MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 chromosome

Total Repeats: 4740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007508	GCCTG	2	10	779	788	0 %	20 %	40 %	40 %	78045557
2	NC_007508	ACCAC	2	10	1223	1232	40 %	0 %	0 %	60 %	78045557
3	NC_007508	GCTTT	2	10	3440	3449	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007508	CGACC	2	10	3705	3714	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_007508	TGGAA	2	10	3964	3973	40 %	20 %	40 %	0 %	78045559
6	NC_007508	GGACG	2	10	4039	4048	20 %	0 %	60 %	20 %	78045559
7	NC_007508	TGCGC	2	10	4086	4095	0 %	20 %	40 %	40 %	78045559
8	NC_007508	GGACG	2	10	4560	4569	20 %	0 %	60 %	20 %	78045559
9	NC_007508	GGCGC	2	10	5558	5567	0 %	0 %	60 %	40 %	78045560
10	NC_007508	CGGTG	2	10	7459	7468	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007508	CGGCC	2	10	8158	8167	0 %	0 %	40 %	60 %	78045561
12	NC_007508	CAGGC	2	10	9272	9281	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007508	CAACA	2	10	9464	9473	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_007508	CACTG	2	10	11039	11048	20 %	20 %	20 %	40 %	78045564
15	NC_007508	CCGGT	2	10	12281	12290	0 %	20 %	40 %	40 %	78045565
16	NC_007508	CGCGC	2	10	12677	12686	0 %	0 %	40 %	60 %	78045566
17	NC_007508	CAACA	2	10	13357	13366	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_007508	GCCGA	2	10	13479	13488	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_007508	TGCCG	2	10	13489	13498	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_007508	CACCG	2	10	13684	13693	20 %	0 %	20 %	60 %	78045568
21	NC_007508	TCCAG	2	10	13839	13848	20 %	20 %	20 %	40 %	78045568
22	NC_007508	GTGCA	2	10	14026	14035	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007508	GGCAC	2	10	14734	14743	20 %	0 %	40 %	40 %	78045569
24	NC_007508	GCGCC	2	10	15325	15334	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_007508	CAGCG	2	10	16334	16343	20 %	0 %	40 %	40 %	78045571
26	NC_007508	AGAGC	2	10	17659	17668	40 %	0 %	40 %	20 %	78045572
27	NC_007508	GGTCG	2	10	21132	21141	0 %	20 %	60 %	20 %	78045576
28	NC_007508	CTGCC	2	10	23763	23772	0 %	20 %	20 %	60 %	78045579
29	NC_007508	GCCCG	2	10	28626	28635	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_007508	GCCAC	2	10	30682	30691	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_007508	CTACC	2	10	30806	30815	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_007508	GCAAG	2	10	31241	31250	40 %	0 %	40 %	20 %	78045584
33	NC_007508	CCAGC	2	10	31791	31800	20 %	0 %	20 %	60 %	78045585
34	NC_007508	CTGCG	2	10	32178	32187	0 %	20 %	40 %	40 %	78045585
35	NC_007508	CGGCG	2	10	35175	35184	0 %	0 %	60 %	40 %	78045589
36	NC_007508	CCAGC	2	10	35293	35302	20 %	0 %	20 %	60 %	78045589
37	NC_007508	CGGGC	2	10	36136	36145	0 %	0 %	60 %	40 %	78045589
38	NC_007508	CGATG	2	10	37189	37198	20 %	20 %	40 %	20 %	78045590
39	NC_007508	GCCGC	2	10	37289	37298	0 %	0 %	40 %	60 %	78045590
40	NC_007508	GCTTA	2	10	38318	38327	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007508	CACAA	2	10	38516	38525	60 %	0 %	0 %	40 %	78045591
42	NC_007508	CTGGT	2	10	38954	38963	0 %	40 %	40 %	20 %	78045592
43	NC_007508	CGGCA	2	10	39118	39127	20 %	0 %	40 %	40 %	78045592
44	NC_007508	CCAGC	2	10	39810	39819	20 %	0 %	20 %	60 %	78045592
45	NC_007508	AGGCC	2	10	40679	40688	20 %	0 %	40 %	40 %	78045593
46	NC_007508	CGCAG	2	10	42929	42938	20 %	0 %	40 %	40 %	78045593
47	NC_007508	CGCTG	2	10	44237	44246	0 %	20 %	40 %	40 %	78045593
48	NC_007508	ACACC	2	10	44594	44603	40 %	0 %	0 %	60 %	78045593
49	NC_007508	CGGCG	2	10	48835	48844	0 %	0 %	60 %	40 %	78045597
50	NC_007508	CGCTA	2	10	48858	48867	20 %	20 %	20 %	40 %	78045597
51	NC_007508	GCGCA	2	10	49150	49159	20 %	0 %	40 %	40 %	78045598
52	NC_007508	GCGCT	2	10	50323	50332	0 %	20 %	40 %	40 %	78045599
53	NC_007508	CGGTG	2	10	51013	51022	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007508	CGTGG	2	10	52496	52505	0 %	20 %	60 %	20 %	78045601
55	NC_007508	GCGCC	2	10	53442	53451	0 %	0 %	40 %	60 %	78045602
56	NC_007508	GTGGC	2	10	53458	53467	0 %	20 %	60 %	20 %	78045602
57	NC_007508	GCATG	2	10	54591	54600	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_007508	ACTCA	2	10	54985	54994	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_007508	GCCAT	2	10	55518	55527	20 %	20 %	20 %	40 %	78045603
60	NC_007508	GCACG	2	10	55588	55597	20 %	0 %	40 %	40 %	78045603
61	NC_007508	GCCGC	2	10	55826	55835	0 %	0 %	40 %	60 %	78045603
62	NC_007508	AGCGC	2	10	57305	57314	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_007508	CCAGG	2	10	58485	58494	20 %	0 %	40 %	40 %	78045606
64	NC_007508	AGCGT	2	10	59012	59021	20 %	20 %	40 %	20 %	78045606
65	NC_007508	CGGGT	2	10	59578	59587	0 %	20 %	60 %	20 %	78045606
66	NC_007508	CGGGC	2	10	60305	60314	0 %	0 %	60 %	40 %	78045606
67	NC_007508	GCGCA	2	10	60573	60582	20 %	0 %	40 %	40 %	78045606
68	NC_007508	GCAGG	2	10	61084	61093	20 %	0 %	60 %	20 %	78045607
69	NC_007508	GGCGT	2	10	62032	62041	0 %	20 %	60 %	20 %	78045607
70	NC_007508	GCAAG	2	10	62605	62614	40 %	0 %	40 %	20 %	78045608
71	NC_007508	GCGCC	3	15	63656	63670	0 %	0 %	40 %	60 %	78045608
72	NC_007508	CAGGC	2	10	64445	64454	20 %	0 %	40 %	40 %	78045608
73	NC_007508	GGCGC	2	10	65969	65978	0 %	0 %	60 %	40 %	78045610
74	NC_007508	GGCGT	2	10	69622	69631	0 %	20 %	60 %	20 %	78045612
75	NC_007508	GGCCG	2	10	71146	71155	0 %	0 %	60 %	40 %	78045615
76	NC_007508	CAATG	2	10	72289	72298	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007508	GCTTC	2	10	75657	75666	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_007508	CCCAA	2	10	76149	76158	40 %	0 %	0 %	60 %	78045619
79	NC_007508	TGCCG	2	10	77061	77070	0 %	20 %	40 %	40 %	78045620
80	NC_007508	ACCTG	2	10	77339	77348	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_007508	CGCAA	2	10	77676	77685	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_007508	ATGTC	2	10	80400	80409	20 %	40 %	20 %	20 %	78045624
83	NC_007508	CTGGG	2	10	83895	83904	0 %	20 %	60 %	20 %	78045628
84	NC_007508	CGTCG	2	10	84359	84368	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_007508	GTGCA	2	10	85003	85012	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007508	CGCTG	2	10	85041	85050	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_007508	CGGCG	2	10	86620	86629	0 %	0 %	60 %	40 %	78045631
88	NC_007508	GTCCA	2	10	86968	86977	20 %	20 %	20 %	40 %	78045632
89	NC_007508	ACCAC	2	10	87197	87206	40 %	0 %	0 %	60 %	78045632
90	NC_007508	TGCCC	2	10	88036	88045	0 %	20 %	20 %	60 %	78045633
91	NC_007508	GCGTG	2	10	88993	89002	0 %	20 %	60 %	20 %	78045634
92	NC_007508	TGGTC	2	10	90281	90290	0 %	40 %	40 %	20 %	78045634
93	NC_007508	CGGCG	2	10	90791	90800	0 %	0 %	60 %	40 %	78045634
94	NC_007508	GCGCA	2	10	91160	91169	20 %	0 %	40 %	40 %	78045634
95	NC_007508	TGCGT	2	10	91886	91895	0 %	40 %	40 %	20 %	78045634
96	NC_007508	GGCCT	2	10	92022	92031	0 %	20 %	40 %	40 %	78045634
97	NC_007508	GCAGC	2	10	92371	92380	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_007508	CCGAC	2	10	92787	92796	20 %	0 %	20 %	60 %	78045635
99	NC_007508	CATCG	2	10	93275	93284	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_007508	TGGCC	2	10	94897	94906	0 %	20 %	40 %	40 %	78045637
101	NC_007508	TCCAG	2	10	95963	95972	20 %	20 %	20 %	40 %	78045638
102	NC_007508	CGCAG	2	10	96042	96051	20 %	0 %	40 %	40 %	78045638
103	NC_007508	CGGCG	2	10	96060	96069	0 %	0 %	60 %	40 %	78045638
104	NC_007508	TGCGG	2	10	97027	97036	0 %	20 %	60 %	20 %	78045639
105	NC_007508	CAACG	2	10	97161	97170	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_007508	CAGCG	2	10	98938	98947	20 %	0 %	40 %	40 %	78045641
107	NC_007508	CAGCG	2	10	99103	99112	20 %	0 %	40 %	40 %	78045641
108	NC_007508	GGGGC	2	10	99521	99530	0 %	0 %	80 %	20 %	78045641
109	NC_007508	GCGCG	2	10	100171	100180	0 %	0 %	60 %	40 %	78045642
110	NC_007508	CGGGC	2	10	101250	101259	0 %	0 %	60 %	40 %	78045642
111	NC_007508	GCCGG	2	10	101354	101363	0 %	0 %	60 %	40 %	78045642
112	NC_007508	GGCGC	2	10	101994	102003	0 %	0 %	60 %	40 %	78045642
113	NC_007508	GCCAC	2	10	102811	102820	20 %	0 %	20 %	60 %	78045643
114	NC_007508	CGGCG	2	10	102929	102938	0 %	0 %	60 %	40 %	78045643
115	NC_007508	ACTGC	2	10	103679	103688	20 %	20 %	20 %	40 %	78045644
116	NC_007508	GCGCA	2	10	104334	104343	20 %	0 %	40 %	40 %	78045644
117	NC_007508	TCCAG	2	10	104377	104386	20 %	20 %	20 %	40 %	78045644
118	NC_007508	GCGCG	2	10	105549	105558	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_007508	TGGGC	2	10	107449	107458	0 %	20 %	60 %	20 %	78045647
120	NC_007508	CACCG	2	10	108345	108354	20 %	0 %	20 %	60 %	78045648
121	NC_007508	AGCCC	2	10	108710	108719	20 %	0 %	20 %	60 %	78045648
122	NC_007508	TGCAA	2	10	111891	111900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_007508	CACTG	4	20	112061	112080	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_007508	GGCAC	2	10	112322	112331	20 %	0 %	40 %	40 %	78045650
125	NC_007508	GCCGC	2	10	113409	113418	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
126	NC_007508	GCCGC	2	10	114363	114372	0 %	0 %	40 %	60 %	78045654
127	NC_007508	TCTGC	2	10	115322	115331	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_007508	GCGAG	2	10	115766	115775	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007508	CGGGA	2	10	116058	116067	20 %	0 %	60 %	20 %	78045655
130	NC_007508	CAGCG	2	10	120052	120061	20 %	0 %	40 %	40 %	78045658
131	NC_007508	CACCG	2	10	120238	120247	20 %	0 %	20 %	60 %	78045658
132	NC_007508	GCCCG	2	10	121212	121221	0 %	0 %	40 %	60 %	78045658
133	NC_007508	CGCAC	2	10	121278	121287	20 %	0 %	20 %	60 %	78045659
134	NC_007508	CGGCA	2	10	122341	122350	20 %	0 %	40 %	40 %	78045660
135	NC_007508	AAACG	2	10	122571	122580	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_007508	GCAGA	2	10	123349	123358	40 %	0 %	40 %	20 %	78045661
137	NC_007508	TGGCG	2	10	125411	125420	0 %	20 %	60 %	20 %	78045664
138	NC_007508	GACTG	2	10	125611	125620	20 %	20 %	40 %	20 %	78045664
139	NC_007508	GACGG	2	10	127973	127982	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007508	ACGGC	2	10	128024	128033	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_007508	CCGGC	2	10	128173	128182	0 %	0 %	40 %	60 %	78045667
142	NC_007508	CCAGC	2	10	129473	129482	20 %	0 %	20 %	60 %	78045667
143	NC_007508	AGCGC	2	10	129567	129576	20 %	0 %	40 %	40 %	78045667
144	NC_007508	CGGCG	2	10	130774	130783	0 %	0 %	60 %	40 %	78045669
145	NC_007508	CCAGA	2	10	130814	130823	40 %	0 %	20 %	40 %	78045669
146	NC_007508	GCGCA	2	10	131654	131663	20 %	0 %	40 %	40 %	78045670
147	NC_007508	CGCGC	2	10	133311	133320	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
148	NC_007508	GATCA	2	10	136391	136400	40 %	20 %	20 %	20 %	78045675
149	NC_007508	CGCTG	2	10	137203	137212	0 %	20 %	40 %	40 %	78045675
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151	NC_007508	GGCAC	2	10	138519	138528	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
152	NC_007508	GGCCT	2	10	138896	138905	0 %	20 %	40 %	40 %	78045676
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154	NC_007508	CGACC	2	10	143225	143234	20 %	0 %	20 %	60 %	78045679
155	NC_007508	CGCGC	2	10	144814	144823	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
156	NC_007508	GGCCA	2	10	146137	146146	20 %	0 %	40 %	40 %	78045680
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158	NC_007508	ATCAG	2	10	152058	152067	40 %	20 %	20 %	20 %	78045684
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161	NC_007508	GCCGC	2	10	156132	156141	0 %	0 %	40 %	60 %	78045687
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164	NC_007508	AATGG	2	10	161069	161078	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
165	NC_007508	CGCTG	2	10	164302	164311	0 %	20 %	40 %	40 %	78045695
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185	NC_007508	GCGTC	2	10	185097	185106	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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187	NC_007508	GCCCG	2	10	185941	185950	0 %	0 %	40 %	60 %	78045711
188	NC_007508	GCGCC	2	10	186674	186683	0 %	0 %	40 %	60 %	78045712
189	NC_007508	GTCGA	2	10	187167	187176	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
190	NC_007508	GGGCT	2	10	188467	188476	0 %	20 %	60 %	20 %	78045714
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192	NC_007508	GGTCT	2	10	190515	190524	0 %	40 %	40 %	20 %	78045715
193	NC_007508	TGCCG	2	10	191610	191619	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
194	NC_007508	CGCCC	2	10	191734	191743	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
195	NC_007508	CAGCG	2	10	191774	191783	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
196	NC_007508	GCCGA	2	10	192024	192033	20 %	0 %	40 %	40 %	78045716
197	NC_007508	CTGGT	2	10	192495	192504	0 %	40 %	40 %	20 %	78045716
198	NC_007508	CAAGG	2	10	193742	193751	40 %	0 %	40 %	20 %	78045717
199	NC_007508	GCCAG	2	10	195311	195320	20 %	0 %	40 %	40 %	78045718
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239	NC_007508	GGGCG	2	10	242523	242532	0 %	0 %	80 %	20 %	78045763
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241	NC_007508	GCAAA	2	10	246222	246231	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
242	NC_007508	CAGGC	2	10	246244	246253	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
243	NC_007508	TTCCT	2	10	246365	246374	0 %	60 %	0 %	40 %	78045766
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246	NC_007508	GCCGC	2	10	252809	252818	0 %	0 %	40 %	60 %	78045770
247	NC_007508	CAGGC	2	10	253340	253349	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
248	NC_007508	CGCTC	2	10	254868	254877	0 %	20 %	20 %	60 %	78045772
249	NC_007508	CTGGT	2	10	255900	255909	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
250	NC_007508	ACAGC	2	10	259001	259010	40 %	0 %	20 %	40 %	78045776
251	NC_007508	CAGTC	2	10	259805	259814	20 %	20 %	20 %	40 %	78045776
252	NC_007508	CGAAC	2	10	259910	259919	40 %	0 %	20 %	40 %	78045776
253	NC_007508	TCCCA	2	10	260895	260904	20 %	20 %	0 %	60 %	78045776
254	NC_007508	GTCTT	2	10	261582	261591	0 %	60 %	20 %	20 %	78045777
255	NC_007508	GAGGT	2	10	261667	261676	20 %	20 %	60 %	0 %	78045777
256	NC_007508	TTGCG	2	10	262578	262587	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
257	NC_007508	AATTG	2	10	263756	263765	40 %	40 %	20 %	0 %	78045780
258	NC_007508	TTCGA	2	10	264742	264751	20 %	40 %	20 %	20 %	78045781
259	NC_007508	TGGAA	2	10	265387	265396	40 %	20 %	40 %	0 %	78045782
260	NC_007508	GCAAA	2	10	265511	265520	60 %	0 %	20 %	20 %	78045782
261	NC_007508	AAGTA	2	10	265635	265644	60 %	20 %	20 %	0 %	78045782
262	NC_007508	CGGGC	2	10	269884	269893	0 %	0 %	60 %	40 %	78045786
263	NC_007508	GCGCA	2	10	272160	272169	20 %	0 %	40 %	40 %	78045787
264	NC_007508	CTGGC	2	10	273910	273919	0 %	20 %	40 %	40 %	78045788
265	NC_007508	GCAGC	2	10	273946	273955	20 %	0 %	40 %	40 %	78045788
266	NC_007508	CCGCG	2	10	275077	275086	0 %	0 %	40 %	60 %	78045789
267	NC_007508	AGCGG	2	10	275946	275955	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
268	NC_007508	CGCTG	2	10	277259	277268	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
269	NC_007508	CAAGG	2	10	278777	278786	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
270	NC_007508	CGCGC	2	10	279911	279920	0 %	0 %	40 %	60 %	78045795
271	NC_007508	GCTGG	2	10	280064	280073	0 %	20 %	60 %	20 %	78045795
272	NC_007508	CGGCC	2	10	280199	280208	0 %	0 %	40 %	60 %	78045795
273	NC_007508	CCGCG	2	10	283198	283207	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
274	NC_007508	GCGAT	2	10	283613	283622	20 %	20 %	40 %	20 %	78045799
275	NC_007508	GCGCG	2	10	283653	283662	0 %	0 %	60 %	40 %	78045799
276	NC_007508	GCAGC	2	10	285094	285103	20 %	0 %	40 %	40 %	78045799
277	NC_007508	ACCTG	2	10	288329	288338	20 %	20 %	20 %	40 %	78045803
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279	NC_007508	ACCCG	2	10	293200	293209	20 %	0 %	20 %	60 %	78045809
280	NC_007508	GTGGC	2	10	293822	293831	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
281	NC_007508	CCGGC	2	10	293965	293974	0 %	0 %	40 %	60 %	78045810
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290	NC_007508	CCGGC	2	10	301426	301435	0 %	0 %	40 %	60 %	78045816
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394	NC_007508	TGCAG	2	10	410269	410278	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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401	NC_007508	GGCGT	2	10	418119	418128	0 %	20 %	60 %	20 %	78045922
402	NC_007508	ACCCG	2	10	419439	419448	20 %	0 %	20 %	60 %	78045923
403	NC_007508	CCTTG	2	10	420440	420449	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
404	NC_007508	CGTGC	2	10	420675	420684	0 %	20 %	40 %	40 %	78045924
405	NC_007508	CTGCG	2	10	421045	421054	0 %	20 %	40 %	40 %	78045924
406	NC_007508	CCAGG	2	10	421603	421612	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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443	NC_007508	CCAGC	2	10	458459	458468	20 %	0 %	20 %	60 %	78045961
444	NC_007508	CAGTT	2	10	459554	459563	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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