MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 53168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004556	GGT	2	6	170224	170229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198068
3502	NC_004556	AAC	3	9	170243	170251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198068
3503	NC_004556	AGA	2	6	170265	170270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198068
3504	NC_004556	TTG	2	6	170306	170311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198068
3505	NC_004556	GAGC	2	8	170363	170370	25 %	0 %	50 %	25 %	28198068
3506	NC_004556	TGG	2	6	170391	170396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198068
3507	NC_004556	ATG	2	6	170397	170402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198068
3508	NC_004556	TTA	2	6	170460	170465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28198068
3509	NC_004556	CTT	2	6	170481	170486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198068
3510	NC_004556	ATTT	2	8	170546	170553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_004556	GT	3	6	170588	170593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_004556	TGAT	2	8	170623	170630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_004556	AAAAC	2	10	170654	170663	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3514	NC_004556	ATA	3	9	170673	170681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_004556	T	6	6	170726	170731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_004556	TAAG	2	8	170742	170749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_004556	TTA	2	6	170775	170780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_004556	T	6	6	170844	170849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_004556	T	6	6	170853	170858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_004556	AGT	2	6	170900	170905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3522	NC_004556	TG	3	6	170973	170978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_004556	GT	3	6	171034	171039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_004556	CTG	2	6	171066	171071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_004556	T	7	7	171098	171104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_004556	GGC	2	6	171161	171166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_004556	GCA	2	6	171192	171197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_004556	GTA	2	6	171203	171208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_004556	CGA	2	6	171400	171405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_004556	GAT	2	6	171425	171430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_004556	GCA	2	6	171474	171479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_004556	GAA	2	6	171533	171538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_004556	GAA	2	6	171570	171575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_004556	GTT	2	6	171596	171601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_004556	CAG	2	6	171642	171647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3537	NC_004556	TGT	2	6	171723	171728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_004556	AGG	2	6	171832	171837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_004556	GGC	2	6	171853	171858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_004556	ACACTG	2	12	171870	171881	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_004556	CGC	2	6	172001	172006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_004556	GAA	2	6	172097	172102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_004556	TGC	2	6	172173	172178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_004556	GTC	2	6	172185	172190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_004556	TCGTG	2	10	172194	172203	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3546	NC_004556	TGG	2	6	172263	172268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_004556	GGA	2	6	172299	172304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_004556	TCA	2	6	172324	172329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_004556	AC	3	6	172350	172355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_004556	TAC	2	6	172357	172362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_004556	TGC	2	6	172490	172495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_004556	AC	3	6	172520	172525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_004556	TTG	2	6	172547	172552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_004556	GAG	2	6	172578	172583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_004556	CCT	2	6	172661	172666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_004556	GTC	2	6	172820	172825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_004556	CCA	2	6	172845	172850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_004556	GGT	2	6	172878	172883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_004556	GGT	2	6	172913	172918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_004556	TCC	2	6	172924	172929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_004556	CCA	2	6	172935	172940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_004556	ATT	2	6	172952	172957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_004556	TGA	2	6	173023	173028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_004556	TTA	2	6	173050	173055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_004556	TGG	2	6	173154	173159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_004556	CAA	2	6	173222	173227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3568	NC_004556	AGT	2	6	173368	173373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3570	NC_004556	TCC	2	6	173534	173539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_004556	GACC	2	8	173556	173563	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_004556	AC	3	6	174056	174061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_004556	CGTC	2	8	174074	174081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_004556	AAC	2	6	174093	174098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_004556	AGG	2	6	174167	174172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3579	NC_004556	GTTG	2	8	174564	174571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3581	NC_004556	T	6	6	174647	174652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_004556	ACCGT	2	10	174711	174720	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3583	NC_004556	AGGT	2	8	174731	174738	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_004556	GA	3	6	174762	174767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_004556	TGG	2	6	174828	174833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3588	NC_004556	TGAAAT	2	12	175124	175135	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_004556	ACG	2	6	175252	175257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3591	NC_004556	TGG	2	6	175346	175351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3595	NC_004556	GGT	2	6	175509	175514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_004556	CGG	2	6	175596	175601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3599	NC_004556	GCT	2	6	175758	175763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_004556	GC	3	6	175879	175884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_004556	GTG	2	6	175939	175944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_004556	GT	3	6	175955	175960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_004556	GCA	2	6	175965	175970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_004556	TCA	2	6	176082	176087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_004556	ACC	2	6	176168	176173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_004556	ATCCC	2	10	176176	176185	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3607	NC_004556	GTTT	2	8	176297	176304	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_004556	CT	3	6	176354	176359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_004556	GTC	2	6	176492	176497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198069
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3611	NC_004556	GT	3	6	176521	176526	0 %	50 %	50 %	0 %	28198069
3612	NC_004556	TCA	2	6	176573	176578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198069
3613	NC_004556	CGT	2	6	176668	176673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198069
3614	NC_004556	CGC	2	6	176695	176700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198069
3615	NC_004556	TGCT	2	8	176707	176714	0 %	50 %	25 %	25 %	28198069
3616	NC_004556	AAG	2	6	176720	176725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198069
3617	NC_004556	GTCGGT	2	12	176863	176874	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28198069
3618	NC_004556	TGC	2	6	176883	176888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198069
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3621	NC_004556	TTGT	2	8	177070	177077	0 %	75 %	25 %	0 %	28198069
3622	NC_004556	GTC	2	6	177083	177088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198069
3623	NC_004556	CCT	2	6	177117	177122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28198069
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3626	NC_004556	GAT	2	6	177229	177234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_004556	TTG	2	6	177237	177242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_004556	ATC	2	6	177256	177261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_004556	ATC	2	6	177396	177401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198070
3630	NC_004556	A	6	6	177413	177418	100 %	0 %	0 %	0 %	28198070
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3761	NC_004556	GTA	3	9	183196	183204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198073
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3764	NC_004556	CA	3	6	183464	183469	50 %	0 %	0 %	50 %	28198073
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3772	NC_004556	ATAAA	2	10	183818	183827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3773	NC_004556	ATT	2	6	183857	183862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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