MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 117125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_006834	CGG	2	6	253416	253421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579863
6002	NC_006834	GC	3	6	253439	253444	0 %	0 %	50 %	50 %	58579863
6003	NC_006834	GCC	2	6	253493	253498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579863
6004	NC_006834	AGC	2	6	253523	253528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_006834	GC	3	6	253717	253722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_006834	GCG	2	6	253786	253791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_006834	CGC	2	6	253799	253804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_006834	CGC	2	6	253878	253883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579864
6009	NC_006834	GCC	2	6	253933	253938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579864
6010	NC_006834	TGC	2	6	254007	254012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579864
6011	NC_006834	TCG	2	6	254045	254050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579864
6012	NC_006834	CAG	2	6	254059	254064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579864
6013	NC_006834	AGCAC	2	10	254115	254124	40 %	0 %	20 %	40 %	58579864
6014	NC_006834	ACC	2	6	254144	254149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579864
6015	NC_006834	CCA	2	6	254196	254201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579864
6016	NC_006834	CGT	2	6	254220	254225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579864
6017	NC_006834	CTG	2	6	254248	254253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579864
6018	NC_006834	CG	3	6	254287	254292	0 %	0 %	50 %	50 %	58579864
6019	NC_006834	CCA	2	6	254310	254315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579864
6020	NC_006834	CGC	2	6	254316	254321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579864
6021	NC_006834	GCA	2	6	254397	254402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579864
6022	NC_006834	GGT	3	9	254404	254412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579864
6023	NC_006834	CATT	2	8	254421	254428	25 %	50 %	0 %	25 %	58579864
6024	NC_006834	TAG	2	6	254435	254440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579864
6025	NC_006834	CCGGG	2	10	254470	254479	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6026	NC_006834	GCG	2	6	254489	254494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_006834	AGG	2	6	254542	254547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_006834	GAAGC	2	10	254570	254579	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6029	NC_006834	TGC	2	6	254698	254703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579865
6030	NC_006834	TTG	2	6	254718	254723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579865
6031	NC_006834	GCCGGC	2	12	254730	254741	0 %	0 %	50 %	50 %	58579865
6032	NC_006834	CG	3	6	254752	254757	0 %	0 %	50 %	50 %	58579865
6033	NC_006834	CGC	2	6	254816	254821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579865
6034	NC_006834	CAA	2	6	254834	254839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579865
6035	NC_006834	CGC	3	9	254954	254962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579865
6036	NC_006834	CGA	2	6	254996	255001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579865
6037	NC_006834	GCC	2	6	255003	255008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579865
6038	NC_006834	CG	3	6	255076	255081	0 %	0 %	50 %	50 %	58579865
6039	NC_006834	TGG	2	6	255115	255120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579865
6040	NC_006834	GCA	2	6	255127	255132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579865
6041	NC_006834	AAG	2	6	255142	255147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579865
6042	NC_006834	ACC	2	6	255183	255188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579865
6043	NC_006834	TGG	2	6	255292	255297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579865
6044	NC_006834	CTG	2	6	255333	255338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579865
6045	NC_006834	GGCCG	2	10	255347	255356	0 %	0 %	60 %	40 %	58579865
6046	NC_006834	CG	3	6	255355	255360	0 %	0 %	50 %	50 %	58579865
6047	NC_006834	GAC	2	6	255384	255389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579865
6048	NC_006834	GGCGC	2	10	255406	255415	0 %	0 %	60 %	40 %	58579865
6049	NC_006834	GCA	2	6	255431	255436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579865
6050	NC_006834	GC	3	6	255441	255446	0 %	0 %	50 %	50 %	58579865
6051	NC_006834	ATC	2	6	255465	255470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579865
6052	NC_006834	GCT	2	6	255490	255495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579865
6053	NC_006834	TGC	2	6	255505	255510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579865
6054	NC_006834	TGC	2	6	255638	255643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579865
6055	NC_006834	TGG	2	6	255773	255778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579865
6056	NC_006834	AGG	2	6	255799	255804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58579865
6057	NC_006834	CTG	2	6	255813	255818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579865
6058	NC_006834	GAC	2	6	255846	255851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579865
6059	NC_006834	TGCG	2	8	255865	255872	0 %	25 %	50 %	25 %	58579865
6060	NC_006834	CG	4	8	255955	255962	0 %	0 %	50 %	50 %	58579865
6061	NC_006834	GCA	2	6	255983	255988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579865
6062	NC_006834	GCC	2	6	255992	255997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579865
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6065	NC_006834	GCG	2	6	256157	256162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579865
6066	NC_006834	GGC	2	6	256200	256205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579865
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6072	NC_006834	TCG	2	6	256342	256347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579865
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6081	NC_006834	CGGCA	2	10	256696	256705	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6082	NC_006834	ATG	2	6	256718	256723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6087	NC_006834	CGC	2	6	256956	256961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_006834	TGA	2	6	257024	257029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6091	NC_006834	GTTG	2	8	257113	257120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_006834	CG	3	6	257133	257138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6100	NC_006834	CGA	3	9	257484	257492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6102	NC_006834	GC	4	8	257529	257536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_006834	TCG	2	6	257587	257592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_006834	GGTGCG	2	12	257610	257621	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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6106	NC_006834	GGC	2	6	257688	257693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6108	NC_006834	CGA	2	6	257755	257760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_006834	CGT	2	6	257772	257777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_006834	CATC	2	8	257815	257822	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_006834	GT	3	6	257831	257836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_006834	GCG	2	6	257985	257990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_006834	GCCG	2	8	258033	258040	0 %	0 %	50 %	50 %	58579868
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6115	NC_006834	GC	4	8	258144	258151	0 %	0 %	50 %	50 %	58579868
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6120	NC_006834	GC	3	6	258339	258344	0 %	0 %	50 %	50 %	58579868
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6126	NC_006834	TCT	2	6	258554	258559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579868
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6131	NC_006834	CGT	2	6	258816	258821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579868
6132	NC_006834	CGT	2	6	258823	258828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579868
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6223	NC_006834	CG	4	8	262237	262244	0 %	0 %	50 %	50 %	58579871
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6232	NC_006834	A	6	6	262619	262624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6233	NC_006834	AC	3	6	262635	262640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6234	NC_006834	ACG	2	6	262735	262740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579872
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6239	NC_006834	ATCG	2	8	263109	263116	25 %	25 %	25 %	25 %	58579872
6240	NC_006834	GCC	2	6	263140	263145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579872
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6251	NC_006834	CGGC	2	8	263770	263777	0 %	0 %	50 %	50 %	58579872
6252	NC_006834	GCA	2	6	263786	263791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579872
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6256	NC_006834	TCG	2	6	263950	263955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579872
6257	NC_006834	GTC	2	6	264069	264074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579872
6258	NC_006834	CCA	2	6	264110	264115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579872
6259	NC_006834	AACTG	2	10	264200	264209	40 %	20 %	20 %	20 %	58579872
6260	NC_006834	GAGC	2	8	264216	264223	25 %	0 %	50 %	25 %	58579872
6261	NC_006834	CG	3	6	264230	264235	0 %	0 %	50 %	50 %	58579872
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6275	NC_006834	GCC	2	6	264858	264863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579872
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6277	NC_006834	TTGG	2	8	264975	264982	0 %	50 %	50 %	0 %	58579872
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6370	NC_006834	A	6	6	269189	269194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6371	NC_006834	AAAG	2	8	269208	269215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6372	NC_006834	CG	4	8	269261	269268	0 %	0 %	50 %	50 %	58579875
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6499	NC_006834	CGC	2	6	273741	273746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579877
6500	NC_006834	ATC	2	6	273855	273860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579877

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