MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 117194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_007705	GC	3	6	609817	609822	0 %	0 %	50 %	50 %	84622214
14503	NC_007705	CGG	2	6	609856	609861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84622214
14504	NC_007705	GCG	2	6	609930	609935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84622214
14505	NC_007705	GCG	2	6	609968	609973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84622214
14506	NC_007705	GGGT	2	8	610025	610032	0 %	25 %	75 %	0 %	84622214
14507	NC_007705	GCA	2	6	610041	610046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84622214
14508	NC_007705	CG	3	6	610061	610066	0 %	0 %	50 %	50 %	84622214
14509	NC_007705	GC	4	8	610095	610102	0 %	0 %	50 %	50 %	84622214
14510	NC_007705	GCG	2	6	610141	610146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84622214
14511	NC_007705	AGC	2	6	610214	610219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84622214
14512	NC_007705	GGC	2	6	610230	610235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84622214
14513	NC_007705	GGC	2	6	610243	610248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84622214
14514	NC_007705	ACA	2	6	610257	610262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84622214
14515	NC_007705	CGGC	2	8	610308	610315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14516	NC_007705	CG	3	6	610323	610328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14517	NC_007705	TGC	2	6	610353	610358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14518	NC_007705	TGC	2	6	610370	610375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14519	NC_007705	TCG	2	6	610443	610448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84622215
14520	NC_007705	GCT	2	6	610465	610470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84622215
14521	NC_007705	CGA	2	6	610555	610560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84622215
14522	NC_007705	CTCA	2	8	610579	610586	25 %	25 %	0 %	50 %	84622215
14523	NC_007705	CGG	2	6	610597	610602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84622215
14524	NC_007705	CTG	3	9	610604	610612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84622215
14525	NC_007705	TCAA	2	8	610704	610711	50 %	25 %	0 %	25 %	84622215
14526	NC_007705	TGG	2	6	610713	610718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84622215
14527	NC_007705	CGG	2	6	610741	610746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84622215
14528	NC_007705	TCT	2	6	610813	610818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84622215
14529	NC_007705	CCA	2	6	610840	610845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14530	NC_007705	AACG	2	8	610943	610950	50 %	0 %	25 %	25 %	84622216
14531	NC_007705	CGA	2	6	611041	611046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84622216
14532	NC_007705	TCG	2	6	611049	611054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84622216
14533	NC_007705	CAT	2	6	611074	611079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84622216
14534	NC_007705	GAC	2	6	611177	611182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84622216
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14536	NC_007705	AAG	2	6	611193	611198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84622216
14537	NC_007705	GCC	2	6	611201	611206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84622216
14538	NC_007705	CAC	2	6	611239	611244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84622216
14539	NC_007705	GCT	2	6	611287	611292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84622216
14540	NC_007705	ATCGCC	2	12	611309	611320	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	84622216
14541	NC_007705	GAA	2	6	611330	611335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84622216
14542	NC_007705	GCA	2	6	611354	611359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84622216
14543	NC_007705	TGC	2	6	611388	611393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84622216
14544	NC_007705	AAGG	2	8	611414	611421	50 %	0 %	50 %	0 %	84622216
14545	NC_007705	AAG	2	6	611423	611428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84622216
14546	NC_007705	GAA	2	6	611468	611473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84622216
14547	NC_007705	CGC	5	15	611479	611493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84622216
14548	NC_007705	GCTG	2	8	611494	611501	0 %	25 %	50 %	25 %	84622216
14549	NC_007705	CGA	2	6	611521	611526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84622216
14550	NC_007705	GAC	3	9	611543	611551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84622216
14551	NC_007705	CGC	3	9	611566	611574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84622216
14552	NC_007705	GAA	2	6	611576	611581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84622216
14553	NC_007705	AAG	2	6	611660	611665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84622216
14554	NC_007705	TGG	2	6	611697	611702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84622216
14555	NC_007705	GC	3	6	611708	611713	0 %	0 %	50 %	50 %	84622216
14556	NC_007705	GCC	2	6	611723	611728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84622216
14557	NC_007705	CAC	2	6	611734	611739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84622216
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14559	NC_007705	GCGTG	2	10	611785	611794	0 %	20 %	60 %	20 %	84622216
14560	NC_007705	TGC	2	6	611826	611831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84622216
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14562	NC_007705	GTC	2	6	611944	611949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84622216
14563	NC_007705	GATCA	2	10	611969	611978	40 %	20 %	20 %	20 %	84622216
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14572	NC_007705	CAA	2	6	612346	612351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84622216
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14580	NC_007705	GGCC	2	8	612610	612617	0 %	0 %	50 %	50 %	84622216
14581	NC_007705	CG	3	6	612624	612629	0 %	0 %	50 %	50 %	84622216
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14584	NC_007705	TGT	2	6	612865	612870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_007705	GCG	2	6	612913	612918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14586	NC_007705	TCACG	2	10	613019	613028	20 %	20 %	20 %	40 %	84622217
14587	NC_007705	CGC	2	6	613091	613096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84622217
14588	NC_007705	ACC	2	6	613103	613108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84622217
14589	NC_007705	CACGAG	2	12	613115	613126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84622217
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14591	NC_007705	CGGGC	2	10	613228	613237	0 %	0 %	60 %	40 %	84622217
14592	NC_007705	AGG	2	6	613251	613256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	84622217
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14595	NC_007705	CG	3	6	613404	613409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14596	NC_007705	ATC	2	6	613418	613423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14597	NC_007705	AGTG	2	8	613440	613447	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_007705	CA	3	6	613481	613486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14599	NC_007705	GCT	2	6	613491	613496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14600	NC_007705	TGC	2	6	613553	613558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14601	NC_007705	CGGT	2	8	613576	613583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14602	NC_007705	GCG	3	9	613600	613608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14603	NC_007705	T	6	6	613656	613661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_007705	GC	3	6	613683	613688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14605	NC_007705	GC	3	6	613707	613712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14606	NC_007705	GCC	2	6	613717	613722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14607	NC_007705	CCA	2	6	613878	613883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14608	NC_007705	TTG	2	6	613940	613945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_007705	CGT	2	6	613960	613965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84622218
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14611	NC_007705	CTC	2	6	614106	614111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	84622218
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14615	NC_007705	TTG	2	6	614260	614265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84622218
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14617	NC_007705	GT	3	6	614333	614338	0 %	50 %	50 %	0 %	84622218
14618	NC_007705	CG	3	6	614339	614344	0 %	0 %	50 %	50 %	84622218
14619	NC_007705	AGTG	2	8	614394	614401	25 %	25 %	50 %	0 %	84622218
14620	NC_007705	G	6	6	614452	614457	0 %	0 %	100 %	0 %	84622218
14621	NC_007705	CCT	2	6	614567	614572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	84622218
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14993	NC_007705	TGC	2	6	630749	630754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84622236
14994	NC_007705	CGG	2	6	630792	630797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84622236
14995	NC_007705	CGTG	2	8	630799	630806	0 %	25 %	50 %	25 %	84622236
14996	NC_007705	GGC	2	6	630820	630825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84622236
14997	NC_007705	CTG	2	6	630841	630846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84622236
14998	NC_007705	GCT	2	6	630856	630861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84622236
14999	NC_007705	CTG	2	6	630934	630939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84622236
15000	NC_007705	GC	3	6	630941	630946	0 %	0 %	50 %	50 %	84622236

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