MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV19

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007505	CGG	2	6	184	189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045243
2	NC_007505	GTC	2	6	195	200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045243
3	NC_007505	GAT	2	6	342	347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045243
4	NC_007505	AAG	2	6	349	354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045243
5	NC_007505	AGC	2	6	370	375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045243
6	NC_007505	TGC	2	6	389	394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045243
7	NC_007505	AAT	2	6	664	669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007505	GCA	2	6	721	726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045244
9	NC_007505	GAC	2	6	754	759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045244
10	NC_007505	TTC	2	6	773	778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045244
11	NC_007505	TCG	2	6	797	802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045244
12	NC_007505	GCC	2	6	829	834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045244
13	NC_007505	AAC	2	6	847	852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045244
14	NC_007505	ACG	2	6	956	961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045244
15	NC_007505	GGC	2	6	1015	1020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
16	NC_007505	CGG	2	6	1044	1049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
17	NC_007505	ATC	2	6	1066	1071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045244
18	NC_007505	TGG	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045244
19	NC_007505	GGC	2	6	1224	1229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
20	NC_007505	TGG	2	6	1277	1282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045244
21	NC_007505	CGG	2	6	1338	1343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
22	NC_007505	GGC	2	6	1410	1415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
23	NC_007505	CCG	3	9	1535	1543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045244
24	NC_007505	GGC	2	6	1668	1673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
25	NC_007505	CTA	2	6	1752	1757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045244
26	NC_007505	CAT	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045244
27	NC_007505	AAG	2	6	1850	1855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045244
28	NC_007505	GCG	3	9	1921	1929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
29	NC_007505	TGG	2	6	2366	2371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045244
30	NC_007505	CAT	2	6	2448	2453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045244
31	NC_007505	ATC	2	6	2629	2634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045244
32	NC_007505	ACA	2	6	2684	2689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045244
33	NC_007505	GCG	2	6	2723	2728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
34	NC_007505	CCA	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045244
35	NC_007505	CTC	2	6	2813	2818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045244
36	NC_007505	GCG	2	6	2864	2869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
37	NC_007505	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
38	NC_007505	TTG	2	6	3125	3130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045245
39	NC_007505	GCC	2	6	3180	3185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045245
40	NC_007505	TGG	2	6	3195	3200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045245
41	NC_007505	GGT	2	6	3300	3305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045245
42	NC_007505	GTT	2	6	3347	3352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045245
43	NC_007505	TCC	2	6	3453	3458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045245
44	NC_007505	CGG	2	6	3634	3639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045245
45	NC_007505	CAT	2	6	3830	3835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045246
46	NC_007505	ATG	2	6	3843	3848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045246
47	NC_007505	CAG	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045246
48	NC_007505	GCA	3	9	4001	4009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045246
49	NC_007505	GGT	2	6	4077	4082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045246
50	NC_007505	AAG	2	6	4270	4275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045246
51	NC_007505	GTG	3	9	4305	4313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007505	GCT	2	6	4374	4379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007505	GGT	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007505	GCC	2	6	4482	4487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007505	CCA	2	6	4641	4646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045247
56	NC_007505	GCG	2	6	4713	4718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045247
57	NC_007505	GCC	2	6	4750	4755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045247
58	NC_007505	GAC	2	6	4785	4790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045247
59	NC_007505	TCA	3	9	4828	4836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045247
60	NC_007505	CGT	2	6	4838	4843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045247
61	NC_007505	CTT	2	6	4899	4904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045247
62	NC_007505	TCT	2	6	5076	5081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045248
63	NC_007505	CGG	2	6	5092	5097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045248
64	NC_007505	CTT	2	6	5178	5183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045248
65	NC_007505	GCC	3	9	5347	5355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045249
66	NC_007505	GCT	2	6	5507	5512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045249
67	NC_007505	GTC	2	6	5529	5534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045249
68	NC_007505	TGC	2	6	5697	5702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045250
69	NC_007505	CCG	2	6	5738	5743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045250
70	NC_007505	TGC	2	6	5746	5751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045250
71	NC_007505	CGC	2	6	5919	5924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045250
72	NC_007505	TCG	2	6	5953	5958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045250
73	NC_007505	CAA	2	6	6038	6043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045250
74	NC_007505	AGC	2	6	6124	6129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045250
75	NC_007505	GAC	3	9	6179	6187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045250
76	NC_007505	CGG	2	6	6219	6224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045250
77	NC_007505	GAG	2	6	6344	6349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045250
78	NC_007505	GGA	2	6	6431	6436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045250
79	NC_007505	CAT	2	6	6563	6568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045250
80	NC_007505	GCG	2	6	6574	6579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045250
81	NC_007505	CGG	2	6	6868	6873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045250
82	NC_007505	TCA	2	6	6877	6882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045250
83	NC_007505	ACC	2	6	7035	7040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045250
84	NC_007505	AGT	2	6	7049	7054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045250
85	NC_007505	CAC	2	6	7279	7284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007505	CGC	2	6	7347	7352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045251
87	NC_007505	CAG	2	6	7681	7686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045252
88	NC_007505	TGC	2	6	7730	7735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045252
89	NC_007505	CGG	2	6	7776	7781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045252
90	NC_007505	CAG	2	6	7867	7872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045252
91	NC_007505	GCT	2	6	7892	7897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045252
92	NC_007505	ACC	2	6	7965	7970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007505	GGA	2	6	8028	8033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007505	GCC	2	6	8128	8133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045253
95	NC_007505	CGC	2	6	8137	8142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045253
96	NC_007505	AGT	2	6	8239	8244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045253
97	NC_007505	CGC	2	6	8273	8278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045253
98	NC_007505	CAA	2	6	8468	8473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045253
99	NC_007505	CTG	2	6	8520	8525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045253
100	NC_007505	CGG	2	6	8610	8615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045253
101	NC_007505	GCC	2	6	8680	8685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045253
102	NC_007505	CTC	2	6	8724	8729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045253
103	NC_007505	GTA	2	6	8856	8861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045253
104	NC_007505	GAA	2	6	8960	8965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045254
105	NC_007505	CGC	2	6	8969	8974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045254
106	NC_007505	CTT	2	6	8996	9001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045254
107	NC_007505	CTC	2	6	9035	9040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045254
108	NC_007505	GCC	2	6	9059	9064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045254
109	NC_007505	CAG	2	6	9110	9115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045254
110	NC_007505	CTC	2	6	9235	9240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_007505	CTT	2	6	9256	9261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007505	GCA	2	6	9680	9685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045255
113	NC_007505	TTC	2	6	9699	9704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045255
114	NC_007505	CGG	2	6	9899	9904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045255
115	NC_007505	GAA	2	6	10150	10155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007505	ATC	2	6	10178	10183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007505	CGA	2	6	10297	10302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045256
118	NC_007505	GAA	2	6	10345	10350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045256
119	NC_007505	CGA	2	6	10441	10446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045256
120	NC_007505	GCC	2	6	10484	10489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045256
121	NC_007505	CCG	2	6	10587	10592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045256
122	NC_007505	TTG	2	6	10618	10623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045256
123	NC_007505	CTG	2	6	10738	10743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045256
124	NC_007505	TCC	2	6	10747	10752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045256
125	NC_007505	CGA	2	6	10833	10838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045256
126	NC_007505	GGC	2	6	10914	10919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045256
127	NC_007505	GCA	2	6	10998	11003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045256
128	NC_007505	CGA	2	6	11085	11090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045256
129	NC_007505	CAG	2	6	11181	11186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045256
130	NC_007505	CCG	2	6	11200	11205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045256
131	NC_007505	CGC	2	6	11214	11219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045256
132	NC_007505	ACA	2	6	11232	11237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045256
133	NC_007505	CAA	2	6	11241	11246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045256
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.