MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 117194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_007705	CAA	3	9	252589	252597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_007705	TGCT	2	8	252615	252622	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6004	NC_007705	GGC	2	6	252656	252661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_007705	GCA	2	6	252750	252755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_007705	GAT	2	6	252796	252801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84621886
6007	NC_007705	GC	4	8	252802	252809	0 %	0 %	50 %	50 %	84621886
6008	NC_007705	CGG	2	6	252826	252831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621886
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6010	NC_007705	GCC	2	6	252880	252885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621886
6011	NC_007705	CATG	2	8	252978	252985	25 %	25 %	25 %	25 %	84621886
6012	NC_007705	GCC	2	6	253048	253053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621886
6013	NC_007705	GGC	2	6	253261	253266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621886
6014	NC_007705	ATC	2	6	253282	253287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84621886
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6016	NC_007705	GCC	2	6	253325	253330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621886
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6018	NC_007705	CAG	2	6	253420	253425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84621886
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6022	NC_007705	CCTT	2	8	253520	253527	0 %	50 %	0 %	50 %	84621886
6023	NC_007705	GTT	2	6	253624	253629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84621886
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6025	NC_007705	ACC	2	6	253859	253864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84621886
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6030	NC_007705	CGG	2	6	254053	254058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	84621886
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6033	NC_007705	GTC	2	6	254180	254185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621886
6034	NC_007705	GTA	2	6	254269	254274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84621886
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6041	NC_007705	CGT	2	6	254658	254663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621886
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6043	NC_007705	ACGG	2	8	254760	254767	25 %	0 %	50 %	25 %	84621886
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6046	NC_007705	GTC	2	6	254806	254811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84621886
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6054	NC_007705	CGC	2	6	255201	255206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621886
6055	NC_007705	CCG	2	6	255252	255257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621886
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6057	NC_007705	CGC	3	9	255270	255278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	84621886
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6059	NC_007705	CCT	2	6	255420	255425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	84621886
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6105	NC_007705	GTG	2	6	256872	256877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84621887
6106	NC_007705	CG	3	6	256991	256996	0 %	0 %	50 %	50 %	84621887
6107	NC_007705	GGC	2	6	257075	257080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_007705	CA	3	6	257128	257133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_007705	ATGA	2	8	257139	257146	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_007705	C	7	7	257168	257174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6111	NC_007705	ATG	2	6	257218	257223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6113	NC_007705	CAG	2	6	257303	257308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_007705	AACGT	2	10	257351	257360	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6115	NC_007705	GCCTT	2	10	257390	257399	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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