MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 53168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004556	CGT	2	6	194483	194488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_004556	CTG	2	6	194542	194547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198083
4003	NC_004556	T	6	6	194595	194600	0 %	100 %	0 %	0 %	28198083
4004	NC_004556	GTG	2	6	194671	194676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198083
4005	NC_004556	CAG	2	6	194698	194703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198083
4006	NC_004556	CTC	2	6	194716	194721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28198083
4007	NC_004556	TGT	2	6	194733	194738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198083
4008	NC_004556	GT	3	6	194737	194742	0 %	50 %	50 %	0 %	28198083
4009	NC_004556	TCT	2	6	194784	194789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198083
4010	NC_004556	CGA	2	6	194796	194801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198083
4011	NC_004556	GCT	2	6	194816	194821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198083
4012	NC_004556	GC	3	6	194834	194839	0 %	0 %	50 %	50 %	28198083
4013	NC_004556	GC	3	6	194843	194848	0 %	0 %	50 %	50 %	28198083
4014	NC_004556	ACTG	2	8	194968	194975	25 %	25 %	25 %	25 %	28198083
4015	NC_004556	CGG	2	6	195081	195086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198083
4016	NC_004556	AGC	2	6	195113	195118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198083
4017	NC_004556	GC	3	6	195265	195270	0 %	0 %	50 %	50 %	28198083
4018	NC_004556	ATG	2	6	195272	195277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198083
4019	NC_004556	CCG	2	6	195410	195415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77747634
4020	NC_004556	TGT	2	6	195435	195440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77747634
4021	NC_004556	CCGC	2	8	195479	195486	0 %	0 %	25 %	75 %	77747634
4022	NC_004556	AGCA	2	8	195487	195494	50 %	0 %	25 %	25 %	77747634
4023	NC_004556	TTTC	2	8	195615	195622	0 %	75 %	0 %	25 %	77747634
4024	NC_004556	TGC	2	6	195670	195675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77747634
4025	NC_004556	CAG	2	6	195693	195698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77747634
4026	NC_004556	CGG	2	6	195737	195742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77747634
4027	NC_004556	TGCC	2	8	195745	195752	0 %	25 %	25 %	50 %	77747634
4028	NC_004556	TGCAT	2	10	195758	195767	20 %	40 %	20 %	20 %	77747634
4029	NC_004556	ACCA	2	8	195896	195903	50 %	0 %	0 %	50 %	77747634
4030	NC_004556	TCC	2	6	195926	195931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77747634
4031	NC_004556	ACA	2	6	195957	195962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77747634
4032	NC_004556	GAT	2	6	196000	196005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77747634
4033	NC_004556	CTG	2	6	196158	196163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77747634
4034	NC_004556	TGC	2	6	196194	196199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198085
4035	NC_004556	GCA	2	6	196229	196234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198085
4036	NC_004556	TCT	2	6	196279	196284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198085
4037	NC_004556	TCG	2	6	196288	196293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198085
4038	NC_004556	GTA	2	6	196379	196384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198085
4039	NC_004556	CCT	3	9	196412	196420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28198085
4040	NC_004556	CAG	2	6	196505	196510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198085
4041	NC_004556	AGT	2	6	196546	196551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198085
4042	NC_004556	CAC	3	9	196554	196562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198085
4043	NC_004556	GGC	2	6	196601	196606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198085
4044	NC_004556	GCT	2	6	196634	196639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198085
4045	NC_004556	GCC	2	6	196640	196645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198085
4046	NC_004556	ATC	2	6	196681	196686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198085
4047	NC_004556	AC	4	8	196709	196716	50 %	0 %	0 %	50 %	28198085
4048	NC_004556	TCA	2	6	196759	196764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198086
4049	NC_004556	AC	3	6	196872	196877	50 %	0 %	0 %	50 %	28198086
4050	NC_004556	GTG	2	6	196899	196904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198086
4051	NC_004556	GT	3	6	196908	196913	0 %	50 %	50 %	0 %	28198086
4052	NC_004556	GGTC	2	8	196918	196925	0 %	25 %	50 %	25 %	28198086
4053	NC_004556	CGT	2	6	196934	196939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198086
4054	NC_004556	AGT	2	6	196955	196960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198086
4055	NC_004556	TGG	2	6	196961	196966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198086
4056	NC_004556	GCA	2	6	197003	197008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198086
4057	NC_004556	CGC	2	6	197011	197016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198086
4058	NC_004556	CGG	2	6	197067	197072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198086
4059	NC_004556	TTG	2	6	197090	197095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198086
4060	NC_004556	CGCGC	2	10	197101	197110	0 %	0 %	40 %	60 %	28198086
4061	NC_004556	GTG	2	6	197211	197216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198086
4062	NC_004556	GCC	2	6	197408	197413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198086
4063	NC_004556	GC	3	6	197457	197462	0 %	0 %	50 %	50 %	28198086
4064	NC_004556	GCATGC	2	12	197496	197507	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28198086
4065	NC_004556	TGA	2	6	197653	197658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198086
4066	NC_004556	CAT	2	6	197671	197676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198086
4067	NC_004556	TTG	2	6	197684	197689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198086
4068	NC_004556	G	7	7	197710	197716	0 %	0 %	100 %	0 %	28198086
4069	NC_004556	GCA	2	6	197746	197751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198086
4070	NC_004556	CA	3	6	197802	197807	50 %	0 %	0 %	50 %	28198086
4071	NC_004556	CAT	2	6	197875	197880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198086
4072	NC_004556	GCA	2	6	197900	197905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198086
4073	NC_004556	CAA	2	6	198004	198009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198086
4074	NC_004556	GGCTT	2	10	198036	198045	0 %	40 %	40 %	20 %	28198086
4075	NC_004556	TGC	2	6	198058	198063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198086
4076	NC_004556	AGC	2	6	198135	198140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198086
4077	NC_004556	TGCT	2	8	198150	198157	0 %	50 %	25 %	25 %	28198086
4078	NC_004556	TGTCA	2	10	198208	198217	20 %	40 %	20 %	20 %	28198087
4079	NC_004556	TCC	2	6	198248	198253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28198087
4080	NC_004556	ACC	2	6	198269	198274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198087
4081	NC_004556	TGC	2	6	198284	198289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198087
4082	NC_004556	ATT	2	6	198338	198343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28198087
4083	NC_004556	CAGG	2	8	198362	198369	25 %	0 %	50 %	25 %	28198087
4084	NC_004556	GT	3	6	198406	198411	0 %	50 %	50 %	0 %	28198087
4085	NC_004556	CAC	2	6	198419	198424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198087
4086	NC_004556	AAC	2	6	198586	198591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198087
4087	NC_004556	CG	3	6	198626	198631	0 %	0 %	50 %	50 %	28198087
4088	NC_004556	TCA	2	6	198764	198769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198087
4089	NC_004556	TGGT	2	8	198789	198796	0 %	50 %	50 %	0 %	28198087
4090	NC_004556	CAG	2	6	198875	198880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198087
4091	NC_004556	TGAT	2	8	198934	198941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_004556	GGC	2	6	198967	198972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_004556	TGC	2	6	198989	198994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_004556	TGA	2	6	199061	199066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_004556	GAT	2	6	199067	199072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_004556	CAC	2	6	199116	199121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_004556	TTA	2	6	199188	199193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_004556	ATTTTT	2	12	199197	199208	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_004556	CAT	2	6	199329	199334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_004556	CCATCA	2	12	199393	199404	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_004556	GAT	2	6	199414	199419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_004556	TGA	2	6	199461	199466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_004556	AGA	2	6	199508	199513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_004556	ATG	2	6	199520	199525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_004556	TCG	2	6	199699	199704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_004556	TGGATA	2	12	199709	199720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_004556	T	6	6	199763	199768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_004556	AGT	2	6	199774	199779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_004556	TG	3	6	199780	199785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_004556	TAAT	2	8	199801	199808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_004556	ATC	2	6	199851	199856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_004556	GTA	2	6	199857	199862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_004556	ATT	2	6	199928	199933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_004556	ATG	2	6	199936	199941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_004556	TC	3	6	199954	199959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_004556	ATGG	2	8	199980	199987	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_004556	TAT	2	6	200011	200016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_004556	T	6	6	200025	200030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_004556	TCT	2	6	200042	200047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_004556	TAT	2	6	200051	200056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_004556	T	6	6	200079	200084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_004556	CAT	2	6	200088	200093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_004556	TGG	2	6	200181	200186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_004556	TGA	2	6	200209	200214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_004556	G	10	10	200229	200238	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_004556	CAC	2	6	200264	200269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_004556	GC	3	6	200353	200358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_004556	TGC	2	6	200408	200413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_004556	TTA	2	6	200422	200427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_004556	GCAAGT	2	12	200498	200509	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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4132	NC_004556	TTG	2	6	200551	200556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198088
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4157	NC_004556	ACG	2	6	201778	201783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198088
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4234	NC_004556	TTTAT	2	10	205200	205209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_004556	CTT	3	9	205243	205251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4236	NC_004556	TGC	2	6	205280	205285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4237	NC_004556	TGA	3	9	205316	205324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4239	NC_004556	TTGT	2	8	205480	205487	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_004556	CATA	2	8	205498	205505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4241	NC_004556	GGAT	2	8	205536	205543	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_004556	CTT	2	6	205550	205555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4243	NC_004556	CTG	2	6	205563	205568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4244	NC_004556	ATG	2	6	205582	205587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_004556	TGA	2	6	205647	205652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_004556	CGTCTT	2	12	205692	205703	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	28198092
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4250	NC_004556	ATCA	2	8	205948	205955	50 %	25 %	0 %	25 %	28198092
4251	NC_004556	GCG	2	6	206044	206049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198092
4252	NC_004556	CAG	2	6	206125	206130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198092
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4254	NC_004556	CTG	2	6	206237	206242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198092
4255	NC_004556	GA	3	6	206249	206254	50 %	0 %	50 %	0 %	28198092
4256	NC_004556	ACC	2	6	206276	206281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198092
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4258	NC_004556	AAT	2	6	206412	206417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_004556	CTG	2	6	206450	206455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4260	NC_004556	CA	3	6	206555	206560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4261	NC_004556	TGT	2	6	206685	206690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198093
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4263	NC_004556	GTTGC	2	10	206994	207003	0 %	40 %	40 %	20 %	28198093
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4268	NC_004556	ATC	2	6	207237	207242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198093
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4270	NC_004556	GCT	2	6	207388	207393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198094
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4283	NC_004556	TTCA	2	8	207790	207797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4284	NC_004556	CGC	2	6	207863	207868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4285	NC_004556	GGC	2	6	207943	207948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4302	NC_004556	TG	4	8	208978	208985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4303	NC_004556	CTG	2	6	208988	208993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4373	NC_004556	GT	3	6	212811	212816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4374	NC_004556	TCAA	2	8	212873	212880	50 %	25 %	0 %	25 %	28198097
4375	NC_004556	GAT	2	6	212936	212941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198097
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4382	NC_004556	TGG	2	6	213282	213287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198097
4383	NC_004556	CTG	2	6	213292	213297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198097
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4498	NC_004556	AT	3	6	219551	219556	50 %	50 %	0 %	0 %	28198103
4499	NC_004556	TTCT	2	8	219654	219661	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4500	NC_004556	GGA	2	6	219717	219722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198104

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