MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 53168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_004556	ATCGC	2	10	1648405	1648414	20 %	20 %	20 %	40 %	28199297
34503	NC_004556	CACTGA	2	12	1648426	1648437	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28199297
34504	NC_004556	CGC	2	6	1648494	1648499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28199297
34505	NC_004556	CGCA	2	8	1648547	1648554	25 %	0 %	25 %	50 %	28199297
34506	NC_004556	CCG	2	6	1648570	1648575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28199297
34507	NC_004556	CTC	2	6	1648587	1648592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28199297
34508	NC_004556	CTAC	2	8	1648619	1648626	25 %	25 %	0 %	50 %	28199297
34509	NC_004556	CCG	2	6	1648648	1648653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28199297
34510	NC_004556	TCCGC	2	10	1648693	1648702	0 %	20 %	20 %	60 %	28199297
34511	NC_004556	AAG	2	6	1648717	1648722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28199297
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34513	NC_004556	CGA	2	6	1648781	1648786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28199297
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34517	NC_004556	CAA	2	6	1648920	1648925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28199297
34518	NC_004556	CAA	2	6	1648979	1648984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28199297
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34523	NC_004556	CACT	2	8	1649155	1649162	25 %	25 %	0 %	50 %	28199297
34524	NC_004556	GGCAT	2	10	1649193	1649202	20 %	20 %	40 %	20 %	28199297
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34526	NC_004556	CGA	2	6	1649273	1649278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28199297
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34528	NC_004556	CAGC	2	8	1649414	1649421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34529	NC_004556	CAA	2	6	1649423	1649428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34530	NC_004556	CCT	2	6	1649441	1649446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34531	NC_004556	ACC	2	6	1649458	1649463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34532	NC_004556	CA	3	6	1649464	1649469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34533	NC_004556	C	6	6	1649472	1649477	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34534	NC_004556	CTCAC	2	10	1649509	1649518	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
34535	NC_004556	CACCC	2	10	1649529	1649538	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
34536	NC_004556	CCCA	2	8	1649557	1649564	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34537	NC_004556	A	6	6	1649588	1649593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34538	NC_004556	GCC	2	6	1649628	1649633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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34541	NC_004556	C	7	7	1649713	1649719	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34542	NC_004556	ATCA	2	8	1649730	1649737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34543	NC_004556	TA	3	6	1649756	1649761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34544	NC_004556	T	7	7	1649779	1649785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34546	NC_004556	ACACC	2	10	1649882	1649891	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
34547	NC_004556	C	7	7	1649890	1649896	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34548	NC_004556	TGC	2	6	1649901	1649906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34554	NC_004556	AT	3	6	1650197	1650202	50 %	50 %	0 %	0 %	28199298
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34617	NC_004556	TA	3	6	1653049	1653054	50 %	50 %	0 %	0 %	28199304
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34855	NC_004556	GCAA	2	8	1662593	1662600	50 %	0 %	25 %	25 %	28199313
34856	NC_004556	TGC	2	6	1662678	1662683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28199313
34857	NC_004556	GCT	2	6	1662687	1662692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28199313
34858	NC_004556	AGG	3	9	1662698	1662706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28199313
34859	NC_004556	GCA	2	6	1662742	1662747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28199313
34860	NC_004556	GCT	2	6	1662839	1662844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28199313
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34863	NC_004556	GCA	2	6	1662934	1662939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28199313
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34886	NC_004556	GCCCT	9	45	1664083	1664127	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34887	NC_004556	TGT	3	9	1664149	1664157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34892	NC_004556	GCG	2	6	1664681	1664686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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34897	NC_004556	CTGT	2	8	1664848	1664855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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34928	NC_004556	TCC	2	6	1666523	1666528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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34932	NC_004556	GCT	2	6	1666759	1666764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34960	NC_004556	CAGT	2	8	1668032	1668039	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34961	NC_004556	CAG	2	6	1668042	1668047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34962	NC_004556	AGC	2	6	1668056	1668061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34963	NC_004556	TCT	2	6	1668072	1668077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34964	NC_004556	TGC	2	6	1668093	1668098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34965	NC_004556	CGG	2	6	1668123	1668128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34966	NC_004556	AGG	2	6	1668156	1668161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34967	NC_004556	GCTG	2	8	1668214	1668221	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34968	NC_004556	CGG	2	6	1668249	1668254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34969	NC_004556	AGC	2	6	1668256	1668261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34970	NC_004556	GGGGGT	2	12	1668272	1668283	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
34971	NC_004556	CGT	2	6	1668363	1668368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34972	NC_004556	AGC	2	6	1668387	1668392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34973	NC_004556	GTGG	2	8	1668405	1668412	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34974	NC_004556	CTC	2	6	1668561	1668566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34975	NC_004556	TCA	2	6	1668590	1668595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34976	NC_004556	CGG	2	6	1668626	1668631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34977	NC_004556	CCA	2	6	1668645	1668650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34978	NC_004556	AG	3	6	1668806	1668811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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34980	NC_004556	CTCC	2	8	1668852	1668859	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34981	NC_004556	TGA	2	6	1668885	1668890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34982	NC_004556	CTG	2	6	1668938	1668943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34983	NC_004556	CGTT	2	8	1668944	1668951	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34984	NC_004556	GCA	2	6	1668971	1668976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34986	NC_004556	ACC	2	6	1669061	1669066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34987	NC_004556	GCG	2	6	1669088	1669093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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34990	NC_004556	CGTG	2	8	1669345	1669352	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34991	NC_004556	GGCAC	2	10	1669369	1669378	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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