GCCG	2	8	1253	1260	0 %	0 %	50 %	50 %	84621658
7	NC_007705	TGCC	2	8	1282	1289	0 %	25 %	25 %	50 %	84621658
8	NC_007705	AAAC	2	8	1544	1551	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007705	CCTG	2	8	1724	1731	0 %	25 %	25 %	50 %	84621659
10	NC_007705	GGAC	2	8	1760	1767	25 %	0 %	50 %	25 %	84621659
11	NC_007705	CCCG	2	8	1854	1861	0 %	0 %	25 %	75 %	84621659
12	NC_007705	CTGC	2	8	1974	1981	0 %	25 %	25 %	50 %	84621659
13	NC_007705	CCGT	2	8	1992	1999	0 %	25 %	25 %	50 %	84621659
14	NC_007705	TGCG	2	8	2434	2441	0 %	25 %	50 %	25 %	84621659
15	NC_007705	CGAA	2	8	2467	2474	50 %	0 %	25 %	25 %	84621659
16	NC_007705	CAAT	2	8	3313	3320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007705	GTCC	2	8	3334	3341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007705	CCTG	2	8	3891	3898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007705	CCGT	2	8	3906	3913	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007705	GCCT	2	8	4854	4861	0 %	25 %	25 %	50 %	84621660
21	NC_007705	CCCG	2	8	5018	5025	0 %	0 %	25 %	75 %	84621660
22	NC_007705	CGAA	2	8	6342	6349	50 %	0 %	25 %	25 %	84621661
23	NC_007705	GCAG	2	8	7147	7154	25 %	0 %	50 %	25 %	84621661
24	NC_007705	GCCG	2	8	8325	8332	0 %	0 %	50 %	50 %	84621662
25	NC_007705	ACCC	2	8	9450	9457	25 %	0 %	0 %	75 %	84621663
26	NC_007705	GCCT	2	8	9622	9629	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007705	GCAA	2	8	9853	9860	50 %	0 %	25 %	25 %	84621664
28	NC_007705	TGGG	2	8	9892	9899	0 %	25 %	75 %	0 %	84621664
29	NC_007705	GTCG	2	8	11711	11718	0 %	25 %	50 %	25 %	84621665
30	NC_007705	CGTT	2	8	12439	12446	0 %	50 %	25 %	25 %	84621666
31	NC_007705	GGTG	2	8	12536	12543	0 %	25 %	75 %	0 %	84621666
32	NC_007705	GAAG	2	8	12906	12913	50 %	0 %	50 %	0 %	84621667
33	NC_007705	GCGA	2	8	13744	13751	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007705	GTGC	2	8	14556	14563	0 %	25 %	50 %	25 %	84621669
35	NC_007705	GATC	2	8	14750	14757	25 %	25 %	25 %	25 %	84621670
36	NC_007705	GGTG	2	8	15793	15800	0 %	25 %	75 %	0 %	84621671
37	NC_007705	CATC	2	8	15925	15932	25 %	25 %	0 %	50 %	84621671
38	NC_007705	AAAG	2	8	16927	16934	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007705	GTTG	2	8	17203	17210	0 %	50 %	50 %	0 %	84621673
40	NC_007705	GTTG	2	8	17489	17496	0 %	50 %	50 %	0 %	84621673
41	NC_007705	GGCT	2	8	17833	17840	0 %	25 %	50 %	25 %	84621673
42	NC_007705	CGGC	2	8	18070	18077	0 %	0 %	50 %	50 %	84621673
43	NC_007705	CGTG	2	8	18720	18727	0 %	25 %	50 %	25 %	84621674
44	NC_007705	TGGC	2	8	19127	19134	0 %	25 %	50 %	25 %	84621674
45	NC_007705	GCCG	2	8	19168	19175	0 %	0 %	50 %	50 %	84621674
46	NC_007705	CGGC	2	8	19310	19317	0 %	0 %	50 %	50 %	84621674
47	NC_007705	CGGG	2	8	20723	20730	0 %	0 %	75 %	25 %	84621675
48	NC_007705	GATC	2	8	20733	20740	25 %	25 %	25 %	25 %	84621675
49	NC_007705	GCCG	2	8	20798	20805	0 %	0 %	50 %	50 %	84621675
50	NC_007705	GAGC	2	8	20967	20974	25 %	0 %	50 %	25 %	84621675
51	NC_007705	AGCA	2	8	21876	21883	50 %	0 %	25 %	25 %	84621675
52	NC_007705	AGCG	2	8	22207	22214	25 %	0 %	50 %	25 %	84621676
53	NC_007705	GCAG	2	8	22224	22231	25 %	0 %	50 %	25 %	84621676
54	NC_007705	GCGT	2	8	22325	22332	0 %	25 %	50 %	25 %	84621676
55	NC_007705	CGTG	2	8	22658	22665	0 %	25 %	50 %	25 %	84621677
56	NC_007705	CCGG	2	8	22671	22678	0 %	0 %	50 %	50 %	84621677
57	NC_007705	TCGA	2	8	22807	22814	25 %	25 %	25 %	25 %	84621677
58	NC_007705	GTCT	2	8	22933	22940	0 %	50 %	25 %	25 %	84621677
59	NC_007705	CGCC	2	8	24321	24328	0 %	0 %	25 %	75 %	84621679
60	NC_007705	CGCC	2	8	24518	24525	0 %	0 %	25 %	75 %	84621679
61	NC_007705	CAGC	2	8	24679	24686	25 %	0 %	25 %	50 %	84621679
62	NC_007705	CGCC	2	8	24906	24913	0 %	0 %	25 %	75 %	84621679
63	NC_007705	CTGC	2	8	25074	25081	0 %	25 %	25 %	50 %	84621679
64	NC_007705	GCGT	2	8	25093	25100	0 %	25 %	50 %	25 %	84621679
65	NC_007705	TGCC	2	8	25463	25470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007705	TGGC	2	8	25488	25495	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007705	CAGC	2	8	25710	25717	25 %	0 %	25 %	50 %	84621680
68	NC_007705	TGCG	2	8	26172	26179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007705	CTTC	2	8	26227	26234	0 %	50 %	0 %	50 %	84621681
70	NC_007705	TTAT	2	8	26361	26368	25 %	75 %	0 %	0 %	84621681
71	NC_007705	GCCC	2	8	26797	26804	0 %	0 %	25 %	75 %	84621681
72	NC_007705	TGCC	2	8	26835	26842	0 %	25 %	25 %	50 %	84621681
73	NC_007705	GCAC	2	8	27393	27400	25 %	0 %	25 %	50 %	84621682
74	NC_007705	GGGC	2	8	27924	27931	0 %	0 %	75 %	25 %	84621683
75	NC_007705	TCGA	2	8	28078	28085	25 %	25 %	25 %	25 %	84621683
76	NC_007705	GGGC	2	8	28128	28135	0 %	0 %	75 %	25 %	84621683
77	NC_007705	GCCG	2	8	28506	28513	0 %	0 %	50 %	50 %	84621683
78	NC_007705	GCCG	2	8	29536	29543	0 %	0 %	50 %	50 %	84621684
79	NC_007705	CGGC	2	8	30042	30049	0 %	0 %	50 %	50 %	84621684
80	NC_007705	GATG	2	8	30099	30106	25 %	25 %	50 %	0 %	84621684
81	NC_007705	TCAC	2	8	30630	30637	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007705	CTTG	2	8	30721	30728	0 %	50 %	25 %	25 %	84621685
83	NC_007705	GCCG	2	8	30787	30794	0 %	0 %	50 %	50 %	84621685
84	NC_007705	ACGC	2	8	31831	31838	25 %	0 %	25 %	50 %	84621686
85	NC_007705	CCTT	2	8	32307	32314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007705	GATT	2	8	32343	32350	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007705	GGGC	2	8	32635	32642	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007705	GGCT	2	8	32706	32713	0 %	25 %	50 %	25 %	84621687
89	NC_007705	CTGC	2	8	32882	32889	0 %	25 %	25 %	50 %	84621687
90	NC_007705	TGGC	2	8	32987	32994	0 %	25 %	50 %	25 %	84621687
91	NC_007705	TGGA	2	8	33794	33801	25 %	25 %	50 %	0 %	84621687
92	NC_007705	TTCT	2	8	33950	33957	0 %	75 %	0 %	25 %	84621688
93	NC_007705	GATT	2	8	34128	34135	25 %	50 %	25 %	0 %	84621688
94	NC_007705	CATG	2	8	34164	34171	25 %	25 %	25 %	25 %	84621688
95	NC_007705	CTCG	2	8	34743	34750	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007705	CAGC	2	8	34982	34989	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007705	CCCG	2	8	35431	35438	0 %	0 %	25 %	75 %	84621689
98	NC_007705	GTGC	2	8	35665	35672	0 %	25 %	50 %	25 %	84621689
99	NC_007705	CGAA	2	8	36437	36444	50 %	0 %	25 %	25 %	84621689
100	NC_007705	GTAG	2	8	36516	36523	25 %	25 %	50 %	0 %	84621690
101	NC_007705	CTGG	2	8	36918	36925	0 %	25 %	50 %	25 %	84621690
102	NC_007705	CGGC	2	8	37471	37478	0 %	0 %	50 %	50 %	84621690
103	NC_007705	GCGA	2	8	37560	37567	25 %	0 %	50 %	25 %	84621690
104	NC_007705	GATC	2	8	37640	37647	25 %	25 %	25 %	25 %	84621690
105	NC_007705	TTTG	2	8	38282	38289	0 %	75 %	25 %	0 %	84621692
106	NC_007705	ACGC	2	8	38889	38896	25 %	0 %	25 %	50 %	84621692
107	NC_007705	GTGC	2	8	39120	39127	0 %	25 %	50 %	25 %	84621693
108	NC_007705	GCCG	2	8	39240	39247	0 %	0 %	50 %	50 %	84621693
109	NC_007705	ATGC	2	8	39538	39545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007705	CCTT	2	8	39862	39869	0 %	50 %	0 %	50 %	84621694
111	NC_007705	AGGA	2	8	39905	39912	50 %	0 %	50 %	0 %	84621694
112	NC_007705	AAGG	2	8	40363	40370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007705	CAAC	2	8	41563	41570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007705	TTAA	2	8	41700	41707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007705	GGGC	2	8	42311	42318	0 %	0 %	75 %	25 %	84621697
116	NC_007705	ACGC	2	8	42539	42546	25 %	0 %	25 %	50 %	84621697
117	NC_007705	GCAC	2	8	42734	42741	25 %	0 %	25 %	50 %	84621697
118	NC_007705	ACGC	2	8	42944	42951	25 %	0 %	25 %	50 %	84621697
119	NC_007705	GCCG	2	8	43226	43233	0 %	0 %	50 %	50 %	84621697
120	NC_007705	TGCG	2	8	43327	43334	0 %	25 %	50 %	25 %	84621697
121	NC_007705	CTCG	2	8	43719	43726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007705	TGCT	2	8	44075	44082	0 %	50 %	25 %	25 %	84621698
123	NC_007705	CCCG	2	8	44278	44285	0 %	0 %	25 %	75 %	84621699
124	NC_007705	GGGC	2	8	44788	44795	0 %	0 %	75 %	25 %	84621700
125	NC_007705	CAGG	2	8	44858	44865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007705	GCCG	2	8	46357	46364	0 %	0 %	50 %	50 %	84621701
127	NC_007705	GGCA	2	8	46731	46738	25 %	0 %	50 %	25 %	84621702
128	NC_007705	CCCA	2	8	46995	47002	25 %	0 %	0 %	75 %	84621702
129	NC_007705	GTGC	2	8	47956	47963	0 %	25 %	50 %	25 %	84621704
130	NC_007705	AGCA	2	8	48339	48346	50 %	0 %	25 %	25 %	84621705
131	NC_007705	GTCC	2	8	48400	48407	0 %	25 %	25 %	50 %	84621705
132	NC_007705	GTTG	2	8	48517	48524	0 %	50 %	50 %	0 %	84621705
133	NC_007705	GCCA	2	8	49547	49554	25 %	0 %	25 %	50 %	84621706
134	NC_007705	GCGT	2	8	50208	50215	0 %	25 %	50 %	25 %	84621706
135	NC_007705	ACCG	2	8	50218	50225	25 %	0 %	25 %	50 %	84621706
136	NC_007705	ATGC	2	8	50505	50512	25 %	25 %	25 %	25 %	84621706
137	NC_007705	GAGT	2	8	50521	50528	25 %	25 %	50 %	0 %	84621706
138	NC_007705	GCGT	2	8	51244	51251	0 %	25 %	50 %	25 %	84621708
139	NC_007705	CTGG	2	8	51776	51783	0 %	25 %	50 %	25 %	84621709
140	NC_007705	GCGA	2	8	51811	51818	25 %	0 %	50 %	25 %	84621709
141	NC_007705	GCTG	2	8	51898	51905	0 %	25 %	50 %	25 %	84621710
142	NC_007705	GCCT	2	8	52132	52139	0 %	25 %	25 %	50 %	84621710
143	NC_007705	ACCG	2	8	52291	52298	25 %	0 %	25 %	50 %	84621710
144	NC_007705	TCAG	2	8	52903	52910	25 %	25 %	25 %	25 %	84621711
145	NC_007705	CTGC	2	8	53372	53379	0 %	25 %	25 %	50 %	84621711
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