MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 117125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_006834	GGA	2	6	549928	549933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	122879026
13002	NC_006834	CG	3	6	549934	549939	0 %	0 %	50 %	50 %	122879026
13003	NC_006834	GCGCT	2	10	549963	549972	0 %	20 %	40 %	40 %	122879026
13004	NC_006834	GCC	2	6	549997	550002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	122879026
13005	NC_006834	TTGA	2	8	550025	550032	25 %	50 %	25 %	0 %	122879026
13006	NC_006834	CGCA	2	8	550043	550050	25 %	0 %	25 %	50 %	122879026
13007	NC_006834	GTT	2	6	550067	550072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_006834	GAG	2	6	550117	550122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_006834	CCCA	2	8	550124	550131	25 %	0 %	0 %	75 %	58580151
13010	NC_006834	CAC	2	6	550136	550141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580151
13011	NC_006834	CGT	3	9	550151	550159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580151
13012	NC_006834	TGC	2	6	550291	550296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580151
13013	NC_006834	TGC	2	6	550303	550308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580151
13014	NC_006834	GCT	2	6	550337	550342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580151
13015	NC_006834	CG	3	6	550411	550416	0 %	0 %	50 %	50 %	58580151
13016	NC_006834	CGA	2	6	550451	550456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580151
13017	NC_006834	CG	3	6	550463	550468	0 %	0 %	50 %	50 %	58580151
13018	NC_006834	GCC	2	6	550494	550499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580151
13019	NC_006834	GGC	2	6	550500	550505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580151
13020	NC_006834	GCAT	2	8	550507	550514	25 %	25 %	25 %	25 %	58580151
13021	NC_006834	TGG	2	6	550531	550536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58580151
13022	NC_006834	GGT	3	9	550541	550549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58580151
13023	NC_006834	GCG	2	6	550559	550564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580151
13024	NC_006834	TGG	2	6	550581	550586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58580151
13025	NC_006834	CTG	3	9	550590	550598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580151
13026	NC_006834	AG	3	6	550643	550648	50 %	0 %	50 %	0 %	58580151
13027	NC_006834	TGC	2	6	550663	550668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580151
13028	NC_006834	GCT	2	6	550697	550702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580151
13029	NC_006834	TGA	2	6	550732	550737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580151
13030	NC_006834	TGG	2	6	550753	550758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58580151
13031	NC_006834	GAA	2	6	550872	550877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58580151
13032	NC_006834	GCC	2	6	550918	550923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580151
13033	NC_006834	TGC	3	9	550963	550971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580151
13034	NC_006834	TGGT	2	8	550974	550981	0 %	50 %	50 %	0 %	58580151
13035	NC_006834	TGGG	2	8	551006	551013	0 %	25 %	75 %	0 %	58580151
13036	NC_006834	AGC	2	6	551051	551056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_006834	TGCA	2	8	551085	551092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13038	NC_006834	TGCC	2	8	551132	551139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13039	NC_006834	AG	3	6	551169	551174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_006834	TC	3	6	551204	551209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13041	NC_006834	CAAT	2	8	551237	551244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13042	NC_006834	CTG	2	6	551248	551253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_006834	GTCC	2	8	551258	551265	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13044	NC_006834	CAG	2	6	551280	551285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_006834	TC	3	6	551287	551292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13046	NC_006834	CAA	2	6	551508	551513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_006834	TGG	2	6	551540	551545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_006834	A	6	6	551678	551683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_006834	GCGA	2	8	551719	551726	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13050	NC_006834	CTG	3	9	551771	551779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580152
13051	NC_006834	ACC	2	6	551804	551809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580152
13052	NC_006834	GAT	2	6	551963	551968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580152
13053	NC_006834	CGA	2	6	551971	551976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580152
13054	NC_006834	TGA	2	6	551983	551988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580152
13055	NC_006834	AGC	2	6	552010	552015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580152
13056	NC_006834	GAT	2	6	552058	552063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580152
13057	NC_006834	GGC	2	6	552081	552086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580152
13058	NC_006834	GGAT	2	8	552105	552112	25 %	25 %	50 %	0 %	58580152
13059	NC_006834	CGG	2	6	552113	552118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580152
13060	NC_006834	ACA	2	6	552156	552161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_006834	CTG	2	6	552200	552205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_006834	GCG	3	9	552210	552218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_006834	CG	3	6	552217	552222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13064	NC_006834	GCG	2	6	552309	552314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_006834	CG	3	6	552371	552376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13066	NC_006834	CGCC	2	8	552429	552436	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13067	NC_006834	GGCA	2	8	552443	552450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13068	NC_006834	GAT	2	6	552461	552466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_006834	GGCG	2	8	552513	552520	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13070	NC_006834	GGC	2	6	552522	552527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_006834	GC	3	6	552559	552564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13072	NC_006834	GC	3	6	552616	552621	0 %	0 %	50 %	50 %	58580153
13073	NC_006834	TGT	2	6	552625	552630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58580153
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13075	NC_006834	GC	4	8	552692	552699	0 %	0 %	50 %	50 %	58580153
13076	NC_006834	CGC	2	6	552703	552708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580153
13077	NC_006834	GCG	2	6	552798	552803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58580153
13078	NC_006834	GC	3	6	552860	552865	0 %	0 %	50 %	50 %	58580153
13079	NC_006834	TTG	2	6	552927	552932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58580153
13080	NC_006834	GTA	2	6	553023	553028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580153
13081	NC_006834	CAG	2	6	553104	553109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580153
13082	NC_006834	GC	5	10	553146	553155	0 %	0 %	50 %	50 %	58580153
13083	NC_006834	ACA	2	6	553163	553168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58580153
13084	NC_006834	CCA	2	6	553235	553240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580153
13085	NC_006834	GCCAGC	2	12	553255	553266	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	58580153
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13087	NC_006834	GCA	2	6	553334	553339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580153
13088	NC_006834	CG	3	6	553403	553408	0 %	0 %	50 %	50 %	58580153
13089	NC_006834	CAC	2	6	553455	553460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580153
13090	NC_006834	GCT	2	6	553520	553525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580153
13091	NC_006834	CAA	2	6	553542	553547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58580153
13092	NC_006834	CAGCGC	2	12	553701	553712	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	58580153
13093	NC_006834	CTG	2	6	553728	553733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580153
13094	NC_006834	GAACCA	2	12	553791	553802	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	58580153
13095	NC_006834	ATG	2	6	553855	553860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580153
13096	NC_006834	GC	3	6	553861	553866	0 %	0 %	50 %	50 %	58580153
13097	NC_006834	GGGAT	2	10	553873	553882	20 %	20 %	60 %	0 %	58580153
13098	NC_006834	GC	3	6	553904	553909	0 %	0 %	50 %	50 %	58580153
13099	NC_006834	CG	3	6	553919	553924	0 %	0 %	50 %	50 %	58580153
13100	NC_006834	CCA	2	6	553937	553942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58580153
13101	NC_006834	GCC	2	6	553978	553983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580153
13102	NC_006834	CCG	2	6	554023	554028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580153
13103	NC_006834	GATCGA	2	12	554046	554057	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	58580153
13104	NC_006834	CCG	2	6	554083	554088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580153
13105	NC_006834	CAG	2	6	554181	554186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580153
13106	NC_006834	TGA	2	6	554204	554209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580153
13107	NC_006834	CAGC	2	8	554219	554226	25 %	0 %	25 %	50 %	58580153
13108	NC_006834	GTG	3	9	554248	554256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58580153
13109	NC_006834	TGCGC	2	10	554366	554375	0 %	20 %	40 %	40 %	58580153
13110	NC_006834	AAC	2	6	554395	554400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58580153
13111	NC_006834	GAT	2	6	554406	554411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580153
13112	NC_006834	GAA	2	6	554460	554465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58580153
13113	NC_006834	AAG	2	6	554470	554475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58580153
13114	NC_006834	ACTG	2	8	554498	554505	25 %	25 %	25 %	25 %	58580153
13115	NC_006834	CG	3	6	554534	554539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13116	NC_006834	TGG	2	6	554566	554571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_006834	GGC	2	6	554574	554579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_006834	GCA	2	6	554634	554639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_006834	CGA	2	6	554643	554648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_006834	GC	4	8	554651	554658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13121	NC_006834	GCC	2	6	554676	554681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13122	NC_006834	CGC	2	6	554733	554738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13123	NC_006834	GAT	2	6	554764	554769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_006834	GGCC	2	8	554847	554854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13125	NC_006834	GCA	2	6	554864	554869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_006834	CCGGCA	2	12	554888	554899	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13127	NC_006834	GCA	3	9	555003	555011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13128	NC_006834	GCA	2	6	555088	555093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13129	NC_006834	GC	3	6	555139	555144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13130	NC_006834	GGT	2	6	555179	555184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13133	NC_006834	CG	3	6	555266	555271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13134	NC_006834	GGCG	2	8	555280	555287	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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13140	NC_006834	CGGCCA	3	18	555448	555465	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13141	NC_006834	GCCG	2	8	555540	555547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13142	NC_006834	CACC	2	8	555605	555612	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13143	NC_006834	CGC	2	6	555624	555629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13147	NC_006834	GCG	2	6	555774	555779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13241	NC_006834	CGC	2	6	559167	559172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13242	NC_006834	GTGG	2	8	559177	559184	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13243	NC_006834	T	6	6	559192	559197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13244	NC_006834	CGC	2	6	559213	559218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13245	NC_006834	CAG	2	6	559362	559367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13246	NC_006834	AGCC	2	8	559460	559467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13247	NC_006834	TTA	2	6	559490	559495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13248	NC_006834	CCG	2	6	559595	559600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13249	NC_006834	T	8	8	559696	559703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13250	NC_006834	TC	3	6	559735	559740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13251	NC_006834	ACG	2	6	559782	559787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13252	NC_006834	GTT	2	6	559793	559798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13253	NC_006834	CTTG	2	8	559808	559815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13254	NC_006834	GTA	2	6	559865	559870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13255	NC_006834	CTC	2	6	559899	559904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13256	NC_006834	AGA	2	6	559906	559911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13257	NC_006834	GAA	2	6	559946	559951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58580159
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13260	NC_006834	CG	5	10	560017	560026	0 %	0 %	50 %	50 %	58580159
13261	NC_006834	CCAG	2	8	560056	560063	25 %	0 %	25 %	50 %	58580159
13262	NC_006834	TCG	2	6	560070	560075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580159
13263	NC_006834	GAGT	2	8	560103	560110	25 %	25 %	50 %	0 %	58580159
13264	NC_006834	GCA	2	6	560136	560141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580159
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13270	NC_006834	ATG	2	6	560397	560402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580159
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13272	NC_006834	CGC	2	6	560470	560475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580159
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13275	NC_006834	TCG	2	6	560667	560672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580159
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13280	NC_006834	CG	3	6	561130	561135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13281	NC_006834	GTT	2	6	561142	561147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13282	NC_006834	TGG	2	6	561163	561168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13283	NC_006834	CGCTG	2	10	561312	561321	0 %	20 %	40 %	40 %	58580160
13284	NC_006834	CGT	2	6	561375	561380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580160
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13307	NC_006834	TTGACC	2	12	562409	562420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58580160
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13311	NC_006834	GCC	2	6	562746	562751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13312	NC_006834	TTC	2	6	562860	562865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13315	NC_006834	ATA	2	6	562996	563001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13316	NC_006834	GC	3	6	563043	563048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13317	NC_006834	TAA	2	6	563061	563066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13318	NC_006834	TCT	2	6	563200	563205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58580161
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13324	NC_006834	A	6	6	563408	563413	100 %	0 %	0 %	0 %	58580161
13325	NC_006834	AGT	2	6	563484	563489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58580161
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13329	NC_006834	CT	3	6	563702	563707	0 %	50 %	0 %	50 %	58580161
13330	NC_006834	TGT	2	6	563742	563747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58580161
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13341	NC_006834	TCG	2	6	564529	564534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58580162
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13362	NC_006834	CGC	2	6	565254	565259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58580162
13363	NC_006834	ATCGGC	2	12	565260	565271	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	58580162
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13371	NC_006834	CAG	2	6	565590	565595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58580162
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13495	NC_006834	GGCG	2	8	571523	571530	0 %	0 %	75 %	25 %	122879027
13496	NC_006834	AGGC	2	8	571537	571544	25 %	0 %	50 %	25 %	122879027
13497	NC_006834	CGT	2	6	571609	571614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122879027
13498	NC_006834	GCG	2	6	571635	571640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122879027
13499	NC_006834	CGGT	2	8	571641	571648	0 %	25 %	50 %	25 %	122879027
13500	NC_006834	GCT	2	6	571650	571655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122879027

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