MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 chromosome

Total Repeats: 127494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_007508	GC	3	6	562139	562144	0 %	0 %	50 %	50 %	78046052
14002	NC_007508	TGC	2	6	562230	562235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046052
14003	NC_007508	C	6	6	562266	562271	0 %	0 %	0 %	100 %	78046052
14004	NC_007508	CTT	2	6	562309	562314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78046052
14005	NC_007508	TGC	2	6	562440	562445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046052
14006	NC_007508	CCTG	2	8	562455	562462	0 %	25 %	25 %	50 %	78046052
14007	NC_007508	GCC	2	6	562487	562492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78046052
14008	NC_007508	CG	4	8	562498	562505	0 %	0 %	50 %	50 %	78046052
14009	NC_007508	GCG	2	6	562537	562542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78046052
14010	NC_007508	GCG	2	6	562555	562560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78046052
14011	NC_007508	TGG	2	6	562576	562581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78046052
14012	NC_007508	TGC	2	6	562635	562640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046052
14013	NC_007508	GC	3	6	562715	562720	0 %	0 %	50 %	50 %	78046052
14014	NC_007508	CGG	2	6	562751	562756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78046052
14015	NC_007508	CGC	2	6	562759	562764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78046052
14016	NC_007508	CTG	2	6	562780	562785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046052
14017	NC_007508	CCTG	2	8	562795	562802	0 %	25 %	25 %	50 %	78046052
14018	NC_007508	TGC	2	6	562821	562826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046052
14019	NC_007508	GTT	2	6	562988	562993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78046052
14020	NC_007508	GC	3	6	563057	563062	0 %	0 %	50 %	50 %	78046052
14021	NC_007508	TTC	2	6	563063	563068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78046052
14022	NC_007508	CTT	2	6	563146	563151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78046052
14023	NC_007508	CTGC	2	8	563239	563246	0 %	25 %	25 %	50 %	78046052
14024	NC_007508	AGC	2	6	563247	563252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78046052
14025	NC_007508	CTC	2	6	563283	563288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14026	NC_007508	GTGTT	2	10	563460	563469	0 %	60 %	40 %	0 %	78046053
14027	NC_007508	GTC	2	6	563552	563557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046053
14028	NC_007508	CG	3	6	563569	563574	0 %	0 %	50 %	50 %	78046053
14029	NC_007508	GCC	2	6	563576	563581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78046053
14030	NC_007508	GAGATG	2	12	563583	563594	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	78046053
14031	NC_007508	CG	3	6	563614	563619	0 %	0 %	50 %	50 %	78046053
14032	NC_007508	CCG	2	6	563646	563651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78046053
14033	NC_007508	ATT	2	6	563675	563680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78046053
14034	NC_007508	CAG	3	9	563720	563728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78046053
14035	NC_007508	CGG	2	6	563774	563779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78046053
14036	NC_007508	CGC	2	6	563824	563829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78046053
14037	NC_007508	CTG	2	6	563854	563859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046053
14038	NC_007508	AGG	2	6	563912	563917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_007508	CTGC	2	8	563986	563993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14040	NC_007508	G	6	6	564047	564052	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_007508	GTC	2	6	564133	564138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046054
14042	NC_007508	CGC	2	6	564192	564197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78046054
14043	NC_007508	GATC	2	8	564360	564367	25 %	25 %	25 %	25 %	78046054
14044	NC_007508	CGG	2	6	564450	564455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78046054
14045	NC_007508	GTC	2	6	564464	564469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046054
14046	NC_007508	GGC	2	6	564508	564513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78046054
14047	NC_007508	CTG	2	6	564534	564539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046054
14048	NC_007508	CGC	2	6	564541	564546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78046054
14049	NC_007508	CTG	2	6	564561	564566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046054
14050	NC_007508	GCAG	2	8	564583	564590	25 %	0 %	50 %	25 %	78046054
14051	NC_007508	TCC	2	6	564647	564652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78046054
14052	NC_007508	GC	3	6	564676	564681	0 %	0 %	50 %	50 %	78046054
14053	NC_007508	TG	3	6	564700	564705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_007508	GCG	2	6	564737	564742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14055	NC_007508	GCCG	2	8	564744	564751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14056	NC_007508	GCA	2	6	564755	564760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14057	NC_007508	GCA	2	6	564869	564874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_007508	GATG	2	8	564888	564895	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_007508	GTGC	2	8	564920	564927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14060	NC_007508	CACC	2	8	564965	564972	25 %	0 %	0 %	75 %	78046055
14061	NC_007508	GC	3	6	564980	564985	0 %	0 %	50 %	50 %	78046055
14062	NC_007508	TGC	2	6	565008	565013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046055
14063	NC_007508	ACT	2	6	565029	565034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78046055
14064	NC_007508	GTT	2	6	565086	565091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78046055
14065	NC_007508	GTA	2	6	565131	565136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78046055
14066	NC_007508	GCT	2	6	565218	565223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046055
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14068	NC_007508	CTG	2	6	565349	565354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046055
14069	NC_007508	TGC	2	6	565428	565433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046055
14070	NC_007508	GTT	2	6	565440	565445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78046055
14071	NC_007508	TGA	2	6	565467	565472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78046055
14072	NC_007508	TGCGC	2	10	565542	565551	0 %	20 %	40 %	40 %	78046055
14073	NC_007508	AGGC	2	8	565553	565560	25 %	0 %	50 %	25 %	78046055
14074	NC_007508	AC	3	6	565615	565620	50 %	0 %	0 %	50 %	78046055
14075	NC_007508	TGG	2	6	565647	565652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78046055
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14077	NC_007508	CGC	2	6	565777	565782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14078	NC_007508	GTGC	2	8	565798	565805	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14079	NC_007508	AATC	2	8	565806	565813	50 %	25 %	0 %	25 %	78046056
14080	NC_007508	CGAT	2	8	565866	565873	25 %	25 %	25 %	25 %	78046056
14081	NC_007508	CGGC	2	8	565879	565886	0 %	0 %	50 %	50 %	78046056
14082	NC_007508	CGGGC	2	10	565892	565901	0 %	0 %	60 %	40 %	78046056
14083	NC_007508	CGG	2	6	565961	565966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78046056
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14085	NC_007508	ATG	2	6	566034	566039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78046056
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14087	NC_007508	CATCGG	2	12	566050	566061	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78046056
14088	NC_007508	GCA	2	6	566106	566111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78046056
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14092	NC_007508	TCGGG	2	10	566554	566563	0 %	20 %	60 %	20 %	78046056
14093	NC_007508	CAC	2	6	566567	566572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78046056
14094	NC_007508	CGGT	2	8	566589	566596	0 %	25 %	50 %	25 %	78046056
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14096	NC_007508	CGG	2	6	566632	566637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78046056
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14098	NC_007508	CGC	2	6	566823	566828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14099	NC_007508	CG	3	6	566853	566858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14100	NC_007508	CGGG	2	8	566890	566897	0 %	0 %	75 %	25 %	78046057
14101	NC_007508	GGT	2	6	567006	567011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78046057
14102	NC_007508	GCT	2	6	567015	567020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046057
14103	NC_007508	GC	3	6	567069	567074	0 %	0 %	50 %	50 %	78046057
14104	NC_007508	CCA	2	6	567113	567118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78046057
14105	NC_007508	ACC	2	6	567161	567166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78046057
14106	NC_007508	CGC	2	6	567199	567204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78046057
14107	NC_007508	GCCA	2	8	567220	567227	25 %	0 %	25 %	50 %	78046057
14108	NC_007508	CGC	2	6	567234	567239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78046057
14109	NC_007508	CCG	2	6	567461	567466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162138543
14110	NC_007508	AAC	2	6	567493	567498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162138543
14111	NC_007508	CCA	3	9	567683	567691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162138543
14112	NC_007508	AGCC	2	8	567708	567715	25 %	0 %	25 %	50 %	162138543
14113	NC_007508	TGC	2	6	567812	567817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162138543
14114	NC_007508	GC	3	6	567900	567905	0 %	0 %	50 %	50 %	162138543
14115	NC_007508	CCG	2	6	567909	567914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162138543
14116	NC_007508	CGACG	2	10	567921	567930	20 %	0 %	40 %	40 %	162138543
14117	NC_007508	ACA	2	6	567974	567979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162138543
14118	NC_007508	CGGC	2	8	567995	568002	0 %	0 %	50 %	50 %	162138543
14119	NC_007508	TCG	2	6	568013	568018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162138543
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14121	NC_007508	CGC	2	6	568108	568113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78046059
14122	NC_007508	GCT	2	6	568145	568150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046059
14123	NC_007508	TCA	2	6	568159	568164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78046059
14124	NC_007508	GGCC	2	8	568205	568212	0 %	0 %	50 %	50 %	78046059
14125	NC_007508	GGA	2	6	568214	568219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78046059
14126	NC_007508	GC	3	6	568223	568228	0 %	0 %	50 %	50 %	78046059
14127	NC_007508	ACT	2	6	568315	568320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78046059
14128	NC_007508	CCGG	2	8	568367	568374	0 %	0 %	50 %	50 %	78046059
14129	NC_007508	GC	3	6	568377	568382	0 %	0 %	50 %	50 %	78046059
14130	NC_007508	GCGG	2	8	568444	568451	0 %	0 %	75 %	25 %	78046059
14131	NC_007508	CTGGA	2	10	568467	568476	20 %	20 %	40 %	20 %	78046059
14132	NC_007508	GC	3	6	568512	568517	0 %	0 %	50 %	50 %	78046059
14133	NC_007508	CGC	2	6	568595	568600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14134	NC_007508	AAGG	2	8	568620	568627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14135	NC_007508	GGC	2	6	568641	568646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14136	NC_007508	CGT	2	6	568682	568687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14137	NC_007508	CAGC	2	8	568743	568750	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14138	NC_007508	GCT	2	6	568778	568783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14139	NC_007508	GC	3	6	568816	568821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14140	NC_007508	ACA	2	6	568868	568873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78046060
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14153	NC_007508	CTG	2	6	569491	569496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046060
14154	NC_007508	GCC	2	6	569533	569538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78046060
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14157	NC_007508	CGC	2	6	569817	569822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14158	NC_007508	GTT	2	6	569837	569842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14159	NC_007508	ACG	2	6	569845	569850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14160	NC_007508	CTG	2	6	569862	569867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14161	NC_007508	CAG	2	6	569876	569881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14162	NC_007508	GAC	2	6	569911	569916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14163	NC_007508	TCGC	2	8	569934	569941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14164	NC_007508	TGG	2	6	569945	569950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14165	NC_007508	TGG	2	6	569954	569959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14166	NC_007508	CGT	2	6	569968	569973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14167	NC_007508	CCGCC	2	10	569974	569983	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14168	NC_007508	GGAA	2	8	569994	570001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14169	NC_007508	GTC	2	6	570003	570008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14170	NC_007508	CAT	2	6	570188	570193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78046061
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14172	NC_007508	GTC	2	6	570261	570266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046061
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14174	NC_007508	CGG	2	6	570359	570364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78046061
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14184	NC_007508	CG	3	6	570798	570803	0 %	0 %	50 %	50 %	78046061
14185	NC_007508	TGCG	2	8	570805	570812	0 %	25 %	50 %	25 %	78046061
14186	NC_007508	CGG	2	6	570848	570853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78046061
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14188	NC_007508	TCG	2	6	570870	570875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046061
14189	NC_007508	GC	3	6	570888	570893	0 %	0 %	50 %	50 %	78046061
14190	NC_007508	CTG	2	6	570984	570989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046061
14191	NC_007508	GATC	2	8	571025	571032	25 %	25 %	25 %	25 %	78046061
14192	NC_007508	GGCC	2	8	571154	571161	0 %	0 %	50 %	50 %	78046061
14193	NC_007508	TGC	2	6	571177	571182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046061
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14195	NC_007508	CGGC	2	8	571195	571202	0 %	0 %	50 %	50 %	78046061
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14198	NC_007508	CGCCAT	2	12	571322	571333	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78046061
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14200	NC_007508	CCGACC	2	12	571399	571410	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	78046061
14201	NC_007508	GC	4	8	571439	571446	0 %	0 %	50 %	50 %	78046061
14202	NC_007508	GGC	2	6	571466	571471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78046061
14203	NC_007508	GGGCA	2	10	571490	571499	20 %	0 %	60 %	20 %	78046062
14204	NC_007508	ACG	2	6	571502	571507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78046062
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14206	NC_007508	CA	3	6	571613	571618	50 %	0 %	0 %	50 %	78046062
14207	NC_007508	CTG	2	6	571676	571681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046062
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14210	NC_007508	GCTG	2	8	571867	571874	0 %	25 %	50 %	25 %	78046062
14211	NC_007508	GAA	2	6	571964	571969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78046062
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14213	NC_007508	CTG	3	9	571997	572005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046062
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14215	NC_007508	GCG	2	6	572030	572035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78046062
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14220	NC_007508	GCT	2	6	572122	572127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046062
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14223	NC_007508	GCG	2	6	572237	572242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78046062
14224	NC_007508	TTC	2	6	572261	572266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78046062
14225	NC_007508	ATGCCA	2	12	572280	572291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78046062
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14227	NC_007508	GC	3	6	572328	572333	0 %	0 %	50 %	50 %	78046062
14228	NC_007508	ACCA	2	8	572354	572361	50 %	0 %	0 %	50 %	78046062
14229	NC_007508	GC	3	6	572379	572384	0 %	0 %	50 %	50 %	78046062
14230	NC_007508	CCACGG	2	12	572481	572492	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78046062
14231	NC_007508	TG	3	6	572505	572510	0 %	50 %	50 %	0 %	78046062
14232	NC_007508	GGC	2	6	572518	572523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78046062
14233	NC_007508	GCA	3	9	572530	572538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78046062
14234	NC_007508	GAC	2	6	572569	572574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14235	NC_007508	CGC	2	6	572605	572610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78046063
14236	NC_007508	TTG	2	6	572672	572677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78046063
14237	NC_007508	GGTT	2	8	572793	572800	0 %	50 %	50 %	0 %	78046063
14238	NC_007508	TGGA	2	8	572802	572809	25 %	25 %	50 %	0 %	78046063
14239	NC_007508	TGC	2	6	573031	573036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046063
14240	NC_007508	CGG	2	6	573124	573129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78046063
14241	NC_007508	GCC	2	6	573194	573199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78046063
14242	NC_007508	CGC	2	6	573237	573242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78046063
14243	NC_007508	CGT	2	6	573252	573257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046063
14244	NC_007508	TGA	2	6	573300	573305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78046063
14245	NC_007508	TGC	2	6	573373	573378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14246	NC_007508	CGC	3	9	573405	573413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14247	NC_007508	AGCG	2	8	573462	573469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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14484	NC_007508	CG	3	6	584015	584020	0 %	0 %	50 %	50 %	78046072
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14488	NC_007508	TGC	2	6	584199	584204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046072
14489	NC_007508	TGC	2	6	584260	584265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046072
14490	NC_007508	TGC	2	6	584307	584312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78046072
14491	NC_007508	GC	3	6	584311	584316	0 %	0 %	50 %	50 %	78046072
14492	NC_007508	CG	3	6	584318	584323	0 %	0 %	50 %	50 %	78046072
14493	NC_007508	GC	5	10	584342	584351	0 %	0 %	50 %	50 %	78046072
14494	NC_007508	CCG	2	6	584436	584441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14495	NC_007508	TGC	2	6	584465	584470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14496	NC_007508	GC	3	6	584477	584482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14497	NC_007508	GCCC	2	8	584518	584525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14498	NC_007508	CGA	2	6	584580	584585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78046073
14499	NC_007508	GC	3	6	584602	584607	0 %	0 %	50 %	50 %	78046073
14500	NC_007508	CG	3	6	584628	584633	0 %	0 %	50 %	50 %	78046073

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