MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 117125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_006834	CAA	2	6	192618	192623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	122878990
4503	NC_006834	GC	3	6	192631	192636	0 %	0 %	50 %	50 %	122878990
4504	NC_006834	GCA	2	6	192737	192742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878990
4505	NC_006834	GC	3	6	192765	192770	0 %	0 %	50 %	50 %	122878990
4506	NC_006834	GCG	2	6	192792	192797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	122878990
4507	NC_006834	CAG	2	6	192855	192860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878990
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4509	NC_006834	GC	3	6	192873	192878	0 %	0 %	50 %	50 %	122878990
4510	NC_006834	GGT	2	6	192930	192935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	122878990
4511	NC_006834	GC	3	6	192960	192965	0 %	0 %	50 %	50 %	122878990
4512	NC_006834	GCACG	2	10	193071	193080	20 %	0 %	40 %	40 %	122878990
4513	NC_006834	ACC	2	6	193093	193098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	122878990
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4519	NC_006834	GCA	2	6	193378	193383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	122878990
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4521	NC_006834	TTG	2	6	193545	193550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_006834	ATG	2	6	193588	193593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_006834	GCT	2	6	193606	193611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_006834	GAG	2	6	193617	193622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_006834	GGC	2	6	193655	193660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4527	NC_006834	GAAATA	2	12	193760	193771	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4529	NC_006834	GCG	2	6	193798	193803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_006834	CGA	2	6	193859	193864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_006834	ATG	2	6	193896	193901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_006834	GC	3	6	193921	193926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_006834	GTT	2	6	193960	193965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_006834	GC	3	6	193976	193981	0 %	0 %	50 %	50 %	58579812
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4541	NC_006834	TGGG	2	8	194502	194509	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_006834	TGG	2	6	194511	194516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4545	NC_006834	CCG	3	9	194668	194676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_006834	GCG	2	6	194719	194724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_006834	CG	3	6	194741	194746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_006834	CGG	2	6	194778	194783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_006834	TCC	2	6	194806	194811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58579813
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4561	NC_006834	CAG	2	6	195285	195290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579813
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4577	NC_006834	GCCT	2	8	195956	195963	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4584	NC_006834	TGC	2	6	196290	196295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4592	NC_006834	CGA	2	6	196549	196554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4597	NC_006834	GTC	2	6	196683	196688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4599	NC_006834	CCA	2	6	196715	196720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4600	NC_006834	TGCC	2	8	196738	196745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4601	NC_006834	CTG	2	6	196773	196778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4603	NC_006834	GC	3	6	196793	196798	0 %	0 %	50 %	50 %	121632020
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4610	NC_006834	CGTG	2	8	197179	197186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4611	NC_006834	CAA	2	6	197263	197268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_006834	GAC	2	6	197278	197283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4618	NC_006834	GCTG	2	8	197372	197379	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4758	NC_006834	ACG	2	6	203301	203306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579820
4759	NC_006834	TCG	2	6	203329	203334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579820
4760	NC_006834	GC	3	6	203365	203370	0 %	0 %	50 %	50 %	58579820
4761	NC_006834	GCG	2	6	203417	203422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579820
4762	NC_006834	AG	3	6	203466	203471	50 %	0 %	50 %	0 %	58579820
4763	NC_006834	CG	3	6	203487	203492	0 %	0 %	50 %	50 %	58579820
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4765	NC_006834	GCGG	2	8	203564	203571	0 %	0 %	75 %	25 %	58579820
4766	NC_006834	CG	3	6	203579	203584	0 %	0 %	50 %	50 %	58579820
4767	NC_006834	CGT	2	6	203591	203596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579820
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4779	NC_006834	GTT	2	6	204204	204209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579820
4780	NC_006834	CGG	2	6	204228	204233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579820
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4782	NC_006834	CG	3	6	204258	204263	0 %	0 %	50 %	50 %	58579820
4783	NC_006834	TCG	2	6	204289	204294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579820
4784	NC_006834	CG	3	6	204366	204371	0 %	0 %	50 %	50 %	58579820
4785	NC_006834	GTC	2	6	204423	204428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579820
4786	NC_006834	GCT	2	6	204476	204481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579820
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4788	NC_006834	ACG	2	6	204571	204576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579820
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4791	NC_006834	GC	3	6	204619	204624	0 %	0 %	50 %	50 %	58579820
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4796	NC_006834	GCCG	2	8	204933	204940	0 %	0 %	50 %	50 %	58579820
4797	NC_006834	GC	4	8	204944	204951	0 %	0 %	50 %	50 %	58579820
4798	NC_006834	GC	3	6	204981	204986	0 %	0 %	50 %	50 %	58579820
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4802	NC_006834	GCC	2	6	205167	205172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579820
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4806	NC_006834	CGT	2	6	205301	205306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579820
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4833	NC_006834	CGC	2	6	206184	206189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4834	NC_006834	CCA	2	6	206191	206196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4839	NC_006834	AGCA	2	8	206458	206465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4840	NC_006834	GTTG	2	8	206505	206512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4841	NC_006834	GC	3	6	206565	206570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4842	NC_006834	GAC	2	6	206598	206603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4846	NC_006834	ACA	2	6	206677	206682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4847	NC_006834	ACG	2	6	206687	206692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4851	NC_006834	C	6	6	206819	206824	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4852	NC_006834	TGA	2	6	206859	206864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4855	NC_006834	CCG	2	6	206909	206914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4856	NC_006834	T	7	7	206919	206925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4857	NC_006834	GC	3	6	206971	206976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4858	NC_006834	GCA	2	6	206979	206984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4859	NC_006834	TCG	2	6	207014	207019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4860	NC_006834	GCCG	2	8	207024	207031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4861	NC_006834	ATC	2	6	207158	207163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4862	NC_006834	TG	3	6	207180	207185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4863	NC_006834	CGT	2	6	207264	207269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4864	NC_006834	CGG	2	6	207303	207308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4865	NC_006834	ACG	2	6	207320	207325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4866	NC_006834	TGGG	2	8	207350	207357	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4867	NC_006834	GCA	2	6	207360	207365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4869	NC_006834	GCT	3	9	207420	207428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4870	NC_006834	GA	4	8	207487	207494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4871	NC_006834	GCG	2	6	207511	207516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4872	NC_006834	CG	3	6	207570	207575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4873	NC_006834	AGCGC	2	10	207582	207591	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4874	NC_006834	ACG	2	6	207667	207672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4875	NC_006834	GAG	2	6	207730	207735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4876	NC_006834	GCA	2	6	207829	207834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4877	NC_006834	GGC	2	6	207902	207907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4878	NC_006834	CAG	2	6	208112	208117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4879	NC_006834	TTTG	2	8	208157	208164	0 %	75 %	25 %	0 %	58579823
4880	NC_006834	CAC	2	6	208210	208215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579823
4881	NC_006834	ACA	2	6	208275	208280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579823
4882	NC_006834	GCT	2	6	208303	208308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579823
4883	NC_006834	CTG	2	6	208319	208324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579823
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4885	NC_006834	GC	3	6	208583	208588	0 %	0 %	50 %	50 %	58579824
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