MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV183

Total Repeats: 3740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007507	CAC	2	6	169959	169964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045471
3502	NC_007507	TCG	2	6	169967	169972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045471
3503	NC_007507	CTT	2	6	170004	170009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045471
3504	NC_007507	TGCC	2	8	170034	170041	0 %	25 %	25 %	50 %	78045471
3505	NC_007507	TCAGC	2	10	170054	170063	20 %	20 %	20 %	40 %	78045471
3506	NC_007507	ACC	2	6	170175	170180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045471
3507	NC_007507	TCG	2	6	170242	170247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045471
3508	NC_007507	GTG	2	6	170295	170300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045471
3509	NC_007507	CGGG	2	8	170312	170319	0 %	0 %	75 %	25 %	78045471
3510	NC_007507	CTC	2	6	170334	170339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045471
3511	NC_007507	GCA	3	9	170359	170367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045471
3512	NC_007507	TCGA	2	8	170443	170450	25 %	25 %	25 %	25 %	78045471
3513	NC_007507	CGA	2	6	170506	170511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045471
3514	NC_007507	CG	3	6	170530	170535	0 %	0 %	50 %	50 %	78045471
3515	NC_007507	AGC	2	6	170545	170550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045471
3516	NC_007507	GCC	2	6	170614	170619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045471
3517	NC_007507	GCGCT	2	10	170646	170655	0 %	20 %	40 %	40 %	78045471
3518	NC_007507	CGC	2	6	170675	170680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045471
3519	NC_007507	AAC	2	6	170686	170691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045471
3520	NC_007507	GGT	2	6	170712	170717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045471
3521	NC_007507	AGC	2	6	170902	170907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045471
3522	NC_007507	GTG	2	6	170908	170913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045471
3523	NC_007507	CCT	2	6	170930	170935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045471
3524	NC_007507	TG	3	6	170965	170970	0 %	50 %	50 %	0 %	78045471
3525	NC_007507	CGCATC	2	12	170998	171009	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78045471
3526	NC_007507	CGC	2	6	171045	171050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045471
3527	NC_007507	GGTC	2	8	171116	171123	0 %	25 %	50 %	25 %	78045471
3528	NC_007507	CG	3	6	171180	171185	0 %	0 %	50 %	50 %	78045471
3529	NC_007507	GGA	2	6	171225	171230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045471
3530	NC_007507	CGGT	2	8	171303	171310	0 %	25 %	50 %	25 %	78045471
3531	NC_007507	CCA	2	6	171395	171400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045471
3532	NC_007507	CT	3	6	171426	171431	0 %	50 %	0 %	50 %	78045471
3533	NC_007507	ACC	2	6	171441	171446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045471
3534	NC_007507	CAG	2	6	171489	171494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045471
3535	NC_007507	TGCC	2	8	171503	171510	0 %	25 %	25 %	50 %	78045471
3536	NC_007507	GAT	2	6	171630	171635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045471
3537	NC_007507	TAA	2	6	171641	171646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78045471
3538	NC_007507	CGG	2	6	171727	171732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045471
3539	NC_007507	AGG	2	6	171818	171823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045471
3540	NC_007507	CT	3	6	171829	171834	0 %	50 %	0 %	50 %	78045471
3541	NC_007507	GC	3	6	171881	171886	0 %	0 %	50 %	50 %	78045471
3542	NC_007507	CCG	2	6	171896	171901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045471
3543	NC_007507	CGC	2	6	171907	171912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045471
3544	NC_007507	CTG	2	6	171959	171964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045471
3545	NC_007507	CGT	2	6	172007	172012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045471
3546	NC_007507	AGG	2	6	172064	172069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045471
3547	NC_007507	CAG	2	6	172158	172163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045471
3548	NC_007507	GC	3	6	172170	172175	0 %	0 %	50 %	50 %	78045471
3549	NC_007507	AG	3	6	172226	172231	50 %	0 %	50 %	0 %	78045471
3550	NC_007507	CAG	2	6	172237	172242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045471
3551	NC_007507	CAG	2	6	172319	172324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045471
3552	NC_007507	CGA	2	6	172364	172369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045471
3553	NC_007507	ACC	3	9	172407	172415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045471
3554	NC_007507	TCA	2	6	172468	172473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045471
3555	NC_007507	GAA	2	6	172505	172510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045471
3556	NC_007507	GGT	2	6	172542	172547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045471
3557	NC_007507	ACT	2	6	172602	172607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045471
3558	NC_007507	CGA	2	6	172649	172654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045471
3559	NC_007507	GCT	2	6	172706	172711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_007507	CT	4	8	172762	172769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_007507	GC	3	6	172877	172882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_007507	ACC	2	6	172893	172898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_007507	TCC	2	6	172942	172947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045472
3564	NC_007507	CTCA	2	8	172962	172969	25 %	25 %	0 %	50 %	78045472
3565	NC_007507	AGCA	2	8	172980	172987	50 %	0 %	25 %	25 %	78045472
3566	NC_007507	CCG	2	6	172991	172996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045472
3567	NC_007507	GTA	2	6	173064	173069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045472
3568	NC_007507	GCT	2	6	173172	173177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045472
3569	NC_007507	TC	3	6	173204	173209	0 %	50 %	0 %	50 %	78045472
3570	NC_007507	GTC	2	6	173280	173285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045472
3571	NC_007507	CAG	2	6	173367	173372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045472
3572	NC_007507	CCCTG	2	10	173409	173418	0 %	20 %	20 %	60 %	78045472
3573	NC_007507	GAGAT	2	10	173434	173443	40 %	20 %	40 %	0 %	78045472
3574	NC_007507	GGAG	2	8	173533	173540	25 %	0 %	75 %	0 %	78045472
3575	NC_007507	ATG	2	6	173578	173583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045472
3576	NC_007507	GGT	2	6	173654	173659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045472
3577	NC_007507	GTA	2	6	173679	173684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045472
3578	NC_007507	TCG	2	6	173764	173769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045472
3579	NC_007507	GT	3	6	173774	173779	0 %	50 %	50 %	0 %	78045472
3580	NC_007507	GCG	2	6	173820	173825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045472
3581	NC_007507	TCT	2	6	173879	173884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045472
3582	NC_007507	CGC	2	6	173939	173944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045472
3583	NC_007507	CCA	2	6	174033	174038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045472
3584	NC_007507	GCT	2	6	174057	174062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045472
3585	NC_007507	CGC	2	6	174086	174091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045472
3586	NC_007507	GCC	2	6	174108	174113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045472
3587	NC_007507	GTC	2	6	174123	174128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045472
3588	NC_007507	CGAAC	2	10	174134	174143	40 %	0 %	20 %	40 %	78045472
3589	NC_007507	GATCG	2	10	174265	174274	20 %	20 %	40 %	20 %	78045473
3590	NC_007507	GCG	2	6	174276	174281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045473
3591	NC_007507	CG	3	6	174440	174445	0 %	0 %	50 %	50 %	78045473
3592	NC_007507	TGCT	2	8	174475	174482	0 %	50 %	25 %	25 %	78045473
3593	NC_007507	CAC	2	6	174493	174498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045473
3594	NC_007507	AGC	2	6	174554	174559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045473
3595	NC_007507	AGAT	2	8	174590	174597	50 %	25 %	25 %	0 %	78045473
3596	NC_007507	GGT	2	6	174642	174647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045473
3597	NC_007507	TGT	2	6	174693	174698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045473
3598	NC_007507	GTG	2	6	174718	174723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045473
3599	NC_007507	GCG	2	6	174775	174780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045473
3600	NC_007507	CAG	2	6	174799	174804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045473
3601	NC_007507	CT	3	6	174808	174813	0 %	50 %	0 %	50 %	78045473
3602	NC_007507	TACT	2	8	174918	174925	25 %	50 %	0 %	25 %	78045474
3603	NC_007507	GAC	2	6	174950	174955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045474
3604	NC_007507	GCA	2	6	175004	175009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045474
3605	NC_007507	GAT	2	6	175119	175124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045474
3606	NC_007507	GC	3	6	175214	175219	0 %	0 %	50 %	50 %	78045474
3607	NC_007507	CAG	3	9	175275	175283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045474
3608	NC_007507	ATC	2	6	175318	175323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045474
3609	NC_007507	A	6	6	175363	175368	100 %	0 %	0 %	0 %	78045475
3610	NC_007507	AAG	2	6	175382	175387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045475
3611	NC_007507	AGT	2	6	175422	175427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045475
3612	NC_007507	GAA	2	6	175529	175534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045475
3613	NC_007507	GCA	2	6	175549	175554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045475
3614	NC_007507	TCA	2	6	175570	175575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045475
3615	NC_007507	TGC	2	6	175626	175631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045475
3616	NC_007507	GCG	2	6	175668	175673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045475
3617	NC_007507	TGC	2	6	175761	175766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045475
3618	NC_007507	CGT	2	6	175882	175887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045475
3619	NC_007507	GTT	2	6	175919	175924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045476
3620	NC_007507	CGTTC	2	10	175936	175945	0 %	40 %	20 %	40 %	78045476
3621	NC_007507	GCG	2	6	176094	176099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045476
3622	NC_007507	TTG	2	6	176125	176130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045476
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3624	NC_007507	CG	3	6	176204	176209	0 %	0 %	50 %	50 %	78045476
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.