MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 117194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_007705	CGA	2	6	128712	128717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621781
3003	NC_007705	GC	3	6	128752	128757	0 %	0 %	50 %	50 %	84621781
3004	NC_007705	TTC	2	6	128845	128850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84621781
3005	NC_007705	GCT	2	6	128899	128904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_007705	AGT	2	6	128945	128950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_007705	GAA	2	6	128984	128989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_007705	CG	3	6	129079	129084	0 %	0 %	50 %	50 %	84621782
3009	NC_007705	CAGC	2	8	129127	129134	25 %	0 %	25 %	50 %	84621782
3010	NC_007705	TTG	2	6	129178	129183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84621782
3011	NC_007705	CAG	2	6	129201	129206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621782
3012	NC_007705	GAC	2	6	129213	129218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621782
3013	NC_007705	TGC	2	6	129251	129256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621782
3014	NC_007705	GAT	2	6	129279	129284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84621782
3015	NC_007705	GTG	2	6	129340	129345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621782
3016	NC_007705	GAA	2	6	129350	129355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621782
3017	NC_007705	CG	3	6	129391	129396	0 %	0 %	50 %	50 %	84621782
3018	NC_007705	GGA	2	6	129437	129442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	84621782
3019	NC_007705	TGG	2	6	129550	129555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621782
3020	NC_007705	GATG	2	8	129587	129594	25 %	25 %	50 %	0 %	84621782
3021	NC_007705	GAA	2	6	129638	129643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621782
3022	NC_007705	CTG	2	6	129657	129662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621782
3023	NC_007705	TGA	2	6	129712	129717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84621782
3024	NC_007705	GCA	2	6	129772	129777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621782
3025	NC_007705	CTG	2	6	129795	129800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621782
3026	NC_007705	GCCA	2	8	129837	129844	25 %	0 %	25 %	50 %	84621782
3027	NC_007705	CAA	2	6	129854	129859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84621782
3028	NC_007705	TGA	2	6	129871	129876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84621782
3029	NC_007705	GAA	2	6	129927	129932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621782
3030	NC_007705	GC	3	6	130027	130032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_007705	GACA	2	8	130120	130127	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_007705	CG	3	6	130129	130134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_007705	CG	3	6	130165	130170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_007705	CGC	2	6	130178	130183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_007705	TCGG	2	8	130263	130270	0 %	25 %	50 %	25 %	84621783
3036	NC_007705	TTC	2	6	130277	130282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84621783
3037	NC_007705	GCG	2	6	130331	130336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621783
3038	NC_007705	GTC	2	6	130337	130342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621783
3039	NC_007705	ACC	2	6	130343	130348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621783
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3041	NC_007705	CGC	2	6	130477	130482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621783
3042	NC_007705	TGC	2	6	130568	130573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_007705	CTG	2	6	130575	130580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_007705	GCT	2	6	130588	130593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_007705	GCG	2	6	130634	130639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621784
3046	NC_007705	CGC	2	6	130670	130675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621784
3047	NC_007705	GC	3	6	130682	130687	0 %	0 %	50 %	50 %	84621784
3048	NC_007705	GCA	2	6	130717	130722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621784
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3050	NC_007705	CGG	2	6	130736	130741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621784
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3052	NC_007705	TGG	2	6	130823	130828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621784
3053	NC_007705	CGGG	2	8	130849	130856	0 %	0 %	75 %	25 %	84621784
3054	NC_007705	CAA	2	6	130920	130925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84621784
3055	NC_007705	GAT	2	6	130935	130940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84621784
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3057	NC_007705	TGG	2	6	131051	131056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621784
3058	NC_007705	CGATGG	2	12	131099	131110	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	84621784
3059	NC_007705	GTC	2	6	131178	131183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621784
3060	NC_007705	ATCG	2	8	131229	131236	25 %	25 %	25 %	25 %	84621784
3061	NC_007705	AC	3	6	131249	131254	50 %	0 %	0 %	50 %	84621784
3062	NC_007705	GAA	2	6	131259	131264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_007705	GTGG	2	8	131268	131275	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_007705	CGC	3	9	131314	131322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3065	NC_007705	TCG	2	6	131327	131332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3069	NC_007705	GCT	2	6	131466	131471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3073	NC_007705	CGGCG	2	10	131574	131583	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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3093	NC_007705	GC	3	6	132456	132461	0 %	0 %	50 %	50 %	84621786
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3097	NC_007705	CG	3	6	132579	132584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_007705	CGC	2	6	132607	132612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_007705	GC	4	8	132682	132689	0 %	0 %	50 %	50 %	84621787
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3118	NC_007705	AGCAC	2	10	133316	133325	40 %	0 %	20 %	40 %	84621787
3119	NC_007705	TCT	2	6	133364	133369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_007705	TCA	3	9	133408	133416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3124	NC_007705	GC	3	6	133539	133544	0 %	0 %	50 %	50 %	84621788
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3126	NC_007705	CGGC	2	8	133576	133583	0 %	0 %	50 %	50 %	84621788
3127	NC_007705	AGC	2	6	133636	133641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621788
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3130	NC_007705	GCT	2	6	133733	133738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621788
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3135	NC_007705	GTTC	2	8	133855	133862	0 %	50 %	25 %	25 %	84621789
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3143	NC_007705	TTG	2	6	134179	134184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_007705	TGC	2	6	134191	134196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3147	NC_007705	GCC	2	6	134315	134320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3151	NC_007705	TGCA	2	8	134454	134461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3152	NC_007705	GCAC	3	12	134479	134490	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3233	NC_007705	CAA	2	6	138525	138530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3234	NC_007705	CTG	2	6	138537	138542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3236	NC_007705	ATCGC	2	10	138624	138633	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3237	NC_007705	TCAT	2	8	138649	138656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3238	NC_007705	AGGTGC	2	12	138753	138764	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	84621793
3239	NC_007705	GCG	2	6	138792	138797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621793
3240	NC_007705	TCG	2	6	138801	138806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621793
3241	NC_007705	CTG	2	6	138842	138847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621793
3242	NC_007705	GGC	2	6	138878	138883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621793
3243	NC_007705	GAGATC	2	12	138884	138895	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	84621793
3244	NC_007705	GCG	2	6	138921	138926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621793
3245	NC_007705	AGA	2	6	139005	139010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621793
3246	NC_007705	CTG	3	9	139025	139033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621793
3247	NC_007705	GCAGC	2	10	139046	139055	20 %	0 %	40 %	40 %	84621793
3248	NC_007705	CGG	2	6	139132	139137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621793
3249	NC_007705	CAG	3	9	139139	139147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621793
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3372	NC_007705	TGC	2	6	144435	144440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3373	NC_007705	CGT	2	6	144452	144457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621799
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3496	NC_007705	GC	3	6	149348	149353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3497	NC_007705	GTGG	2	8	149371	149378	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_007705	GTC	2	6	149407	149412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621804
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