MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 35227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004556	GCT	2	6	82	87	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_004556	CAT	2	6	92	97	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004556	TGA	2	6	132	137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004556	CCA	2	6	191	196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28197946
5	NC_004556	TAG	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197946
6	NC_004556	AGT	2	6	352	357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197946
7	NC_004556	ACA	2	6	383	388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197946
8	NC_004556	TAC	2	6	409	414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197946
9	NC_004556	TTG	2	6	480	485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197946
10	NC_004556	TGC	2	6	511	516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197946
11	NC_004556	TGG	2	6	574	579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197946
12	NC_004556	TGC	2	6	610	615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197946
13	NC_004556	AAG	2	6	801	806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197946
14	NC_004556	ATT	2	6	851	856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197946
15	NC_004556	CCT	2	6	947	952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28197946
16	NC_004556	TAG	2	6	1089	1094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197946
17	NC_004556	CAA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197946
18	NC_004556	ATT	2	6	1215	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197946
19	NC_004556	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197946
20	NC_004556	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_004556	ACA	2	6	1652	1657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004556	ACC	4	12	1690	1701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_004556	GTA	2	6	1804	1809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197947
24	NC_004556	TAA	2	6	1847	1852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28197947
25	NC_004556	GAT	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197947
26	NC_004556	GAT	2	6	2023	2028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197947
27	NC_004556	TAT	3	9	2124	2132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
28	NC_004556	TTA	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
29	NC_004556	CAA	2	6	2185	2190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197947
30	NC_004556	TTA	2	6	2199	2204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
31	NC_004556	ATT	2	6	2323	2328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
32	NC_004556	TTA	2	6	2362	2367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
33	NC_004556	GGC	2	6	2553	2558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28197947
34	NC_004556	GTG	2	6	2582	2587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197947
35	NC_004556	AAG	3	9	2642	2650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197947
36	NC_004556	GAA	2	6	2656	2661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197947
37	NC_004556	ATT	2	6	2711	2716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
38	NC_004556	GTG	2	6	2741	2746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197947
39	NC_004556	TTC	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28197947
40	NC_004556	AGT	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197947
41	NC_004556	ATA	2	6	2864	2869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004556	ATA	2	6	2881	2886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004556	TAA	2	6	2937	2942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004556	TAA	2	6	2992	2997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004556	TGT	2	6	3028	3033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004556	ATG	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004556	TTA	2	6	3074	3079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004556	TCA	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_004556	TTC	2	6	3098	3103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_004556	GTT	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197948
51	NC_004556	AGT	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197948
52	NC_004556	TCA	2	6	3532	3537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197948
53	NC_004556	ACG	2	6	3554	3559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197948
54	NC_004556	ATT	2	6	3578	3583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197948
55	NC_004556	AAC	2	6	3637	3642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197948
56	NC_004556	AAC	2	6	3760	3765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197948
57	NC_004556	CGT	2	6	3837	3842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197948
58	NC_004556	CTA	2	6	4011	4016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197948
59	NC_004556	ATT	2	6	4283	4288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004556	TCT	2	6	4329	4334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_004556	ATT	2	6	4426	4431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004556	GCT	2	6	4766	4771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
63	NC_004556	GGC	2	6	4779	4784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28197950
64	NC_004556	TAC	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197950
65	NC_004556	CAC	2	6	4884	4889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28197950
66	NC_004556	AGA	2	6	5027	5032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197950
67	NC_004556	TGG	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197950
68	NC_004556	CGA	2	6	5087	5092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197950
69	NC_004556	TGG	2	6	5111	5116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197950
70	NC_004556	CAA	2	6	5199	5204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197950
71	NC_004556	TAC	2	6	5267	5272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197950
72	NC_004556	GTG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197950
73	NC_004556	GGT	2	6	5433	5438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197950
74	NC_004556	TTG	2	6	5524	5529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197950
75	NC_004556	TGC	2	6	5534	5539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
76	NC_004556	TGC	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
77	NC_004556	TGA	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197950
78	NC_004556	TTC	2	6	5771	5776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28197950
79	NC_004556	GGA	2	6	5846	5851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28197950
80	NC_004556	TGC	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
81	NC_004556	GCT	2	6	5925	5930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
82	NC_004556	TCG	2	6	6040	6045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
83	NC_004556	CTG	2	6	6055	6060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
84	NC_004556	TCA	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197950
85	NC_004556	GCC	2	6	6368	6373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197950
86	NC_004556	GCC	2	6	6491	6496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197950
87	NC_004556	CGC	2	6	6539	6544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197950
88	NC_004556	CCT	2	6	6587	6592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28197950
89	NC_004556	TGA	2	6	6734	6739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197950
90	NC_004556	ACA	2	6	6740	6745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197950
91	NC_004556	GCC	2	6	6750	6755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197950
92	NC_004556	TTG	2	6	6756	6761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197950
93	NC_004556	GAA	2	6	6962	6967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197950
94	NC_004556	TAC	2	6	7028	7033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197950
95	NC_004556	TGC	2	6	7085	7090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
96	NC_004556	TTA	2	6	7190	7195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004556	TGT	2	6	7207	7212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004556	TCA	2	6	7344	7349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_004556	TGG	2	6	7485	7490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197951
100	NC_004556	GTT	3	9	7516	7524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197951
101	NC_004556	TGA	2	6	7552	7557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197951
102	NC_004556	CAT	2	6	7562	7567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197951
103	NC_004556	TCG	2	6	7749	7754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197951
104	NC_004556	ATT	2	6	7780	7785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197951
105	NC_004556	ATT	2	6	7913	7918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197951
106	NC_004556	TAC	2	6	7999	8004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197951
107	NC_004556	GAA	2	6	8088	8093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004556	TGA	2	6	8125	8130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197952
109	NC_004556	GTG	2	6	8218	8223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197952
110	NC_004556	GCA	3	9	8228	8236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197952
111	NC_004556	TTG	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197952
112	NC_004556	GAA	2	6	8403	8408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197952
113	NC_004556	GCT	2	6	8490	8495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197952
114	NC_004556	CGT	2	6	8519	8524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197952
115	NC_004556	TCA	2	6	8531	8536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197952
116	NC_004556	GAG	2	6	8538	8543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28197952
117	NC_004556	TGC	2	6	8621	8626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197952
118	NC_004556	TTG	2	6	8713	8718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197952
119	NC_004556	GAA	2	6	8774	8779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197952
120	NC_004556	CCG	2	6	8805	8810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197952
121	NC_004556	AGC	2	6	8860	8865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197952
122	NC_004556	GCA	2	6	8934	8939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197952
123	NC_004556	TCT	2	6	8954	8959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_004556	CTG	2	6	9073	9078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197953
125	NC_004556	GGT	2	6	9106	9111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197953
126	NC_004556	CTG	2	6	9122	9127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197953
127	NC_004556	TGC	2	6	9165	9170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197953
128	NC_004556	CTC	2	6	9234	9239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28197953
129	NC_004556	GCT	2	6	9388	9393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197953
130	NC_004556	GCA	2	6	9420	9425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197953
131	NC_004556	AAC	2	6	9466	9471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197953
132	NC_004556	TGC	2	6	9485	9490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197953
133	NC_004556	TTA	2	6	9647	9652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197953
134	NC_004556	CTT	2	6	9668	9673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28197953
135	NC_004556	TTA	2	6	9700	9705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197953
136	NC_004556	GTG	2	6	9850	9855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197953
137	NC_004556	ACA	2	6	9935	9940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197953
138	NC_004556	TTA	2	6	10032	10037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197953
139	NC_004556	GAA	2	6	10074	10079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197953
140	NC_004556	GCT	2	6	10081	10086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197953
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145	NC_004556	TAC	2	6	10404	10409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_004556	GAA	2	6	10689	10694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197954
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160	NC_004556	CTC	2	6	11059	11064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28197954
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163	NC_004556	AAT	2	6	11351	11356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_004556	ATC	2	6	11415	11420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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249	NC_004556	CTG	2	6	18004	18009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_004556	TCA	2	6	18030	18035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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252	NC_004556	TGA	2	6	18204	18209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_004556	CTG	2	6	18240	18245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_004556	TCA	2	6	18471	18476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_004556	TGA	2	6	18498	18503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
256	NC_004556	GTT	2	6	18582	18587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_004556	TGT	3	9	18847	18855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_004556	GTA	2	6	18910	18915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_004556	CTC	2	6	18919	18924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
260	NC_004556	TTG	2	6	18995	19000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_004556	CTG	2	6	19010	19015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_004556	ATT	2	6	19021	19026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_004556	GCA	2	6	19066	19071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_004556	GCA	2	6	19105	19110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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