MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 13923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006834	CAGC	2	8	18	25	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006834	GATG	2	8	44	51	25 %	25 %	50 %	0 %	58579624
3	NC_006834	CCCG	2	8	89	96	0 %	0 %	25 %	75 %	58579624
4	NC_006834	GTCG	2	8	839	846	0 %	25 %	50 %	25 %	58579624
5	NC_006834	CGAT	2	8	847	854	25 %	25 %	25 %	25 %	58579624
6	NC_006834	GCCG	2	8	1257	1264	0 %	0 %	50 %	50 %	58579624
7	NC_006834	TGCC	2	8	1286	1293	0 %	25 %	25 %	50 %	58579624
8	NC_006834	AAAC	2	8	1548	1555	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_006834	CCTG	2	8	1728	1735	0 %	25 %	25 %	50 %	58579625
10	NC_006834	GGAC	2	8	1764	1771	25 %	0 %	50 %	25 %	58579625
11	NC_006834	CCCG	2	8	1858	1865	0 %	0 %	25 %	75 %	58579625
12	NC_006834	CTGC	2	8	1978	1985	0 %	25 %	25 %	50 %	58579625
13	NC_006834	CCGT	2	8	1996	2003	0 %	25 %	25 %	50 %	58579625
14	NC_006834	TGCG	2	8	2438	2445	0 %	25 %	50 %	25 %	58579625
15	NC_006834	CGAA	2	8	2471	2478	50 %	0 %	25 %	25 %	58579625
16	NC_006834	CAAT	2	8	3317	3324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_006834	GTCC	2	8	3338	3345	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_006834	CCTG	2	8	3895	3902	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_006834	CCGT	2	8	3910	3917	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006834	GCCT	2	8	4858	4865	0 %	25 %	25 %	50 %	58579626
21	NC_006834	CCCG	2	8	5022	5029	0 %	0 %	25 %	75 %	58579626
22	NC_006834	CGAA	2	8	6348	6355	50 %	0 %	25 %	25 %	58579627
23	NC_006834	GCAG	2	8	7153	7160	25 %	0 %	50 %	25 %	58579627
24	NC_006834	GCCG	2	8	8331	8338	0 %	0 %	50 %	50 %	58579628
25	NC_006834	ACCC	2	8	9456	9463	25 %	0 %	0 %	75 %	58579629
26	NC_006834	GCCT	2	8	9628	9635	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_006834	GCAA	2	8	9859	9866	50 %	0 %	25 %	25 %	58579630
28	NC_006834	TGGG	2	8	9898	9905	0 %	25 %	75 %	0 %	58579630
29	NC_006834	GTCG	2	8	11717	11724	0 %	25 %	50 %	25 %	58579631
30	NC_006834	CGTT	2	8	12445	12452	0 %	50 %	25 %	25 %	58579632
31	NC_006834	GGTG	2	8	12542	12549	0 %	25 %	75 %	0 %	58579632
32	NC_006834	GAAG	2	8	12912	12919	50 %	0 %	50 %	0 %	58579633
33	NC_006834	GCGA	2	8	13750	13757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_006834	GTGC	2	8	14562	14569	0 %	25 %	50 %	25 %	58579635
35	NC_006834	GATC	2	8	14756	14763	25 %	25 %	25 %	25 %	58579636
36	NC_006834	GGTG	2	8	15799	15806	0 %	25 %	75 %	0 %	58579637
37	NC_006834	CATC	2	8	15931	15938	25 %	25 %	0 %	50 %	58579637
38	NC_006834	AAAG	2	8	16933	16940	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006834	GTTG	2	8	17209	17216	0 %	50 %	50 %	0 %	122878976
40	NC_006834	GTTG	2	8	17495	17502	0 %	50 %	50 %	0 %	122878976
41	NC_006834	GGCT	2	8	17839	17846	0 %	25 %	50 %	25 %	122878976
42	NC_006834	CGGC	2	8	18076	18083	0 %	0 %	50 %	50 %	122878976
43	NC_006834	CGTG	2	8	18726	18733	0 %	25 %	50 %	25 %	161899024
44	NC_006834	TGGC	2	8	19133	19140	0 %	25 %	50 %	25 %	161899024
45	NC_006834	GCCG	2	8	19174	19181	0 %	0 %	50 %	50 %	161899024
46	NC_006834	CGGC	2	8	19316	19323	0 %	0 %	50 %	50 %	161899024
47	NC_006834	CGGG	2	8	20729	20736	0 %	0 %	75 %	25 %	122878977
48	NC_006834	GATC	2	8	20739	20746	25 %	25 %	25 %	25 %	122878977
49	NC_006834	GCCG	2	8	20804	20811	0 %	0 %	50 %	50 %	122878977
50	NC_006834	GAGC	2	8	20973	20980	25 %	0 %	50 %	25 %	122878977
51	NC_006834	AGCA	2	8	21882	21889	50 %	0 %	25 %	25 %	122878977
52	NC_006834	AGCG	2	8	22213	22220	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_006834	GCAG	2	8	22230	22237	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_006834	GCGT	2	8	22331	22338	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_006834	CGTG	2	8	22664	22671	0 %	25 %	50 %	25 %	58579642
56	NC_006834	CCGG	2	8	22677	22684	0 %	0 %	50 %	50 %	58579642
57	NC_006834	TCGA	2	8	22813	22820	25 %	25 %	25 %	25 %	58579642
58	NC_006834	GTCT	2	8	22939	22946	0 %	50 %	25 %	25 %	58579642
59	NC_006834	CGCC	2	8	24327	24334	0 %	0 %	25 %	75 %	58579645
60	NC_006834	CGCC	2	8	24524	24531	0 %	0 %	25 %	75 %	58579645
61	NC_006834	CAGC	2	8	24685	24692	25 %	0 %	25 %	50 %	58579645
62	NC_006834	CGCC	2	8	24912	24919	0 %	0 %	25 %	75 %	58579645
63	NC_006834	CTGC	2	8	25080	25087	0 %	25 %	25 %	50 %	58579645
64	NC_006834	GCGT	2	8	25099	25106	0 %	25 %	50 %	25 %	58579645
65	NC_006834	TGCC	2	8	25469	25476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_006834	TGGC	2	8	25494	25501	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_006834	CAGC	2	8	25716	25723	25 %	0 %	25 %	50 %	58579646
68	NC_006834	TGCG	2	8	26178	26185	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_006834	CTTC	2	8	26233	26240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_006834	TTAT	2	8	26367	26374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006834	GCCC	2	8	26803	26810	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_006834	TGCC	2	8	26841	26848	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_006834	GCAC	2	8	27399	27406	25 %	0 %	25 %	50 %	58579649
74	NC_006834	GGGC	2	8	27930	27937	0 %	0 %	75 %	25 %	122878978
75	NC_006834	TCGA	2	8	28084	28091	25 %	25 %	25 %	25 %	122878978
76	NC_006834	GGGC	2	8	28134	28141	0 %	0 %	75 %	25 %	122878978
77	NC_006834	GCCG	2	8	28512	28519	0 %	0 %	50 %	50 %	122878978
78	NC_006834	GCCG	2	8	29551	29558	0 %	0 %	50 %	50 %	58579651
79	NC_006834	CGGC	2	8	30057	30064	0 %	0 %	50 %	50 %	58579651
80	NC_006834	GATG	2	8	30114	30121	25 %	25 %	50 %	0 %	58579651
81	NC_006834	TCAC	2	8	30645	30652	25 %	25 %	0 %	50 %	58579652
82	NC_006834	CTTG	2	8	30736	30743	0 %	50 %	25 %	25 %	58579652
83	NC_006834	GCCG	2	8	30802	30809	0 %	0 %	50 %	50 %	58579652
84	NC_006834	ACGC	2	8	31846	31853	25 %	0 %	25 %	50 %	58579653
85	NC_006834	GGTG	2	8	32394	32401	0 %	25 %	75 %	0 %	58579654
86	NC_006834	AGAA	2	8	32636	32643	75 %	0 %	25 %	0 %	58579654
87	NC_006834	CTTT	2	8	32946	32953	0 %	75 %	0 %	25 %	58579654
88	NC_006834	AGCA	2	8	33490	33497	50 %	0 %	25 %	25 %	58579654
89	NC_006834	TCAA	2	8	33653	33660	50 %	25 %	0 %	25 %	58579654
90	NC_006834	TTTG	2	8	34550	34557	0 %	75 %	25 %	0 %	58579655
91	NC_006834	ACGC	2	8	35157	35164	25 %	0 %	25 %	50 %	58579655
92	NC_006834	GTGC	2	8	35388	35395	0 %	25 %	50 %	25 %	58579655
93	NC_006834	GCTC	2	8	35468	35475	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_006834	TGGG	2	8	35667	35674	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006834	GTCT	2	8	35693	35700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_006834	GTGC	2	8	36904	36911	0 %	25 %	50 %	25 %	122878979
97	NC_006834	GGCG	2	8	36949	36956	0 %	0 %	75 %	25 %	122878979
98	NC_006834	CAGG	2	8	37534	37541	25 %	0 %	50 %	25 %	58579658
99	NC_006834	CCAG	2	8	38395	38402	25 %	0 %	25 %	50 %	58579659
100	NC_006834	CGAC	2	8	38914	38921	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_006834	ACCA	2	8	39167	39174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_006834	TGCG	3	12	41562	41573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_006834	TGCA	2	8	41590	41597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_006834	CAGT	2	8	41612	41619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_006834	CGAA	2	8	42188	42195	50 %	0 %	25 %	25 %	58579663
106	NC_006834	GCCG	2	8	42468	42475	0 %	0 %	50 %	50 %	58579664
107	NC_006834	TGCT	2	8	42763	42770	0 %	50 %	25 %	25 %	58579665
108	NC_006834	TCGG	2	8	43226	43233	0 %	25 %	50 %	25 %	58579665
109	NC_006834	TCCA	2	8	43872	43879	25 %	25 %	0 %	50 %	58579666
110	NC_006834	CATG	2	8	44124	44131	25 %	25 %	25 %	25 %	58579666
111	NC_006834	GCAG	2	8	44187	44194	25 %	0 %	50 %	25 %	58579667
112	NC_006834	GCGG	2	8	44202	44209	0 %	0 %	75 %	25 %	58579667
113	NC_006834	CCAC	2	8	44776	44783	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_006834	TCGA	2	8	44814	44821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_006834	CGAA	2	8	45031	45038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_006834	CCCG	2	8	45195	45202	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_006834	GATG	2	8	45615	45622	25 %	25 %	50 %	0 %	58579670
118	NC_006834	CCGA	2	8	45781	45788	25 %	0 %	25 %	50 %	58579670
119	NC_006834	GACA	2	8	45908	45915	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_006834	CTGG	2	8	46206	46213	0 %	25 %	50 %	25 %	58579671
121	NC_006834	CCAT	2	8	46456	46463	25 %	25 %	0 %	50 %	58579671
122	NC_006834	GCTG	2	8	46917	46924	0 %	25 %	50 %	25 %	58579671
123	NC_006834	CGTC	2	8	47639	47646	0 %	25 %	25 %	50 %	58579672
124	NC_006834	GCGT	2	8	47712	47719	0 %	25 %	50 %	25 %	58579672
125	NC_006834	CACG	2	8	47881	47888	25 %	0 %	25 %	50 %	58579672
126	NC_006834	CGTC	2	8	48177	48184	0 %	25 %	25 %	50 %	58579672
127	NC_006834	ATCC	2	8	48372	48379	25 %	25 %	0 %	50 %	58579673
128	NC_006834	CGCA	2	8	48863	48870	25 %	0 %	25 %	50 %	58579674
129	NC_006834	GTGC	2	8	48903	48910	0 %	25 %	50 %	25 %	58579674
130	NC_006834	CTGA	2	8	48968	48975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_006834	AAGC	2	8	49233	49240	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_006834	GCTG	2	8	51198	51205	0 %	25 %	50 %	25 %	58579679
133	NC_006834	CAGC	2	8	51795	51802	25 %	0 %	25 %	50 %	58579679
134	NC_006834	GTGA	2	8	52141	52148	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006834	TGCG	2	8	52311	52318	0 %	25 %	50 %	25 %	58579680
136	NC_006834	TGGC	2	8	53183	53190	0 %	25 %	50 %	25 %	58579681
137	NC_006834	CGCA	2	8	53872	53879	25 %	0 %	25 %	50 %	58579681
138	NC_006834	GCCG	2	8	54216	54223	0 %	0 %	50 %	50 %	122878980
139	NC_006834	GACG	2	8	54490	54497	25 %	0 %	50 %	25 %	122878980
140	NC_006834	CACC	2	8	55682	55689	25 %	0 %	0 %	75 %	58579683
141	NC_006834	GTTG	2	8	55862	55869	0 %	50 %	50 %	0 %	58579683
142	NC_006834	CGCT	2	8	55921	55928	0 %	25 %	25 %	50 %	58579683
143	NC_006834	GCCG	2	8	56094	56101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_006834	CCAG	2	8	56434	56441	25 %	0 %	25 %	50 %	58579684
145	NC_006834	GCAC	2	8	56472	56479	25 %	0 %	25 %	50 %	58579684
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