MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 53168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_004556	CTG	2	6	97163	97168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_004556	TGA	2	6	97245	97250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_004556	CGTG	2	8	97291	97298	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2004	NC_004556	ATG	2	6	97316	97321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_004556	ATG	2	6	97331	97336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_004556	CGT	2	6	97660	97665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198013
2007	NC_004556	CGT	2	6	97671	97676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198013
2008	NC_004556	TTG	2	6	97766	97771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198013
2009	NC_004556	CGG	2	6	97775	97780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198013
2010	NC_004556	TGC	2	6	97872	97877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198013
2011	NC_004556	TGCA	2	8	97916	97923	25 %	25 %	25 %	25 %	28198013
2012	NC_004556	TGCAT	2	10	97956	97965	20 %	40 %	20 %	20 %	28198013
2013	NC_004556	TCTTT	2	10	97968	97977	0 %	80 %	0 %	20 %	28198013
2014	NC_004556	ACG	2	6	97999	98004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198013
2015	NC_004556	CCG	2	6	98109	98114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198013
2016	NC_004556	CG	3	6	98144	98149	0 %	0 %	50 %	50 %	28198013
2017	NC_004556	CG	3	6	98196	98201	0 %	0 %	50 %	50 %	28198013
2018	NC_004556	ACA	2	6	98237	98242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198013
2019	NC_004556	TTG	2	6	98248	98253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198013
2020	NC_004556	GCT	2	6	98298	98303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198013
2021	NC_004556	T	6	6	98313	98318	0 %	100 %	0 %	0 %	28198013
2022	NC_004556	ACA	2	6	98336	98341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198013
2023	NC_004556	GTA	2	6	98437	98442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198013
2024	NC_004556	CCG	2	6	98449	98454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198013
2025	NC_004556	GCG	2	6	98658	98663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198013
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2039	NC_004556	TTCT	2	8	99831	99838	0 %	75 %	0 %	25 %	28198014
2040	NC_004556	GCA	2	6	99878	99883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198014
2041	NC_004556	TGGCG	2	10	99885	99894	0 %	20 %	60 %	20 %	28198014
2042	NC_004556	CCG	2	6	99912	99917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198014
2043	NC_004556	GAT	2	6	99943	99948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198014
2044	NC_004556	TGATGC	2	12	100017	100028	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28198014
2045	NC_004556	CAC	2	6	100260	100265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2046	NC_004556	ATC	2	6	100355	100360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198015
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2048	NC_004556	CAG	2	6	100392	100397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198015
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2055	NC_004556	GCGTA	2	10	100670	100679	20 %	20 %	40 %	20 %	28198015
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2059	NC_004556	TG	3	6	100977	100982	0 %	50 %	50 %	0 %	28198015
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2061	NC_004556	TACA	2	8	101125	101132	50 %	25 %	0 %	25 %	28198015
2062	NC_004556	ATGC	2	8	101236	101243	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2063	NC_004556	ATGC	2	8	101268	101275	25 %	25 %	25 %	25 %	28198016
2064	NC_004556	GC	3	6	101301	101306	0 %	0 %	50 %	50 %	28198016
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2125	NC_004556	AATG	2	8	104823	104830	50 %	25 %	25 %	0 %	28198018
2126	NC_004556	TGA	2	6	104866	104871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198019
2127	NC_004556	GGT	2	6	104910	104915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198019
2128	NC_004556	GTG	2	6	104926	104931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198019
2129	NC_004556	TTA	2	6	104991	104996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28198019
2130	NC_004556	CGA	2	6	105161	105166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198019
2131	NC_004556	AC	3	6	105200	105205	50 %	0 %	0 %	50 %	28198019
2132	NC_004556	ATG	2	6	105259	105264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198019
2133	NC_004556	GCGAGC	2	12	105280	105291	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	28198019
2134	NC_004556	TTG	2	6	105352	105357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198019
2135	NC_004556	CAC	2	6	105444	105449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2136	NC_004556	GAT	2	6	105637	105642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198020
2137	NC_004556	GGT	3	9	105652	105660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198020
2138	NC_004556	TGCC	2	8	105693	105700	0 %	25 %	25 %	50 %	28198020
2139	NC_004556	GCA	2	6	105715	105720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198020
2140	NC_004556	CTG	2	6	105766	105771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198020
2141	NC_004556	CG	3	6	105781	105786	0 %	0 %	50 %	50 %	28198020
2142	NC_004556	TGC	2	6	105800	105805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198020
2143	NC_004556	TGT	2	6	105899	105904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198020
2144	NC_004556	AGG	2	6	105956	105961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198020
2145	NC_004556	ACG	2	6	105971	105976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198020
2146	NC_004556	AGC	2	6	106005	106010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198020
2147	NC_004556	CATC	2	8	106042	106049	25 %	25 %	0 %	50 %	28198020
2148	NC_004556	CAG	2	6	106123	106128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198020
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2150	NC_004556	TGA	2	6	106206	106211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198020
2151	NC_004556	CA	3	6	106221	106226	50 %	0 %	0 %	50 %	28198020
2152	NC_004556	T	6	6	106316	106321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2153	NC_004556	CGT	2	6	106392	106397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2154	NC_004556	TAT	2	6	106460	106465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28198021
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2156	NC_004556	AG	3	6	106560	106565	50 %	0 %	50 %	0 %	28198021
2157	NC_004556	CCA	2	6	106597	106602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198021
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2159	NC_004556	GT	3	6	106666	106671	0 %	50 %	50 %	0 %	28198021
2160	NC_004556	CAT	2	6	106688	106693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198021
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2162	NC_004556	TTA	2	6	106742	106747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28198021
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2165	NC_004556	GCT	2	6	106794	106799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198021
2166	NC_004556	TTG	2	6	106854	106859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2167	NC_004556	G	7	7	106859	106865	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2168	NC_004556	TTCA	2	8	106919	106926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2169	NC_004556	GAG	2	6	106949	106954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2170	NC_004556	GCGGA	2	10	106966	106975	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2171	NC_004556	TG	3	6	107087	107092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2172	NC_004556	TGG	2	6	107275	107280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77747627
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2183	NC_004556	TGG	2	6	108098	108103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2184	NC_004556	GCA	2	6	108170	108175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2185	NC_004556	GT	4	8	108197	108204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2186	NC_004556	TGT	2	6	108240	108245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2187	NC_004556	ATG	2	6	108393	108398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2188	NC_004556	GCGTTT	2	12	108408	108419	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2189	NC_004556	AATGC	2	10	108473	108482	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2190	NC_004556	GCA	2	6	108490	108495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2191	NC_004556	TGC	2	6	108526	108531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2193	NC_004556	ATG	2	6	108568	108573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2199	NC_004556	CAACC	2	10	108728	108737	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2200	NC_004556	TGT	2	6	108789	108794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161484690
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2215	NC_004556	AAG	2	6	109680	109685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198024
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2220	NC_004556	GGT	2	6	110013	110018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2221	NC_004556	TGC	2	6	110023	110028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2222	NC_004556	T	7	7	110057	110063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2223	NC_004556	TCAG	2	8	110067	110074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2224	NC_004556	CTT	2	6	110141	110146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2225	NC_004556	GAT	2	6	110210	110215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198025
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2231	NC_004556	CTG	2	6	110666	110671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198025
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2236	NC_004556	TCGCA	2	10	111055	111064	20 %	20 %	20 %	40 %	28198025
2237	NC_004556	GAA	2	6	111101	111106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198025
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2239	NC_004556	TGA	2	6	111202	111207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198025
2240	NC_004556	TG	3	6	111211	111216	0 %	50 %	50 %	0 %	28198025
2241	NC_004556	TTGC	2	8	111269	111276	0 %	50 %	25 %	25 %	28198025
2242	NC_004556	A	6	6	111330	111335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2243	NC_004556	ATC	2	6	111507	111512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2244	NC_004556	GAC	2	6	111533	111538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2245	NC_004556	TGT	2	6	111588	111593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2246	NC_004556	CCA	2	6	111619	111624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2247	NC_004556	TCA	2	6	111641	111646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2248	NC_004556	CAAA	2	8	111658	111665	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2249	NC_004556	GCAACG	2	12	111768	111779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198026
2250	NC_004556	GCG	2	6	111800	111805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198026
2251	NC_004556	TCG	2	6	111851	111856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198026
2252	NC_004556	CGG	2	6	111864	111869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198026
2253	NC_004556	GCA	2	6	111957	111962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198026
2254	NC_004556	GAA	2	6	112018	112023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198026
2255	NC_004556	ACC	2	6	112084	112089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198026
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2257	NC_004556	CGCGT	2	10	112165	112174	0 %	20 %	40 %	40 %	28198026
2258	NC_004556	CTG	2	6	112393	112398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198026
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2263	NC_004556	CATCG	2	10	112453	112462	20 %	20 %	20 %	40 %	28198026
2264	NC_004556	TGG	2	6	112486	112491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198026
2265	NC_004556	GCG	2	6	112543	112548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198026
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2293	NC_004556	GCT	2	6	113430	113435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2363	NC_004556	CG	3	6	117132	117137	0 %	0 %	50 %	50 %	28198029
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2370	NC_004556	TCT	2	6	117361	117366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198029
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2372	NC_004556	TGA	3	9	117497	117505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198029
2373	NC_004556	TTG	2	6	117519	117524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198029
2374	NC_004556	TGAGG	2	10	117581	117590	20 %	20 %	60 %	0 %	28198029
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