MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 chromosome

Total Repeats: 127494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007508	TGG	2	6	119381	119386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045658
3002	NC_007508	CG	3	6	119387	119392	0 %	0 %	50 %	50 %	78045658
3003	NC_007508	GC	4	8	119441	119448	0 %	0 %	50 %	50 %	78045658
3004	NC_007508	GCG	2	6	119465	119470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045658
3005	NC_007508	TGG	2	6	119480	119485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045658
3006	NC_007508	GGCCAG	2	12	119512	119523	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	78045658
3007	NC_007508	GC	3	6	119546	119551	0 %	0 %	50 %	50 %	78045658
3008	NC_007508	TGC	2	6	119564	119569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3009	NC_007508	CGG	2	6	119604	119609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045658
3010	NC_007508	TGC	2	6	119612	119617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3011	NC_007508	GAC	2	6	119644	119649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3012	NC_007508	GC	3	6	119661	119666	0 %	0 %	50 %	50 %	78045658
3013	NC_007508	GCA	2	6	119675	119680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3014	NC_007508	CAG	2	6	119716	119721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3015	NC_007508	GGC	2	6	119742	119747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045658
3016	NC_007508	GCC	2	6	119837	119842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045658
3017	NC_007508	GCAG	2	8	119985	119992	25 %	0 %	50 %	25 %	78045658
3018	NC_007508	GGC	2	6	120046	120051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045658
3019	NC_007508	CAGCG	2	10	120052	120061	20 %	0 %	40 %	40 %	78045658
3020	NC_007508	CGGG	2	8	120113	120120	0 %	0 %	75 %	25 %	78045658
3021	NC_007508	GATC	2	8	120123	120130	25 %	25 %	25 %	25 %	78045658
3022	NC_007508	GC	3	6	120157	120162	0 %	0 %	50 %	50 %	78045658
3023	NC_007508	GCCG	2	8	120188	120195	0 %	0 %	50 %	50 %	78045658
3024	NC_007508	CGCCAG	2	12	120226	120237	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78045658
3025	NC_007508	CACCG	2	10	120238	120247	20 %	0 %	20 %	60 %	78045658
3026	NC_007508	TCG	2	6	120260	120265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3027	NC_007508	AC	3	6	120269	120274	50 %	0 %	0 %	50 %	78045658
3028	NC_007508	TGG	2	6	120346	120351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045658
3029	NC_007508	GAGC	2	8	120357	120364	25 %	0 %	50 %	25 %	78045658
3030	NC_007508	GCT	2	6	120375	120380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3031	NC_007508	GAC	2	6	120415	120420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3032	NC_007508	CGA	2	6	120444	120449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3033	NC_007508	GC	3	6	120459	120464	0 %	0 %	50 %	50 %	78045658
3034	NC_007508	CGA	2	6	120507	120512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3035	NC_007508	GTCG	2	8	120531	120538	0 %	25 %	50 %	25 %	78045658
3036	NC_007508	GGC	2	6	120589	120594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045658
3037	NC_007508	CCA	2	6	120623	120628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045658
3038	NC_007508	GCA	2	6	120647	120652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3039	NC_007508	GC	4	8	120657	120664	0 %	0 %	50 %	50 %	78045658
3040	NC_007508	GCG	2	6	120668	120673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045658
3041	NC_007508	CGA	3	9	120708	120716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3042	NC_007508	GCA	2	6	120746	120751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3043	NC_007508	GCC	2	6	120817	120822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045658
3044	NC_007508	CAG	2	6	120823	120828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3045	NC_007508	TCG	2	6	120848	120853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3046	NC_007508	CAG	2	6	120888	120893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045658
3047	NC_007508	TGG	2	6	120917	120922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045658
3048	NC_007508	GC	3	6	120967	120972	0 %	0 %	50 %	50 %	78045658
3049	NC_007508	ACC	2	6	121105	121110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045658
3050	NC_007508	GC	3	6	121125	121130	0 %	0 %	50 %	50 %	78045658
3051	NC_007508	CGCA	2	8	121134	121141	25 %	0 %	25 %	50 %	78045658
3052	NC_007508	CTA	2	6	121203	121208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045658
3053	NC_007508	GCCCG	2	10	121212	121221	0 %	0 %	40 %	60 %	78045658
3054	NC_007508	GGC	2	6	121258	121263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045658
3055	NC_007508	CGCAC	2	10	121278	121287	20 %	0 %	20 %	60 %	78045659
3056	NC_007508	ACC	2	6	121288	121293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045659
3057	NC_007508	CGA	2	6	121328	121333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045659
3058	NC_007508	CCG	2	6	121399	121404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045659
3059	NC_007508	TC	3	6	121415	121420	0 %	50 %	0 %	50 %	78045659
3060	NC_007508	GCC	2	6	121464	121469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045659
3061	NC_007508	CTG	3	9	121482	121490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045659
3062	NC_007508	GCC	2	6	121509	121514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045659
3063	NC_007508	GCC	2	6	121533	121538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045659
3064	NC_007508	GGC	2	6	121550	121555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045659
3065	NC_007508	CAG	2	6	121595	121600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045659
3066	NC_007508	CGAC	2	8	121603	121610	25 %	0 %	25 %	50 %	78045659
3067	NC_007508	CGGC	2	8	121663	121670	0 %	0 %	50 %	50 %	78045659
3068	NC_007508	GCT	2	6	121727	121732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_007508	CCT	2	6	121773	121778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_007508	CGA	2	6	121863	121868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045660
3071	NC_007508	GGC	2	6	121897	121902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045660
3072	NC_007508	GGC	2	6	121906	121911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045660
3073	NC_007508	CTG	2	6	121916	121921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045660
3074	NC_007508	CGC	2	6	121930	121935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045660
3075	NC_007508	CCGG	2	8	121976	121983	0 %	0 %	50 %	50 %	78045660
3076	NC_007508	GCA	3	9	122017	122025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045660
3077	NC_007508	CGC	3	9	122055	122063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045660
3078	NC_007508	CG	3	6	122130	122135	0 %	0 %	50 %	50 %	78045660
3079	NC_007508	CGC	2	6	122152	122157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045660
3080	NC_007508	CG	3	6	122181	122186	0 %	0 %	50 %	50 %	78045660
3081	NC_007508	CGGCA	2	10	122341	122350	20 %	0 %	40 %	40 %	78045660
3082	NC_007508	CCGC	2	8	122438	122445	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3083	NC_007508	TTGA	2	8	122452	122459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_007508	CTC	2	6	122496	122501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_007508	GT	3	6	122513	122518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_007508	CGG	2	6	122563	122568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_007508	AAACG	2	10	122571	122580	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3088	NC_007508	CTG	2	6	122598	122603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_007508	T	6	6	122644	122649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_007508	CCA	2	6	122789	122794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045661
3091	NC_007508	CGG	2	6	122850	122855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045661
3092	NC_007508	ACA	2	6	122891	122896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045661
3093	NC_007508	CG	3	6	122931	122936	0 %	0 %	50 %	50 %	78045661
3094	NC_007508	GCG	2	6	122959	122964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045661
3095	NC_007508	TGC	2	6	122970	122975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045661
3096	NC_007508	AGG	2	6	122987	122992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045661
3097	NC_007508	CCA	2	6	123008	123013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045661
3098	NC_007508	CG	3	6	123178	123183	0 %	0 %	50 %	50 %	78045661
3099	NC_007508	GTG	2	6	123250	123255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045661
3100	NC_007508	GCT	2	6	123282	123287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045661
3101	NC_007508	GCC	2	6	123319	123324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045661
3102	NC_007508	GTG	2	6	123334	123339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045661
3103	NC_007508	GCAGA	2	10	123349	123358	40 %	0 %	40 %	20 %	78045661
3104	NC_007508	CTG	2	6	123400	123405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045661
3105	NC_007508	ACC	3	9	123505	123513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045661
3106	NC_007508	GCCA	2	8	123535	123542	25 %	0 %	25 %	50 %	78045661
3107	NC_007508	TCT	2	6	123590	123595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045661
3108	NC_007508	GAC	2	6	123616	123621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045661
3109	NC_007508	TCAA	2	8	123665	123672	50 %	25 %	0 %	25 %	78045661
3110	NC_007508	GT	3	6	123679	123684	0 %	50 %	50 %	0 %	78045661
3111	NC_007508	CG	4	8	123695	123702	0 %	0 %	50 %	50 %	78045661
3112	NC_007508	GC	3	6	123748	123753	0 %	0 %	50 %	50 %	78045661
3113	NC_007508	GGC	2	6	123756	123761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045661
3114	NC_007508	AGC	2	6	123821	123826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045661
3115	NC_007508	A	6	6	123830	123835	100 %	0 %	0 %	0 %	78045661
3116	NC_007508	TC	3	6	123837	123842	0 %	50 %	0 %	50 %	78045661
3117	NC_007508	CGG	2	6	123885	123890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045661
3118	NC_007508	CAA	2	6	123960	123965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045661
3119	NC_007508	AGG	2	6	123980	123985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045661
3120	NC_007508	GGT	2	6	123999	124004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045661
3121	NC_007508	CAC	2	6	124011	124016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045661
3122	NC_007508	CG	3	6	124120	124125	0 %	0 %	50 %	50 %	78045661
3123	NC_007508	TGC	2	6	124176	124181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045661
3124	NC_007508	GAT	2	6	124227	124232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045661
3125	NC_007508	AGCC	2	8	124346	124353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_007508	CTG	2	6	124363	124368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_007508	TGCA	2	8	124405	124412	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_007508	GGC	2	6	124449	124454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_007508	CAC	2	6	124490	124495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045662
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3131	NC_007508	TGT	2	6	124579	124584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045662
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3133	NC_007508	CGG	2	6	124595	124600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045662
3134	NC_007508	CTG	2	6	124601	124606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045662
3135	NC_007508	TCG	2	6	124648	124653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045662
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3137	NC_007508	GGC	2	6	124683	124688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045662
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3139	NC_007508	GC	3	6	124705	124710	0 %	0 %	50 %	50 %	78045662
3140	NC_007508	TCA	2	6	124741	124746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045662
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3144	NC_007508	GGTT	2	8	124921	124928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_007508	GC	3	6	125000	125005	0 %	0 %	50 %	50 %	78045663
3146	NC_007508	CTT	2	6	125013	125018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045663
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3148	NC_007508	TGGG	2	8	125122	125129	0 %	25 %	75 %	0 %	78045663
3149	NC_007508	TGG	2	6	125156	125161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045663
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3151	NC_007508	GCC	2	6	125300	125305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3152	NC_007508	GC	4	8	125375	125382	0 %	0 %	50 %	50 %	78045664
3153	NC_007508	TGGCG	2	10	125411	125420	0 %	20 %	60 %	20 %	78045664
3154	NC_007508	GCC	3	9	125458	125466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045664
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3156	NC_007508	GACTG	2	10	125611	125620	20 %	20 %	40 %	20 %	78045664
3157	NC_007508	CTGG	2	8	125651	125658	0 %	25 %	50 %	25 %	78045664
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3160	NC_007508	A	6	6	125822	125827	100 %	0 %	0 %	0 %	78045665
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3232	NC_007508	CAC	2	6	128735	128740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045667
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3238	NC_007508	TCG	2	6	129036	129041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045667
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3248	NC_007508	CAGG	2	8	129372	129379	25 %	0 %	50 %	25 %	78045667
3249	NC_007508	CTGC	2	8	129396	129403	0 %	25 %	25 %	50 %	78045667
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3251	NC_007508	CCAGC	2	10	129473	129482	20 %	0 %	20 %	60 %	78045667
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3370	NC_007508	GCA	3	9	133842	133850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3371	NC_007508	GCA	2	6	133891	133896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3499	NC_007508	ACCGCC	2	12	139232	139243	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	78045676
3500	NC_007508	CAA	2	6	139252	139257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045676

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