MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. 8004 chromosome

Total Repeats: 4685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007086	GCCTG	2	10	820	829	0 %	20 %	40 %	40 %	66766353
2	NC_007086	ACCAC	2	10	1264	1273	40 %	0 %	0 %	60 %	66766353
3	NC_007086	CCGCG	2	10	7241	7250	0 %	0 %	40 %	60 %	66766356
4	NC_007086	TGCGG	2	10	9466	9475	0 %	20 %	60 %	20 %	66766359
5	NC_007086	CAACA	2	10	12975	12984	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_007086	GCGAT	2	10	13133	13142	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007086	ATCGC	2	10	13335	13344	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_007086	CAAAC	2	10	13444	13453	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_007086	TCCAC	2	10	13832	13841	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_007086	CCATG	2	10	19435	19444	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_007086	CCGCG	2	10	21104	21113	0 %	0 %	40 %	60 %	66766370
12	NC_007086	CGGTG	2	10	21483	21492	0 %	20 %	60 %	20 %	66766370
13	NC_007086	CGGCC	2	10	21642	21651	0 %	0 %	40 %	60 %	66766370
14	NC_007086	GCCCT	2	10	21767	21776	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_007086	CCTGC	2	10	22158	22167	0 %	20 %	20 %	60 %	66766372
16	NC_007086	TGGCG	2	10	22386	22395	0 %	20 %	60 %	20 %	66766372
17	NC_007086	GTTGC	2	10	23117	23126	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007086	TGCGC	2	10	26559	26568	0 %	20 %	40 %	40 %	66766374
19	NC_007086	CGGGT	2	10	27032	27041	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007086	CGGGC	2	10	28098	28107	0 %	0 %	60 %	40 %	66766376
21	NC_007086	CCAGC	2	10	31018	31027	20 %	0 %	20 %	60 %	66766378
22	NC_007086	CTTGC	2	10	32584	32593	0 %	40 %	20 %	40 %	66766379
23	NC_007086	CGCAG	2	10	33360	33369	20 %	0 %	40 %	40 %	66766379
24	NC_007086	CCAGC	2	10	34159	34168	20 %	0 %	20 %	60 %	66766380
25	NC_007086	TGCGC	2	10	36052	36061	0 %	20 %	40 %	40 %	66766381
26	NC_007086	GCCGC	2	10	36149	36158	0 %	0 %	40 %	60 %	66766381
27	NC_007086	CGCGA	2	10	36899	36908	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_007086	GGTTA	2	10	37783	37792	20 %	40 %	40 %	0 %	66766382
29	NC_007086	CTGGT	2	10	38146	38155	0 %	40 %	40 %	20 %	66766383
30	NC_007086	GCCGG	2	10	39010	39019	0 %	0 %	60 %	40 %	66766383
31	NC_007086	AGGCC	2	10	39864	39873	20 %	0 %	40 %	40 %	66766384
32	NC_007086	CGCAG	2	10	42114	42123	20 %	0 %	40 %	40 %	66766384
33	NC_007086	CGCTG	2	10	43422	43431	0 %	20 %	40 %	40 %	66766384
34	NC_007086	CGGCG	2	10	43545	43554	0 %	0 %	60 %	40 %	66766384
35	NC_007086	CAGCG	2	10	43930	43939	20 %	0 %	40 %	40 %	66766384
36	NC_007086	CAGGC	2	10	44625	44634	20 %	0 %	40 %	40 %	66766385
37	NC_007086	CCGGC	2	10	44761	44770	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_007086	CAGCC	2	10	47387	47396	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_007086	GGTGA	2	10	47738	47747	20 %	20 %	60 %	0 %	66766388
40	NC_007086	AGTGG	2	10	48900	48909	20 %	20 %	60 %	0 %	66766389
41	NC_007086	GCTCG	2	10	49323	49332	0 %	20 %	40 %	40 %	66766389
42	NC_007086	GCCAC	2	10	49559	49568	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_007086	TGCAG	2	10	49586	49595	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007086	AGGCG	2	10	52773	52782	20 %	0 %	60 %	20 %	66766392
45	NC_007086	ACCGC	2	10	53840	53849	20 %	0 %	20 %	60 %	66766393
46	NC_007086	GCGCA	2	10	54312	54321	20 %	0 %	40 %	40 %	66766394
47	NC_007086	TAGCG	2	10	54778	54787	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007086	CGGTG	2	10	55045	55054	0 %	20 %	60 %	20 %	66766395
49	NC_007086	CGTGG	2	10	55099	55108	0 %	20 %	60 %	20 %	66766395
50	NC_007086	GCGCC	2	10	56042	56051	0 %	0 %	40 %	60 %	66766396
51	NC_007086	GTGGC	2	10	56058	56067	0 %	20 %	60 %	20 %	66766396
52	NC_007086	ACGAC	2	10	56924	56933	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_007086	GCATC	2	10	57555	57564	20 %	20 %	20 %	40 %	66766397
54	NC_007086	TGGTC	2	10	58265	58274	0 %	40 %	40 %	20 %	66766397
55	NC_007086	GGCAA	2	10	58896	58905	40 %	0 %	40 %	20 %	66766398
56	NC_007086	TGGCC	2	10	59040	59049	0 %	20 %	40 %	40 %	66766398
57	NC_007086	CCCAG	2	10	61031	61040	20 %	0 %	20 %	60 %	77761060
58	NC_007086	GCGCG	2	10	62387	62396	0 %	0 %	60 %	40 %	77761060
59	NC_007086	GCGCA	2	10	63234	63243	20 %	0 %	40 %	40 %	77761060
60	NC_007086	GGCCG	2	10	63492	63501	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_007086	ATTAA	2	10	63594	63603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007086	CGGCG	2	10	64701	64710	0 %	0 %	60 %	40 %	66766401
63	NC_007086	CCGCG	2	10	66887	66896	0 %	0 %	40 %	60 %	66766402
64	NC_007086	GCGCG	2	10	68240	68249	0 %	0 %	60 %	40 %	77761061
65	NC_007086	GCTGG	2	10	68263	68272	0 %	20 %	60 %	20 %	77761061
66	NC_007086	GCGGG	2	10	74066	74075	0 %	0 %	80 %	20 %	66766408
67	NC_007086	CGGCG	2	10	74282	74291	0 %	0 %	60 %	40 %	66766408
68	NC_007086	GCCCA	2	10	75825	75834	20 %	0 %	20 %	60 %	66766410
69	NC_007086	GGGCA	2	10	76360	76369	20 %	0 %	60 %	20 %	66766411
70	NC_007086	CGTTT	2	10	77037	77046	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007086	TGCTT	2	10	77330	77339	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_007086	GGGTG	2	10	77423	77432	0 %	20 %	80 %	0 %	66766413
73	NC_007086	AGCGC	2	10	79079	79088	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_007086	CCAGG	2	10	79626	79635	20 %	0 %	40 %	40 %	66766414
75	NC_007086	TCTTG	2	10	81622	81631	0 %	60 %	20 %	20 %	77761063
76	NC_007086	AAGAA	2	10	83464	83473	80 %	0 %	20 %	0 %	66766417
77	NC_007086	GCGCG	2	10	83519	83528	0 %	0 %	60 %	40 %	66766417
78	NC_007086	TGGCT	2	10	84253	84262	0 %	40 %	40 %	20 %	66766419
79	NC_007086	ACCAA	2	10	85720	85729	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_007086	GTCGC	2	10	85800	85809	0 %	20 %	40 %	40 %	66766421
81	NC_007086	GCTGG	2	10	86072	86081	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007086	ACGGT	2	10	89485	89494	20 %	20 %	40 %	20 %	77761065
83	NC_007086	AGCGC	2	10	89619	89628	20 %	0 %	40 %	40 %	77761065
84	NC_007086	CGCTG	2	10	89710	89719	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_007086	GCGGG	2	10	90635	90644	0 %	0 %	80 %	20 %	66766426
86	NC_007086	GCCAC	2	10	90754	90763	20 %	0 %	20 %	60 %	66766426
87	NC_007086	CGGCG	2	10	91852	91861	0 %	0 %	60 %	40 %	66766427
88	NC_007086	GTCCA	2	10	92202	92211	20 %	20 %	20 %	40 %	66766428
89	NC_007086	CGGTG	2	10	93915	93924	0 %	20 %	60 %	20 %	66766430
90	NC_007086	ATGGC	2	10	93986	93995	20 %	20 %	40 %	20 %	66766430
91	NC_007086	GGCCG	2	10	94134	94143	0 %	0 %	60 %	40 %	66766430
92	NC_007086	GGTGG	2	10	94237	94246	0 %	20 %	80 %	0 %	66766430
93	NC_007086	TGCAA	2	10	94873	94882	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_007086	TGCGC	2	10	94915	94924	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_007086	CTGCG	2	10	95756	95765	0 %	20 %	40 %	40 %	66766431
96	NC_007086	CCGCA	2	10	96449	96458	20 %	0 %	20 %	60 %	66766432
97	NC_007086	CCGAC	2	10	96556	96565	20 %	0 %	20 %	60 %	66766432
98	NC_007086	GCAAT	2	10	97975	97984	40 %	20 %	20 %	20 %	66766434
99	NC_007086	TGCCC	2	10	99401	99410	0 %	20 %	20 %	60 %	66766435
100	NC_007086	TCCAG	2	10	99671	99680	20 %	20 %	20 %	40 %	66766435
101	NC_007086	CGCAG	2	10	99992	100001	20 %	0 %	40 %	40 %	66766436
102	NC_007086	CGATG	2	10	101466	101475	20 %	20 %	40 %	20 %	66766437
103	NC_007086	CTGTC	2	10	101683	101692	0 %	40 %	20 %	40 %	66766438
104	NC_007086	TGGCC	2	10	103196	103205	0 %	20 %	40 %	40 %	66766438
105	NC_007086	CAGGG	2	10	103426	103435	20 %	0 %	60 %	20 %	66766438
106	NC_007086	GCGCG	2	10	104127	104136	0 %	0 %	60 %	40 %	66766439
107	NC_007086	GCGGG	2	10	104736	104745	0 %	0 %	80 %	20 %	66766439
108	NC_007086	GGCCG	2	10	104845	104854	0 %	0 %	60 %	40 %	66766439
109	NC_007086	ACCAC	2	10	106295	106304	40 %	0 %	0 %	60 %	66766440
110	NC_007086	CCGCA	2	10	106647	106656	20 %	0 %	20 %	60 %	66766440
111	NC_007086	GCAGC	2	10	106922	106931	20 %	0 %	40 %	40 %	66766440
112	NC_007086	GCGCC	2	10	106956	106965	0 %	0 %	40 %	60 %	66766440
113	NC_007086	ACGGC	2	10	108106	108115	20 %	0 %	40 %	40 %	66766442
114	NC_007086	CGGCG	2	10	111271	111280	0 %	0 %	60 %	40 %	66766444
115	NC_007086	GCCGG	2	10	112105	112114	0 %	0 %	60 %	40 %	66766445
116	NC_007086	GCACG	2	10	118884	118893	20 %	0 %	40 %	40 %	66766449
117	NC_007086	GGTGC	2	10	119777	119786	0 %	20 %	60 %	20 %	66766450
118	NC_007086	CAGCG	2	10	120107	120116	20 %	0 %	40 %	40 %	66766450
119	NC_007086	CACCG	2	10	120293	120302	20 %	0 %	20 %	60 %	66766450
120	NC_007086	GAGCT	2	10	120845	120854	20 %	20 %	40 %	20 %	66766450
121	NC_007086	CACCG	2	10	120964	120973	20 %	0 %	20 %	60 %	66766450
122	NC_007086	CCCGG	2	10	121268	121277	0 %	0 %	40 %	60 %	66766450
123	NC_007086	CACAA	2	10	124649	124658	60 %	0 %	0 %	40 %	66766454
124	NC_007086	CGGCG	2	10	125807	125816	0 %	0 %	60 %	40 %	66766456
125	NC_007086	TCCGC	2	10	126284	126293	0 %	20 %	20 %	60 %	66766457
126	NC_007086	CGGGG	2	10	127278	127287	0 %	0 %	80 %	20 %	66766458
127	NC_007086	TCGGC	2	10	130427	130436	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_007086	GTCTG	2	10	130488	130497	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007086	CGCGT	2	10	131280	131289	0 %	20 %	40 %	40 %	66766459
130	NC_007086	GGCGC	2	10	132413	132422	0 %	0 %	60 %	40 %	66766461
131	NC_007086	CAGCG	2	10	132699	132708	20 %	0 %	40 %	40 %	66766461
132	NC_007086	GCGCC	2	10	134251	134260	0 %	0 %	40 %	60 %	66766462
133	NC_007086	GCTGG	2	10	135580	135589	0 %	20 %	60 %	20 %	66766464
134	NC_007086	GGTCG	2	10	136063	136072	0 %	20 %	60 %	20 %	66766464
135	NC_007086	GCCGC	2	10	136684	136693	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_007086	TGAAC	2	10	137460	137469	40 %	20 %	20 %	20 %	66766465
137	NC_007086	CGCTG	2	10	137691	137700	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_007086	TGTCC	2	10	138574	138583	0 %	40 %	20 %	40 %	66766467
139	NC_007086	GCCAA	2	10	139667	139676	40 %	0 %	20 %	40 %	66766467
140	NC_007086	CCAGC	2	10	140036	140045	20 %	0 %	20 %	60 %	66766467
141	NC_007086	GCGCC	2	10	140174	140183	0 %	0 %	40 %	60 %	66766467
142	NC_007086	GGCAC	2	10	141970	141979	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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144	NC_007086	CAGCG	2	10	144157	144166	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_007086	CAGCG	2	10	144194	144203	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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258	NC_007086	ATCGC	2	10	268870	268879	20 %	20 %	20 %	40 %	66766567
259	NC_007086	GCGTT	2	10	269319	269328	0 %	40 %	40 %	20 %	66766568
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271	NC_007086	GTGAT	2	10	277806	277815	20 %	40 %	40 %	0 %	66766574
272	NC_007086	CGTTG	2	10	278293	278302	0 %	40 %	40 %	20 %	66766574
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403	NC_007086	CGTTG	2	10	407963	407972	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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