MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 117125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_006834	CTG	2	6	106065	106070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878983
2502	NC_006834	CCAT	2	8	106072	106079	25 %	25 %	0 %	50 %	122878983
2503	NC_006834	GGCG	2	8	106115	106122	0 %	0 %	75 %	25 %	122878983
2504	NC_006834	CGAG	2	8	106139	106146	25 %	0 %	50 %	25 %	122878983
2505	NC_006834	GGAGTT	2	12	106151	106162	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	122878983
2506	NC_006834	GCG	2	6	106186	106191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878983
2507	NC_006834	GTCAGC	2	12	106221	106232	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	122878983
2508	NC_006834	CCGGC	2	10	106249	106258	0 %	0 %	40 %	60 %	122878983
2509	NC_006834	GCT	2	6	106280	106285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878983
2510	NC_006834	CGC	2	6	106295	106300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	122878983
2511	NC_006834	GC	3	6	106306	106311	0 %	0 %	50 %	50 %	122878983
2512	NC_006834	CGA	2	6	106358	106363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878983
2513	NC_006834	GTT	2	6	106463	106468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	122878983
2514	NC_006834	GGT	2	6	106472	106477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	122878983
2515	NC_006834	CGG	2	6	106565	106570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878983
2516	NC_006834	GGTG	2	8	106628	106635	0 %	25 %	75 %	0 %	122878983
2517	NC_006834	GCG	2	6	106664	106669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878983
2518	NC_006834	CTG	2	6	106692	106697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878983
2519	NC_006834	CTGC	2	8	106754	106761	0 %	25 %	25 %	50 %	122878983
2520	NC_006834	CGG	2	6	106778	106783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878983
2521	NC_006834	GAC	2	6	106800	106805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878983
2522	NC_006834	GC	3	6	106865	106870	0 %	0 %	50 %	50 %	122878983
2523	NC_006834	GCCT	2	8	106885	106892	0 %	25 %	25 %	50 %	122878983
2524	NC_006834	CTG	2	6	106896	106901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878983
2525	NC_006834	GCG	2	6	106902	106907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878983
2526	NC_006834	GCG	2	6	106910	106915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878983
2527	NC_006834	TGC	2	6	106924	106929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878983
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2529	NC_006834	TC	5	10	106964	106973	0 %	50 %	0 %	50 %	122878983
2530	NC_006834	GCAGGA	2	12	107038	107049	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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2533	NC_006834	TCGA	2	8	107294	107301	25 %	25 %	25 %	25 %	122878984
2534	NC_006834	TGC	2	6	107394	107399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878984
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2537	NC_006834	GC	3	6	107442	107447	0 %	0 %	50 %	50 %	122878984
2538	NC_006834	TGGT	2	8	107520	107527	0 %	50 %	50 %	0 %	122878984
2539	NC_006834	GCG	2	6	107548	107553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878984
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2542	NC_006834	TGC	2	6	107658	107663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878984
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2552	NC_006834	CGGC	2	8	108199	108206	0 %	0 %	50 %	50 %	122878984
2553	NC_006834	CTG	2	6	108224	108229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878984
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2561	NC_006834	CGA	2	6	108691	108696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878984
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2563	NC_006834	CTG	2	6	108761	108766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878984
2564	NC_006834	GC	4	8	108840	108847	0 %	0 %	50 %	50 %	122878984
2565	NC_006834	GCT	2	6	108862	108867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878984
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2572	NC_006834	GCA	2	6	109131	109136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878984
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2574	NC_006834	GCAT	2	8	109176	109183	25 %	25 %	25 %	25 %	122878984
2575	NC_006834	CGCCTG	2	12	109196	109207	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	122878984
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2577	NC_006834	ATCT	2	8	109229	109236	25 %	50 %	0 %	25 %	122878984
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2580	NC_006834	GC	3	6	109382	109387	0 %	0 %	50 %	50 %	58579737
2581	NC_006834	GC	3	6	109430	109435	0 %	0 %	50 %	50 %	58579737
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2590	NC_006834	GCACGG	2	12	109812	109823	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58579737
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2599	NC_006834	GC	3	6	110275	110280	0 %	0 %	50 %	50 %	58579737
2600	NC_006834	CG	3	6	110321	110326	0 %	0 %	50 %	50 %	58579737
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2608	NC_006834	CCCGA	2	10	110653	110662	20 %	0 %	20 %	60 %	58579737
2609	NC_006834	ACGCA	2	10	110705	110714	40 %	0 %	20 %	40 %	58579737
2610	NC_006834	GGC	2	6	110733	110738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579737
2611	NC_006834	TGGCG	2	10	110784	110793	0 %	20 %	60 %	20 %	58579737
2612	NC_006834	GC	4	8	110797	110804	0 %	0 %	50 %	50 %	58579737
2613	NC_006834	CGTG	2	8	110805	110812	0 %	25 %	50 %	25 %	58579737
2614	NC_006834	CGG	2	6	110859	110864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579737
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2621	NC_006834	TGC	2	6	111250	111255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878985
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2623	NC_006834	GC	4	8	111344	111351	0 %	0 %	50 %	50 %	122878985
2624	NC_006834	CGC	3	9	111349	111357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	122878985
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2996	NC_006834	CG	3	6	127957	127962	0 %	0 %	50 %	50 %	58579751
2997	NC_006834	GCG	2	6	128015	128020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579751
2998	NC_006834	GTG	2	6	128070	128075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579751
2999	NC_006834	CTG	2	6	128077	128082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579751
3000	NC_006834	CGGT	2	8	128096	128103	0 %	25 %	50 %	25 %	58579751

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