MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 53168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004556	GT	3	6	146669	146674	0 %	50 %	50 %	0 %	28198050
3002	NC_004556	GATGTG	2	12	146707	146718	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	28198050
3003	NC_004556	AGG	2	6	146722	146727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198050
3004	NC_004556	CGG	2	6	146733	146738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198050
3005	NC_004556	GCG	2	6	146761	146766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198050
3006	NC_004556	CGG	2	6	146811	146816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198050
3007	NC_004556	CGA	2	6	146906	146911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_004556	TGGT	2	8	146921	146928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_004556	TGC	2	6	146944	146949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_004556	TGATGG	2	12	147005	147016	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	77747630
3011	NC_004556	T	8	8	147038	147045	0 %	100 %	0 %	0 %	77747630
3012	NC_004556	ACGC	2	8	147087	147094	25 %	0 %	25 %	50 %	77747630
3013	NC_004556	GTT	2	6	147101	147106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77747630
3014	NC_004556	GTTG	2	8	147117	147124	0 %	50 %	50 %	0 %	77747630
3015	NC_004556	GC	3	6	147132	147137	0 %	0 %	50 %	50 %	77747630
3016	NC_004556	AGCC	2	8	147200	147207	25 %	0 %	25 %	50 %	77747630
3017	NC_004556	GTG	2	6	147223	147228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77747630
3018	NC_004556	T	7	7	147273	147279	0 %	100 %	0 %	0 %	77747630
3019	NC_004556	TGG	3	9	147341	147349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77747630
3020	NC_004556	GT	3	6	147380	147385	0 %	50 %	50 %	0 %	77747630
3021	NC_004556	TGT	2	6	147475	147480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77747630
3022	NC_004556	GGTT	2	8	147486	147493	0 %	50 %	50 %	0 %	77747630
3023	NC_004556	TGG	2	6	147500	147505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77747630
3024	NC_004556	AAT	2	6	147616	147621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77747630
3025	NC_004556	CGC	2	6	147654	147659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77747630
3026	NC_004556	ATT	2	6	147693	147698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77747630
3027	NC_004556	GC	3	6	147724	147729	0 %	0 %	50 %	50 %	77747630
3028	NC_004556	CTT	2	6	147756	147761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_004556	GT	3	6	147769	147774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_004556	TGCGT	2	10	147864	147873	0 %	40 %	40 %	20 %	28198052
3031	NC_004556	GT	3	6	147899	147904	0 %	50 %	50 %	0 %	28198052
3032	NC_004556	ATGC	2	8	147923	147930	25 %	25 %	25 %	25 %	28198052
3033	NC_004556	CAG	2	6	147969	147974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198052
3034	NC_004556	ATC	2	6	148018	148023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198052
3035	NC_004556	TGCG	2	8	148220	148227	0 %	25 %	50 %	25 %	28198052
3036	NC_004556	CTT	2	6	148316	148321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198052
3037	NC_004556	CCA	2	6	148324	148329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198052
3038	NC_004556	GCA	2	6	148352	148357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198052
3039	NC_004556	CGGG	2	8	148373	148380	0 %	0 %	75 %	25 %	28198052
3040	NC_004556	GTC	2	6	148557	148562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198052
3041	NC_004556	GCC	2	6	148593	148598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198052
3042	NC_004556	CTC	2	6	148599	148604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28198052
3043	NC_004556	TTC	2	6	148641	148646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198052
3044	NC_004556	GTAG	2	8	148736	148743	25 %	25 %	50 %	0 %	28198052
3045	NC_004556	GTG	2	6	148755	148760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198052
3046	NC_004556	TGC	2	6	148764	148769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198052
3047	NC_004556	GTC	2	6	148773	148778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198052
3048	NC_004556	TGA	2	6	148796	148801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198052
3049	NC_004556	GCCA	2	8	148827	148834	25 %	0 %	25 %	50 %	28198052
3050	NC_004556	CGCGTG	2	12	148913	148924	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	28198052
3051	NC_004556	CGT	2	6	148964	148969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198052
3052	NC_004556	GCG	2	6	149041	149046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198052
3053	NC_004556	TGA	2	6	149204	149209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198052
3054	NC_004556	TGC	2	6	149259	149264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198052
3055	NC_004556	TGC	2	6	149294	149299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198052
3056	NC_004556	AGC	2	6	149314	149319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198052
3057	NC_004556	TAG	2	6	149396	149401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198052
3058	NC_004556	GTGGGT	2	12	149469	149480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_004556	GT	3	6	149479	149484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_004556	GATA	2	8	149488	149495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_004556	GAG	2	6	149522	149527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_004556	GCT	2	6	149550	149555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_004556	AGCC	2	8	149599	149606	25 %	0 %	25 %	50 %	28198053
3064	NC_004556	CGA	2	6	149756	149761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198053
3065	NC_004556	CGT	2	6	149791	149796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198053
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3067	NC_004556	CG	3	6	149862	149867	0 %	0 %	50 %	50 %	28198053
3068	NC_004556	GGC	2	6	149982	149987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198053
3069	NC_004556	TGC	2	6	150015	150020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198053
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3071	NC_004556	CAG	2	6	150087	150092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198053
3072	NC_004556	GCA	2	6	150116	150121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198053
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3074	NC_004556	CAG	2	6	150219	150224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198053
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3078	NC_004556	TCA	2	6	150378	150383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198054
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3081	NC_004556	GTG	2	6	150425	150430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198054
3082	NC_004556	TGC	2	6	150435	150440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198054
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3090	NC_004556	GT	3	6	150863	150868	0 %	50 %	50 %	0 %	28198054
3091	NC_004556	TTG	3	9	150902	150910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198054
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3096	NC_004556	TGG	2	6	151097	151102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198054
3097	NC_004556	CGG	2	6	151157	151162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198054
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3099	NC_004556	TGGT	2	8	151358	151365	0 %	50 %	50 %	0 %	28198054
3100	NC_004556	ATG	2	6	151382	151387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198054
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3107	NC_004556	TG	3	6	151792	151797	0 %	50 %	50 %	0 %	28198055
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3109	NC_004556	GTT	2	6	151889	151894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198055
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3111	NC_004556	TTG	2	6	152008	152013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198055
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3113	NC_004556	GCGT	2	8	152050	152057	0 %	25 %	50 %	25 %	28198055
3114	NC_004556	GGA	2	6	152062	152067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_004556	ACG	2	6	152115	152120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_004556	TGT	2	6	152144	152149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_004556	TTG	2	6	152152	152157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_004556	G	6	6	152177	152182	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_004556	TACA	2	8	152185	152192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3120	NC_004556	GCA	2	6	152211	152216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_004556	GCA	2	6	152347	152352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_004556	TGC	2	6	152418	152423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_004556	GC	3	6	152437	152442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_004556	GGC	2	6	152472	152477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_004556	TGG	2	6	152481	152486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_004556	CGG	2	6	152570	152575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_004556	GT	3	6	152612	152617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_004556	ACTT	2	8	152644	152651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3129	NC_004556	GGT	2	6	152676	152681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3131	NC_004556	TGC	2	6	152804	152809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3133	NC_004556	TGT	2	6	152855	152860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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