MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 117125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006834	GGC	2	6	213491	213496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878993
5002	NC_006834	TGC	2	6	213502	213507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878993
5003	NC_006834	GAC	2	6	213549	213554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878993
5004	NC_006834	AAG	2	6	213567	213572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	122878993
5005	NC_006834	TCGG	2	8	213582	213589	0 %	25 %	50 %	25 %	122878993
5006	NC_006834	GCC	2	6	213610	213615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	122878993
5007	NC_006834	GCG	2	6	213731	213736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878993
5008	NC_006834	AAG	2	6	213738	213743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	122878993
5009	NC_006834	GC	3	6	213808	213813	0 %	0 %	50 %	50 %	122878993
5010	NC_006834	GGC	2	6	213827	213832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878993
5011	NC_006834	CGT	2	6	213836	213841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878993
5012	NC_006834	CTG	2	6	213903	213908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878993
5013	NC_006834	GCA	2	6	213925	213930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878993
5014	NC_006834	TGG	2	6	213942	213947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	122878993
5015	NC_006834	GCC	2	6	213971	213976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	122878993
5016	NC_006834	AGCC	2	8	213977	213984	25 %	0 %	25 %	50 %	122878993
5017	NC_006834	CGG	2	6	214135	214140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878993
5018	NC_006834	CA	3	6	214156	214161	50 %	0 %	0 %	50 %	122878993
5019	NC_006834	GCT	2	6	214187	214192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878993
5020	NC_006834	GCC	2	6	214202	214207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	122878993
5021	NC_006834	ACT	2	6	214228	214233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	122878993
5022	NC_006834	CGC	2	6	214400	214405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	122878993
5023	NC_006834	A	7	7	214440	214446	100 %	0 %	0 %	0 %	122878993
5024	NC_006834	CCGC	2	8	214486	214493	0 %	0 %	25 %	75 %	122878993
5025	NC_006834	CGGATT	2	12	214617	214628	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	122878993
5026	NC_006834	AGT	2	6	214648	214653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_006834	CGC	2	6	214721	214726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579835
5028	NC_006834	GGC	2	6	214730	214735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579835
5029	NC_006834	GTGC	2	8	214824	214831	0 %	25 %	50 %	25 %	58579835
5030	NC_006834	GC	3	6	214884	214889	0 %	0 %	50 %	50 %	58579835
5031	NC_006834	AGC	2	6	214893	214898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579835
5032	NC_006834	GTC	2	6	214904	214909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579835
5033	NC_006834	TGC	2	6	214911	214916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579835
5034	NC_006834	CGGT	2	8	214929	214936	0 %	25 %	50 %	25 %	58579835
5035	NC_006834	CG	3	6	214972	214977	0 %	0 %	50 %	50 %	58579835
5036	NC_006834	CG	3	6	214992	214997	0 %	0 %	50 %	50 %	58579835
5037	NC_006834	ACGC	2	8	215012	215019	25 %	0 %	25 %	50 %	58579835
5038	NC_006834	GGT	2	6	215061	215066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579835
5039	NC_006834	GCG	2	6	215132	215137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579835
5040	NC_006834	GCT	2	6	215147	215152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579835
5041	NC_006834	GCAGCG	2	12	215153	215164	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58579835
5042	NC_006834	GCATGG	2	12	215189	215200	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	58579835
5043	NC_006834	GC	3	6	215246	215251	0 %	0 %	50 %	50 %	58579835
5044	NC_006834	CG	3	6	215252	215257	0 %	0 %	50 %	50 %	58579835
5045	NC_006834	GCA	2	6	215293	215298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579835
5046	NC_006834	CCAA	2	8	215397	215404	50 %	0 %	0 %	50 %	58579835
5047	NC_006834	GTG	2	6	215423	215428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579835
5048	NC_006834	GCC	2	6	215449	215454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579835
5049	NC_006834	GCTTCG	2	12	215511	215522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579835
5050	NC_006834	CAGG	2	8	215542	215549	25 %	0 %	50 %	25 %	58579835
5051	NC_006834	GAT	2	6	215599	215604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579835
5052	NC_006834	GCG	2	6	215616	215621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579835
5053	NC_006834	GC	3	6	215629	215634	0 %	0 %	50 %	50 %	58579835
5054	NC_006834	GGCG	2	8	215635	215642	0 %	0 %	75 %	25 %	58579835
5055	NC_006834	GGGCA	2	10	215672	215681	20 %	0 %	60 %	20 %	58579835
5056	NC_006834	CGG	2	6	215710	215715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579835
5057	NC_006834	AGC	2	6	215757	215762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579835
5058	NC_006834	GTGC	2	8	215763	215770	0 %	25 %	50 %	25 %	58579835
5059	NC_006834	CGC	2	6	215798	215803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579835
5060	NC_006834	CTGC	2	8	215842	215849	0 %	25 %	25 %	50 %	58579835
5061	NC_006834	GCC	2	6	215853	215858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579835
5062	NC_006834	GCA	2	6	215869	215874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579835
5063	NC_006834	CCTT	2	8	216006	216013	0 %	50 %	0 %	50 %	58579835
5064	NC_006834	CGGC	2	8	216022	216029	0 %	0 %	50 %	50 %	58579835
5065	NC_006834	GC	3	6	216070	216075	0 %	0 %	50 %	50 %	58579835
5066	NC_006834	AGC	2	6	216078	216083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579835
5067	NC_006834	CG	3	6	216100	216105	0 %	0 %	50 %	50 %	58579835
5068	NC_006834	CCA	2	6	216133	216138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579835
5069	NC_006834	CCG	2	6	216156	216161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579835
5070	NC_006834	GA	3	6	216162	216167	50 %	0 %	50 %	0 %	58579835
5071	NC_006834	TGG	2	6	216238	216243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579835
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5073	NC_006834	GC	5	10	216293	216302	0 %	0 %	50 %	50 %	58579837
5074	NC_006834	GCG	2	6	216310	216315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579837
5075	NC_006834	GCA	2	6	216353	216358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579837
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5077	NC_006834	GC	3	6	216425	216430	0 %	0 %	50 %	50 %	58579837
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5081	NC_006834	GTC	2	6	216507	216512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579837
5082	NC_006834	TTGA	2	8	216516	216523	25 %	50 %	25 %	0 %	58579837
5083	NC_006834	GTC	2	6	216632	216637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_006834	CGG	2	6	216646	216651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_006834	GCC	2	6	216672	216677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_006834	TGC	2	6	216688	216693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_006834	CGA	2	6	216761	216766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878994
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5089	NC_006834	TCG	2	6	216952	216957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878994
5090	NC_006834	CGG	2	6	216958	216963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878994
5091	NC_006834	GGT	2	6	217016	217021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	122878994
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5093	NC_006834	GTGA	2	8	217096	217103	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_006834	GCC	2	6	217106	217111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_006834	GCA	2	6	217120	217125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_006834	ATGCCG	2	12	217138	217149	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_006834	GTGC	2	8	217262	217269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5098	NC_006834	GC	4	8	217268	217275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_006834	TGT	2	6	217300	217305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_006834	AGCA	2	8	217309	217316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5101	NC_006834	GGC	2	6	217321	217326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_006834	ACA	2	6	217335	217340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_006834	GCG	2	6	217402	217407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_006834	GAGT	2	8	217430	217437	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_006834	GCA	2	6	217508	217513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_006834	AAC	2	6	217578	217583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_006834	CGC	2	6	217615	217620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579838
5108	NC_006834	GACGC	2	10	217676	217685	20 %	0 %	40 %	40 %	58579838
5109	NC_006834	TGG	2	6	217720	217725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579838
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5111	NC_006834	TGG	2	6	217855	217860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579838
5112	NC_006834	GCA	2	6	217900	217905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579838
5113	NC_006834	CAG	2	6	217910	217915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579838
5114	NC_006834	TGCC	2	8	217951	217958	0 %	25 %	25 %	50 %	58579838
5115	NC_006834	CCGC	2	8	217967	217974	0 %	0 %	25 %	75 %	58579838
5116	NC_006834	GTG	2	6	218004	218009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579838
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5119	NC_006834	GGCC	2	8	218108	218115	0 %	0 %	50 %	50 %	58579838
5120	NC_006834	ACG	3	9	218116	218124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579838
5121	NC_006834	GCG	2	6	218139	218144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579838
5122	NC_006834	CGGC	2	8	218169	218176	0 %	0 %	50 %	50 %	58579838
5123	NC_006834	GC	3	6	218245	218250	0 %	0 %	50 %	50 %	58579838
5124	NC_006834	GCA	2	6	218269	218274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579838
5125	NC_006834	GAC	2	6	218331	218336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579838
5126	NC_006834	CG	4	8	218342	218349	0 %	0 %	50 %	50 %	58579838
5127	NC_006834	GC	4	8	218357	218364	0 %	0 %	50 %	50 %	58579838
5128	NC_006834	TGC	2	6	218497	218502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579838
5129	NC_006834	CG	3	6	218520	218525	0 %	0 %	50 %	50 %	58579838
5130	NC_006834	GCAG	2	8	218621	218628	25 %	0 %	50 %	25 %	58579838
5131	NC_006834	GC	3	6	218679	218684	0 %	0 %	50 %	50 %	58579838
5132	NC_006834	TAC	2	6	218724	218729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579838
5133	NC_006834	AG	3	6	218738	218743	50 %	0 %	50 %	0 %	58579838
5134	NC_006834	GTG	2	6	218787	218792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579838
5135	NC_006834	GTG	2	6	218811	218816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579838
5136	NC_006834	CCG	2	6	218817	218822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579838
5137	NC_006834	CCA	2	6	218851	218856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579838
5138	NC_006834	GCT	2	6	218876	218881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579838
5139	NC_006834	GGCC	2	8	218957	218964	0 %	0 %	50 %	50 %	58579838
5140	NC_006834	ACG	2	6	219070	219075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579838
5141	NC_006834	GC	3	6	219099	219104	0 %	0 %	50 %	50 %	58579838
5142	NC_006834	CGG	2	6	219113	219118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579838
5143	NC_006834	TCT	2	6	219148	219153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579838
5144	NC_006834	GC	3	6	219270	219275	0 %	0 %	50 %	50 %	58579838
5145	NC_006834	GCAC	2	8	219297	219304	25 %	0 %	25 %	50 %	58579838
5146	NC_006834	GCCGC	2	10	219321	219330	0 %	0 %	40 %	60 %	58579838
5147	NC_006834	GCG	2	6	219409	219414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579838
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5151	NC_006834	CGC	2	6	219500	219505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579838
5152	NC_006834	GCT	2	6	219510	219515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579838
5153	NC_006834	GCA	2	6	219645	219650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579838
5154	NC_006834	GC	3	6	219683	219688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5155	NC_006834	GCG	2	6	219714	219719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5156	NC_006834	GC	3	6	219759	219764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5157	NC_006834	GCA	2	6	219817	219822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5158	NC_006834	GTG	2	6	219833	219838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5159	NC_006834	CAG	2	6	219863	219868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5160	NC_006834	GTC	2	6	219887	219892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5161	NC_006834	CCAT	2	8	219912	219919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5162	NC_006834	GCC	2	6	219946	219951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5163	NC_006834	GTGCC	2	10	219954	219963	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5164	NC_006834	GGC	2	6	220040	220045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5165	NC_006834	GAT	2	6	220076	220081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_006834	TAA	2	6	220138	220143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_006834	AGC	2	6	220164	220169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5168	NC_006834	ATTTT	2	10	220194	220203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5169	NC_006834	TGTCG	2	10	220261	220270	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5170	NC_006834	CGC	2	6	220339	220344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5171	NC_006834	TGCG	2	8	220528	220535	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5172	NC_006834	TGA	2	6	220577	220582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	122878995
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5182	NC_006834	GCG	2	6	221041	221046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878995
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5186	NC_006834	GAC	2	6	221311	221316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878995
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5188	NC_006834	CGA	2	6	221673	221678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579841
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5200	NC_006834	CGGC	2	8	222008	222015	0 %	0 %	50 %	50 %	58579841
5201	NC_006834	GTG	3	9	222019	222027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579841
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5212	NC_006834	CAG	2	6	222426	222431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5233	NC_006834	CAC	2	6	223218	223223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579842
5234	NC_006834	ATC	2	6	223264	223269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579842
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5238	NC_006834	GCGG	2	8	223493	223500	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5239	NC_006834	CGG	2	6	223511	223516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5240	NC_006834	CAG	2	6	223610	223615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5241	NC_006834	T	6	6	223681	223686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_006834	TGC	2	6	223784	223789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878996
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5246	NC_006834	GGT	2	6	223844	223849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	122878996
5247	NC_006834	CG	5	10	223856	223865	0 %	0 %	50 %	50 %	122878996
5248	NC_006834	GCT	2	6	223883	223888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878996
5249	NC_006834	GCAG	2	8	223931	223938	25 %	0 %	50 %	25 %	122878996
5250	NC_006834	CGG	2	6	223973	223978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878996
5251	NC_006834	CAAC	2	8	224006	224013	50 %	0 %	0 %	50 %	122878996
5252	NC_006834	GCCA	2	8	224037	224044	25 %	0 %	25 %	50 %	122878996
5253	NC_006834	GCA	2	6	224074	224079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878996
5254	NC_006834	CGGG	2	8	224116	224123	0 %	0 %	75 %	25 %	122878996
5255	NC_006834	TCATCG	2	12	224203	224214	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	122878996
5256	NC_006834	GAACT	2	10	224226	224235	40 %	20 %	20 %	20 %	122878996
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5258	NC_006834	GC	5	10	224250	224259	0 %	0 %	50 %	50 %	122878996
5259	NC_006834	TC	3	6	224354	224359	0 %	50 %	0 %	50 %	122878996
5260	NC_006834	CTG	2	6	224424	224429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	122878996
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5272	NC_006834	GC	3	6	224991	224996	0 %	0 %	50 %	50 %	122878996
5273	NC_006834	CGA	2	6	225005	225010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878996
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5276	NC_006834	GCG	2	6	225164	225169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878996
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5280	NC_006834	ATCGC	2	10	225391	225400	20 %	20 %	20 %	40 %	122878996
5281	NC_006834	GCA	2	6	225401	225406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878996
5282	NC_006834	ACC	2	6	225420	225425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	122878996
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5289	NC_006834	GGC	2	6	225708	225713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5292	NC_006834	GGCCTT	2	12	225823	225834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5357	NC_006834	TGCA	2	8	228443	228450	25 %	25 %	25 %	25 %	58579845
5358	NC_006834	CGA	2	6	228454	228459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579845
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5361	NC_006834	CGA	2	6	228526	228531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579845
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5365	NC_006834	ACGCC	2	10	228627	228636	20 %	0 %	20 %	60 %	58579845
5366	NC_006834	CTG	2	6	228647	228652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579845
5367	NC_006834	GCCG	2	8	228715	228722	0 %	0 %	50 %	50 %	58579845
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5369	NC_006834	GC	3	6	228804	228809	0 %	0 %	50 %	50 %	58579845
5370	NC_006834	CTA	2	6	228817	228822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579845
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5372	NC_006834	CGA	2	6	228909	228914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579845
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5374	NC_006834	CCAT	2	8	228955	228962	25 %	25 %	0 %	50 %	58579845
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5379	NC_006834	CCTG	2	8	229033	229040	0 %	25 %	25 %	50 %	58579845
5380	NC_006834	CTG	2	6	229070	229075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579845
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5391	NC_006834	CG	3	6	229431	229436	0 %	0 %	50 %	50 %	58579845
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5485	NC_006834	TGGGC	2	10	233230	233239	0 %	20 %	60 %	20 %	122878998
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5497	NC_006834	AGC	2	6	233688	233693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878998
5498	NC_006834	AAT	2	6	233713	233718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	122878998
5499	NC_006834	TGG	2	6	233742	233747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	122878998
5500	NC_006834	CAT	2	6	233833	233838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	122878998

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