MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 117125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006834	CCGCAT	2	12	172032	172043	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_006834	GGCCT	2	10	172062	172071	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4003	NC_006834	GGCT	2	8	172077	172084	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_006834	CCA	2	6	172192	172197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_006834	CCA	2	6	172210	172215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_006834	CGC	2	6	172229	172234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_006834	ACA	2	6	172360	172365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_006834	GCC	2	6	172411	172416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_006834	TGC	2	6	172432	172437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_006834	GTG	2	6	172464	172469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_006834	TGC	2	6	172477	172482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_006834	GGC	2	6	172494	172499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_006834	CTG	2	6	172557	172562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_006834	GCG	2	6	172579	172584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_006834	ACGC	2	8	172613	172620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_006834	GGGCGA	2	12	172625	172636	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4017	NC_006834	GCA	2	6	172724	172729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_006834	GGC	2	6	172791	172796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_006834	AGCG	2	8	172815	172822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_006834	ACA	2	6	172840	172845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_006834	GCG	2	6	172858	172863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_006834	CG	4	8	172868	172875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4023	NC_006834	GCC	2	6	172962	172967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_006834	AGC	2	6	172977	172982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_006834	GC	4	8	172981	172988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_006834	TCG	2	6	173038	173043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_006834	CTG	2	6	173094	173099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_006834	GCCC	2	8	173108	173115	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4029	NC_006834	GCGCG	2	10	173121	173130	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4030	NC_006834	CG	3	6	173147	173152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_006834	ACC	2	6	173195	173200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_006834	ACC	2	6	173294	173299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_006834	GCAC	2	8	173414	173421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_006834	GCG	2	6	173563	173568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_006834	GC	3	6	173578	173583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_006834	GTG	2	6	173587	173592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_006834	ACC	2	6	173596	173601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_006834	GC	3	6	173640	173645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_006834	GCG	2	6	173669	173674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_006834	CGG	2	6	173691	173696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_006834	AGC	2	6	173725	173730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_006834	GC	3	6	173768	173773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_006834	GGCC	2	8	173805	173812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4044	NC_006834	CGG	2	6	173898	173903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_006834	AGC	2	6	173917	173922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_006834	GCCGC	2	10	173961	173970	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4047	NC_006834	GGC	2	6	174013	174018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_006834	CTG	2	6	174022	174027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_006834	CGA	2	6	174054	174059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_006834	CAG	2	6	174100	174105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_006834	ACCG	2	8	174130	174137	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_006834	GCG	2	6	174152	174157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_006834	GTCG	2	8	174213	174220	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_006834	CCTT	2	8	174233	174240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_006834	GGT	2	6	174255	174260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_006834	CAC	2	6	174279	174284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_006834	TGC	2	6	174293	174298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_006834	GCA	2	6	174300	174305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_006834	GCA	2	6	174356	174361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_006834	CCTGG	2	10	174363	174372	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4061	NC_006834	CAG	2	6	174421	174426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_006834	GGCC	2	8	174531	174538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4063	NC_006834	CGGC	2	8	174558	174565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_006834	CACC	2	8	174599	174606	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4065	NC_006834	GTC	2	6	174649	174654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579795
4066	NC_006834	AC	3	6	174663	174668	50 %	0 %	0 %	50 %	58579795
4067	NC_006834	TCG	2	6	174676	174681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579795
4068	NC_006834	GCC	2	6	174695	174700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579795
4069	NC_006834	GCT	2	6	174709	174714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579795
4070	NC_006834	CAG	2	6	174718	174723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579795
4071	NC_006834	CGC	2	6	174744	174749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579795
4072	NC_006834	CCG	2	6	174752	174757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579795
4073	NC_006834	CGG	2	6	174785	174790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579795
4074	NC_006834	CTT	2	6	174814	174819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579795
4075	NC_006834	CAA	2	6	174907	174912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579795
4076	NC_006834	TGC	2	6	174921	174926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579795
4077	NC_006834	AGC	2	6	174932	174937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579795
4078	NC_006834	TTG	2	6	174950	174955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579795
4079	NC_006834	CGC	3	9	175071	175079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579795
4080	NC_006834	CGG	2	6	175110	175115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579795
4081	NC_006834	AAC	2	6	175130	175135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579795
4082	NC_006834	CTG	2	6	175139	175144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579795
4083	NC_006834	CGG	2	6	175158	175163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579795
4084	NC_006834	AC	3	6	175164	175169	50 %	0 %	0 %	50 %	58579795
4085	NC_006834	GCA	2	6	175292	175297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579795
4086	NC_006834	CGG	2	6	175317	175322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579795
4087	NC_006834	GGCT	2	8	175328	175335	0 %	25 %	50 %	25 %	58579795
4088	NC_006834	GCA	2	6	175346	175351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579795
4089	NC_006834	CGA	2	6	175393	175398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579795
4090	NC_006834	GGC	2	6	175444	175449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_006834	TG	3	6	175458	175463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_006834	CGCC	2	8	175471	175478	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4093	NC_006834	CTC	2	6	175496	175501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_006834	CGC	2	6	175553	175558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_006834	GA	3	6	175578	175583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_006834	CTG	2	6	175626	175631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_006834	TGC	2	6	175673	175678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_006834	GCA	2	6	175795	175800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579796
4099	NC_006834	CAGG	2	8	175836	175843	25 %	0 %	50 %	25 %	58579796
4100	NC_006834	ACCG	2	8	175851	175858	25 %	0 %	25 %	50 %	58579796
4101	NC_006834	GCA	2	6	175928	175933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579796
4102	NC_006834	GCA	3	9	175955	175963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579796
4103	NC_006834	GCC	2	6	176019	176024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579796
4104	NC_006834	GGTC	2	8	176027	176034	0 %	25 %	50 %	25 %	58579796
4105	NC_006834	CAC	2	6	176102	176107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579796
4106	NC_006834	CG	3	6	176273	176278	0 %	0 %	50 %	50 %	58579796
4107	NC_006834	CAC	2	6	176295	176300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579796
4108	NC_006834	CTG	2	6	176301	176306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579796
4109	NC_006834	CCA	2	6	176322	176327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579796
4110	NC_006834	GCAC	2	8	176359	176366	25 %	0 %	25 %	50 %	58579796
4111	NC_006834	CGTGC	2	10	176513	176522	0 %	20 %	40 %	40 %	58579796
4112	NC_006834	GCA	2	6	176536	176541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579796
4113	NC_006834	CGAA	2	8	176551	176558	50 %	0 %	25 %	25 %	58579796
4114	NC_006834	ATGC	2	8	176586	176593	25 %	25 %	25 %	25 %	58579796
4115	NC_006834	GCAG	2	8	176600	176607	25 %	0 %	50 %	25 %	58579796
4116	NC_006834	CGG	2	6	176645	176650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579796
4117	NC_006834	CAC	2	6	176655	176660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579796
4118	NC_006834	GCG	2	6	176689	176694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579796
4119	NC_006834	TGC	2	6	176732	176737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579796
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4121	NC_006834	GCC	2	6	176780	176785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579796
4122	NC_006834	CGT	2	6	176808	176813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579796
4123	NC_006834	GCC	2	6	176815	176820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579796
4124	NC_006834	GCAC	2	8	176824	176831	25 %	0 %	25 %	50 %	58579796
4125	NC_006834	GCC	2	6	176856	176861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579796
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4129	NC_006834	CG	3	6	176991	176996	0 %	0 %	50 %	50 %	58579796
4130	NC_006834	CTG	2	6	177033	177038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579796
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4132	NC_006834	TGC	2	6	177088	177093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579796
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4135	NC_006834	CTG	2	6	177229	177234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4137	NC_006834	GCTG	2	8	177270	177277	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4138	NC_006834	GCA	2	6	177303	177308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4141	NC_006834	ATAC	2	8	177425	177432	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4142	NC_006834	CGCC	2	8	177452	177459	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4143	NC_006834	GTCC	2	8	177498	177505	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4144	NC_006834	TGA	2	6	177528	177533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4148	NC_006834	CG	3	6	177688	177693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4152	NC_006834	CGT	2	6	177858	177863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4155	NC_006834	GCA	2	6	177967	177972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4250	NC_006834	CGAT	2	8	181798	181805	25 %	25 %	25 %	25 %	122878988
4251	NC_006834	GCG	2	6	181813	181818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878988
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4253	NC_006834	GCA	2	6	181883	181888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878988
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4255	NC_006834	CGA	2	6	182060	182065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878988
4256	NC_006834	GCC	2	6	182086	182091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	122878988
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4367	NC_006834	TG	3	6	186602	186607	0 %	50 %	50 %	0 %	122878989
4368	NC_006834	TGG	2	6	186621	186626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	122878989
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4370	NC_006834	CTG	2	6	186674	186679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878989
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4372	NC_006834	CAC	2	6	186743	186748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4373	NC_006834	CA	3	6	186779	186784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4374	NC_006834	GTTC	2	8	186785	186792	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4375	NC_006834	C	6	6	186798	186803	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4376	NC_006834	CGAAC	2	10	186807	186816	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4377	NC_006834	TTC	2	6	186861	186866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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