MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 117125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2261	NC_006834	TGC	2	6	96824	96829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579727
2262	NC_006834	TGC	2	6	96833	96838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579727
2263	NC_006834	CGC	2	6	96879	96884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579727
2264	NC_006834	TCA	2	6	96941	96946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579727
2265	NC_006834	TG	4	8	96971	96978	0 %	50 %	50 %	0 %	58579727
2266	NC_006834	GCT	2	6	97020	97025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579727
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2268	NC_006834	GGC	2	6	97151	97156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579727
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2271	NC_006834	GCGT	2	8	97391	97398	0 %	25 %	50 %	25 %	58579727
2272	NC_006834	TGCAGT	2	12	97430	97441	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58579727
2273	NC_006834	TGC	2	6	97484	97489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579727
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2277	NC_006834	GCT	2	6	97644	97649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579727
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2281	NC_006834	CTG	2	6	97789	97794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579728
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2285	NC_006834	GCAGCG	2	12	98027	98038	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58579728
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2289	NC_006834	CG	3	6	98558	98563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2290	NC_006834	CTG	2	6	98603	98608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2291	NC_006834	GGT	2	6	98671	98676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2292	NC_006834	GCG	2	6	98731	98736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2293	NC_006834	GTC	2	6	98843	98848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2294	NC_006834	CG	3	6	98896	98901	0 %	0 %	50 %	50 %	58579731
2295	NC_006834	CGG	2	6	98910	98915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579731
2296	NC_006834	CAG	2	6	98921	98926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579731
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2299	NC_006834	CAT	2	6	99026	99031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579731
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2332	NC_006834	GCC	2	6	100437	100442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579731
2333	NC_006834	ATGC	2	8	100451	100458	25 %	25 %	25 %	25 %	58579731
2334	NC_006834	CAA	3	9	100487	100495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579731
2335	NC_006834	TGCG	2	8	100506	100513	0 %	25 %	50 %	25 %	58579731
2336	NC_006834	CCG	2	6	100524	100529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579731
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2341	NC_006834	CGAC	2	8	100704	100711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2342	NC_006834	GC	3	6	100717	100722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2343	NC_006834	GCT	2	6	100730	100735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2344	NC_006834	GCT	2	6	100775	100780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2357	NC_006834	GCGCGG	2	12	101098	101109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878982
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2361	NC_006834	ACGTGG	2	12	101262	101273	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	122878982
2362	NC_006834	ATC	2	6	101336	101341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	122878982
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2367	NC_006834	GAC	2	6	101462	101467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878982
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2370	NC_006834	TGA	2	6	101544	101549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	122878982
2371	NC_006834	CGG	3	9	101590	101598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878982
2372	NC_006834	TGG	3	9	101634	101642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	122878982
2373	NC_006834	CGT	2	6	101652	101657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878982
2374	NC_006834	GCA	2	6	101661	101666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878982
2375	NC_006834	GCTG	2	8	101670	101677	0 %	25 %	50 %	25 %	122878982
2376	NC_006834	CGT	2	6	101722	101727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878982
2377	NC_006834	GCA	2	6	101763	101768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878982
2378	NC_006834	GGC	2	6	101807	101812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2379	NC_006834	TGC	2	6	101830	101835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2380	NC_006834	ATC	2	6	101884	101889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2381	NC_006834	GACA	2	8	101951	101958	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2382	NC_006834	GCA	2	6	101970	101975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579733
2383	NC_006834	AGA	2	6	101979	101984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579733
2384	NC_006834	GAT	2	6	101990	101995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579733
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2386	NC_006834	GCAG	2	8	102019	102026	25 %	0 %	50 %	25 %	58579733
2387	NC_006834	TGC	2	6	102037	102042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579733
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2483	NC_006834	CAC	2	6	105552	105557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2495	NC_006834	GGGCT	2	10	105969	105978	0 %	20 %	60 %	20 %	122878983
2496	NC_006834	CTG	2	6	105990	105995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878983
2497	NC_006834	GC	3	6	106015	106020	0 %	0 %	50 %	50 %	122878983
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2500	NC_006834	CAC	2	6	106052	106057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	122878983

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