MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 4609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004556	AT	3	6	13	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004556	AC	4	8	456	463	50 %	0 %	0 %	50 %	28197946
3	NC_004556	TG	3	6	2279	2284	0 %	50 %	50 %	0 %	28197947
4	NC_004556	GA	3	6	3750	3755	50 %	0 %	50 %	0 %	28197948
5	NC_004556	AT	3	6	4472	4477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004556	AT	3	6	4785	4790	50 %	50 %	0 %	0 %	28197950
7	NC_004556	CT	3	6	6159	6164	0 %	50 %	0 %	50 %	28197950
8	NC_004556	AT	3	6	6533	6538	50 %	50 %	0 %	0 %	28197950
9	NC_004556	CG	3	6	7276	7281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_004556	GC	3	6	7568	7573	0 %	0 %	50 %	50 %	28197951
11	NC_004556	GC	3	6	7721	7726	0 %	0 %	50 %	50 %	28197951
12	NC_004556	GT	3	6	7794	7799	0 %	50 %	50 %	0 %	28197951
13	NC_004556	AT	3	6	9003	9008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004556	GC	3	6	9576	9581	0 %	0 %	50 %	50 %	28197953
15	NC_004556	CT	3	6	11602	11607	0 %	50 %	0 %	50 %	28197955
16	NC_004556	TC	3	6	11842	11847	0 %	50 %	0 %	50 %	28197955
17	NC_004556	AG	3	6	12833	12838	50 %	0 %	50 %	0 %	28197957
18	NC_004556	TG	3	6	13177	13182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004556	GC	3	6	13272	13277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_004556	AT	3	6	13617	13622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004556	CG	3	6	14473	14478	0 %	0 %	50 %	50 %	28197958
22	NC_004556	TC	3	6	15282	15287	0 %	50 %	0 %	50 %	28197958
23	NC_004556	TA	3	6	15789	15794	50 %	50 %	0 %	0 %	28197958
24	NC_004556	CA	3	6	17465	17470	50 %	0 %	0 %	50 %	28197960
25	NC_004556	GT	3	6	18704	18709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004556	TG	3	6	18866	18871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004556	CG	5	10	19161	19170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_004556	GT	3	6	19302	19307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004556	TG	4	8	19462	19469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004556	TC	3	6	19476	19481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_004556	AG	3	6	19876	19881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004556	CG	3	6	20159	20164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_004556	GT	4	8	20368	20375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004556	GT	3	6	20979	20984	0 %	50 %	50 %	0 %	28197961
35	NC_004556	AC	3	6	21479	21484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_004556	GT	3	6	21736	21741	0 %	50 %	50 %	0 %	77747623
37	NC_004556	GC	3	6	22307	22312	0 %	0 %	50 %	50 %	77747623
38	NC_004556	AG	3	6	22792	22797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004556	TG	3	6	24076	24081	0 %	50 %	50 %	0 %	28197963
40	NC_004556	AC	3	6	24315	24320	50 %	0 %	0 %	50 %	28197963
41	NC_004556	TC	3	6	24375	24380	0 %	50 %	0 %	50 %	28197963
42	NC_004556	GC	3	6	24616	24621	0 %	0 %	50 %	50 %	28197964
43	NC_004556	GC	3	6	26399	26404	0 %	0 %	50 %	50 %	28197966
44	NC_004556	GT	3	6	27194	27199	0 %	50 %	50 %	0 %	28197967
45	NC_004556	GC	3	6	28470	28475	0 %	0 %	50 %	50 %	28197967
46	NC_004556	GT	3	6	30075	30080	0 %	50 %	50 %	0 %	28197967
47	NC_004556	GC	3	6	30591	30596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_004556	CG	3	6	33010	33015	0 %	0 %	50 %	50 %	28197970
49	NC_004556	CA	3	6	33056	33061	50 %	0 %	0 %	50 %	28197970
50	NC_004556	TG	3	6	33951	33956	0 %	50 %	50 %	0 %	28197970
51	NC_004556	GC	3	6	34086	34091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_004556	CT	3	6	34333	34338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_004556	GT	3	6	34716	34721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004556	GT	3	6	35830	35835	0 %	50 %	50 %	0 %	28197972
55	NC_004556	TG	3	6	36066	36071	0 %	50 %	50 %	0 %	28197973
56	NC_004556	AG	3	6	36093	36098	50 %	0 %	50 %	0 %	28197973
57	NC_004556	TG	3	6	36464	36469	0 %	50 %	50 %	0 %	28197974
58	NC_004556	AT	3	6	36498	36503	50 %	50 %	0 %	0 %	28197974
59	NC_004556	TA	3	6	37682	37687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004556	CT	3	6	38983	38988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_004556	TC	3	6	39880	39885	0 %	50 %	0 %	50 %	28197977
62	NC_004556	CA	3	6	39925	39930	50 %	0 %	0 %	50 %	28197977
63	NC_004556	GT	3	6	40987	40992	0 %	50 %	50 %	0 %	28197977
64	NC_004556	CT	3	6	41094	41099	0 %	50 %	0 %	50 %	28197977
65	NC_004556	TC	3	6	41259	41264	0 %	50 %	0 %	50 %	28197977
66	NC_004556	TA	3	6	42877	42882	50 %	50 %	0 %	0 %	28197977
67	NC_004556	GC	3	6	42896	42901	0 %	0 %	50 %	50 %	28197977
68	NC_004556	GT	3	6	43677	43682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004556	TG	3	6	44389	44394	0 %	50 %	50 %	0 %	77747624
70	NC_004556	AG	3	6	44605	44610	50 %	0 %	50 %	0 %	28197979
71	NC_004556	GC	3	6	44788	44793	0 %	0 %	50 %	50 %	28197979
72	NC_004556	GT	3	6	45212	45217	0 %	50 %	50 %	0 %	28197980
73	NC_004556	GT	3	6	45454	45459	0 %	50 %	50 %	0 %	28197980
74	NC_004556	GT	4	8	45842	45849	0 %	50 %	50 %	0 %	28197980
75	NC_004556	GC	3	6	46265	46270	0 %	0 %	50 %	50 %	28197980
76	NC_004556	CG	3	6	46450	46455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_004556	TG	3	6	46606	46611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004556	CG	3	6	47031	47036	0 %	0 %	50 %	50 %	28197981
79	NC_004556	GT	3	6	47206	47211	0 %	50 %	50 %	0 %	28197981
80	NC_004556	CG	6	12	47433	47444	0 %	0 %	50 %	50 %	28197981
81	NC_004556	GT	3	6	48170	48175	0 %	50 %	50 %	0 %	28197981
82	NC_004556	GA	3	6	48787	48792	50 %	0 %	50 %	0 %	28197981
83	NC_004556	GT	4	8	49240	49247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004556	AG	3	6	49414	49419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004556	CA	3	6	49426	49431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_004556	TG	4	8	49518	49525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004556	GT	3	6	49980	49985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004556	AG	4	8	52173	52180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004556	AG	3	6	52595	52600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004556	GA	3	6	52731	52736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004556	AG	3	6	52886	52891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004556	GT	3	6	53271	53276	0 %	50 %	50 %	0 %	28197983
93	NC_004556	GT	3	6	54058	54063	0 %	50 %	50 %	0 %	28197984
94	NC_004556	AT	3	6	54539	54544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004556	GT	3	6	54959	54964	0 %	50 %	50 %	0 %	28197985
96	NC_004556	TG	3	6	55763	55768	0 %	50 %	50 %	0 %	28197985
97	NC_004556	TG	3	6	56183	56188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004556	TA	3	6	56579	56584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004556	TG	3	6	56699	56704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004556	GT	3	6	56993	56998	0 %	50 %	50 %	0 %	28197986
101	NC_004556	TC	3	6	58927	58932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_004556	GC	3	6	59138	59143	0 %	0 %	50 %	50 %	28197988
103	NC_004556	GC	3	6	59333	59338	0 %	0 %	50 %	50 %	28197988
104	NC_004556	GC	3	6	59826	59831	0 %	0 %	50 %	50 %	28197988
105	NC_004556	TG	4	8	60228	60235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_004556	GT	3	6	61096	61101	0 %	50 %	50 %	0 %	28197990
108	NC_004556	GC	3	6	61967	61972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_004556	CT	3	6	62097	62102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_004556	GT	3	6	62414	62419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004556	GT	3	6	62576	62581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004556	GT	3	6	62646	62651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004556	TG	3	6	63718	63723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004556	AT	3	6	64091	64096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004556	AG	3	6	64524	64529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004556	TA	3	6	65117	65122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004556	TG	3	6	65890	65895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004556	GT	3	6	65951	65956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004556	AC	3	6	67267	67272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_004556	AC	3	6	67437	67442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_004556	AC	3	6	68973	68978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_004556	GA	3	6	69679	69684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004556	TG	3	6	70350	70355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004556	GC	3	6	70796	70801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_004556	GT	3	6	70872	70877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004556	CT	3	6	71271	71276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_004556	GT	3	6	71438	71443	0 %	50 %	50 %	0 %	28197991
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129	NC_004556	TC	3	6	73175	73180	0 %	50 %	0 %	50 %	28197993
130	NC_004556	AG	4	8	74625	74632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_004556	GT	3	6	75631	75636	0 %	50 %	50 %	0 %	28197995
133	NC_004556	GT	3	6	75807	75812	0 %	50 %	50 %	0 %	28197995
134	NC_004556	AC	3	6	76074	76079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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136	NC_004556	TG	3	6	76645	76650	0 %	50 %	50 %	0 %	77747625
137	NC_004556	TG	3	6	77043	77048	0 %	50 %	50 %	0 %	77747625
138	NC_004556	TA	3	6	77664	77669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004556	AT	3	6	77885	77890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004556	GC	3	6	78494	78499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_004556	GT	3	6	78686	78691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004556	TA	3	6	79186	79191	50 %	50 %	0 %	0 %	28197997
143	NC_004556	AT	3	6	79488	79493	50 %	50 %	0 %	0 %	28197997
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148	NC_004556	AG	3	6	84228	84233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004556	CT	3	6	85208	85213	0 %	50 %	0 %	50 %	28198000
150	NC_004556	AT	3	6	85506	85511	50 %	50 %	0 %	0 %	28198001
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