MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 117125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006834	GAC	2	6	63900	63905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_006834	GCAAGC	3	18	63941	63958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_006834	CTG	2	6	64015	64020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_006834	TGC	2	6	64088	64093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_006834	GCA	2	6	64107	64112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_006834	CGG	2	6	64136	64141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_006834	AAG	2	6	64142	64147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_006834	CGG	2	6	64188	64193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_006834	ACG	2	6	64216	64221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_006834	CTG	2	6	64240	64245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_006834	GC	3	6	64261	64266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_006834	GCGGG	2	10	64317	64326	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1513	NC_006834	GCG	2	6	64351	64356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_006834	AAG	2	6	64411	64416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_006834	CAC	2	6	64480	64485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_006834	CGG	2	6	64496	64501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_006834	GCT	2	6	64533	64538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_006834	AAGCGC	2	12	64606	64617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_006834	CTG	2	6	64871	64876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_006834	TG	3	6	64884	64889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_006834	A	6	6	64932	64937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_006834	GCTT	2	8	64973	64980	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_006834	AAT	2	6	65030	65035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_006834	CTA	2	6	65048	65053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579692
1525	NC_006834	AGT	2	6	65129	65134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579692
1526	NC_006834	TGC	2	6	65135	65140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579692
1527	NC_006834	CG	3	6	65234	65239	0 %	0 %	50 %	50 %	58579692
1528	NC_006834	CAG	2	6	65247	65252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579692
1529	NC_006834	TGG	2	6	65287	65292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579692
1530	NC_006834	GCT	2	6	65318	65323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579692
1531	NC_006834	GGC	2	6	65324	65329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579692
1532	NC_006834	GGC	2	6	65333	65338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579692
1533	NC_006834	TGC	2	6	65344	65349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579692
1534	NC_006834	GAC	2	6	65391	65396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579692
1535	NC_006834	AAG	2	6	65409	65414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579692
1536	NC_006834	TCGG	2	8	65424	65431	0 %	25 %	50 %	25 %	58579692
1537	NC_006834	GCC	2	6	65452	65457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579692
1538	NC_006834	GCG	2	6	65573	65578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579692
1539	NC_006834	AAG	2	6	65580	65585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579692
1540	NC_006834	GC	3	6	65650	65655	0 %	0 %	50 %	50 %	58579692
1541	NC_006834	CGT	2	6	65678	65683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579692
1542	NC_006834	CTG	2	6	65745	65750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579692
1543	NC_006834	GCA	2	6	65767	65772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579692
1544	NC_006834	TGG	2	6	65784	65789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579692
1545	NC_006834	GCC	2	6	65813	65818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579692
1546	NC_006834	AGCC	2	8	65819	65826	25 %	0 %	25 %	50 %	58579692
1547	NC_006834	CGG	2	6	65977	65982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579692
1548	NC_006834	CA	3	6	65998	66003	50 %	0 %	0 %	50 %	58579692
1549	NC_006834	GCT	2	6	66031	66036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579692
1550	NC_006834	GCC	2	6	66046	66051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_006834	ACT	2	6	66072	66077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_006834	CGC	2	6	66244	66249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579693
1553	NC_006834	A	8	8	66284	66291	100 %	0 %	0 %	0 %	58579693
1554	NC_006834	CCGC	2	8	66331	66338	0 %	0 %	25 %	75 %	58579693
1555	NC_006834	AAGG	2	8	66493	66500	50 %	0 %	50 %	0 %	58579693
1556	NC_006834	AAC	2	6	66505	66510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579693
1557	NC_006834	CTT	2	6	66534	66539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_006834	GCC	2	6	66606	66611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_006834	GCA	2	6	66614	66619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_006834	GCA	2	6	66634	66639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579694
1561	NC_006834	CG	3	6	66776	66781	0 %	0 %	50 %	50 %	58579694
1562	NC_006834	CG	4	8	66822	66829	0 %	0 %	50 %	50 %	58579694
1563	NC_006834	TTG	2	6	66831	66836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579694
1564	NC_006834	GGC	2	6	66863	66868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579694
1565	NC_006834	TCG	2	6	66900	66905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579694
1566	NC_006834	GCA	2	6	66961	66966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579694
1567	NC_006834	TGCG	2	8	66968	66975	0 %	25 %	50 %	25 %	58579694
1568	NC_006834	TGCAC	2	10	67006	67015	20 %	20 %	20 %	40 %	58579694
1569	NC_006834	GTG	2	6	67016	67021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579694
1570	NC_006834	CTT	2	6	67085	67090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579694
1571	NC_006834	CG	3	6	67111	67116	0 %	0 %	50 %	50 %	58579695
1572	NC_006834	CGA	2	6	67165	67170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579695
1573	NC_006834	GCC	2	6	67308	67313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579695
1574	NC_006834	CGC	2	6	67327	67332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579695
1575	NC_006834	CTG	2	6	67389	67394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579695
1576	NC_006834	GTC	2	6	67446	67451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121632013
1577	NC_006834	GCTTGC	2	12	67545	67556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121632013
1578	NC_006834	CCT	2	6	67596	67601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_006834	GTT	2	6	67637	67642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_006834	CG	3	6	67805	67810	0 %	0 %	50 %	50 %	58579696
1581	NC_006834	T	8	8	67855	67862	0 %	100 %	0 %	0 %	58579696
1582	NC_006834	GCG	2	6	67897	67902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579696
1583	NC_006834	AGT	2	6	68069	68074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579696
1584	NC_006834	CGG	2	6	68094	68099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579696
1585	NC_006834	CAG	2	6	68109	68114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579696
1586	NC_006834	TG	3	6	68141	68146	0 %	50 %	50 %	0 %	58579696
1587	NC_006834	CCG	2	6	68162	68167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579696
1588	NC_006834	GCTG	2	8	68319	68326	0 %	25 %	50 %	25 %	58579696
1589	NC_006834	CCA	2	6	68355	68360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579696
1590	NC_006834	TGC	2	6	68372	68377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579696
1591	NC_006834	CAG	2	6	68394	68399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579696
1592	NC_006834	ACG	2	6	68461	68466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579696
1593	NC_006834	GC	3	6	68489	68494	0 %	0 %	50 %	50 %	58579696
1594	NC_006834	GCCT	2	8	68553	68560	0 %	25 %	25 %	50 %	58579696
1595	NC_006834	GGC	2	6	68687	68692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579696
1596	NC_006834	ACCG	2	8	68712	68719	25 %	0 %	25 %	50 %	58579696
1597	NC_006834	CTT	2	6	68746	68751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121632014
1598	NC_006834	GTC	2	6	68764	68769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121632014
1599	NC_006834	GCA	2	6	68811	68816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121632014
1600	NC_006834	GCC	2	6	68822	68827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121632014
1601	NC_006834	CCG	2	6	68829	68834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121632014
1602	NC_006834	CAG	2	6	68836	68841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121632014
1603	NC_006834	CCA	2	6	68868	68873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121632014
1604	NC_006834	CG	3	6	68921	68926	0 %	0 %	50 %	50 %	121632014
1605	NC_006834	GCA	2	6	69020	69025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121632014
1606	NC_006834	ACT	2	6	69026	69031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121632014
1607	NC_006834	CG	3	6	69084	69089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_006834	ATT	2	6	69125	69130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_006834	GGTT	2	8	69184	69191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_006834	TTCG	2	8	69200	69207	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_006834	GCG	2	6	69235	69240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_006834	GAG	2	6	69277	69282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_006834	GAT	2	6	69290	69295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_006834	CAG	2	6	69316	69321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_006834	T	7	7	69332	69338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_006834	GGCGAA	2	12	69390	69401	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1617	NC_006834	GGC	2	6	69494	69499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121632015
1618	NC_006834	GAG	2	6	69516	69521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121632015
1619	NC_006834	GTG	2	6	69522	69527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121632015
1620	NC_006834	TGC	2	6	69529	69534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121632015
1621	NC_006834	CTG	2	6	69552	69557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121632015
1622	NC_006834	TGGC	2	8	69566	69573	0 %	25 %	50 %	25 %	121632015
1623	NC_006834	GGT	2	6	69668	69673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121632015
1624	NC_006834	CGTGT	2	10	69678	69687	0 %	40 %	40 %	20 %	121632015
1625	NC_006834	AGG	2	6	69721	69726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121632015
1626	NC_006834	CAT	2	6	69730	69735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121632015
1627	NC_006834	CGG	2	6	69745	69750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579697
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