MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 117194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_007705	GCC	2	6	42934	42939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621697
1003	NC_007705	ACGC	2	8	42944	42951	25 %	0 %	25 %	50 %	84621697
1004	NC_007705	GC	3	6	42953	42958	0 %	0 %	50 %	50 %	84621697
1005	NC_007705	TGG	2	6	42985	42990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621697
1006	NC_007705	CG	4	8	43004	43011	0 %	0 %	50 %	50 %	84621697
1007	NC_007705	CATCGA	2	12	43013	43024	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	84621697
1008	NC_007705	CGG	2	6	43033	43038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621697
1009	NC_007705	CG	4	8	43097	43104	0 %	0 %	50 %	50 %	84621697
1010	NC_007705	GCG	2	6	43114	43119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621697
1011	NC_007705	GC	4	8	43145	43152	0 %	0 %	50 %	50 %	84621697
1012	NC_007705	GGC	2	6	43159	43164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621697
1013	NC_007705	GCCG	2	8	43226	43233	0 %	0 %	50 %	50 %	84621697
1014	NC_007705	CGG	2	6	43286	43291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621697
1015	NC_007705	AAG	2	6	43314	43319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84621697
1016	NC_007705	TGCG	2	8	43327	43334	0 %	25 %	50 %	25 %	84621697
1017	NC_007705	GCG	3	9	43332	43340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621697
1018	NC_007705	CCG	2	6	43428	43433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1020	NC_007705	CAG	2	6	43532	43537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_007705	CTG	2	6	43562	43567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_007705	CCAGCA	2	12	43593	43604	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_007705	TCG	2	6	43627	43632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_007705	ACG	2	6	43712	43717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_007705	CTCG	2	8	43719	43726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_007705	ATGCG	2	10	43731	43740	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1027	NC_007705	CAA	2	6	43743	43748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1030	NC_007705	GAC	3	9	43792	43800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_007705	GC	3	6	43859	43864	0 %	0 %	50 %	50 %	84621698
1032	NC_007705	CGA	2	6	43896	43901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621698
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1043	NC_007705	CCCG	2	8	44278	44285	0 %	0 %	25 %	75 %	84621699
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1055	NC_007705	CAGG	2	8	44858	44865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_007705	GCA	2	6	44926	44931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1058	NC_007705	GGC	2	6	44955	44960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_007705	GC	3	6	45017	45022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_007705	GTT	2	6	45056	45061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_007705	CGC	2	6	45079	45084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_007705	A	7	7	45144	45150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_007705	CCG	2	6	45188	45193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_007705	GC	3	6	45285	45290	0 %	0 %	50 %	50 %	84621701
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1070	NC_007705	GCA	2	6	45613	45618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621701
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1101	NC_007705	CG	4	8	47106	47113	0 %	0 %	50 %	50 %	84621702
1102	NC_007705	GC	3	6	47130	47135	0 %	0 %	50 %	50 %	84621702
1103	NC_007705	CAT	2	6	47162	47167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621702
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1108	NC_007705	CAATC	2	10	47516	47525	40 %	20 %	0 %	40 %	84621703
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1110	NC_007705	CGC	2	6	47561	47566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621703
1111	NC_007705	TCA	2	6	47610	47615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621703
1112	NC_007705	GCACT	2	10	47656	47665	20 %	20 %	20 %	40 %	84621703
1113	NC_007705	ACGGC	2	10	47679	47688	20 %	0 %	40 %	40 %	84621703
1114	NC_007705	GCA	2	6	47706	47711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621703
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1117	NC_007705	GTG	2	6	47819	47824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_007705	TG	3	6	47823	47828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1120	NC_007705	GCC	2	6	47916	47921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_007705	GCC	2	6	47941	47946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621704
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1123	NC_007705	GCG	2	6	47988	47993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621704
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1261	NC_007705	TGG	2	6	55185	55190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621713
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