MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 117125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006834	ACGC	2	8	128106	128113	25 %	0 %	25 %	50 %	58579751
3002	NC_006834	TGG	2	6	128129	128134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579751
3003	NC_006834	CAG	2	6	128146	128151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579751
3004	NC_006834	GCA	2	6	128181	128186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579751
3005	NC_006834	CG	3	6	128260	128265	0 %	0 %	50 %	50 %	58579751
3006	NC_006834	GAT	2	6	128338	128343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579751
3007	NC_006834	GC	3	6	128395	128400	0 %	0 %	50 %	50 %	58579751
3008	NC_006834	GCC	2	6	128406	128411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579751
3009	NC_006834	GCAAC	2	10	128484	128493	40 %	0 %	20 %	40 %	58579751
3010	NC_006834	CAT	2	6	128522	128527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579751
3011	NC_006834	ACG	2	6	128628	128633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579751
3012	NC_006834	TGT	2	6	128732	128737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579751
3013	NC_006834	TGGC	2	8	128767	128774	0 %	25 %	50 %	25 %	58579751
3014	NC_006834	GCA	3	9	128822	128830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579751
3015	NC_006834	GC	4	8	128922	128929	0 %	0 %	50 %	50 %	58579751
3016	NC_006834	CGC	2	6	129052	129057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579752
3017	NC_006834	A	8	8	129092	129099	100 %	0 %	0 %	0 %	58579752
3018	NC_006834	CCGC	2	8	129139	129146	0 %	0 %	25 %	75 %	58579752
3019	NC_006834	TAT	2	6	129336	129341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_006834	GGC	2	6	129351	129356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_006834	CGACC	2	10	129374	129383	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3022	NC_006834	TGG	2	6	129437	129442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_006834	GC	3	6	129451	129456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_006834	CGG	2	6	129473	129478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_006834	TGG	2	6	129482	129487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_006834	CGG	2	6	129698	129703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_006834	CGG	2	6	129743	129748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_006834	GATC	2	8	129790	129797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_006834	TGA	2	6	129850	129855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_006834	T	6	6	129863	129868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_006834	TCG	2	6	129891	129896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_006834	ACGG	2	8	129912	129919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3033	NC_006834	TGCT	2	8	129975	129982	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_006834	GAG	2	6	130034	130039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_006834	CCG	2	6	130054	130059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_006834	GTC	2	6	130093	130098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_006834	GC	3	6	130192	130197	0 %	0 %	50 %	50 %	121632016
3038	NC_006834	GGC	3	9	130217	130225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121632016
3039	NC_006834	AGC	2	6	130282	130287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121632016
3040	NC_006834	CGC	2	6	130328	130333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121632016
3041	NC_006834	GCAC	2	8	130358	130365	25 %	0 %	25 %	50 %	121632016
3042	NC_006834	GGC	2	6	130375	130380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121632016
3043	NC_006834	GCG	3	9	130398	130406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_006834	GCC	2	6	130438	130443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_006834	CA	3	6	130493	130498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_006834	GCG	2	6	130539	130544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_006834	CGCC	2	8	130583	130590	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3048	NC_006834	CTG	2	6	130609	130614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_006834	GCCGT	2	10	130633	130642	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3050	NC_006834	AGTGC	2	10	130656	130665	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3051	NC_006834	GAT	2	6	130704	130709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_006834	GCG	2	6	130755	130760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_006834	CGG	2	6	130767	130772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_006834	GATTG	2	10	130796	130805	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_006834	GGCCT	2	10	130823	130832	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3056	NC_006834	GCC	2	6	130894	130899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_006834	CCG	2	6	130995	131000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_006834	CAG	2	6	131098	131103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_006834	TGA	2	6	131147	131152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_006834	CG	3	6	131180	131185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_006834	GC	4	8	131202	131209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_006834	GCG	2	6	131245	131250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121632017
3063	NC_006834	TGGG	2	8	131314	131321	0 %	25 %	75 %	0 %	121632017
3064	NC_006834	CCT	2	6	131351	131356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3065	NC_006834	CTGGC	2	10	131359	131368	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3066	NC_006834	CG	3	6	131383	131388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_006834	GAC	2	6	131414	131419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_006834	GCA	2	6	131519	131524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_006834	TGCC	2	8	131578	131585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_006834	GCCT	2	8	131588	131595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_006834	AC	3	6	131654	131659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3072	NC_006834	GCG	2	6	131851	131856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579753
3073	NC_006834	CGGC	2	8	131952	131959	0 %	0 %	50 %	50 %	58579753
3074	NC_006834	GCG	2	6	132013	132018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579753
3075	NC_006834	GCG	2	6	132023	132028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579753
3076	NC_006834	GTG	2	6	132136	132141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579753
3077	NC_006834	GAC	2	6	132259	132264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579753
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3081	NC_006834	CGCGG	2	10	132356	132365	0 %	0 %	60 %	40 %	58579753
3082	NC_006834	C	6	6	132401	132406	0 %	0 %	0 %	100 %	58579753
3083	NC_006834	GCC	2	6	132414	132419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579753
3084	NC_006834	CTG	2	6	132460	132465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579753
3085	NC_006834	GGT	2	6	132489	132494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579753
3086	NC_006834	CGA	2	6	132495	132500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579753
3087	NC_006834	GTG	2	6	132511	132516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579753
3088	NC_006834	TGCGC	2	10	132519	132528	0 %	20 %	40 %	40 %	58579753
3089	NC_006834	GCC	2	6	132637	132642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579753
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3092	NC_006834	GC	3	6	132706	132711	0 %	0 %	50 %	50 %	58579753
3093	NC_006834	CCGC	2	8	132741	132748	0 %	0 %	25 %	75 %	58579753
3094	NC_006834	TGC	2	6	132753	132758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579753
3095	NC_006834	CTG	2	6	132865	132870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579753
3096	NC_006834	TGCGCG	2	12	132914	132925	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	58579753
3097	NC_006834	CG	3	6	133025	133030	0 %	0 %	50 %	50 %	58579753
3098	NC_006834	GCG	2	6	133125	133130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_006834	T	7	7	133170	133176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_006834	CGG	2	6	133235	133240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_006834	AAC	2	6	133260	133265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_006834	GC	3	6	133299	133304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_006834	GCC	2	6	133361	133366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_006834	AGCGC	2	10	133375	133384	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3105	NC_006834	TGC	2	6	133390	133395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579754
3106	NC_006834	CCTG	2	8	133456	133463	0 %	25 %	25 %	50 %	58579754
3107	NC_006834	GCCC	2	8	133526	133533	0 %	0 %	25 %	75 %	58579754
3108	NC_006834	ACG	2	6	133591	133596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579754
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3110	NC_006834	CGG	2	6	133661	133666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579754
3111	NC_006834	ACG	2	6	133741	133746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579754
3112	NC_006834	CAC	2	6	133805	133810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579754
3113	NC_006834	GCA	2	6	133835	133840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579754
3114	NC_006834	GCG	2	6	133966	133971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_006834	CAA	2	6	133979	133984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_006834	GCC	2	6	133999	134004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_006834	CGGG	2	8	134036	134043	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3118	NC_006834	GC	3	6	134069	134074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_006834	GCG	2	6	134100	134105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_006834	GCC	2	6	134130	134135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579755
3121	NC_006834	GGC	2	6	134150	134155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579755
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3123	NC_006834	CTG	2	6	134227	134232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579755
3124	NC_006834	AGCA	2	8	134239	134246	50 %	0 %	25 %	25 %	58579755
3125	NC_006834	CCG	2	6	134265	134270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579755
3126	NC_006834	ACT	2	6	134303	134308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579755
3127	NC_006834	GCC	2	6	134358	134363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579755
3128	NC_006834	TTC	2	6	134416	134421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579755
3129	NC_006834	CG	3	6	134456	134461	0 %	0 %	50 %	50 %	58579755
3130	NC_006834	GTC	3	9	134521	134529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_006834	GGC	2	6	134535	134540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_006834	GAG	2	6	134556	134561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_006834	TTG	2	6	134573	134578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_006834	CGCAT	2	10	134581	134590	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3135	NC_006834	CGAG	2	8	134595	134602	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3136	NC_006834	CGT	2	6	134604	134609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_006834	CGA	2	6	134689	134694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_006834	CTG	2	6	134716	134721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3139	NC_006834	GCA	2	6	134753	134758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3140	NC_006834	CTG	2	6	134784	134789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_006834	GTT	2	6	134861	134866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_006834	GCG	2	6	134887	134892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3143	NC_006834	CTGCGC	2	12	134972	134983	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	58579756
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3149	NC_006834	CTG	2	6	135164	135169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579756
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3151	NC_006834	GC	4	8	135216	135223	0 %	0 %	50 %	50 %	58579756
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3154	NC_006834	GTCGAT	2	12	135296	135307	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58579756
3155	NC_006834	CG	4	8	135310	135317	0 %	0 %	50 %	50 %	58579756
3156	NC_006834	CCA	2	6	135331	135336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579756
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3159	NC_006834	CGG	2	6	135381	135386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579756
3160	NC_006834	CGG	2	6	135457	135462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579756
3161	NC_006834	CGA	2	6	135475	135480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579756
3162	NC_006834	CAG	2	6	135485	135490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579756
3163	NC_006834	GCA	2	6	135511	135516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579756
3164	NC_006834	GCA	2	6	135523	135528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579756
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3192	NC_006834	GTTG	2	8	136751	136758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3194	NC_006834	ATC	2	6	136855	136860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3223	NC_006834	GCG	2	6	137972	137977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3229	NC_006834	TGA	2	6	138306	138311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3230	NC_006834	GAG	2	6	138314	138319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3231	NC_006834	TCCT	2	8	138409	138416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3232	NC_006834	GA	3	6	138443	138448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_006834	A	6	6	138448	138453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3234	NC_006834	GC	3	6	138491	138496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3235	NC_006834	AGG	2	6	138549	138554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_006834	GTC	2	6	138564	138569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3237	NC_006834	GGC	2	6	138605	138610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3238	NC_006834	CA	3	6	138703	138708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3239	NC_006834	TGCA	2	8	138775	138782	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3240	NC_006834	CGC	2	6	138855	138860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3241	NC_006834	GC	3	6	138900	138905	0 %	0 %	50 %	50 %	58579758
3242	NC_006834	GC	3	6	138911	138916	0 %	0 %	50 %	50 %	58579758
3243	NC_006834	CCG	2	6	138924	138929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579758
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3247	NC_006834	CGGC	2	8	139020	139027	0 %	0 %	50 %	50 %	58579758
3248	NC_006834	CACG	2	8	139040	139047	25 %	0 %	25 %	50 %	58579758
3249	NC_006834	CAC	3	9	139052	139060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579758
3250	NC_006834	GGCGT	2	10	139062	139071	0 %	20 %	60 %	20 %	58579758
3251	NC_006834	CGGC	2	8	139074	139081	0 %	0 %	50 %	50 %	58579758
3252	NC_006834	TGC	2	6	139138	139143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579758
3253	NC_006834	CTG	2	6	139154	139159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579758
3254	NC_006834	GCAC	2	8	139194	139201	25 %	0 %	25 %	50 %	58579758
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3256	NC_006834	GCG	2	6	139264	139269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121632018
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3372	NC_006834	A	6	6	145195	145200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3373	NC_006834	CGA	2	6	145254	145259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3375	NC_006834	CCA	2	6	145295	145300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3376	NC_006834	CA	3	6	145299	145304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3377	NC_006834	AGT	2	6	145329	145334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3380	NC_006834	CGA	2	6	145393	145398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3382	NC_006834	CAC	3	9	145413	145421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3383	NC_006834	C	6	6	145433	145438	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3384	NC_006834	CAG	2	6	145458	145463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3499	NC_006834	ATG	2	6	150440	150445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_006834	CCT	2	6	150481	150486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58579775

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