MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 117125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_006834	TGCT	2	8	42763	42770	0 %	50 %	25 %	25 %	58579665
1003	NC_006834	TTC	2	6	42800	42805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579665
1004	NC_006834	CGT	2	6	42817	42822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579665
1005	NC_006834	GCA	2	6	42850	42855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579665
1006	NC_006834	GCG	2	6	42871	42876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579665
1007	NC_006834	GC	3	6	42899	42904	0 %	0 %	50 %	50 %	58579665
1008	NC_006834	GCG	2	6	42962	42967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579665
1009	NC_006834	GCA	2	6	43074	43079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579665
1010	NC_006834	GC	3	6	43093	43098	0 %	0 %	50 %	50 %	58579665
1011	NC_006834	CG	3	6	43140	43145	0 %	0 %	50 %	50 %	58579665
1012	NC_006834	CGC	2	6	43219	43224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579665
1013	NC_006834	TCGG	2	8	43226	43233	0 %	25 %	50 %	25 %	58579665
1014	NC_006834	CAC	2	6	43243	43248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579665
1015	NC_006834	GAT	2	6	43288	43293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579665
1016	NC_006834	CG	3	6	43344	43349	0 %	0 %	50 %	50 %	58579665
1017	NC_006834	AGCGC	2	10	43356	43365	20 %	0 %	40 %	40 %	58579665
1018	NC_006834	GC	4	8	43362	43369	0 %	0 %	50 %	50 %	58579665
1019	NC_006834	GCG	2	6	43439	43444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_006834	GC	3	6	43466	43471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_006834	GC	3	6	43529	43534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_006834	CGC	2	6	43550	43555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_006834	GGC	2	6	43586	43591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579666
1024	NC_006834	GC	3	6	43590	43595	0 %	0 %	50 %	50 %	58579666
1025	NC_006834	AGGCA	2	10	43646	43655	40 %	0 %	40 %	20 %	58579666
1026	NC_006834	AGC	2	6	43680	43685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579666
1027	NC_006834	TGC	2	6	43755	43760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579666
1028	NC_006834	TTC	2	6	43832	43837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579666
1029	NC_006834	CAC	2	6	43850	43855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579666
1030	NC_006834	TCCA	2	8	43872	43879	25 %	25 %	0 %	50 %	58579666
1031	NC_006834	GCC	2	6	43889	43894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579666
1032	NC_006834	GCA	2	6	43933	43938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579666
1033	NC_006834	CAG	3	9	43940	43948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579666
1034	NC_006834	CAC	2	6	43975	43980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579666
1035	NC_006834	CAC	2	6	44018	44023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579666
1036	NC_006834	GGC	2	6	44060	44065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579666
1037	NC_006834	CATG	2	8	44124	44131	25 %	25 %	25 %	25 %	58579666
1038	NC_006834	GC	3	6	44146	44151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_006834	GCG	2	6	44153	44158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_006834	GCAG	2	8	44187	44194	25 %	0 %	50 %	25 %	58579667
1041	NC_006834	GCGG	2	8	44202	44209	0 %	0 %	75 %	25 %	58579667
1042	NC_006834	CG	3	6	44215	44220	0 %	0 %	50 %	50 %	58579667
1043	NC_006834	GCA	2	6	44339	44344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_006834	CG	3	6	44348	44353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_006834	CCGCG	2	10	44465	44474	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1046	NC_006834	GCC	2	6	44485	44490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_006834	GGC	2	6	44515	44520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_006834	GC	3	6	44531	44536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_006834	GCA	2	6	44578	44583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_006834	GC	3	6	44603	44608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_006834	CGG	2	6	44655	44660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_006834	GCG	2	6	44665	44670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_006834	CAC	2	6	44692	44697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_006834	CGA	2	6	44719	44724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_006834	GCG	3	9	44729	44737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_006834	CCAC	2	8	44776	44783	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1057	NC_006834	TTC	2	6	44787	44792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_006834	GT	3	6	44797	44802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_006834	TCGA	2	8	44814	44821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_006834	CGA	2	6	44867	44872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_006834	CCATCG	2	12	44941	44952	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_006834	CAC	2	6	44993	44998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_006834	CGAA	2	8	45031	45038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_006834	ATC	2	6	45111	45116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_006834	TTG	2	6	45126	45131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_006834	CCCG	2	8	45195	45202	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1067	NC_006834	CCA	2	6	45223	45228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_006834	GGC	2	6	45261	45266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_006834	GCC	2	6	45309	45314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_006834	CGG	2	6	45323	45328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_006834	TGC	2	6	45329	45334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_006834	CG	3	6	45363	45368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_006834	CGG	2	6	45374	45379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_006834	CGC	2	6	45412	45417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1076	NC_006834	GCA	2	6	45470	45475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_006834	GCA	2	6	45478	45483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_006834	GCG	2	6	45569	45574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579670
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1081	NC_006834	GAC	2	6	45709	45714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579670
1082	NC_006834	CGC	2	6	45715	45720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579670
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1084	NC_006834	CCGA	2	8	45781	45788	25 %	0 %	25 %	50 %	58579670
1085	NC_006834	GCG	2	6	45868	45873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_006834	CG	3	6	45881	45886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_006834	CGT	2	6	45894	45899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_006834	GACA	2	8	45908	45915	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_006834	CG	3	6	45917	45922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_006834	GC	3	6	46019	46024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_006834	TCT	2	6	46117	46122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579671
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1098	NC_006834	CAG	2	6	46389	46394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579671
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1100	NC_006834	CCAT	2	8	46456	46463	25 %	25 %	0 %	50 %	58579671
1101	NC_006834	CAC	2	6	46473	46478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579671
1102	NC_006834	CCA	2	6	46496	46501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579671
1103	NC_006834	CTC	2	6	46608	46613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58579671
1104	NC_006834	CG	3	6	46655	46660	0 %	0 %	50 %	50 %	58579671
1105	NC_006834	CTT	2	6	46695	46700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579671
1106	NC_006834	ACC	2	6	46704	46709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579671
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1108	NC_006834	GCA	2	6	46795	46800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579671
1109	NC_006834	GTC	2	6	46833	46838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579671
1110	NC_006834	CTG	2	6	46845	46850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579671
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1112	NC_006834	GCG	2	6	46899	46904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579671
1113	NC_006834	GCTG	2	8	46917	46924	0 %	25 %	50 %	25 %	58579671
1114	NC_006834	CG	3	6	46967	46972	0 %	0 %	50 %	50 %	58579671
1115	NC_006834	TTC	2	6	47062	47067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579671
1116	NC_006834	ACT	2	6	47101	47106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579671
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1118	NC_006834	GAA	2	6	47201	47206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579672
1119	NC_006834	GC	3	6	47294	47299	0 %	0 %	50 %	50 %	58579672
1120	NC_006834	TCG	2	6	47334	47339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579672
1121	NC_006834	GACGGC	2	12	47464	47475	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58579672
1122	NC_006834	TCA	2	6	47479	47484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579672
1123	NC_006834	GCC	2	6	47522	47527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579672
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1126	NC_006834	GCGT	2	8	47712	47719	0 %	25 %	50 %	25 %	58579672
1127	NC_006834	CTT	2	6	47864	47869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579672
1128	NC_006834	CACG	2	8	47881	47888	25 %	0 %	25 %	50 %	58579672
1129	NC_006834	TCA	2	6	48013	48018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579672
1130	NC_006834	GCC	2	6	48029	48034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579672
1131	NC_006834	ACG	2	6	48085	48090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579672
1132	NC_006834	TTCGCC	2	12	48110	48121	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	58579672
1133	NC_006834	TTC	2	6	48149	48154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579672
1134	NC_006834	GCC	2	6	48159	48164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579672
1135	NC_006834	CGTC	2	8	48177	48184	0 %	25 %	25 %	50 %	58579672
1136	NC_006834	TC	3	6	48183	48188	0 %	50 %	0 %	50 %	58579672
1137	NC_006834	TCA	2	6	48190	48195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579672
1138	NC_006834	CAG	2	6	48208	48213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579672
1139	NC_006834	TTA	2	6	48244	48249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_006834	GC	3	6	48254	48259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1141	NC_006834	GAT	2	6	48291	48296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_006834	CAGGT	2	10	48326	48335	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1143	NC_006834	ATCC	2	8	48372	48379	25 %	25 %	0 %	50 %	58579673
1144	NC_006834	GGT	2	6	48469	48474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579673
1145	NC_006834	TTCAT	2	10	48563	48572	20 %	60 %	0 %	20 %	58579673
1146	NC_006834	CA	3	6	48577	48582	50 %	0 %	0 %	50 %	58579673
1147	NC_006834	CTG	2	6	48610	48615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579673
1148	NC_006834	GCA	2	6	48716	48721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579674
1149	NC_006834	CG	3	6	48777	48782	0 %	0 %	50 %	50 %	58579674
1150	NC_006834	CGCA	2	8	48863	48870	25 %	0 %	25 %	50 %	58579674
1151	NC_006834	GTGC	2	8	48903	48910	0 %	25 %	50 %	25 %	58579674
1152	NC_006834	CTGA	2	8	48968	48975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1153	NC_006834	GCT	2	6	49074	49079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1154	NC_006834	GGC	2	6	49114	49119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1155	NC_006834	CAGCGG	2	12	49173	49184	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1156	NC_006834	AAGC	2	8	49233	49240	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1157	NC_006834	GCG	2	6	49248	49253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1158	NC_006834	T	6	6	49276	49281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1159	NC_006834	TGCGCT	2	12	49595	49606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579677
1160	NC_006834	TCC	2	6	49660	49665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58579677
1161	NC_006834	GCA	2	6	49673	49678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579677
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1163	NC_006834	GTG	2	6	49728	49733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579677
1164	NC_006834	CTT	2	6	49797	49802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579677
1165	NC_006834	CCCGC	2	10	49887	49896	0 %	0 %	20 %	80 %	58579677
1166	NC_006834	GC	3	6	49944	49949	0 %	0 %	50 %	50 %	58579677
1167	NC_006834	CAG	2	6	49965	49970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579677
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1171	NC_006834	CTT	2	6	50063	50068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579677
1172	NC_006834	CCG	2	6	50069	50074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579677
1173	NC_006834	CTG	2	6	50097	50102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579677
1174	NC_006834	GCA	2	6	50117	50122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579677
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1192	NC_006834	GCC	3	9	50875	50883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1193	NC_006834	GCTTG	2	10	50950	50959	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1225	NC_006834	GTGA	2	8	52141	52148	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1256	NC_006834	GC	3	6	53649	53654	0 %	0 %	50 %	50 %	58579681
1257	NC_006834	CCG	2	6	53684	53689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579681
1258	NC_006834	CCT	2	6	53699	53704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58579681
1259	NC_006834	TGG	2	6	53726	53731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579681
1260	NC_006834	CCT	2	6	53830	53835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58579681
1261	NC_006834	CGCA	2	8	53872	53879	25 %	0 %	25 %	50 %	58579681
1262	NC_006834	CAG	2	6	53972	53977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1264	NC_006834	CT	3	6	54092	54097	0 %	50 %	0 %	50 %	122878980
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1493	NC_006834	CTG	2	6	63515	63520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1499	NC_006834	TCC	2	6	63775	63780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1500	NC_006834	CTCC	2	8	63796	63803	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding

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