MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 117125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006834	GCT	2	6	150547	150552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579775
3502	NC_006834	TGC	2	6	150640	150645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579775
3503	NC_006834	GGC	2	6	150698	150703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579775
3504	NC_006834	GAT	2	6	150712	150717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579775
3505	NC_006834	CGG	2	6	150739	150744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579775
3506	NC_006834	GCC	2	6	150770	150775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579775
3507	NC_006834	CGG	2	6	150808	150813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579775
3508	NC_006834	CAG	2	6	150833	150838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579775
3509	NC_006834	GAC	2	6	150844	150849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579775
3510	NC_006834	GCG	2	6	150851	150856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579775
3511	NC_006834	ACC	2	6	150870	150875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579775
3512	NC_006834	GCTGC	2	10	150929	150938	0 %	20 %	40 %	40 %	58579775
3513	NC_006834	GCG	3	9	151022	151030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579775
3514	NC_006834	AAC	2	6	151047	151052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579775
3515	NC_006834	ACC	2	6	151055	151060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579775
3516	NC_006834	TCC	2	6	151146	151151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58579775
3517	NC_006834	CAG	2	6	151154	151159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579775
3518	NC_006834	TG	3	6	151212	151217	0 %	50 %	50 %	0 %	58579775
3519	NC_006834	TGCGC	2	10	151234	151243	0 %	20 %	40 %	40 %	58579775
3520	NC_006834	GC	3	6	151332	151337	0 %	0 %	50 %	50 %	58579775
3521	NC_006834	GGC	2	6	151393	151398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579775
3522	NC_006834	GGA	2	6	151400	151405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58579775
3523	NC_006834	TCAGG	2	10	151437	151446	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3524	NC_006834	GCC	2	6	151494	151499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_006834	GCG	3	9	151733	151741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_006834	TTG	2	6	151846	151851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_006834	CAG	2	6	151881	151886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_006834	TCA	2	6	151893	151898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_006834	GTG	2	6	152005	152010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_006834	CTAT	2	8	152078	152085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3531	NC_006834	GGC	2	6	152089	152094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_006834	GACCT	2	10	152140	152149	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3533	NC_006834	TCC	2	6	152183	152188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58579776
3534	NC_006834	GCC	2	6	152190	152195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579776
3535	NC_006834	GC	3	6	152251	152256	0 %	0 %	50 %	50 %	58579776
3536	NC_006834	CA	3	6	152371	152376	50 %	0 %	0 %	50 %	58579776
3537	NC_006834	CTG	2	6	152429	152434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579776
3538	NC_006834	GGA	2	6	152437	152442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58579776
3539	NC_006834	GGT	2	6	152528	152533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579776
3540	NC_006834	GTT	2	6	152536	152541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579776
3541	NC_006834	CGC	3	9	152558	152566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579776
3542	NC_006834	AGC	2	6	152649	152654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579776
3543	NC_006834	GTG	2	6	152711	152716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579776
3544	NC_006834	CGC	2	6	152732	152737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579776
3545	NC_006834	GTC	2	6	152739	152744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579776
3546	NC_006834	CTG	2	6	152750	152755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579776
3547	NC_006834	CCG	2	6	152775	152780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579776
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3549	NC_006834	CCG	2	6	152844	152849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579776
3550	NC_006834	ATC	2	6	152871	152876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579776
3551	NC_006834	GCC	2	6	152885	152890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579776
3552	NC_006834	GCA	2	6	152943	152948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579776
3553	NC_006834	AGC	2	6	153036	153041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579776
3554	NC_006834	TCT	2	6	153093	153098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579776
3555	NC_006834	GAG	2	6	153101	153106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58579776
3556	NC_006834	TAA	2	6	153146	153151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_006834	CGC	2	6	153172	153177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_006834	TGCT	2	8	153258	153265	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3559	NC_006834	ACG	3	9	153274	153282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_006834	CAG	3	9	153434	153442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_006834	AAG	2	6	153502	153507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_006834	GAT	2	6	153607	153612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_006834	CGA	2	6	153675	153680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_006834	CAT	2	6	153685	153690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_006834	AAC	2	6	153776	153781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579777
3566	NC_006834	CTG	2	6	153791	153796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579777
3567	NC_006834	ATCGCC	2	12	153860	153871	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	58579777
3568	NC_006834	TCG	3	9	153876	153884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579777
3569	NC_006834	TGC	3	9	153891	153899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579777
3570	NC_006834	GTG	4	12	153913	153924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579777
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3572	NC_006834	GCA	2	6	153984	153989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579777
3573	NC_006834	CGT	3	9	153990	153998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579777
3574	NC_006834	GTG	2	6	154022	154027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579777
3575	NC_006834	TGC	2	6	154071	154076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579777
3576	NC_006834	TGA	2	6	154080	154085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579777
3577	NC_006834	CGATC	2	10	154132	154141	20 %	20 %	20 %	40 %	58579777
3578	NC_006834	CGG	2	6	154182	154187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579777
3579	NC_006834	GGCCGA	2	12	154228	154239	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58579777
3580	NC_006834	TGCGC	2	10	154318	154327	0 %	20 %	40 %	40 %	58579777
3581	NC_006834	GC	4	8	154324	154331	0 %	0 %	50 %	50 %	58579777
3582	NC_006834	CACG	2	8	154366	154373	25 %	0 %	25 %	50 %	58579777
3583	NC_006834	GTG	2	6	154409	154414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579777
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3587	NC_006834	TGGAAG	2	12	154536	154547	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	58579777
3588	NC_006834	GCCG	2	8	154591	154598	0 %	0 %	50 %	50 %	58579777
3589	NC_006834	ATC	2	6	154652	154657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579777
3590	NC_006834	T	6	6	154753	154758	0 %	100 %	0 %	0 %	58579777
3591	NC_006834	GCA	3	9	154774	154782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579777
3592	NC_006834	CTG	2	6	154820	154825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579777
3593	NC_006834	GGT	2	6	154924	154929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579777
3594	NC_006834	GTC	2	6	154958	154963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579777
3595	NC_006834	GC	3	6	155027	155032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_006834	TGC	2	6	155033	155038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_006834	GC	4	8	155037	155044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_006834	GCG	2	6	155092	155097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_006834	CGGTTG	2	12	155159	155170	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3600	NC_006834	TGT	2	6	155172	155177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_006834	TGC	2	6	155178	155183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_006834	CTT	2	6	155327	155332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_006834	CCA	2	6	155508	155513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_006834	A	8	8	155548	155555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_006834	CG	3	6	155683	155688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_006834	CTG	2	6	155728	155733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_006834	GGT	2	6	155796	155801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_006834	G	6	6	156033	156038	0 %	0 %	100 %	0 %	58579780
3609	NC_006834	CAA	2	6	156080	156085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579780
3610	NC_006834	CTG	2	6	156092	156097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579780
3611	NC_006834	CATG	2	8	156149	156156	25 %	25 %	25 %	25 %	58579780
3612	NC_006834	ATCGC	2	10	156179	156188	20 %	20 %	20 %	40 %	58579780
3613	NC_006834	TCAT	2	8	156204	156211	25 %	50 %	0 %	25 %	58579780
3614	NC_006834	AGGTGC	2	12	156308	156319	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	58579780
3615	NC_006834	GCG	2	6	156347	156352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579780
3616	NC_006834	TCG	2	6	156356	156361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579780
3617	NC_006834	CTG	2	6	156397	156402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579780
3618	NC_006834	GGC	2	6	156433	156438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579780
3619	NC_006834	GAGATC	2	12	156439	156450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	58579780
3620	NC_006834	GCG	2	6	156476	156481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579780
3621	NC_006834	AGA	2	6	156560	156565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579780
3622	NC_006834	CTG	3	9	156580	156588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579780
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3624	NC_006834	CGG	2	6	156687	156692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579780
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3998	NC_006834	AGC	2	6	171916	171921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3999	NC_006834	TTAAT	2	10	171922	171931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_006834	TTG	2	6	171984	171989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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